1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Ботанический журнал
  4. T. 108, № 5, 2023

Ботанический журнал, 2023, T. 108, № 5, стр. 491-505

Геоданные гербария МГУ: структура данных и методика геопривязки

А. П. Серёгин 1, *, В. Н. Пашкина 1, И. Н. Поспелов 2

1 Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
119991 Москва, Ленинские горы, 1, Россия

2 Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН
119071 Москва, Ленинский пр.,33, Россия

* E-mail: botanik.seregin@gmail.com

Поступила в редакцию 13.03.2023
После доработки 08.04.2023
Принята к публикации 18.04.2023

Аннотация

Оцифровка Гербария Московского университета (MW) была начата весной 2015 г., с октября 2016 г. мы стали размещать изображения образцов в открытый доступ на портале Цифрового гербария МГУ (https://plant.depo.msu.ru/). Постепенно на нашем портале стали появляться и расширенные метаданные: полные расшифровки текста этикеток и геопривязки, т.е. значения координат места сбора каждого образца. На 14.01.2023 две трети образцов Гербария МГУ (693168 штук, или 66%) имеют электронные метки на карте, в то время как 359593 образца их пока не имеют. В статье дана характеристика массива геоданных Гербария Московского университета как в географическом аспекте (покрытие геоданных для разных регионов), так и в аспекте точности геопривязок. Приведены общие методические указания по геопривязке гербарных коллекций.

Ключевые слова: гербарий, пространственные данные, география растений

Список литературы

  1. [Belov] Белов М.И. 1959а. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 3. Советское арктическое мореплавание 1917–1932 гг. Л. 511 с.

  2. [Belov] Белов. М.И. 1959b. История открытия и освоения Северного Морского пути. Т. 4. Научное и хозяйственное освоение Советского Севера. 1933–1945 гг. Л. 616 с.

  3. Bijmoer R., Scherrenberg M., Creuwels J. 2023. Naturalis Biodiversity Center (NL) – Botany. Naturalis Biodiversity Center. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ib5ypt accessed via GBIF.org on 2023-01-31.

  4. Catalogue of Life. 2023. https://www.catalogueoflife.org/

  5. Chapman A.D., Wieczorek J.R. 2020. Georeferencing best practices. Version 1.0. Copenhagen, Denmark, GBIF Secretariat. 112 p. https://doi.org/10.15468/doc-gg7h-s853

  6. Drinkwater R.E., Cubey R.W., Haston E.M. 2014. The use of Optical Character Recognition (OCR) in the digitisation of herbarium specimen labels. – PhytoKeys. 19(38): 15–30.

  7. EtoMesto.ru. 2023. http://www.etomesto.ru/

  8. [Glinka et al.] Глинка Г.В., Тхоржевский И.И., Цветков М.А. 1914. Атлас Азиатской России. Издание переселенческого управления главного управления землеустройства и земледелия. СПб. 71 с. http://kartolog.ru/2009/09/atlas-aziatskoj-rossii-1914-g/?ysclid=ld1jlbtnsj906089553

  9. Global Biodiversity Information Facility. 2023. https://www.gbif.org/

  10. Güntsch A., Groom Q., Ernst M., Holetschek J., Plank A., Röpert D., Fichtmüller D., Shorthouse D.P., Hyam R., Dillen M., Trekels M., Haston E., Rainer H. 2021. A botanical demonstration of the potential of linking data using unique identifiers for people. – PLoS ONE. 16(12): e0261130. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0261130

  11. Le Bras G., Pignal M., Jeanson M.L., Muller S., Aupic C., Carré B., Flament G., Gaudeul M., Gonçalves C., Invernón V.R., Jabbour F., Lerat E., Lowry P.P., Offroy B., Pimparé E.P., Poncy O., Rouhan G., Haevermans T. 2017. The French Muséum national d’histoire naturelle vascular plant herbarium collection dataset. – Scientific Data. 4(1): 1–16.

