1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Доклады Российской академии наук. Науки о жизни
  4. T. 509, № 1, 2023

Доклады Российской академии наук. Науки о жизни, 2023, T. 509, № 1, стр. 155-160

Филогения видового комплекса Dipus sagitta по результатам секвенирования ядерных генов

А. А. Лисенкова 1, *, В. С. Лебедев 2, Э. Ундрахбаяр 3, В. Ю. Богатырева 2, М. Н. Мельникова 1, Р. А. Назаров 2, К. А. Роговин 4, член-корреспондент РАН А. В. Суров 4, Г. И. Шенброт 5, А. А. Банникова 1

1 Биологический факультет Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова
Москва, Россия

2 Зоологический музей Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова
Москва, Россия

3 Институт общей и экспериментальной биологии Монгольской Академии Наук
Улан-Батор, Монголия

4 Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук
Москва, Россия

5 Mitrani Department of Desert Ecology, Jacob Blaustein Institutes for Desert Research, Ben-Gurion University of the Negev
Midreshet, Ben-Gurion, Israel

* E-mail: biolisenkova@yandex.ru

Поступила в редакцию 10.12.2022
После доработки 16.12.2022
Принята к публикации 19.12.2022

Аннотация

Мохноногий тушканчик Dipus sagitta длительное время считался единым политипическим видом. Ранее на основании митохондриальных и нескольких ядерных генов было выявлено высокое генетическое разнообразие D. sagitta и выдвинута гипотеза о существовании в его пределах нескольких видов. Однако небольшое число ядерных генов не позволило установить взаимоотношения между выявленными филогенетическими линиями. Мы значительно расширили набор используемых локусов ядерной ДНК, что привело к достаточно высокому разрешению филогенетического дерева для 10 форм D. sagitta. Выявленная структура вида в основном подтвердила характер и взаимоотношения линий мтДНК. Вместе с тем нельзя говорить о полном соответствии митохондриальной и ядерной филогений, часть генетических линий D. sagitta является, вероятно, продуктом ретикулярных процессов. Таким образом, этот таксон представляет собой сложный видовой комплекс D. sagitta sensu lato, в котором давно разошедшиеся линии не всегда репродуктивно изолированы.

Ключевые слова: тушканчиковые, видовой комплекс Dipus sagitta, филогения, ядерная ДНК, Dipodidae

Список литературы

  1. Шенброт Г.И. Географическая изменчивость мохноногого тушканчика Dipus Sagitta (Rodenita, Didodidae). Подвидовая дифференциация на территории Восточного Казахстана, Тувы и Монголии // Зоологический журнал. 1991. V. 70. № 7. P. 91–97.

  2. Шенброт Г.И. Географическая изменчивость мохноногого тушканчика Dipus Sagitta (Rodenita, Didodidae). Общий характер внутривидовой изменчивости и подвидовая дифференциация в западной части видового ареала // Зоологический журнал. 1991. V. 70. № 5. P. 101–110.

  3. Lebedev V.S., Bannikova A.A., Lu L., et al. Phylogeographical study reveals high genetic diversity in a widespread desert rodent, Dipus sagitta (Dipodidae: Rodentia) // Biological Journal of Linnean Society. 2018. V. 123. № 2. P. 445–462.

  4. Cheng J., Ge D., Xia L., et al. Phylogeny and taxonomic reassessment of jerboa, Dipus (Rodentia, Dipodinae), in inland Asia // Zoologica Scripta. 2018. V. 47. № 6. P. 630–644.

  5. Cheng J., Lv, X., Xia L., et al. Impact of orogeny and environmental change on genetic divergence and demographic history of Dipus sagitta (Dipodoidea, Dipodinae) since the Pliocene in Inland East Asia // Journal of Mammalian Evolution. 2019. V. 26. № 2. P. 253–266.

  6. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning – a laboratory manual. Sec. ed. N.Y.k: Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989. 385 p.

  7. Lebedev V.S., Shenbrot G.I., Krystufek B., et al. Phylogenetic relations and range history of jerboas of the Allactaginae subfamily (Dipodidae, Rodentia) // Scientific Reports. 2022. V. 12. № 1. P. 842.

  8. Tamura K., Stecher G., Peterson D., et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. 2013. V. 30. № 12. P. 2725–2729.

  9. Nguyen L.-T., Schmidt H.A., Haeseler von A., et al. IQ-TREE: a fast and effective stochastic algorithm for estimating maximum-likelihood phylogenies // Molecular Biology and Evolution. 2015. V. 32. № 1. P. 268–274.

  10. Chernomor O., von Haeseler A., Minh B.Q. Terrace aware data structure for phylogenomic inference from supermatrices // Systematic Biology. 2016. V. 65. № 6. P. 997–1008.

  11. Huson D.H., Bryant D. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies // Molecular Biology and Evolution. 2006. V. 23. № 2. P. 254–267.

  12. Suchard M.A., Lemey P., Baele G., et al. Bayesian phylogenetic and phylodynamic data integration using BEAST 1.10 // Virus Evolution. 2018. V. 4. № 1. vey016.

  13. Swofford D.L. PAUP*: Phylogenetic analysis using parsimony (* and other methods), version 40b10: 40b10. Sunderland: Sinauer, 2003.

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Доклады Российской академии наук. Науки о жизни

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал