Генетика, 2020, T. 56, № 6, стр. 677-689

Дифференциация северной азиатской кеты (Oncorhynchus keta W.) по микросателлитным маркерам

М. В. Шитова 1*, Ю. Н. Хохлов 23, А. И. Никифоров 4, П. К. Афанасьев 5, С. Ю. Орлова 6, А. Н. Ельников 6, А. В. Бугаев 7, Т. А. Ракицкая 1, В. Д. Прохоровская 1, Т. В. Малинина 1, Д. В. Политов 1, К. И. Афанасьев 16, Г. А. Рубцова 1, Л. А. Животовский 16**

1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
119991 Москва, Россия

2 Тихоокеанский научно-исследовательский рыбохозяйственный центр, Чукотское отделение
689000 Анадырь, Россия

3 Пермское краевое отделение общероссийской общественной организации “Всероссийское общество охраны природы”
614025 Пермь, Россия

4 Московский государственный институт международных отношений (Университет)
119454 Москва, Россия

5 Главное бассейновое управление по рыболовству и сохранению водных биологических ресурсов
115114 Москва, Россия

6 Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии
107140 Москва, Россия

7 Камчатский филиал Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии
683000 Петропавловск-Камчатский, Россия

* E-mail: shitova-m@rambler.ru
** E-mail: levazh@gmail.com

Поступила в редакцию 24.05.2019
После доработки 21.11.2019
Принята к публикации 14.01.2020

Аннотация

В работе была проанализирована 41 выборка кеты северной части ареала по десяти микросателлитным локусам. В северной части ареала азиатской кеты однозначно выделяются такие группы выборок как “Магаданская область”, “северная часть Камчатки”, “р. Пенжина”, “бассейн р. Анадырь”. Популяции кеты из р. Апука и группы “Корякское нагорье” показывают слабую генетическую дифференциацию от остальных групп. Наблюдается положительная связь между географической широтой и средней ожидаемой гетерозиготностью на данной части ареала. Кета реки Пенжина показывает генетическую близость с кетой из бассейна реки Анадырь.

Ключевые слова: популяционная генетика, кета, Oncorhynchus keta, Чукотка, микросателлитные локусы.

DOI: 10.31857/S0016675820060119

Список литературы

  1. Коротаев Ю.А. Влияние гидрологических условий на воспроизводство анадырской кеты // Тез. докл. I конгресса ихтиологов России. 1997. С. 43.

  2. Макоедов А.Н., Коротаев Ю.А., Антонов Н.П. Азиатская кета. Петропавловск-Камчатский: Издательство ФГУП Камчатский институт рыбного хозяйства и океанографии (КамчатНИРО), 2009. 355 с.

  3. Путивкин С.В. Биология и динамика численности анадырской кеты: Афтореф. дис. … канд. биол. наук. Магадан: ТИНРО-Центр, 1999. 24 с.

  4. Костарев В.Л. Влияние некоторых климатических факторов на эффективность естественного воспроизводства охотской кеты // Изв. ТИНРО. 1970. Т. 71. С. 109–121.

  5. Варнавская Н.В. Генетическая дифференциация популяций тихоокеанских лососей. Петропавловск-Камчатский: Изд-во КамчатНИРО, 2006. 488 с.

  6. Воронский Б.Б. Материалы по биологии и промысловому использованию чавычи (Oncorhynchus tschawytscha W.) Камчатки // Научный отчет КамчатНИРО. Петропавловск-Камчатский: Изд-во КамчатНИРО, 1970. 164 с.

  7. Пустовойт С.П. Анализ структуры генетического разнообразия популяций кеты Oncorhynchus keta (Walbaum) рек Анадырь, Камчатка и Амур // Генетика. 1998. Т. 34. № 2. С. 278–284.

  8. Викторовский Р.М., Бачевская Л.Т., Ермоленко Л.Н. и др. Генетическая структура популяций кеты Северо-востока СССР и проблемы рационального использования ее запасов // Резервы лососевого хозяйства Дальнего Востока. Сб. науч. тр. Владивосток. 1989. С. 66–74.

  9. Салменкова Е.А., Алтухов Ю.П., Викторовский Р.М. и др. Генетическая структура популяций кеты, размножающихся в реках Дальнего Востока и северо-востока СССР // Журн. общей биол. 1986. Т. XLVII. № 4. С. 529–549.

  10. Салменкова Е.А. Основные результаты и задачи популяционно-генетических исследований лососевых рыб // Генетика в аквакультуре. М.: Наука, 1989. С. 7–29.

  11. Салменкова Е.А., Омельченко В.Т., Афанасьев К.И., Рубцова Г.А. Генетическое разнообразие азиатской кеты Oncorhynchus keta (Salmonidae, Salmoniformes) и динамика генофондов сахалинских популяций при искусственном воспроизводстве // Вопр. ихтиол. 2008. Т. 48. № 3. С. 361–373.

  12. Sato S., Ando J., Ando H. et al. Genetic variation among Japanese populations of chum salmon inferred from nucleotide sequences of the mitochondrial DNA control region // Zool. Sci. 2001. 18. P. 99–106. https://doi.org/10.2108/zsj.18.99

  13. Abe S., Sato S., Kojima H. et al. Development of molecular markers for genetic stock identification of chum salmon // Fisheries Sci. 2002. V. 68 (Suppl. 1). P. 353–356. https://doi.org/10.2331/fishsci.68.sup1_353

  14. Животовский Л.А., Рубцова Г.И., Шитова М.В. и др. База микросателлитных ДНК-данных по кете Дальнего Востока России // Реализация “Концепции дальневосточной бассейновой программы изучения тихоокеанских лососей”. Владивосток: Изд-во ТИНРО-центр, 2010. Бюл. № 5. С. 53–63.

  15. Афанасьев К.И., Рубцова Г.А., Шитова М.В. и др. Популяционная структура кеты Oncorhynchus keta российского Дальнего Востока, выявленная по микросателлитным маркерам // Биол. моря. 2011. Т. 37. № 1. С. 39–47.

  16. Lewis P.O., Zaykin D. Genetic Data Analysis: Computer program for the analysis of allelic data. Version 1.0 (d16c). 2001. Free program distributed by the authors over the internet from http://lewis.eeb.uconn.edu/lewishome/software.html.

  17. Вейр Б. Анализ генетических данных. М.: Мир, 1995. 400 с.

  18. Животовский Л.А. Статистические методы анализа частот генов в природных популяциях // Итоги науки и техники. Общая генетика. М.: ВИНИТИ, 1983. Т. 8. С. 76–104.

  19. Животовский Л.А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 267 с.

  20. Felsenstein J. PHYLIP Phylogeny Inference Package (Version 3.2) // Cladistics. 1989. V. 5. P. 164–166.

  21. Stöver B.C., Müller K.F. TreeGraph 2: Combining and visualizing evidence from different phylogenetic analyses BMC // Bioinformatics. 2010. V. 11. P. 7. https://doi.org/10.1186/1471-2105-11-7

  22. Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies // Mol. Biol. Evol. 2006. V. 23. № 2. P. 254–267. https://doi.org/10.1093/molbev/msj030

  23. Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data // Genetics. 2000. V. 155. P. 945–959.

  24. Earl D.A., vonHoldt B.M. STRUCTURE HARVESTER: A website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method // Conservation Genetics Resources. 2012. V. 4. № 2. P. 359–361. https://doi.org/10.1007/s12686-011-9548-7

  25. Линдберг Г.У. Крупные колебания океана в четвертичное время и их влияние на бассейн Северного Ледовитого океана и его органический мир // Северный Ледовитый океан. Ленинград: Гидрометеоиздат, 1970. С. 101–112.

  26. Линдберг Г.У. История “Берингии” в свете гипотезы крупных геогидрократических колебаний уровня океана // Берингийская суша и ее значение для развития голарктических флор и фаун в кайнозое. Хабаровск: [Б.И.], 1973. С. 43–45.

  27. Politov D.V., Borovikova E.A., Gordon N.Y. Penzhina river cisco Coregonus subautumnalis Kaganovsky does not belong to the Arctic cisco species complex: First genetic evidence based on allozyme data // Advances in Limnology. 2007. V. 60. P. 69–81.

  28. Черешнев И.А. Биологическое разнообразие пресноводной ихтиофауны Северо-Востока России. Владивосток: Дальнаука, 1996. 196 с.

  29. Баранова Ю.П., Бискэ С.Ф., Гончаров В.Ф. и др. Кайнозой Северо-востока СССР. М.: Наука, 1968. 137 с.

Дополнительные материалы отсутствуют.