1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Координационная химия
  4. T. 49, № 5, 2023

Координационная химия, 2023, T. 49, № 5, стр. 269-277

Синтез, строение и распределение электронной плотности в кристаллах K2(L-Trp)2(H2O) (HTrp = триптофан)

Н. А. Бондарева 1, П. П. Пурыгин 1, Ю. П. Зарубин 1, П. В. Дороватовский 2, А. А. Корлюков 3, 4, А. В. Вологжанина 4, *

1 Самарский национальный исследовательский университет им. академика С.П. Королева
Самара, Россия

2 Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Москва, Россия

3 Российский национальный медицинский университет им. Н.И. Пирогова
Москва, Россия

4 Институт элементоорганических соединений им. А.Н. Несмеянова РАН
Москва, Россия

* E-mail: vologzhanina@mail.ru

Поступила в редакцию 18.07.2022
После доработки 21.08.2022
Принята к публикации 23.08.2022

Аннотация

Взаимодействием L-триптофана (HTrp) с гидроксидом калия в водно-спиртовом растворе получена первая соль щелочного металла и L-триптофана, имеющая состав K2(L-Trp)2(H2O) (I). Cоединение I охарактеризовано методами спектроскопии ИК и ЯМР 1H и дифракционными методами (CCDC № 2184367). Установлено, что наличие мостиковой молекулы воды и хелатно-мостиковых анионов в структуре I приводит к тому, что соединение имеет слоистое строение. С помощью квантовохимических расчетов кристаллической структуры (PBE, базис плоских волн, 800 эВ) оценена прочность взаимодействий иона калия с L-триптофанат-анионом в зависимости от типа координации и влияние конформации аниона на прочность координационных, гидрофобных и гидрофильных взаимодействий.

Ключевые слова: L-триптофан, соли калия, периодические квантовохимические расчеты, кристаллическая структура, молекулярные полиэдры Вороного–Дирихле

Список литературы

  1. Soldevila-Barreda J.J., Metzler-Nolte N. // Chem. Rev. 2019. V. 119. № 2. P. 829. https://doi.org/10.1021/acs.chemrev.8b00493

  2. Saboury A.A. // J. Iran. Chem. Soc. 2006. V. 3. № 1. P. 1. https://doi.org/10.1007/BF03245784

  3. Poursharifi M., Wlodarczyk M.T., Mieszawska A.J. // Inorganics. 2019. V. 7. № 1. P. 2. https://doi.org/10.3390/inorganics7010002

  4. Palermo G., Spinello A., Saha A. et al. // Expert Opin. Drug Discov. 2021. V. 16. № 5. P. 497. https://doi.org/10.1080/17460441.2021.1851188

  5. Vidossich P., Magistrato A. // Biomolecules. 2014. V. 4. № 3. P. 616. https://doi.org/10.3390/biom4030616

  6. Palermo G., Magistrato A., Riedel T. et al. // ChemMedChem. 2016. V. 11. № 12. P. 1199. https://doi.org/10.1002/cmdc.201500478

  7. Dey D., Basu S. // J. Lumin. 2011. V. 131. № 4. P. 732. https://doi.org/10.1016/j.jlumin.2010.11.027

  8. Mosae Selvakumar P., Suresh E., Subramanian P.S. // Polyhedron. 2009. V. 28. № 2. P. 245. https://doi.org/10.1016/j.poly.2008.10.072

  9. Maclaren J.K., Janiak C. // Inorg. Chim. Acta. 2012. V. 389. P. 183. https://doi.org/10.1016/j.ica.2012.03.010

  10. Wang J., Xu X.-Y., Ma W.-X. et al. // Jiegou Huaxue. 2008. V. 27. P. 153.

  11. Wang J., Xu X., Ma W. et al. // Acta Crystallogr. E. 2007. V. 63. № 11. P. m2867. https://doi.org/10.1107/S1600536807053421

  12. Xie Y., Wu H.-H., Yong G.-P. et al. // Acta Crystallogr. E. 2006. V. 62. № 9. P. m2089. https://doi.org/10.1107/S1600536806030364

  13. Mendiratta S., Usman M., Luo T.-T. et al. // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 4. P. 1572. https://doi.org/10.1021/cg401472k

  14. Xiao D.-R., Zhang G.-J., Liu J.-L. et al. // Dalton Trans. 2011. V. 40. № 21. P. 5680. https://doi.org/10.1039/C1DT10262A

  15. Mendiratta S., Tseng T.-W., Luo T.-T. et al. // Cryst. Growth Des. 2018. V. 18. № 5. P. 2672. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.8b00012

  16. Patra A.K., Bhowmick T., Ramakumar S. et al. // Dalton Trans. 2008. № 48. P. 6966. https://doi.org/10.1039/B802948B

  17. Şenel P., İnci D., Aydın R. et al. // Appl. Organomet. Chem. 2019. V. 33. № 10. P. E5122. https://doi.org/10.1002/aoc.5122

  18. Kumita H., Kato T., Jitsukawa K. et al. // Inorg. Chem. 2001. V. 40. № 16. P. 3936. https://doi.org/10.1021/ic000990p

  19. Lazarenko V.A., Dorovatovskii P.V., Zubavichus Y.V. et al. // Crystals. 2017. V. 7. № 11. P. 325. https://doi.org/10.3390/cryst7110325

  20. Svetogorov R.D., Dorovatovskii P.V., Lazarenko V.A. // Cryst. Res. Technol. 2020. V. 55. № 5. P. 1900184. https://doi.org/10.1002/crat.201900184

  21. Kabsch W. // Acta Crystallogr. D. 2010. V. 66. № 2. P. 125. https://doi.org/10.1107/S0907444909047337

  22. Evans P. // Acta Crystallogr. D. 2006. V. 62. № 1. P. 72. https://doi.org/10.1107/S0907444905036693

  23. Sheldrick G.M. // Acta Crystallogr. A. 2015. V. 71. № 1. P. 3. https://doi.org/10.1107/S2053273314026370

  24. Sheldrick G.M. // Acta Crystallogr. C. 2015. V. 71. № 1. P. 3. https://doi.org/10.1107/S2053229614024218

  25. Dolomanov O.V., Bourhis L.J., Gildea R.J. et al. // J. A-ppl. Crystallogr. 2009. V. 42. № 2. P. 339. https://doi.org/10.1107/S0021889808042726

  26. Peresypkina E.V., Blatov V.A. // Acta Crystallogr. B. 2000. V. 56. № 3. P. 501. https://doi.org/10.1107/S0108768199016675

  27. Peresypkina E.V., Blatov V.A. // Acta Crystallogr. B. 2000. V. 56. № 6. P. 1035. https://doi.org/10.1107/S0108768100011824

  28. Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576. https://doi.org/10.1021/cg500498k

  29. Kresse G., Hafner J. // Phys. Rev. B. 1993. V. 47. № 1. P. 558. https://doi.org/10.1103/PhysRevB.47.558

  30. Kresse G., Hafner J. // Phys. Rev. B. 1994. V. 49. № 20. P. 14251. https://doi.org/10.1103/PhysRevB.49.14251

  31. Kresse G., Furthmüller J. // Phys. Rev. B. 1996. V. 54. № 16. P. 11169. https://doi.org/10.1103/PhysRevB.54.11169

  32. Kresse G., Furthmüller J. // Comput. Mater. Sci. 1996. V. 6. № 1. P. 15. https://doi.org/10.1016/0927-0256(96)00008-0

  33. Kresse G., Joubert D. // Phys. Rev. B. 1999. V. 59. № 3. P. 1758. https://doi.org/10.1103/PhysRevB.59.1758

  34. Gonze X., Beuken J.-M., Caracas R. et al. // Comput. Mater. Sci. 2002. V. 25. № 3. P. 478. https://doi.org/10.1016/S0927-0256(02)00325-7

  35. Tang W., Sanville E., Henkelman G. // J. Phys. Condens. Matter. 2009. V. 21. № 8. P. 084204. https://doi.org/10.1088/0953-8984/21/8/084204

  36. Bader R.F.W. // Atoms in Molecules: A Quantum Theory, Clarendon Press, 1994. 438 p. https://books.google.ru/books?id=tyVpQgAACAAJ

  37. Bader R.F.W. // Acc. Chem. Res. 1985. V. 18. № 1. P. 9. https://doi.org/10.1021/ar00109a003

  38. Korlyukov A.A., Khrustalev V.N., Vologzhanina A.V. et al. // Acta Crystallogr. B. 2011. V. 67. № 4. P. 315. https://doi.org/10.1107/S0108768111022695

  39. Vologzhanina A.V., Savchenkov A.V., Dmitrienko A.O. et al. // J. Phys. Chem. A. 2014. V. 118. № 41. P. 9745. https://doi.org/10.1021/jp507386j

  40. Вологжанина А.В., Лысенко К.А. // Изв. АН. Сер. хим. 2013. Т. 62. № 8. С. 1786 (Vologzhanina A.V., Lyssenko K.A. // Russ. Chem. Bull. 2013. V. 62. № 8. P. 1786). https://doi.org/10.1007/s11172-013-0257-0

  41. Serezhkin V.N., Serezhkina L.B., Vologzhanina A.V. // Acta Crystallogr. B. 2012. V. 68. № 3. P. 305. https://doi.org/10.1107/S0108768112014711

  42. Serezhkin V.N., Savchenkov A.V. // Cryst. Growth Des. 2015. V. 15. № 6. P. 2878. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.5b00326

  43. Serezhkin V.N., Savchenkov A.V. // Cryst. Growth Des. 2020. V. 20. № 3. P. 1997. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.9b01645

  44. Serezhkin V.N., Savchenkov A.V. // CrystEngComm. 2021. V. 23. № 3. P. 562. https://doi.org/10.1039/D0CE01535K

  45. Vologzhanina A.V. // Crystals. 2019. V. 9. № 9. P. 478. https://doi.org/10.3390/cryst9090478

  46. Зорина-Тихонова Е.Н., Чистяков А.С., Кискин М.А. и др. // Коорд. химия. 2021. Т. 47. № 6. С. 373 (Zorina-Tikhonova E.N., Chistyakov A.S., Kiskin M.A. et al. // Russ. J. Coord. Chem. 2021. V. 47. № 6. P. 409). https://doi.org/10.1134/S1070328421060099

  47. Karnoukhova V.A., Baranov V.V., Vologzhanina A.V. et al. // CrystEngComm. 2021. V. 23. № 24. P. 4312. https://doi.org/10.1039/D1CE00434D

  48. Vologzhanina A.V., Ushakov I.E., Korlyukov A.A. // Int. J. Mol. Sci. 2020. V. 21. № 23. P. 8970. https://doi.org/10.3390/ijms21238970

  49. Espinosa E., Molins E., Lecomte C. // Chem. Phys. Lett. 1998. V. 285. № 3. P. 170. https://doi.org/10.1016/S0009-2614(98)00036-0

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Координационная химия

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал