Физика и химия стекла, 2019, T. 45, № 4, стр. 303-310

Кластерная самоорганизация интерметаллических систем. Новый кластер-прекурсор (InNa5)(AuAu5) и первичная цепь c симметрией 5m для самосборки кристаллической структуры Na32Au44In24-oP100

В. Я. Шевченко 12*, В. А. Блатов 3, Г. Д. Илюшин 34

1 Институт химии силикатов им. И.В. Гребенщикова РАН
199034 Санкт-Петербург, наб. Макарова 2, Россия

2 Санкт-Петербургский Научный Центр РАН
199034 Санкт-Петербург, Университетская наб., 5, Россия

3 Международный научно-исследовательский центр по теоретическому материаловедению, Самарский государственный технический университет
443100 Самара, ул. Молодогвардейская, 244, Россия

4 Федеральный научно-исследовательский центр “Кристаллография и фотоника”
119333 Москва, Ленинский пр. 59, Россия

* E-mail: shevchenko@isc.nw.ru

Поступила в редакцию 21.01.18
После доработки 29.03.19
Принята к публикации 04.04.19

Полный текст (PDF)

Аннотация

С помощью компьютерных методов (пакет программ ToposPro) осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование самосборки кристаллической структуры Na32Au44In24oP100 (пр. гр. P bcm, a = 5.483, b = 24.519, c = 14.573 Å, V = 1895 Å3). Установлен новый тип 12-атомного кластера K12 образованного из сдвоенных пентагональных пирамид AuAu5 и InNa5. Максимальная симметрия кластера K12 и первичной цепи из трансляционно-связанных кластеров K12 соответствует не-кристаллографической симметрии 5m. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры Na32Au44In24oP100 из нанокластеров-прекурсоров K12 в виде: первичная цепь → микрослой → микрокаркас. Первичные цепи из связанных кластеров K12 с симметрией m расположены в направлении [100] и расстояние между центрами кластеров определяет значение вектора a = 5.483 Å. В локальном окружении первичной цепи находятся 4 первичных цепи. В 2D слое между первичными цепями расположены цепи из атомов InAu и кластеров NaAu2In2. Расстояние между эквивалентными цепями в направлении [001] определяет значение вектора c = 14.573 Å. В 3D каркасе в направлении [010], расстояние между эквивалентными слоями 2D слоями определяет значение вектора b = 24.519 Å.

Ключевые слова: самосборка кристаллической структуры, кластер-прекурсор K12 = (InNa5)(AuAu5), первичная цепь с симметрией 5m, интерметаллид Na32Au44In24oP100

ВВЕДЕНИЕ

В настоящее время установлена кристаллизация 14 972 тройных AnBmСk [1, 2]. В образовании интерметаллидов участвует 67 химических элементов. Из 47 905 комбинаторно возможных композиций кристаллизация установлена только в 4813 системах. Наибольшее число тройных интерметаллидов образуется с участием элементов Fe, Co, Ni, Cu, Au, Al, Ga, In, Ge, Sn [1, 2]. Наименьшее число соединений образуется с участием элементов Cs, Rb, K, Be, Hg, Tl [1, 2]. Кристаллизация одного, двух и трех интерметаллидов установлена в 2132, 920 и 482 тройных системах [1, 2].

В тройных системах Na–Au–M (M – Ga, In, Tl) число кристаллохимически различных интерметалидов в ряду Ga → In → Tl уменьшается от 11 → 4 → 1 [1, 2].

Среди тройных Ga- и In-интерметаллидов встречаются как распространённые, так и уникальные типы кристаллических структур [1, 2]. Уникальный состав и кристаллическую структуру имеет Tl-интерметаллид Na32Au8Tl8oP48 [3].

Остаются неизвестными причины, определяющие распространенность и уникальность структурных типов тройных интерметаллидов [49]. Уникальность кристаллической структуры интерметаллида может определяться особым геометрическим типом металлокластера-прекурсора или участием в самосборке кристаллической структуры двух различных типов металлокластеров-прекурсоров.

В системе Na–Au–In не имеет кристаллохимических аналогов интерметаллид Na32Au44In24oP100 с пр. группой Pbcm [10]. Параметры орторомбической ячейки: a = 5.483, b = 25.663, c = 15.046 Å, V = 2117 Å3. Последовательность Вайкоффа для 13 кристаллографически независимых атомов имеет вид e9d7. Атомы Na характеризуются КЧ = 14 (один), 15 (один), 16 (три), все атомы Au (семь) и In (четыре) имеют КЧ = 12. Значение самого короткого модуля вектора трансляций a = 5.483 Å указывает, что кристаллическая структура является двухслойной, а модули вектора трансляций b = 25.663 и c = 15.046 Å – на сложный механизм самосборки в этих кристаллографических направлениях.

В настоящей работе проведен геометрический и топологический анализ кристаллической структуры интерметаллида Na32Au44In24 (пакет программ ToposPro [11]). Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры Na32Au44In24oP100 из кластеров-прекурсоров K12 в виде: первичная цепь → микрослой → микрокаркас.

Работа продолжает исследования [1218] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением современных компьютерных методов.

МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ

Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [11], позволяющего проводить многоцелевое исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде “свернутых графов” (фактор-графов). Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т.е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома.

Полученные значения координационных последовательностей атомов в 3D-сетках, приведены в таблице, представлены числа соседних атомов в ближайшем окружении, т.е. в первой координационной сфере атома. Все атомы характеризуются различными наборами координационных последовательностей {Nk}, следовательно, все атомы топологически (и функционально) различны.

Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы основывается на следующих принципах. Структура образуется в результате самосборки из кластеров-прекурсоров. При этом кластеры-прекурсоры образуют каркас структуры, пустоты в котором заполняются кластерами-спейсерами (состоящими из небольшого числа атомов). Нанокластеры-прекурсоры не имеют общих внутренних атомов, но они могут иметь общие атомы на поверхности. Кластеры-прекурсоры занимают высокосимметричные позиции. Набор нанокластеров-прекурсоров и кластеров-спейсеров включает в себя все атомы структуры. Алгоритм реализован в комплексе программ ToposPro [11].

САМОСБОРКА КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ Na32Au44In24

Использованный нами метод моделирования кристаллической структуры основан на определении иерархической последовательности ее самосборки в кристаллографическом пространстве [16]. На первом уровне самоорганизации системы определяется механизм формирования первичной цепи структуры из нанокластеров 0-уровня, сформированных на темплатной стадии химической эволюции системы, далее – механизм самосборки из цепи слоя (2-ой уровень) и затем из слоя – трехмерного каркаса (3-й уровень).

Кристаллографические данные. Пространственная группа P 2/b 21/c 21/m (Pbcm, no. 57) c элементами точечной симметрии: g = –1 (4a, 4b), 2 (4c), m (4d). Порядок группы равен 8. Из 13 кристаллографически независимых атомов 7 атомов находятся в плоскости m и 9 атомов – в общем положении.

В табл. 1 приведено локальное окружение атомов Au, Na, In и значения их координационных последовательностей в 3D атомной сетке. Атомы Na характеризуются КЧ = 14 (один), 15 (один), 16 (три), все атомы Au и In имеют икосаэдрическую координацию (КЧ = 12). При проведении расчетов некорректное значение х-координаты атома Au1 приведенное в [1, 10] было исправлено с 0.0985 на 0.00985.

Кластер-прекурсор K12. Кластер K12 образован из сдвоенных пентагональных пирамид Au(Au5) и In(Na5) (рис. 1а). Максимальная симметрия кластера K12 и первичной цепи из трансляционно связанных кластеров K12 соответствует некристаллографической симметрии 5m. В кристаллической структуре кластер K12 и первичная цепь характеризуется симметрией m.

Рис. 1.

Кластеры в кристаллических структурах Na32Au44In24 (a) и K34 Au10 In95 (б).

В кристаллической структуре K34Au10In95 [19] пентагональные пирамиды с химическим составом In(In5) и In(K5) участвуют в образованиее двухслойных икосаэдрических кластеров (рис. 1б).

В Na32Au44In24 кластеры K12 состава Au(Au5)In(Na5) связаны трансляциями (рис. 2), в K34Au10In95 – кластеры K12 состава In(In5)In(K5) связаны центром симметрии.

Рис. 2.

Na32Au44In24. Первичные цепи ${\text{S}}_{3}^{1}$ из связанных кластеров K12 = Au(Au5)In(Na5) (две проекции).

Самосборка кристаллической структуры. Первичная цепь. Самосборка первичных цепей из кластеров K12 происходит в направлении [100] (рис. 2). Расстояние между центрами кластеров K12 определяет значение наименьшего вектора трансляций a = 5.483 Å.

Слой. Образование слоя ${\text{S}}_{3}^{2}$ происходит при связывании расположенных непараллельно первичных цепей ${\text{S}}_{3}^{1}$ + ${\text{S}}_{3}^{1}$ (g = –1, позиции 4a (0. 0. 1/2)) (рис. 3). Расстояние между эквивалентными цепями в направлении [001] определяет значение вектора c = = 14.573 Å. Между первичными цепями располагаются кластеры NaAu2In2 и InAu, образующие цепи в направлении [100].

Рис. 3.

Na32Au44In24. Cлой ${\text{S}}_{3}^{2}$ из связанных первичных цепей ${\text{S}}_{3}^{1}.$ Между первичными цепями располагаются кластеры NaAu2In2 и InAu, образующие цепи в направлении [100].

Самосборка каркаса. 3D каркасная структура S33 формируется при связывании слоев в направлении [010] (рис. 2, 4, 5 ). В 3D каркасе в направлении [010], расстояние между эквивалентными слоями 2D слои определяет значение вектора b = 24.519 Å.

Рис. 4.

Na32Au44In24. Каркасная структура ${\text{S}}_{3}^{3}$ из связанных слоев ${\text{S}}_{3}^{2}$ (две проекции).

Таблица 1.  

Локальное окружение атомов Na, Au, In в кристалической структуре и значения их координационных последовательностей

Атом Локальное
окружение
Координационные
последовательности
N1 N2 N3 N4 N5
Na1 3Na + 6In + 6Au 15 52 113 224 338
Na2 4Na + 3In + 9Au 16 51 113 213 347
Na3 4Na + 3In + 7Au 14 49 119 212 359
Na4 2Na + 5In + 9Au 16 48 115 213 341
Na5 4Na + 3In + 9Au 16 52 121 213 337
In1 5Na + 3In + 4Au 12 50 120 209 341
In2 6Na + 1In + 5Au 12 50 107 205 344
In3 5Na + 2In + 5Au 12 47 109 209 337
In4 5Na + 7Au 12 43 103 203 317
Au1 6Na + 3In + 3Au 12 50 107 205 344
Au2 6Na + 2In + 4Au 12 49 116 207 333
Au3 6Na + 2In + 4Au 12 50 111 210 335
Au4 5Na + 4In + 3Au 12 49 118 210 333
Au5 5Na + 2In + 5Au 12 43 103 203 317
Au6 6Na + 2In + 4Au 12 48 116 222 336
Au7 5Na + 4In + 3Au 12 47 109 209 337

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование кластерной самосборки кристаллической структуры Na32Au44In24oP100.

Установлен новый тип 12-атомного кластера K12 образованного из сдвоенных пентагональных пирамид Au(Au5) и In(Na5). Максимальная симметрия кластера K12 и первичной цепи из трансляционно связанных кластеров K12 соответствует не-кристаллографической симметрии 5m.

Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры из нанокластеров-прекурсоров K12 в виде: первичная цепь → микрослой → микрокаркас. Первичные цепи из связанных кластеров K12 с симметрией m расположены в направлении [100] и расстояние между центрами кластеров определяет значение вектора a = 5.483 Å. В 2D слое между первичными цепями расположены цепи из атомов InAu и кластеров NaAu2In2. Расстояние между эквивалентными цепями в направлении [001] определяет значение вектора c = 14.573 Å.

Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ № 19-02-00636) и Министерства науки и высшего образования в рамках выполнения работ по Государственному заданию ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН.

Список литературы

  1. Inorganic crystal structure database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ), Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.

  2. Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.

  3. Zachwieja U., Mueller J. Na4AuTl, die erste ternaere Verbindung im System Natrium/Gold/Thallium. Zeitschrift fuer Anorganische und Allgemeine Chemie. 1997. V. 623. P. 1621–1624.

  4. Pearson W.B. The crystal chemistry and physics of metals and alloys. Wiley-Interscience, New York, USA. 1972.

  5. Крипякевич П.И. Структурные типы интерметаллических соединений. Москва. Наука. 1977.

  6. Wells A.F. Structural Inorganic Chemistry. 5th ed. Oxford University Press. London, 1984.

  7. Dshemuchadse J., Steurer W. Some Statistics on Intermetallic Compounds // Inorg. Chem. 2015. V.54. P. 1120–1128.

  8. Dshemuchadse J., Steurer W. More statistics on intermetallic compounds – ternary phases //Acta Crystallogr. 2015A. V. 71. P. 335–345.

  9. Steurer W., Dshemuchadse J. Intermetallics: Structures, Properties, and Statistics // Oxford University Press, International Union of Crystallography Monographs on Crystallography, 2016. ISBN: 9780198714552.

  10. Zachwieja U. Na8 Au11 In6; ein Gold-Indium-Polyederger?st mit pentagonal-dipyramidalen Au Au5 In-Baueinheiten. Zeitschrift fuer Anorganische und Allgemeine Chemie. 1996. V. 622. P. 1581–1586

  11. Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576–3585. http://topospro.com/.

  12. Ilyushin G.D. Modeling of the Self-OrInnization Processes in Crystal-Forming Systems. Tetrahedral Metal Clusters and the Self-Assembly of Crystal Structures of Intermetallic Compounds // Crystallography Reports. 2017. V. 62. 5. P. 670–683.

  13. Ilyushin G.D. Symmetry and Topology Code of the Cluster Self-Assembly of Intermetallic Compounds A[16]2 B[12]4 of the Friauf Families Mg2Cu4 and Mg2Zn4 // Crystallography Reports. 2018. V. 63. 4. P. 543–552.

  14. Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D. M. Nanocluster model of intermetallic compounds with giant unit cells: β, β'-Mg2Al3 polymorphs // Inorg. Chem., 2010. V. 49. № 4. P. 1811–1818.

  15. Pankova A.A., Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D.M. γ-Brass Polyhedral Core in Intermetallics: The Nanocluster Model // Inorg. Chem. 2013. V. 52. № 22. P. 13094–13107.

  16. Илюшин Г.Д. Моделирование процессов самоорганизации в кристаллообразующих системах. М.: Едиториал УРСС. 2003. 376 с.

  17. Pankova A.A., Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D.M. γ-Brass Polyhedral Core in Intermetallics: The Nanocluster Model // Inorg. Chem. 2013. V. 52. № 22. P. 13094–13107.

  18. Шевченко В.Я., Блатов В.А., Илюшин Г.Д. Симметрийный и топологический код (программа) кластерной самосборки икосаэдрических структур семейства NaZn13-cF112 и TRB66 -cF1944 // Физика и химия стекла. 2015. V. 41. № 4. P. 341–351.

  19. Li B., Corbett J.D. Electronic Stabilization Effects: Three New K–In–T (T = Mg, Au, Zn) Network Compounds // Inorganic Chemistry. 2006. V. 45(22). P. 8958–8964.

Дополнительные материалы отсутствуют.