Ботанический журнал, 2023, T. 108, № 6, стр. 603-614

Специфические проблемы при выделении геномной ДНК из растений: пути решения

У. А. Галактионова 12, В. Н. Большаков 1, М. Ю. Тиходеева 2, О. Н. Тиходеев 2***

1 ООО Вега ГК Алкор Био
192148 Санкт-Петербург, Железнодорожный проспект, 40А, Россия

2 Санкт-Петербургский государственный университет
199034 Санкт-Петербург, Университетская наб., 7/9/11, Россия

* E-mail: tikhodeyev@mail.ru
** E-mail: o.tihodeev@spbu.ru

Поступила в редакцию 08.12.2022
После доработки 28.05.2023
Принята к публикации 06.06.2023

Аннотация

Важную роль в современных ботанических исследованиях играют различные молекулярно-генетические методы: секвенирование генома, ПЦР, AFLP-анализ и т.п. Эти методы требуют использования высококачественной (т.е. хорошо очищенной и не деградировавшей) геномной ДНК. Однако выделение такой ДНК из растений осложнено широким спектром органических соединений, загрязняющих ДНК и резко снижающих ее качество. В результате протоколы выделения ДНК из растений обычно отличаются трудоемкостью, большими затратами времени и требуют приобретения дорогостоящих реагентов, большинство из которых производится за рубежом. При массовом выделении ДНК из растительного материала перечисленные недостатки имеют большое значение, особенно с учетом текущих проблем с импортом. Более того, не существует универсального протокола, пригодного для любых видов растений и любых вариантов используемого растительного материала: в разных случаях приходится применять разные протоколы и зачастую вводить в них дополнительные модификации. К перспективным путям преодоления этих проблем относится поиск упрощенных методов выделения ДНК из растений, а также использование специально подготовленного исходного материала.

Ключевые слова: геномная ДНК растений, протоколы выделения ДНК, вторичные метаболиты, полифенолы, полисахариды, CTAB, поливинилпирролидон, Myrica gale L.

Дополнительные материалы отсутствуют.