Физика и химия стекла, 2023, T. 49, № 1, стр. 15-26
Самоорганизация интерметаллических систем: новые кластерные прекурсоры K12 =0@12(Li9Ge3) и K9 = 0@9(Li8Ge) в кристаллической структуре Li68Ge16-oC84, кластерные прекурсоры K11 =0@11(Li6Ge5) и K6 = 0@6(Li5Ge) в кристаллической структуре Li44Ge24-oC68, и кластерные прекурсоры K6= 0@6(Li3Ge3) в кристаллической структуре Li12Ge12-tI24
В. Я. Шевченко 1, *, Г. Д. Илюшин 2, **
1 Институт химии силикатов им. И.В. Гребенщикова РАН
199034 Санкт-Петербург, наб. Макарова, 2, Россия
2 Научно-исследовательский центр “Кристаллография и фотоника”
119333 Москва, Ленинский пр., 59, Россия
* E-mail: shevchenko@isc.nw.ru
** E-mail: gdilyushin@gmail.com
Поступила в редакцию 06.09.2022
После доработки 07.10.2022
Принята к публикации 27.10.2022
- EDN: CGQPBO
- DOI: 10.31857/S0132665122600662
Аннотация
Проведен геометрический и топологический анализ кристаллических структур интерметаллидов Li68Ge16-oC84 (a = 4.551 Å, b = 22.086 Å, c = 13.275 Å, V = 13.275 Å3, Cmcm), Li44Ge24-oC68 (a = 4.380 Å, b = 24.550 Å, c = 10.540 Å, V = 1144.11 Å3, Cmcm), и Li12Ge12-tI24 (a = b = 4.053 Å, c = 23.282 Å3, I41/amd). Для интерметаллида Li68Ge16-oC84 установлены два новых каркасобразующих кластера: K12 = 0@12(Li9Ge3) с симметрией m в виде связанных 5-ных колец Li3Ge2 и Li4Ge, с атомами Li, расположенными в центре 5-ных колец, и K9 = 0@9(Li3Ge)(Li3)2 с симметрией m в виде связанных 3-ных колец (Li3)(GeLi2)(Li3). Для интерметаллида Li44Ge24-oC68 установлены два новых каркасобразующих кластеров: K11 = 0@11 (LiLi5)(Ge5) с симметрией m в виде 5-ных колец Ge5 (лежащих в основании пирамиды), которые связаны с 5-атомами Li, лежащими в одной плоскости с атомом Li (вершиной пирамиды) и K6 = 0@ 6(GeLi5) с симметрией m в виде сдвоенных тетраэдров Li3Ge, имеющих общее ребро LiGe. Для интерметаллида Li12Ge12-tI24 установлен каркасобразующий кластер K6 = 0@ 6(Ge3Li3) с симметрией 2 в виде сдвоенных тетраэдров Li2Ge2, имеющих общее ребро LiGe. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур Li68Ge16-oC84, Li44Ge24-oC68, Li12Ge12-tI24 из кластерных прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
ВВЕДЕНИЕ
В двойных системах A–B с участием атомов щелочных металлов A – Li, Na, K, Rb, Cs установлена кристаллизация около 350 интерметаллидов. В образовании 126 интерметаллидов LinMkи 71 интерметаллидов NanMk принимают участие 22 и 18 атомов М [1, 2]. Наибольшее число интерметаллидов LinMk образуется с участием атомов M = = Ge, Al, и Ni.
В системе Li–Ge установлена кристаллизация десяти интерметаллидов LinGek с областью изменения значений q = Li/Ge = 0.58–4.25 и V = 382.4–6700.1 Å3 (табл. 1). Пять кристаллических структур имеют небольшие значения векторов трансляций 4.053–4.551 Å, соответствующих размеру двухслойного пакета, и содержат в элементарных ячейках от 24 атомов в Li3M3-tI24 до 84 атомов в Li68Ge16-oC84 (табл. 1) [3–11]. Кристаллические структуры Li68Ge16-oC84 [3], Li44Ge24-oC68 [7], Li12Ge7-oP152 [8], LiGe-tI32 [10], Li7Ge12-mP78 [11] не имеют кристаллохимических аналогов.
Таблица 1.
Интерметаллид | q = Li/Ge | Группа симметрии |
Параметры элементарной ячейки, Å |
V, Å3 |
---|---|---|---|---|
Li68Ge16-oC84 [3] | 4.25 | Cmcm (63) | 4.551,22.086,13.275 | 1334.4 |
Li17Ge4-cF420 [3] | 4.25 | F-43m (216) | 18.852,18.852,18.852 | 6700.1 |
Li15Ge4-cI76 [4] | 3.75 | I -43d (220) | 10.720,10.720,10.720 | 1231.9 |
Li28Ge8 -oC36 [5] | 3.5 | Cmmm (65) | 9.240,13.210,4.630 | 565.1 |
Li9Ge4-oC52 [6] | 2.25 | Cmcm (63) | 4.490,7.870,24.440 | 863.6 |
Li44Ge24-oC68 [7] | 1.83 | Cmcm (63) | 4.380,24.550,10.640 | 1144.1 |
Li12Ge7-oP152 [8] | 1.71 | P nma (62) | 8.667,19.931,14.516 | 2507.5 |
Li3Ge3-tI24 [9] | 1 | I41/amd(141) | 4.053,4.053,23.282 | 382.4 |
LiGe-tI32 [10] | 1 | I 41/a (88) | 9.750,9.750, 5.780 | 549.5 |
Li7Ge12-mP78 [11] | 0.58 | P 2/n (13) | 11.526,8.031,15.354 | 1421.2 |
В системе Na–Ge установлена кристаллизация четырех интерметаллидов NanGek с областью изменения значений q = Na/Ge = 1–8, 5 и V = 779.7–11 764.4 Å3 (табл. 2) [12–15]. Из них только NaGe3.25-hP44 с пр. группой P6/m (не имеющий кристаллохимических аналогов) имеет значение вектора трансляций 3.967 Å, соответствующего размеру двухслойного пакета.
Таблица 2.
Интерметаллид | Na/Ge | Группа симметрии |
Параметры элементарной ячейки, Å, углы, ° |
V, Å3 |
---|---|---|---|---|
Na4(Ge4)-mP32 [12] | 1 | P 21/c (14) | 12.363, 6.659, 11.478; β = 120.22 | 816.4 |
Na12(Ge4)2Ge9-mP464 [13] | 1.42 | P 21/c (14) | 22.117,12.803, 41.557; β = 91.31 | 11764.4 |
NaGe3.25-hP44 [14] | 3.25 | P 6/m (175) | 15.064,15.064, 3.967 | 779.7 |
Na16 – xGe136-cF152 [15] | 8.5 | Fd-3m (227) | 15.216, 15.216, 15.216 | 3522.7 |
В настоящей работе осуществлен геометрический и топологический анализ кристаллических структур интерметаллида Li68Ge16-oC84, Li44Ge24-oC68, Li12Ge12-tI24. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур из кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Работа продолжает исследования [16–20] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением современных компьютерных методов.
МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ
Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [21], позволяющего проводить многоцелевое исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде “свернутых графов” (фактор-графов).
Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т.е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома. Полученные значения координационных последовательностей атомов для Li68Ge16-oC84, Li44Ge24-oC68, Li12Ge12-tI24, приведены в табл. 3.
Таблица 3.
Интерметаллид | Атом | Локальное окружение | Координационные последовательности |
---|---|---|---|
N1 N2 N3 N4 N5 | |||
Li68Ge16-oC84 | Li1 | 10Li +4Ge | 14 45 104 197 314 |
Li2 | 10Li + 3Ge | 13 47 114 198 324 | |
Li3 | 11Li + 3Ge | 14 48 110 198 318 | |
Li4 | 9Li + 2Ge | 11 46 112 193 313 | |
Li5 | 11Li + 3Ge | 14 51 110 202 316 | |
Li6 | 8Li + 1Ge | 9 44 108 191 316 | |
Li8 | 10Li + 3Ge | 13 49 114 202 323 | |
Li9 | 12Li + 2Ge | 14 51 111 202 317 | |
Li10 | 8Li + 4Ge | 12 46 105 191 302 | |
Li11 | 9Li + 3Ge | 12 51 112 200 314 | |
Li12 | 10Li + 3Ge | 13 48 111 201 313 | |
Ge1 | 12Li | 12 45 112 193 307 | |
Ge2 | 13Li | 13 45 100 188 310 | |
Ge3 | 12Li | 12 49 108 195 308 | |
Li44Ge24-oC68 | Li1 | 8Li + 4Ge | 12 45 107 178 286 |
Li2 | 7Li + 4Ge | 11 43 100 182 275 | |
Li3 | 8Li + 5Ge | 13 47 98 176 286 | |
Li4 | 7Li + 5Ge | 12 40 96 170 276 | |
Li5 | 5Li + 10Ge | 15 44 102 179 282 | |
Li6 | 5Li + 5Ge | 10 40 97 175 273 | |
Li7 | 7Li + 4Ge | 11 41 97 173 282 | |
Ge1 | 8Li + 2Ge | 10 41 96 178 271 | |
Ge2 | 10Li + 2Ge | 12 44 98 179 287 | |
Ge3 | 8Li + 2Ge | 10 43 89 174 280 | |
Ge4 | 11Li | 11 42 96 179 274 | |
Li3Ge3-tI24 | Li1 | 4Li + 8Ge | 12 42 92 162 252 |
Li2 | 4Li + 8Ge | 12 42 92 162 252 | |
Ge1 | 8Li + 4Ge | 12 42 92 162 252 | |
Ge2 | 8Li + 4Ge | 12 42 92 162 252 |
Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы основывается на следующих принципах: структура образуется в результате самосборки из кластеров-прекурсоров, образующих каркас структуры, пустоты в котором заполняют спейсеры; кластеры-прекурсоры занимают высокосимметричные позиции; набор кластеров-прекурсоров и спейсеров включает в себя все атомы структуры.
СИММЕТРИЙНЫЙ И ТОПОЛОГИЧЕСКИЙ КОД (ПРОГРАММА) САМОСБОРКИ КРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СТРУКТУР
При моделировании кристаллической структуры определяется иерархическая последовательность ее самосборки в кристаллографическом пространстве XYZ, т.е. восстанавливается симметрийно-топологический код формирования макроструктуры в виде последовательности значимых элементарных событий, характеризующих самую короткую (быструю) программу конвергентной кластерной самосборки. Алгоритм самосборки трехмерной структуры реализуется в соответствии с универсальным принципом максимального (комплементарного) связывания кластеров-прекурсоров при переходе на более высокий уровень структурной самоорганизации системы.
Кристаллическая структура Li68Ge16-oC84.
Пространственная группа Cmcm характеризуется элементами точечной симметрии: 2/m (4a, 4b), m2m (4c), -1(8d), 2(8e), m(8f), и m(8g).
В элементарной ячейке все атомы находятся в частных позициях в двух плоскостях (100) на высоте 0 и 0.5. Из них в позиции 4с (m2m) – атомы Li1–Li6, Ge1, Ge, и в позиции 8f (m) – атомы Li8–Li12, Ge3.
В табл. 3 приведено локальное окружение атомов Li и Ge и значения их координационных последовательностей в 3D атомной сетке. Значения координационных чисел для атомов Li – 9 (1 атом), 11 (1 атом), 12 (2 атома), 13 (3 атома), 14 (4 атома); для атомов Ge – 12 (2 атома), 13 (1 атом).
Для интерметаллида Li68Ge16-oC84 установлены два новых каркасобразующих кластера: K12 = 0@12(Li9Ge3) с симметрией m в виде связанных 5-ных колец Li3Ge2 и Li4Ge, с атомами Li, расположенными в центре 5-ных колец, и K9 = 0@9(Li3Ge)(Li3)2 с симметрией m в виде трех связанных 3-ных колец (Li3)(GeLi2)(Li3) (рис. 1).
Последовательность самосборки кристаллической структуры следующая. Образование димера ${\text{S}}_{3}^{0}$ из кластеров K12 + K9 происходит с индексом связанности Рс = 10 (рис. 2). Образование тетрамера ${\text{S}}_{3}^{1}$ происходит при связывании димеров ${\text{S}}_{3}^{0}$ + ${\text{S}}_{3}^{0}$ (g = –1) (рис. 2). Образование октамера ${\text{S}}_{3}^{2}$ происходит при связывании тетраметров ${\text{S}}_{3}^{1}$ + ${\text{S}}_{3}^{1}$ (g = = –1) (рис. 3). Каркасная структура ${\text{S}}_{3}^{3}$ формируется при связывании слоев ${\text{S}}_{3}^{2}$ + ${\text{S}}_{3}^{2}$ в направлении [100] (рис. 3). Расстояние между слоями определяет длину вектора a = = 4.551 Å.
Кристаллическая структура Li44Ge24-oC68
В элементарной ячейке все атомы находятся в частных позициях пространственной группы Cmcm в двух плоскостях (100) на высоте 0 и 0.5. Из них в позиции 4с (m2m) – атомы Li2, Li3, Li6, Ge1, Ge2, и в позиции 8f (m) – атомы Li1, Li4, Li5, Ge3, Ge4.
В табл. 3 приведено локальное окружение атомов Li и Ge и значения их координационных последовательностей в 3D атомной сетке. Значения координационных чисел для атомов Li – 10 (1 атом), 11 (2 атома), 12 (2 атома), 13 (1 атом), 15 (1 атом); для атомов Ge – 10 (2 атома), 11 (1 атом), 12 (1 атом).
Кластерный прекурсор K11 = 0@11(Li6Ge5) с центром в позиции 8g (1/4, 0.36, 3/4) представляет собой 5-ные кольца Ge5 (лежащие в основании пирамиды), связанные с 5-атомами Li, лежащими в одной плоскости с атомом Li (вершиной пирамиды) (рис. 1). Максимальная симметрия кластера K11 соответствует некристаллографической симметрии 5m. В кристаллической структуре кластер K11 сохраняет плоскость симметрии m. Центр кластера K11 находится в позиции 8g (1/4, 0.36, 1/4).
Кластерный прекурсор K6 = 0@6(Li5Ge) с симметрией m и центром в позиции 8g (1/4, 0.39, 1/4) представляет собой сдвоенные тетраэдры (Li2)(GeLi)(Li2) (рис. 1).
Последовательность самосборки кристаллической структуры следующая. Образование димера ${\text{S}}_{3}^{0}$ из кластеров K11 + K6 происходит с индексом связанности Рс = 8 (рис. 4). Образование тетрамера ${\text{S}}_{3}^{1}$ происходит при связывании димеров ${\text{S}}_{3}^{0}$ + ${\text{S}}_{3}^{0}$ (g = –1) (рис. 4). Образование октамера ${\text{S}}_{3}^{2}$ происходит при связывании тетраметров ${\text{S}}_{3}^{1}$ + ${\text{S}}_{3}^{1}$ (g = = –1) (рис. 5). Расстояние между слоями определяет длину вектора a = 4.380 Å.
Кристаллическая структура Li12Ge12-tI24
Кристаллохимическим аналогом Li12Ge12-tI24 является Li12Sn12-tI24 [22].Пространственная группа I 41/a 2/m 2/d (141) характеризуется элементами точечной симметрии: g = –4m2 (4a, 4b), 2/m (8c, 8d), 2mm (8e), 2 (16f, 16g), m (16h).
В элементарной ячейке находятся 4 кристаллографически независимых атомов: в позициях 4a и 4b – атомы Li1 и Ge1 и в позициях 8e – атомы Li2 и Ge2. Значения координационных чисел для всех атомов равны 12 (табл. 3).
Кластерный прекурсор K6 = Li3Ge3 в виде сдвоенных тетраэдров с центром в позиции 16g (3/4, 1/2, 7/8) характеризуется симметрией 2 (рис. 1).
Последовательность самосборки кристаллической структуры следующая. Образование димера K12 из кластеров K6 + K6 (g = 2) происходит в направлении оси X с индексом связанности Рс = 7 (рис. 6). Образование тетрамера К24 происходит при связывании димеров K12 + K12 (g = 2) в направлении оси Y (рис. 6). Образование октамера K48 происходит при связывании тетрамеров ${\text{S}}_{3}^{2}$ + ${\text{S}}_{3}^{2}$ (g = –1) в направлении оси Z (рис. 7). Расстояние между слоями определяет длину вектора a = 4.053 Å.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Проведен геометрический и топологический анализ кристаллических структур интерметаллидов Li68Ge16-oC84, Li44Ge24-oC68, Li12Ge12-tI24. Для интерметаллида Li68Ge16-oC84 установлены два новых кластера-прекурсора: K12 = 0@12(Li9Ge3) и K9 = 0@9(Li8Ge). Для интерметаллида Li44Ge24-oC68 установлены два новых кластера-прекурсора: K11 = 0@11(Li6Ge5) и кластерный прекурсор K6 = 0@6(Li5Ge). Для интерметаллида Li12Ge12-tI24 установлен новый кластерный прекурсор K6 = 0@6 (Li3Ge3). Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур Li68Ge16-oC84, Li44Ge24-oC68, Li12Ge12-tI24 из кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Анализ самосборки кристаллических структур выполнен при поддержке Минобрнауки РФ в рамках выполнения работ по государственному заданию ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН, кластерный анализ выполнен при поддержке Российского научного фонда (РНФ № 21-73-30019).
Список литературы
Inorganic crystal structure database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ). Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.
Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.
Zeilinger Michael, Faessler Thomas F. Structural and thermodynamic similarities of phases in the Li – Tt (Tt = Si, Ge) systems: redetermination of the lithium-rich side of the Li–Ge phase diagram and crystal structures of Li17Si4.0 –xGex for x = 2.3, 3.1, 3.5, and 4 as well as Li4.1Ge // Dalton Trans. 2014. V. 43. P. 14959–970.
Johnson Q., Smith G.S., Wood D. The crystal structure of Li15 Ge4 // Acta Crystallographica. 1965. V. 18. P. 131–132.
Hopf V., Mueller W., Schaefer H. Die Struktur der Phase Li7Ge2 // Zeitschrift fuer Naturforschung, Teil B. 1972. V. 27. P. 1157–1160.
Hopf V., Schaefer H., Weiss A. Die Kristallstruktur der Phase Li9Ge4 // Zeitschrift fuer Naturforschung, Teil B. 1970. V. 25. P. 653–653.
Frank U., Mueller W. Li11Ge6, eine Phase mit isolierten, ebenen Ge-Fuenfringen // Zeitschrift fuer Naturforschung, Teil B. 1975. V. 30. P. 313–315.
Scherf Lavinia M., Riphaus Nathalie, Faessler Thomas F. Site-specific substitution preferences in the solid solutions Li12Si7 –xGex, Li12 –yNaySi7, Na7LiSi8 –zGez, and Li3NaSi6 –vGev // Zeitschrift fuer Anorganische und Allgemeine Chemie. 2016. V. 642. P. 1143–1151.
Evers J., Oehlinger G., Sextl G., Becker H.O. Hochdruck LiGe mit Schichten aus zwei- und vierbindigen Germanium atomen // Angewandte Chemie (German Edition). 1987. V. 99. P. 69–71.
Menges E., Hopf V., Schaefer H., Weiss A. Die Kristallstruktur von LiGe – ein neuartiger, dreidimensionaler Verband von Element (IV)-atomen // Zeitschrift fuer Naturforschung. Teil B. 1969. V. 24. P. 1351–1352.
Kiefer F., Faessler T.F. Synthesis and revised structure of the Zintl phase Li7Ge12 // Solid State Sciences. 2011. V. 13. P. 636–640.
Morito Haruhiko, Momma Kenji, Yamane Hisanori. Crystal structure analysis of Na4 Si4 – xGex by single crystal X-ray diffraction // J. Alloys Compd. 2015. V. 623. P. 473–479.
Carrillo Cabrera W., Cardoso Gil R., Somer M., Persil O., vonSchnering H.G. Na12Ge17: a compound with the Zintl anions (Ge4)(4-) and (Ge9)(4-) -synthesis, crystal structure and Raman spectrum // Zeitschrift fuer Anorganische und Allgemeine Chemie. 2003. V. 629. P. 601–608.
Beekman M.,S tefanoski S., Wong-Ng W., Kaduk J.A., Huang Q., Reeg C., Bowers C.R., Nolas G.S. Structure and thermal conductivity of Na(1– x)Ge(3 +z) // J. Solid State Chemistry. 2010. V. 183. P. 1272–1277.
Boehme Bodo, Reibold Marianne, Auffermann Gudrun, Lichte Hannes, Baitinger Michael, Grin Yuri. Preparation of anionic clathrate-II K24 – xGe136 by filling of Ge(cF136) // Zeitschrift fuer Kristallographie – Crystalline Materials. 2014. V. 229. P. 677–686.
Шевченко В.Я., Блатов В.А., Илюшин Г.Д. Кластерная самоорганизация интерметаллических систем: новый кластер-прекурсор K65 = 0@3@20@42 для самосборки кристаллической структуры Sc96Mg8Zn600-cP704 // Физика и химия стекла. 2022. Т. 42. № 2. С. 94–99.
Ilyushin G.D. Theory of cluster self-organization of crystal-forming systems. Geometrical-topological modeling of nanocluster precursors with a hierarchical structure // Struct. Chem. 2012. V. 20. № 6. P. 975–1043.
Shevchenko V.Ya., Medrish I.V., Ilyushin G.D., Blatov V.A. From clusters to crystals: scale chemistry of intermetallics // Struct. Chem., 2019. V. 30. № 6. P. 2015–2027.
Ilyushin G.D. Intermetallic Compounds KnMm (M = Ag, Au, As, Sb, Bi, Ge, Sn, Pb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 7. P. 1095–1105.
Ilyushin G.D. Intermetallic Compounds NakMn (M = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 4. P. 539–545.
Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576–3585.
Blase W., Cordier G. Crystal structure of beta-lithium stannide, beta-LiSn // Zeitschrift fuer Kristallographie. 1990. V. 193. P. 317–318.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Физика и химия стекла