Доклады Российской академии наук. Химия, науки о материалах , 2020, T. 494, № 1, стр. 15-20

О влиянии природы заместителей на антимикробную активность водорастворимых ацилгидразонов на платформе изатина

А. В. Богданов 1*, А. Д. Волошина 1, А. Р. Хаматгалимов 1, Н. В. Терехова 1, член-корреспондент РАН В. Ф. Миронов 1

1 Институт органической и физической химии им. А.Е. Арбузова ФИЦ Казанский научный центр Российской академии наук
Казань, Россия

* E-mail: abogdanov@inbox.ru

Поступила в редакцию 23.06.2020
После доработки 06.07.2020
Принята к публикации 02.09.2020

Полный текст (PDF)

Аннотация

На примере некоторых аммониевых изатин-3-ацилгидразонов с использованием простых молекулярных дескрипторов и квантово-химических расчетов выявлена зависимость уровня антимикробной активности от объема и электронной природы заместителей в бензильном фрагменте. Показано, что для проявления активности ключевыми факторами являются строение и электронная природа заместителей в положении 1 и липофильность соединений данного ряда.

Ключевые слова: антимикробная активность, гидразоны, гетероциклы, “структура–активность”, изатин

Гетероциклическая платформа оксиндола встречается во многих биологически активных соединениях и относится к классу “привилегированных структур” [1]. Среди многообразия соединений, содержащих этот структурный мотив, наиболее широко исследуемым является изатин (индолин-2,3-дион). Легкость модификации по карбонильной группе, ароматическому фрагменту и атому азота обусловливает большие возможности и перспективы его применения в медицине, органическом синтезе и химии функциональных материалов [26] с возможностью управления свойствами его производных в результате модификации того или иного реакционного центра. Известно, что многочисленные производные изатина проявляют различные виды биологической активности, такие как противораковая [7], антитуберкулезная [8], антимикробная [9] и фунгицидная [10]. Одним из наиболее изучаемых классов являются изатин-5-сульфонамиды, которые обладают свойством ингибирования каспаз – ключевых апоптотических ферментов. Функционализация оксиндольного цикла гидразонным фрагментом зачастую приводит к проявлению данными соединениями новых видов активности (схема 1). При этом следует отметить существенное влияние строения заместителей на периферии гетероциклической платформы на уровень и тип физиологического действия.

Схема 1.

В этом контексте одной из главных проблем, ограничивающих проведение большего спектра биологических исследований, является плохая растворимость целевых соединений в биосовместимых растворителях, и прежде всего в воде. Одним из решений этой задачи может являться введение в структуру производного изатина солевого фрагмента, в качестве источника которого могут выступать реагенты Жирара – гидразиды, содержащие положительно заряженный атом азота.

Высокая реакционная способность карбонильной группы изатина в положении 3 позволяет разрабатывать подход к получению водорастворимых аммониевых изатин-3-ацилгидразонов [1114]. Исследования антимикробной активности указывают на высокий потенциал нескольких рядов этих соединений в дизайне и поиске эффективных и нетоксичных антимикробных агентов.

В данной работе представлен синтез ряда новых триметиламмониевых изатин-3-ацилгидразонов, содержащих различные по строению и электронной природе заместители в бензильном фрагменте (схема 2).

Схема 2.

Строение полученных соединений было подтверждено данными 1Н и 13С ЯМР, ИК-спектроскопии и масс-спектрометрии МАЛДИ (табл. 1).

Таблица 1.

Спектральные характеристики и константы соединений еа

Соединениеб 1H ЯМР (CDCl3, δ, м. д., J, Гц); 13С ЯМР (CDCl3, δ, м. д.); ИК (ν, см–1); MALDI TOF, m/z
Желтый порошок, выход 84%. 1Н ЯМР: 7.69 (д, 1H, J 7.6, Наром), 7.21–7.28 (м, 6H, Наром), 7.05 (д. д, 1H, J 7.1, 8.2, Наром), 6.78 (д, 1Н, J 8.1, Наром), 5.11 (с, 2H, С(О)CН2), 4.87 (с, 2H, NCН2), 3.50 (с, 9Н, NСН3).
13С ЯМР: 158.2, 150.3, 138.6 138.4, 130.8, 130.4, 127.7, 126.10, 126.06, 125.7, 124.2, 117.8, 110.7, 77.2, 67.0, 43.6.
ИК: 3400 (νNH), 2954 (νCH), 2926 (νAr–H), 1710 (νC=O), 1678 (νC=O), 1615 (νC=C). MALDI TOF: 351 [M–Cl]+. Тпл 248°С.
Элементный анализ. Найдено, %: C, 61.90; H, 5.87; N, 14.40. Вычислено для C20H23ClN4O2, %: C, 62.09; H, 5.99; N, 14.48.
Желтый порошок, выход 93%. 1Н ЯМР: 7.66 (уш. с, 1H, Наром), 7.39–7.37 (м, 3H, Наром), 7.29 (д, 2Н, J 7.9, Наром), 7.14 (т, 1H, J 7.4, Наром), 6.98 (д, 1Н, J 7.9, Наром), 6.65 (д. д, 1Н, J 17.6, 11.0, СН=СН2), 5.75 (д, 1Н, J 17.6, СН=СН2), 5.22 (д, 1Н, J 11.0, СН=СН2), 4.90 (с, 2H, NCН2), 3.99 (с, 2H, С(О)CН2), 3.30 (с, 9Н, NСН3).
13С ЯМР: 166.7, 161.3, 143.7, 137.5, 136.6 136.0, 135.6, 133.0, 128.5, 127.2, 124.4, 122.1, 119.5, 115.6, 111.2, 62.8, 54.6, 40.0.
ИК: 3433 (νNH), 3010 (νCH), 2937 (νAr–H), 1678 (νC=O), 1615 (νC=C). MALDI TOF: 377 [M–Cl]+. Тпл 230°С.
Элементный анализ. Найдено, %: C, 63.85; H, 6.00; N, 13.39. Вычислено для C22H25ClN4O2, %: C, 63.99; H, 6.10; N, 13.57.
Желтый порошок, выход 90%. 1Н ЯМР: 8.03–7.99 (м, 2H, Наром), 7.64 (д, 1Н, J 7.7, Наром), 7.42–7.32 (м, 3H, Наром), 7.14 (д. д, 1H, J 7.8, 7.5, Наром), 6.81 (м, 1Н, Наром), 4.93 (с, 2H, С(О)CН2), 4.75 (с, 2H, NCН2), 3.41 (с, 9Н, NСН3).
13С ЯМР: 166.4, 160.9, 147.3, 143.5, 143.1, 135.4, 132.6, 128.8, 124.1, 123.9, 121.5, 119.1, 110.7, 62.2, 53.9, 42.5.
ИК: 3412 (νNH), 2972 (νCH), 2902 (νAr–H), 1710 (νC=O), 1692 (νC=O), 1613 (νC=C). MALDI TOF: 397 [M–Cl]+. Тпл 247°С (разл.).
Элементный анализ. Найдено, %: C, 55.50; H, 5.01; N, 16.09. Вычислено для C20H22ClN5O4, %: C, 55.62; H, 5.13; N, 16.22.
Желтый порошок, выход 95%. 1Н ЯМР: 7.71 (д, 1H, J 1.9, Наром), 7.66 (м, 1H, Наром), 7.62 (д, 1H, J 8.3, Наром), 7.45 (д. д, 1H, J 8.0, 1.7, Наром), 7.38 (д, 1H, J 8.3, Наром), 7.19 (д, 1H, J 7.7, Наром), 7.12 (д, 1H, J 8.0, Наром), 5.00 (ушир. с, 4H, NCН2, С(О)CН2), 3.35 (ушир. с, 9Н, NСН3).
13С ЯМР: 168.1, 165.0, 142.9, 136.8, 132.3 131.3, 130.9, 130.4, 129.6, 127.8, 123.5, 121.1, 110.5, 61.8, 53.5, 41.6.
ИК: 3408 (νNH), 3018 (νCH), 2937 (νAr–H), 1702 (νC=O), 1677 (νC=O), 1613 (νC=C). MALDI TOF: 419 [M–Cl]+. Тпл 221°С (разл.).
Элементный анализ. Найдено, %: C, 52.59; H, 4.50; N, 12.09. Вычислено для C20H21Cl3N4O2, %: C, 52.71; H, 4.64; N, 12.29.
Желтый порошок, выход 97%. 1Н ЯМР: 12.66 (ушир. с, 1H, NН), 8.23 (д, 1H, J 9.3, Наром), 8.00 (д. д, 1H, J 8.5, 1.1, Наром), 7.89 (д, 1H, J 8.2, Наром), 7.70–7.58 (м, 3H, Наром), 7.44 (д. д, 1H, J 8.0, 7.3, Наром), 7.40 (д. д. д, 1H, J 7.9, 7.9, 1.1, Наром), 7.35 (д, 1H, J 7.3, Наром), 7.18 (д. д, 1H, J 7.6, 7.6, Наром), 7.01 (д, 1H, J 8.0, Наром), 5.49 (с, 2H, NCН2), 5.01 (ушир. с, 2H, С(О)CН2), 3.36 (ушир. с, 9Н, NСН3).
13С ЯМР: 166.5, 159.8, 143.8, 138.3, 133.7, 132.8, 130.7, 130.5, 129.1, 128.6, 127.1, 126.6, 125.7, 124.7, 123.9, 123.3, 121.5, 119.2, 111.1, 62.4, 54.1, 41.4.
ИК: 34248 (νNH), 3057 (νCH), 2961 (νAr–H), 1718 (νC=O), 1688 (νC=O), 1612 (νC=C). MALDI TOF: 401 [M–Cl]+. Тпл 200°С.
Элементный анализ. Найдено, %: C, 65.87; H, 5.58; N, 12.71. Вычислено для C24H25ClN4O2, %: C, 65.97; H, 5.77; N, 12.82.
Все физико-химические характеристики и константы совпали с описанными ранее в [16].

а Эксперименты ЯМР были проведены на спектрометрах Avance-400 и 600 (Bruker, Германия) в растворе CDCl3 или ДМСО-d6 при температуре 30°С. Спектры ИК снимали на Фурье-спектрометре Vector 22 (Bruker, Германия) в таблетках KBr. Масс-спектры регистрировали на масс-спектрометре MALDI‑TOF Ultraflex III (Bruker, Германия). Элементный анализ выполнен на анализаторе EuroVector 2000 CHNS-O (Италия). В работе использованы штаммы микроорганизмов Staphylococcus aureus ATCC 209p, Bacillus cereus ATCC 8035. б, хлорид 2-[2-(1-бензил-2-оксоиндолин-3-илиден)гидразинил]-N,N,N-триметил-2-оксоэтиламмония; , хлорид N,N,N-триметил-2-оксо-2-{2-[2-оксо-1-(4-винилбензил)индолин-3-илиден]гидразинил}этиламмония; , хлорид N,N,N-триметил-2-оксо-2-{2-[2-оксо-1-(4-нитробензил)индолин-3-илиден]гидразинил}этиламмония; , хлорид 2-{2-[1-(3,4-дихлорбензил)-2-оксоиндолин-3-илиден]гидразинил}-N,N,N-триметил-2-оксоэтан-1-аммония; , хлорид N,N,N-триметил-2-{2-[1-(нафталин-1-илметил)-2-оксоиндолин-3-илиден]гидразинил}-2-оксоэтиламмония.

Наличие в структуре соединений 2 гидразонного фрагмента подтверждается присутствием в спектрах 1H ЯМР сигналов протонов NH-группы в области 12 м. д., интенсивных синглетов протонов метильных групп в области 3.30–3.50 м. д. и уширенных сигналов метиленовых протонов гидразонного фрагмента в области 5 м. д. Кроме того, в спектрах ИК присутствуют полосы поглощения в области 3400 см–1, соответствующие колебаниям связи N–H. В масс-спектрах соединений е, зарегистрированных в положительной моде, детектируются пики, соответствующие массам катионной части молекул.

Исследование антимикробной активности полученных соединений показало сильную зависимость уровня активности от строения заместителей в бензильном фрагменте (табл. 2).

Таблица 2.

Антимикробная активность соединений е

Соединение Saа Bcа
>500 >500
125 ± 10.1 >500
>500 >500
250 ± 20.1 >500
62.5 ± 5.8 >500
3.9 ± 0.2 15.6 ± 1.2
Хлорамфеникол 62.5 62.5

а Приведены данные минимальных ингибирующих концентраций (МИК, мкг/мл).

Так, производные ,г, содержащие электроноакцепторный заместитель (нитро-группу или атом хлора), не проявляли активности против золотистого стафилококка и Bacillus cereus. Наиболее активным в отношении данных патогенов оказалось соединение , превосходящее препарат сравнения – хлорамфеникол – в отношении Staphylococcus aureus (Sa) в 18 раз и Bacillus cereus (Bc) в 4 раза.

Мы предположили, что проявление антимикробной активности может зависеть, прежде всего, от липофильности представителей данного ряда производных изатина. Полученный ряд соединений был оценен при помощи простых молекулярных дескрипторов, рассчитанных с использованием сервиса Molinspiration [15], которые широко используются для анализа биологически активных соединений (табл. 3).

Таблица 3.

Антимикробная активность и некоторые расчетные данные для соединений е

Соединение Saа Bcа Mб logPв Vг
386.88 –1.66 330.53
303 412.92 –0.81 358.26
431.88 –1.70 396.43
550 455.76 –0.38 357.60
143 436.94 –0.50 374.52
7.6 30.3 515.10 1.39 470.92

а Минимальные ингибирующие концентрации представлены в мкМ/л, б рассчитаны по атомным весам, в значения logP это milog P, расчитанные при помощи сервиса Molinspiration, гмолярный объем

На основании полученных данных можно сделать вывод, что определяющим фактором является липофильность (log P) исследуемых соединений, что объясняет результаты, полученные для соединений ,в, и наибольшую активность для соли в отношении как Sa, так и Bc. Интересно соотношение структура–активность для производных д, в случае которых значения минимальных ингибирующих концентраций (МИК) изменяется немонотонно. Видно, что введение в бензильный фрагмент атомов хлора приводит к снижению активности в сравнении с алифатическими заместителями производных и , несмотря на большее значение log P. Данную зависимость, вероятно, можно объяснить сольватационными эффектами в отношении более полярной молекулы соединения в водной среде, что и приводит к снижению ее активности. Однако данный вопрос требует дополнительных исследований.

Квантово-химические расчеты (Gaussian 16/B3LYP/6-31+G*) показали, что введение заместителей к атому азота в гетероциклическом фрагменте влияет на состав и энергии граничных орбиталей. Так, в случаях соединений ,в ВЗМО локализована на гетероциклическом фрагменте, в то время как для соединений ,ге основной вклад в нее вносят атомные орбитали заместителей (рис. 1).

Рис. 1.

ВЗМО в соединениях 2а–е.

Это приводит к изменению энергии ВЗМО, а также размера энергетической щели ВЗМО–НВМО, которая в случаях соединений ,в,г предсказывалась выше (табл. 4).

Таблица 4.

Размер энергетической щели ВЗМО-НВМО (эВ), молярный объем (Vm, см3/моль), молекулярный объем (Vmol, ×10–22 см3)

  ВЗМО-НВМО Vm Vmol
3.40 264.47 4.39
2.78 313.62 5.21
3.44 276.73 4.59
3.33 282.82 4.69
2.57 293.47 4.87
2.58 336.63 5.59

Кроме того, наблюдается корреляция между объемом катионов солей и антимикробной активностью. Так, соединения ,д,е с большими молярным и молекулярным объемами и проявляют активность (табл. 4).

Таким образом, комплексный подход с использованием квантово-химических расчетов и компьютерного моделирования и экспериментальных данных позволил выявить зависимость антимикробной активности от строения аммониевых изатин-3-ацилгидразонов. При этом было установлено, что, чем выше липофильность и объем молекулы данных соединений, тем выше их антимикробная активность.

Список литературы

  1. Welsch M.E., Snyder S.A., Stockwell B.R. // Curr. Opin. Chem. Biol. 2010. V. 14. P. 347–361.

  2. Xu Zh., Zhang Sh., Gao Ch., et al. // Chinese Chem. Lett. 2017. V. 28. P. 159–167.

  3. Zhang Y.-Zh., Du H.-Zh., Liu H.-L., et al. // Arch. Pharm. Chem. Life Sci. 2020. V. 353. e1900299.

  4. Bogdanov A.V., Musin L.I., Mironov V.F. // Arkivoc. 2015. V. 6. P. 362–392.

  5. Bogdanov A.V., Mironov V.F. // Synthesis. 2018. V. 50. P. 1601–1609.

  6. Decker M., editor. Design of Hybrid Molecules for Drug Development. Elsevier, 2017. 352 p.

  7. Limpachayaporn P., Schäfers M., Haufe G. // Future Med. Chem. 2015. V. 7. P. 1173–1196.

  8. Kumar S.B., Ravinder M., Kishore G., et al. // Med. Chem. Res. 2014. V. 23. P. 1934–1940.

  9. Al-Wabli R.I., Zakaria A.S., Attia M.I. // Molecules 2017. V. 22. P. 1958–1973.

  10. Wang J., Tan H., Li Y., et al. // J. Agric. Food Chem. 2011. V. 59. P. 9892–9900.

  11. Bogdanov A.V., Kadomtseva M.E., Bukharov S.V., et al. // Russ. J. Org. Chem. 2020. V. 56. P. 555–558.

  12. Bogdanov A.V., Zaripova I.F., Voloshina A.D., et al. // J. Fluorine Chem. 2019. V. 227. P. 109345.

  13. Pashirova T.N., Bogdanov A.V., Zaripova I.F., et al. // J. Mol. Liq. 2019. V. 290. P. 111220.

  14. Bogdanov A.V., Zaripova I.F., Voloshina A.D., et al. // ChemistrySelect 2019. V. 4. P. 6162–6166.

  15. http://www.molinspiration.com

  16. Bogdanov A.V., Zaripova I.F., Voloshina A.D., et al. // Monatsh. Chem. 2018. V. 149. P. 111–117.

Дополнительные материалы отсутствуют.