Генетика, 2021, T. 57, № 3, стр. 358-360
Изоляция расстоянием у северных осетин
Г. И. Ельчинова 1, *, В. В. Кадышев 1, Р. А. Зинченко 1, 2
1 Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова
115522 Москва, Россия
2 Национальный научно-исследовательский институт общественного
здоровья им. Н.А. Семашко
105064 Москва, Россия
* E-mail: elchinova@med-gen.ru
Поступила в редакцию 18.03.2020
После доработки 22.04.2020
Принята к публикации 17.06.2020
Аннотация
Использована модель изоляции расстоянием Малеко для описания популяционной структуры населения Северной Осетии – Алании по 12 308 брачным записям для популяции ранга “республика”. Получен ряд положительных корреляций с результатами предыдущих исследований. Подтверждено отличие Моздокского р-на от остальных р-нов Республики.
Комплексное генетико-эпидемиологическое обследование населения Северной Осетии (Алании) (РСО) проводится с 2017 г. Исследования идут в соответствии с разработанным Протоколом [1], предусматривающим изучение генетической структуры как с использованием методов клинической и молекулярной генетики, так и описание методами популяционной статистики. Обследование популяций русского Нечерноземья, Поволжья, южных российских популяций и народов Северного Кавказа проходило в соответствии с этим Протоколом. Результаты исследований полностью представлены в открытой печати как отечественной, так и зарубежной. Модель изоляции расстоянием Малеко [2] наряду с другими (планетарная, островная, лестничная и др.) неплохо отражает популяционно-генетические особенности изучаемого региона. Модель предполагает равномерное распределение населения по территории, изотропность миграций, отсутствие явных изоляционных барьеров и, как мы выяснили в наших исследованиях, однородный этнический состав населения. Население Кавказа не вполне соответствует указанным ограничениям, однако для популяции ранга “район” мы получили вполне приемлемый результат [3], в данной работе мы рассмотрели использование модели изоляции расстоянием для популяции ранга “республика”, отобрав лишь осетинские внутриэтнические браки. Модель успешно использована для популяции ранга “республика” при изучении Казахстана [4].
Из тотальной выборки брачных записей за 1990–2000 гг. по всей РСО отобраны те, в которых оба супруга осетины. Измерения и расчеты выполнены стандартным образом [5, 6]. Часть брачных записей не содержала полной информации о местах рождения супругов (например, указано только “Ставропольский край”), что сделало невозможным точное измерение расстояния брачной миграции. Кроме этого, многие мелкие населенные пункты, еще существовавшие полвека назад, когда в основном родились брачующиеся в 90-е годы, исчезли к настоящему времени; в этом случае измерение проводилось с точностью до райцентра. Тем не менее, в анализ вошли 13 935 брачных записей, из которых 12 308 по дальности не превышали 500 км, что оптимально при использовании модели изоляции расстоянием.
В табл. 1 представлены значения параметров изоляции расстоянием Малеко для осетин. Коэффициент линейной корреляции средней квадратичной миграции σ и индекса эндогамии осетин [7] ожидаемо отрицателен и значим – r = –0.81 ± 0.22. Локальный инбридинг а не коррелирует со значением случайного инбридинга Fst (r = –0.30 ± 0.36), оба вектора значений определены для популяции ранга “район”. Учитываем, что случайный инбридинг подсчитан по всему списку фамилий, а в Моздокском р-не осетины составляют лишь 10% населения. Исключив из корреляционного анализа этих показателей значения по Моздокскому р-ну, получаем ожидаемо положительное и значимое значение коэффициента корреляции (r = 0.72 ± ± 0.28). Не обнаружено корреляции локального инбридинга и индекса эндогамии (r = 0.09 ± 0.37); при исключении Моздокского р-на коэффициент корреляции возрастает до r = 0.92 ± 0.16.
Таблица 1.
Осетины | Ne | σ | a | b |
---|---|---|---|---|
Моздокский район | 2810 | 102.6 | 0.001603 | 0.003572 |
Дигорский район | 5693 | 55.1 | 0.000531 | 0.013578 |
Кировский район | 8469 | 73.4 | 0.000334 | 0.006798 |
Правобережный район | 16 672 | 65.8 | 0.000172 | 0.007717 |
Ардонский район | 8532 | 69.2 | 0.000380 | 0.006628 |
Алагирский район | 11 914 | 65.1 | 0.000240 | 0.008495 |
Ирафский район | 4964 | 43.6 | 0.000725 | 0.012476 |
Пригородный район | 24 307 | 73.3 | 0.000149 | 0.005612 |
Владикавказ город | 65 482 | 78.2 | 0.000048 | 0.006401 |
По оригинальной метрике рассчитана и составлена дистанционная матрица с использованием параметров изоляции расстоянием Малеко [8]. Коэффициент корреляции этой матрицы с матрицей фамильных дистанций составил 0.74 ± ± 0.12, то есть ожидаемо положителен и значим. Влияние полиэтничного Моздокского р-на нивелировано тем, что фамильные дистанционные матрицы рассчитываются не по всему списку фамилий, а лишь по частым (частота более 0.1%). Схема инбредного ландшафта представлена на рис. 1. Реальные значения инбредных дистанций увеличены в 1000 раз. Концентричные эквидистантные фигуры без самопересечений, ориентированы вдоль основных путей сообщения. Центром кластеризации является Владикавказ. Единственным недостатком схемы можно считать отсутствие явного разделения субэтнических групп осетин (иронцев и дигорцев) на два кластера, но тем не менее, центральный кластер с уровнем 0.10 является “иронским”, а “дигорские” районы присоединяются к нему значительно позже, что не противоречит логике. Кроме того, при использовании разнообразных математических моделей может акцентироваться внимание на различных элементах популяционной структуры, что неизбежно приведет как к неполным корреляциям, так и к несовпадающим графическим образам. Моздокский р-н, отличающийся от остальных районов РСО по многим параметрам [7, 9], на этой схеме также отдален. До 1944 г. Моздок входил в состав Ставропольского края [10].
Таким образом, модель изоляции расстоянием Малеко можно принять для описания инбредной структуры североосетинских популяций. Проведенный анализ параметров изоляции расстоянием опять выявил отличие Моздокского р-на от остальных районов Северной Осетии – Алании.
Исследование выполнено при поддержке гранта РНФ № 17-15-01051 и государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ.
Все процедуры, выполненные в исследовании с участием людей, соответствуют этическим стандартам институционального и/или национального комитета по исследовательской этике и Хельсинкской декларации 1964 г. и ее последующим изменениям или сопоставимым нормам этики.
От каждого из включенных в исследование участников было получено информированное добровольное согласие.
Настоящее генетико-эпидемиологическое исследование одобрено этическим комитетом ФГБНУ “МГНЦ” (протокол № 7 от 20.12.2017).
Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Список литературы
Зинченко Р.А., Куцев С.И., Александрова О.Ю., Гинтер Е.К. Основные методологические подходы к выявлению и диагностике моногенных наследственных заболеваний и проблемы в организации медицинской помощи и единых профилактических программ // Пробл. соц. гигиены, здравоохранения и истории медицины. 2019. Т. 27. № 5. С. 865–877. https://doi.org/10.32687/0869-866X-2019-27-5-865-877
Malécot G. Isolation by distance // Genetic Structure of Population / Ed. Morton N.E. Honolulu: Univ. of Hawaii Press, 1973. P. 72–75.
Ельчинова Г.И., Джаджиева М.Ю., Гетоева З.К. и др. Осетинские фамилии как генетический маркер // Генетика. 2019. Т. 55. № 7. С. 849–853. https://doi.org/10.1134/S001667581906002X
Березина Г.М., Ельчинова Г.И., Святова Г.С., Абдуллаева А.М. Параметры изоляции расстоянием Малеко и индекс эндогамии в сельских популяциях Казахстана // Мед. генетика. 2005. Т. 4. № 3. С. 103–107.
Morton N.E. Isolation by distance in human populations // Ann. Hum. Genet. 1977. V. 40. P. 361–365.
Ельчинова Г.И. Методы обработки популяционно-генетических данных: структура брачных миграций // Мед. генетика. 2004. Т. 3. № 4. С. 185–192.
Ельчинова Г.И., Кадышев В.В., Гетоева З.К. и др. Эндогамность населения Северной Осетии (конец ХХ века) // Генетика. 2020. Т. 56. № 7. С. 855–860.
Ельчинова Г.И. Метрика, построенная через параметры изоляции расстоянием Малеко, как характеристика генетического сходства популяций // Генетика. 2000. Т. 36. № 6. С. 856–858.
Ельчинова Г.И., Кадышев В.В., Гетоева З.К. и др. Картографический анализ случайного инбридинга и фамильной структуры населения Северной Осетии // Генетика. 2020. Т. 56. № 8. С. 969–973.
https://ru.wikipedia.org/wiki/Моздок (18 марта 2020 г.).
Дополнительные материалы отсутствуют.