  12. Marcer A., Groom Q., Haston E., Uribe F. 2021. Natural History collections: georeferencing survey report: current georeferencing practices across institutions worldwide. – Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.4644529

  13. Marshruty.ru 2023. https://maps.marshruty.ru/

  14. Nelson G., Paul D., Riccardi G., Mast A.R. 2012. Five task clusters that enable efficient and effective digitization of biological collections. – ZooKeys. 209: 19–45. https://doi.org/10.3897/zookeys.209.3135

  15. [OOPT] ООПТ России. 2023. http://www.oopt.aari.ru/

  16. [Pomogator…] Помогатор Цифрового гербария МГУ. 2023.

  17. https://plant.depo.msu.ru/pomogator

  18. Pospelov I.N. 2018. The experience of geographical fixing Central Siberia herbarium collections from the Moscow State University (MW) collection. – In: Abstracts of the conference “Information Technologies in the Research of Biodiversity” (BIT–2018). Irkutsk. P. 105–106.

  19. [Pospelov] Поспелов И.Н. 2020. Уровни географической локализации пространственных данных в информационных ресурсах о биологическом разнообразии. – В кн.: Информационные технологии в исследовании биоразнообразия: материалы III Национальной науч. конф. с междунар. участием, посвященной 100-летию со дня рождения академика РАН П.Л. Горчаковского. – Екатеринбург. С. 448–451.

  20. [Pospelov, Pospelova] Поспелов И.Н., Поспелова Е.Б. 2019. О возможностях исследования флористического разнообразия на основании анализа гербарных сборов (Цифровой гербарий MW). – В кн.: Ботанико-географические исследования. Камелинские чтения: сб. науч. тр. Пермь. С. 134–138.

  21. Ramirez J., Watson K., McMillin L., Gjieli E., Sessa E. 2022. The New York Botanical Garden Herbarium (NY). Version 1.56. The New York Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/6e8nje

  22. Ranwashe F. et al. 2022. Botanical Database of Southern Africa (BODATSA): Botanical Collections. Version 1.16. South African National Biodiversity Institute. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/2aki0q

  23. RetroMap. 2023. RetroMap: Старые карты России и зарубежья. http://retromap.ru/

  24. [Rodnaya…] Родная Вятка. 2023. http://rodnaya-vyatka.ru/

  25. [Seregin] Серегин А.П. 2017. Гербарий Московского университета (MW) сегодня: фонды, онлайн доступ и научная работа. – Бот. журн. 102 (3): 281–308.

  26. Seregin A.P. 2018. The largest digital herbarium in Russia is now available online! – Taxon. 67 (2): 463–467. https://doi.org/10.12705/672.34

  27. Seregin A.P. 2020. Moscow Digital Herbarium: a consortium since 2019 – Taxon. 67 (2): 417–419. https://doi.org/10.1002/TAX.12228

  28. [Seregin] Серегин А.П. 2022. Инструкция по геопривязке образцов Гербария Московского университета (MW). Вариант “Монголия”. Версия 1.0. М. https://doi.org/10.13140/RG.2.2.14879.84645

  29. Seregin A. 2023a. Moscow University Herbarium (MW). Version 1.265. Lomonosov Moscow State University. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31.https://doi.org/10.15468/cpnhcc

  30. Seregin A.P. (Ed.). 2023b. Moscow Digital Herbarium: Electronic resource. Moscow State University, Moscow. https://plant.depo.msu.ru/

  31. Thiers B.M. 2023. Index Herbariorum. https://sweetgum.nybg.org/science/ih/

  32. [Tupitsyna et al.] Тупицына Н.Н., Шауло Д.Н., Гуреева И.И. 2016. Обзор флористических исследований Средней Сибири. Красноярск. 253 с. https://doi.org/10.17223/9785946216371/33 (https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/services/Download/vtls:000617746/SOURCE1)

  33. Teisher J., Stimmel H. 2022. Tropicos Specimen Data. Missouri Botanical Garden. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/hja69f

  34. Wittzell H., Shah M. 2022. Lund Botanical Museum (LD). Lund Botanical Museum (LD). Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2023-01-31https://doi.org/10.15468/c4w4co

  35. [Yandex] Яндекс.Карты. 2023. https://yandex.ru/maps/

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Ботанический журнал

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал