Генетика, 2021, T. 57, № 5, стр. 590-603

Роль полиморфных вариантов ряда генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов в развитии рака желудка

Л. Ф. Галлямова 1*, А. Х. Нургалиева 1, И. И. Хидиятов 2, Т. Р. Насибуллин 3, Ф. Р. Мунасыпов 4, Ш. М. Хуснутдинов 4, Р. Р. Рахимов 4, Р. Р. Абдеев 4, Д. Д. Сакаева 2, Э. К. Хуснутдинова 13

1 Башкирский государственный университет
450076 Уфа, Россия

2 Башкирский государственный медицинский университет
450008 Уфа, Россия

3 Институт биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук
450054 Уфа, Россия

4 Республиканский клинический онкологический диспансер
450054 Уфа, Россия

* E-mail: liliyagallyamova@mail.ru

Поступила в редакцию 24.06.2020
После доработки 15.10.2020
Принята к публикации 27.10.2020

Полный текст (PDF)

Аннотация

Основная функция матриксных металлопротеиназ – деградация внеклеточного матрикса и участие в сигнальной трансдукции. Кроме этого известно, что они вовлечены во все этапы прогрессии опухолевого процесса. Активность металлопротеиназ может регулироваться взаимодействиями со специфическими ингибиторами матриксных металлопротеиназ, таким образом последние также способны участвовать в опухолевом росте. Для генов матриксных металлопротеиназ и их ингибиторов, как и для многих других генов, характерен полиморфизм. Проведен анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов rs1799750 и rs494379 гена MMP1, rs2285053 гена MMP2, rs3025058 гена MMP3, rs3918242 и rs17576 гена MMP9, rs2276109 гена MMP12, rs8179090 гена TIMP2 и rs9619311 гена TIMP3 у 314 пациентов с установленным диагнозом “рак желудка”, а также у 339 неродственных здоровых индивидов, проживающих на территории Республики Башкортостан. Показано, что маркерами повышенного риска развития рака желудка для татар являются генотипы rs1799750*1G/2G гена MMP1 и rs2276109*A/A гена MMP12, для русских – генотип rs9619311*Т/Т гена TIMP3. Обнаружены ассоциации аллеля rs494379*G гена MMP1 с риском развития злокачественных опухолей желудка у мужчин. С помощью алгоритма APSampler выявлены сочетания аллелей/генотипов, ассоциированные с повышенным, а также с пониженным риском развития онкопатологий желудка. Полученные результаты подтверждают влияние исследованных полиморфных вариантов генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов на риск развития рака желудка и имеют важное значение для понимания генетической структуры изучаемой патологии.

Ключевые слова: рак желудка, матриксные металлопротеиназы, тканевые ингибиторы матриксных металлопротеиназ, ассоциация, полиморфный вариант.

Рак желудка (РЖ) входит в число лидирующих причин смерти от онкологических заболеваний во всем мире. В Российской Федерации рак данной локализации занимает шестое место среди всех злокачественных опухолей по заболеваемости и второе – по смертности. В 2018 г. выявлен 36 941 новый случай РЖ. Заболеваемость составила 25.16 на 100 000 населения и заняла шестое место (5.9%) в структуре онкозаболеваний. Смертность достигла уровня 19.42 на 100 000 населения (9.5%), что соответствует второму месту среди мужчин (10.4%) и третьему – среди женщин (8.4%) [1]. В Республике Башкортостан (РБ) также наблюдаются высокие показатели заболеваемости и смертности от РЖ. В 2017 г. в структуре смертности от злокачественных новообразований населения РБ опухоли желудка заняли второе место (10.5%, или 703 случая) (http://02.rospotrebnadzor.ru/ content/228/37374/). Поскольку смертность от РЖ остается на очень высоком уровне, это диктует необходимость разработки новых концепций диагностики, прогноза течения и лечения болезни.

Трансформация клеток в раковые и прогрессия онкологического процесса связаны с накоплением генетических и эпигенетических изменений в геноме, возникающих в результате нарушения нормального его функционирования [2].

В изучении генетической предрасположенности к развитию РЖ особое внимание привлекает класс генов, кодирующих матриксные металлопротеиназы и их тканевые ингибиторы. Матриксные металлопротеиназы (MMP) представляют собой семейство цинк-зависимых эндопептидаз, обладающих способностью разрушать основные компоненты экстрацеллюлярного матрикса (ЭЦМ), играют важнейшую роль в процессах его регулируемой (физиологической) деградации, т.е. в тканевом морфогенезе, репарации тканей, эмбриогенезе и ангиогенезе. Ряд патологических состояний, в их числе язвенная болезнь, опухолевая инвазия и метастазирование, развиваются с нарушением регуляции деградации ЭЦМ, а значит с участием MMP [3]. В настоящее время уже известно, что MMP вовлечены во все этапы прогрессии опухолевого процесса при РЖ и других онкопатологиях [4].

В этой связи исследование полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов при РЖ – одно из важных, клинически перспективных направлений.

Целью настоящей работы стал поиск ассоциаций полиморфных вариантов генов матриксных металлопротеиназ MMP1 (rs1799750 и rs494379), MMP2 (rs2285053), MMP3 (rs3025058), MMP9 (rs3918242 и rs17576), MMP12 (rs2276109) и генов тканевых ингибиторов матриксных металлопротеиназ TIMP2 (rs8179090) и TIMP3 (rs9619311) с риском развития рака желудка в Республике Башкортостан.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Материалом для исследования послужили образцы ДНК больных РЖ и здоровых доноров в возрасте от 21 до 88 лет, проживающих в РБ. Группа больных состояла из 314 человек с клинически установленным диагнозом “рак желудка”, находящихся на лечении в ГАУЗ “Республиканский клинический онкологический диспансер”. Диагноз был поставлен на основании данных клинического и гистологического обследования. В качестве контроля исследована группа здоровых доноров без каких-либо признаков заболеваний желудочно-кишечного тракта, состоящая из 339 человек. Характеристика выборки пациентов и индивидов контрольной группы представлена в табл. 1.

Таблица 1.

Характеристика выборки больных РЖ и контрольной группы

Характеристика Больные РЖ (N = 314) Контроль (N = 339)
Средний возраст (mean ± SE), годы 62.67 ± 0.58 58.06 ± 0.73
Этническая принадлежность, n (%)
Русские 134 (42.67) 170 (50.15)
Татары 145 (46.18) 129 (38.05)
Башкиры 29 (9.24) 28 (8.26)
Другие
(чуваши, евреи, украинцы, метисы)
6 (1.91) 12 (3.54)
Пол, n (%)
Мужчины 180 (57.32) 201 (59.29)
Женщины 134 (42.68) 138 (40.71)
Стадия по TNM, n (%)
I 17 (5.52)
II 56 (18.18)
III 207 (67.21)
IV 28 (9.09)
Степень дифференцировки опухоли, n (%)
Высоко- и умереннодифференцированный РЖ 135 (45.30)
Низко- и недифференцированный РЖ 163 (54.70)
Умершие в последующие 2–3 года после оперативного вмешательства, n (%) 61 (19.43)

Все испытуемые прошли анкетирование, учитывающее национальную принадлежность до трех поколений, год рождения, статус курения, тип питания, наличие у близких родственников отягощенности по онкологическим заболеваниям, а также подписали информированное добровольное согласие на участие в исследовании в соответствии с Хельсинкской декларацией Всемирной медицинской ассоциации “Этические принципы проведения медицинских исследований с участием человека в качестве субъекта”.

Геномную ДНК выделяли из лимфоцитов периферической крови методом последовательной фенольно-хлороформной экстракции по К.Г. Мэтью [5]. Отбор полиморфных локусов для исследования проводили на основе следующих критериев: 1) наличие ассоциации с исследуемым признаком по результатам ранее проведенных ассоциативных (в том числе репликативных) исследований; 2) наличие ассоциации с фенотипами, имеющими общие биологические пути с исследуемым признаком; 3) регуляторный потенциал; 4) влияние на экспрессию генов; 5) связь с несинонимическими заменами; 6) частота полиморфного варианта не менее 5% [6]. Амплификацию исследованных локусов ДНК проводили с помощью полимеразной цепной реакции синтеза ДНК на амплификаторе GeneAmp PCR System 2720 производства компании “Applied Biosystems” (США). Определение нуклеотидных замен проводили методом ПЦР с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ-анализ). Перечень исследованных локусов, последовательности специфичных олигонуклеотидных праймеров, названия рестриктаз, размеры амплифицируемых фрагментов представлены в табл. 2. Результаты ПЦР и ПДРФ-анализа оценивали методом электрофореза в 7%-ном полиакриламидном геле с последующим окрашиванием бромистым этидием и визуализацией в проходящем ультрафиолетовом свете.

Таблица 2.

Полиморфные локусы, последовательности праймеров, номенклатура аллелей анализируемых ДНК-локусов

Ген, локализация Полиморфный локус, dbSNP Последовательности праймеров Рестриктаза Аллели,
размер фрагментов
MMP1,
11q22.2
rs1799750
(g.3471del)
TGAGGAAATTGTAGTTAAATCCTTAGAAAG
TCCCCTTATGGATTCCTGTTTTCTT
BseLI 2G – 118 пн,
1G – 29 + 89 пн
MMP1,
11q22.2
rs494379
(g.102798479 A>G)
CATGGTGCTATCGCAATAGGGT
TGCTACAGGTTTCTCCACACAC
KpnI G – 200 пн,
A – 176 + 24 пн
MMP2,
16q12.2
rs2285053
(g.4297 C>T)
ATAGGGTAAACCTCCCCACATT
GGTAAAATGAGGCTGAGACCTG
HinfI C – 300 пн,
T
– 254 + 46 пн
MMP3,
11q22.2
rs3025058
(g.13452_13453insA)
GGTTCTCCATTCCTTTGATGGGGGGAAAGA
CTTCCTGGAATTCACACTACTGCCACCACT
PsyI 6A – 129 пн,
5A – 97 + 32 пн
MMP9,
20q13.12
rs3918242
(g.3430 C>T)
TTCGTGACGCAAAGCAGA
AGCAGCCTCCCTCACTCCT
SphI C – 560 пн,
T – 300 + 260 пн
MMP9,
20q13.12
rs17576
(g.7679 A>G)
AATTCACCCTCCCGCACTCT
GTTTTGGGGGCCAATACATGA
SmaI A – 397 пн,
G – 224 + 173 пн
MMP12,
11q22.2
rs2276109
(g.4974 A>G)
GAGATAGTCAAGGGATGATATCAG
AAGAGCTCCAGAAGCAGTGG
PvuII A – 199 пн,
G – 175 + 24 пн
TIMP2,
17q25.3
rs8179090
(g.76921889 C>G)
CGTCTCTTGTTGGCTGGTCA
CCTTCAGCTCGACTCTGGAG
Eco881 G – 230 + 51 + 23 пн,
C – 253 + 51 пн
TIMP3,
22q12.3
rs9619311
(g.4892 T>C)
CAAAGCAGAATCAAGATGTCAAT
CTGGGTTAAGCAACACAAAGC
AluI C – 204 + 160 + 69 + 55 пн,
T – 204 + 128 + 69 + 55 + 32 пн

Статистическую обработку результатов исследования проводили c применением программного обеспечения MS Office Excel. При попарном сравнении частот аллелей и генотипов в группах больных и контроля применялся критерий χ2 для таблиц сопряженности 2×2 с поправкой Йейтса на непрерывность (http://www.biometrica.tomsk.ru/). Все статистические тесты выполнялись для двустороннего уровня значимости. Поправку на множественное тестирование проводили с помощью метода оценки доли ложно-положительных результатов FDR (False Discovery Rate; Benjiamini Hochberg), предусмотренного пакетом программы Plink 1.9. Статистически значимыми считали различия при рfdr < 0.05, где р – уровень значимости критерия. При обнаружении статистически значимых различий между исследуемыми выборками проводилась оценка показателя отношения шансов (odds ratio, OR), а также границ его 95%-ного доверительного интервала (95% CI) [7].

Поиск сочетаний аллелей/генотипов, ассоциированных с РЖ, осуществлялся с помощью программы APSampler 3.6.1 (http://sourceforge.net/projects/apsampler/). Основной алгоритм этой программы описан в статье А.В. Фаворова с соавт. [8]. В качестве поправки на множественность сравнений использовали перестановочный тест (Permutation Test), статистически значимыми считали различия при pperm < 0.05.

РЕЗУЛЬТАТЫ

У больных РЖ и индивидов контрольной группы из Республики Башкортостан проведен анализ распределения частот аллелей и генотипов девяти полиморфных локусов: rs1799750 и rs494379 гена MMP1, rs2285053 гена MMP2, rs3025058 гена MMP3, rs3918242 и rs17576 гена MMP9, rs2276109 гена MMP12, rs8179090 гена TIMP2 и rs9619311 гена TIMP3. Наблюдаемое распределение частот генотипов по всем полиморфным локусам соответствует ожидаемым из уравнения Харди–Вайнберга. Поскольку население РБ в этническом отношении является неоднородным, исследуемая выборка была разделена на подгруппы в зависимости от этнической принадлежности. В отдельные подгруппы были выделены русские и татары. Другие национальности в данном исследовании не учитывались ввиду их немногочисленности в обеих репрезентативных выборках. Было проведено сравнение распределения частот аллелей и генотипов полиморфных ДНК-локусов с целью выявления маркеров повышенного и пониженного риска развития РЖ между выборками больных и индивидов контрольной группы соответствующей этнической и гендерной принадлежности.

Ген ММР1 локализован на длинном плече хромосомы 11, кодирует фермент коллагеназу, способную расщеплять коллаген межклеточного матрикса [9]. Нами проведен анализ ассоциации аллелей и генотипов полиморфных локусов rs1799750 (–1607 1G>2G) и rs494379 (–519 A>G), расположенных в промоторном регионе гена MMP1, с риском развития РЖ для жителей РБ.

В результате сравнительного анализа распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs1799750 гена MMP1 среди больных РЖ и здоровых индивидов обнаружено, что для татар маркером повышенного риска развития РЖ является гетерозиготный генотип rs1799750*1G/2G2 = 7.82; pfdr = 0.016; OR = 2.08; 95% CI 1.27–3.41) (табл. 3).

Таблица 3.

Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs1799750 гена MMP1 в выборках больных РЖ и индивидов контрольной группы в зависимости от этнической принадлежности

Генотип, аллель Больные (в целом) Контроль (в целом) Русские с РЖ Русские, контроль Татары с РЖ Татары, контроль
1G/1G ni 79 81 39 35 29 38
pi ± sp
(95% CI)
25.16 ± 2.45
(20.45–30.34)
25.47 ± 2.44
(20.77–30.63)
29.10 ± 3.92
(21.58–37.57)
21.88 ± 3.27
(15.73–29.09)
20.00 ± 3.32
(13.82–27.44)
32.20 ± 4.30
(23.90–41.43)
χ2 0.000001 1.66 4.48
p (pfdr) 0.999 (0.999) 0.198 (0.475) 0.034 (0.051)
1G/2G ni 170 163 70 94 84 47
pi ± sp
(95% CI)
54.14 ± 2.81
(48.45–59.75)
51.26 ± 2.80
(45.62–56.87)
52.24 ± 4.32
(43.44–60.93)
58.75 ± 3.89
(50.71–66.46)
57.93 ± 4.10
(49.46–66.07)
39.83 ± 4.51
(30.93–49.25)
χ2 0.42 1.00 7.82
p (pfdr) 0.518 (0.777) 0.316 (0.475) 0.005 (0.016)
OR (CI)     2.08 (1.27–3.41)
2G/2G ni 65 74 25 31 32 33
pi ± sp
(95% CI)
20.70 ± 2.29
(16.36–25.61)
23.27 ± 2.37
(18.74–28.31)
18.66 ± 3.37
(12.45–26.30)
19.38 ± 3.12
(13.56–26.36)
22.07 ± 3.44
(15.61–29.70)
27.97 ± 4.13
(20.10–36.98)
χ2 0.47 0.00005 0.92
p (pfdr) 0.494 (0.777) 0.994 (0.994) 0.338 (0.927)
1G ni 328 325 148 164 142 123
pi ± sp
(95% CI)
52.23 ± 1.99
(48.24–56.20)
51.10 ± 1.98
(47.14–55.05)
55.22 ± 3.04
(49.05–61.28)
51.25 ± 2.79
(45.63–56.85)
48.97 ± 2.94
(43.08–54.88)
52.12 ± 3.25
(45.54–58.64)
χ2 0.12 0.77 0.40
p (pfdr) 0.730 (0.819) 0.380 (0.512) 0.528 (0.955)
2G ni 300 311 120 156 148 113
pi ± sp
(95% CI)
47.77 ± 1.99
(43.80–51.76)
48.90 ± 1.98
(44.95–52.86)
44.78 ± 3.04
(38.72–50.95)
48.75 ± 2.79
(43.15–54.37)
51.03 ± 2.94
(45.12–56.92)
47.88 ± 3.25
(41.36–54.46)
χ2 0.12 0.77 0.40
p (pfdr) 0.730 (0.819) 0.380 (0.512) 0.528 (0.955)

Анализ распределения частот аллелей и генотипов однонуклеотидной замены rs494379 гена MMP1 у больных РЖ и здоровых доноров из РБ показал, что для мужчин носительство аллеля rs494379*А и генотипа rs494379*А/А связано с пониженным риском развития РЖ (χ2 = 8.95; pfdr = = 0.030; OR = 0.62; 95% CI 0.46–0.84 и χ2 = 6.13; pfdr = 0.040; OR = 0.58; 95% CI 0.39–0.88 соответственно), а носительство мужчинами аллеля rs494379*G, напротив, повышает риск развития заболевания (χ2 = 8.95; pfdr = 0.030; OR = 1.62; 95% CI 1.19–2.20) (табл. 4).

Таблица 4.

Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs494379 гена MMP1 в выборках больных РЖ и индивидов контрольной группы в зависимости от гендерной принадлежности

Генотип,
аллель
Мужчины
с РЖ
Мужчины, контроль Женщины
с РЖ
Женщины, контроль
A/A ni 73 103 51 54
pi ± sp
(95% CI)
40.78 ± 3.67
(33.51–48.36)
54.21 ± 3.61
(46.85–61.44)
38.64 ± 4.24
(30.29–47.50)
41.54 ± 4.32
(32.97–50.51)
χ2 6.13 0.12
p (pfdr) 0.013 (0.040) 0.724 (0.999)
OR (CI) 0.58 (0.39–0.88)  
A/G ni 71 65 63 52
pi ± sp
(95% CI)
39.66 ± 3.66
(32.44–47.23)
34.21 ± 3.44
(27.50–41.43)
47.73 ± 4.35
(38.97–56.59)
40.00 ± 4.30
(31.51–48.95)
χ2 0.96 1.29
p (pfdr) 0.328 (0.854) 0.256 (0.555)
G/G ni 35 22 18 24
pi ± sp
(95% CI)
19.55 ± 2.96
(14.01–26.13)
11.58 ± 2.32
(7.40–17.00)
13.64 ± 2.99
(8.29–20.69)
18.46 ± 3.40
(12.20–26.21)
χ2 3.90 0.80
p (pfdr) 0.048 (0.073) 0.370 (0.555)
A ni 217 271 165 160
pi ± sp
(95% CI)
60.61 ± 2.58
(55.34–65.71)
71.32 ± 2.32
(66.48–75.81)
62.50 ± 2.98
(56.36–68.36)
61.54 ± 3.02
(55.33–67.48)
χ2 8.95 0.02
p (pfdr) 0.003 (0.030) 0.891 (0.892)
OR (CI) 0.62 (0.46–0.84)  
G ni 141 109 99 100
pi ± sp
(95% CI)
39.39 ± 2.58
(34.29–44.66)
28.68 ± 2.32
(24.19–33.52)
37.50 ± 2.98
(31.64–43.64)
38.46 ± 3.02
(32.52–44.67)
χ2 8.95 0.02
p (pfdr) 0.003 (0.030) 0.891 (0.892)
OR (CI) 1.62 (1.19–2.20)  

Ген MMP2 локализован в 16-й хромосоме, в позиции 16q12.2. MMP2 кодирует металлопротеиназу-2, которая специфически активна в отношении коллагена IV типа, основного компонента базальных мембран [10]. Существует мнение, что продукция MMP2 опухолевыми клетками обеспечивает их инвазивный потенциал [11, 12]. Нами проведен сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs2285053 (–735 C>T) гена ММP2 среди больных РЖ и здоровых доноров из РБ. Однако полученные результаты не показали статистически значимых различий между группами больных РЖ и здоровых доноров.

Ген MMP3 так же, как ген MMP1, локализован на длинном плече 11-й хромосомы. Некоторыми авторами было высказано предположение о возможности использования MMP3 в качестве маркера инвазии, метастазирования, а также в качестве фактора для прогноза развития РЖ [13]. Проведенный нами сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs3025058 (–1171 5A>6A) гена MMP3 между пациентами с РЖ и здоровыми лицами статистически значимых различий не выявил.

Ген MMP9 кодирует желатиназу B. MMP9 принимает участие в процессах воспаления (так же, как и MMP2, может обладать про- и противовоспалительной активностью), ремоделирования тканей и репарации, мобилизации матрикс-связанных факторов роста и процессинга цитокинов [10]. Также известно, что желатиназа В обеспечивает ангиогенез, в том числе и в опухолевой ткани, тем самым способствуя ее росту [12]. В рамках нашего исследования проведен ассоциативный анализ полиморфных локусов гена MMP9 с риском развития РЖ для жителей РБ: rs3918242 (–1562 C>T), расположенный в промоторе гена, и rs17576 (836 A>G), расположенный в экзоне 6 и приводящий к замене аминокислоты в белке (Gln279Arg). Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов по полиморфным локусам rs3918242 и rs17576 гена MMP9 среди больных РЖ и здоровых доноров из РБ, согласно их этнической и гендерной принадлежности, не выявил ассоциаций описываемых ДНК-локусов с риском развития РЖ.

Ген MMP12, расположенный на коротком плече 11-й хромосомы, кодирует металлоэластазу макрофагов (ММP12). ММP12 − малоизученная металлоэластаза, ее роль в опухолевой прогрессии остается до конца неясной; известно, что данная молекула наряду с другими MMP способна ингибировать ангиогенез [10, 14]. Нами проведено ассоциативное исследование полиморфного локуса rs2276109 гена MMP12 с риском развития РЖ для жителей РБ.

Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs2276109 (–82 A>G) гена MMP12 между больными РЖ и здоровыми индивидами показал этнические различия: генотип rs2276109*А/А является для татар маркером повышенного риска развития изучаемой патологии (χ2 = 9.64; pfdr = 0.003; OR = = 2.55; 95% CI 1.43–4.53), а маркером пониженного риска для этой же подгруппы испытуемых – гетерозиготный генотип rs2276109*A/G2 = 11.75; pfdr = 0.002; OR = 0.35; 95% CI 0.19–0.63) (табл. 5).

Таблица 5.

Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs2276109 гена MMP12 в выборках больных РЖ и индивидов контрольной группы в зависимости от этнической принадлежности

Генотип, аллель Больные (в целом) Контроль (в целом) Русские с РЖ Русские, контроль Татары с РЖ Татары, контроль
A/A ni 256 253 105 101 124 109
pi ± sp
(95% CI)
81.53 ± 2.19
(76.79–85.66)
78.09 ± 2.30
(73.18–82.47)
78.36 ± 3.56
(70.42–85.00)
83.47 ± 3.38
(75.63–89.60)
85.52 ± 2.92
(78.72–90.81)
69.87 ± 3.67
(62.02–76.95)
χ2 0.97 0.77 9.64
p (pfdr) 0.325 (0.547) 0.381 (0.572) 0.002 (0.003)
OR (CI)     2.55 (1.43–4.53)
A/G ni 56 68 29 18 19 47
pi ± sp
(95% CI)
17.83 ± 2.16
(13.76–22.53)
20.99 ± 2.26
(16.68–25.83)
21.64 ± 3.56
(15.00–29.58)
14.88 ± 3.24
(9.06–22.49)
13.10 ± 2.80
(8.08–19.70)
30.13 ± 3.67
(23.05–37.98)
χ2 0.82 1.51 11.75
p (pfdr) 0.365 (0.547) 0.219 (0.572) 0.0006 (0.002)
OR (CI)     0.35 (0.19–0.63)
G/G ni 2 3 0 2 2 0
pi ± sp
(95% CI)
0.64 ± 0.45
(0.08–2.28)
0.93 ± 0.53
(0.19–2.68)
0 1.65 ± 1.16
(0.20–5.84)
1.38 ± 0.97
(0.17–4.89)
0
χ2 0.001 0.16 0.14
p (pfdr) 0.972 (0.995) 0.687 (0.975) 0.705 (0.927)
A ni 568 574 239 220 267 265
pi ± sp
(95% CI)
90.45 ± 1.17
(87.87–92.63)
88.58 ± 1.25
(85.88–90.93)
89.18 ± 1.90
(84.83–92.63)
90.91 ± 1.85
(86.56–94.21)
92.07 ± 1.59
(88.34–94.91)
84.94 ± 2.03
(80.48–88.72)
χ2 0.99 0.25 6.76
p (pfdr) 0.320 (0.577) 0.615 (0.644) 0.009 (0.159)
G ni 60 74 29 22 23 47
pi ± sp
(95% CI)
9.55 ± 1.17
(7.37–12.13)
11.42 ± 1.25
(9.07–14.12)
10.82 ± 1.90
(7.37–15.17)
9.09 ± 1.85
(5.79–13.44)
7.93 ± 1.59
(5.09–11.66)
15.06 ± 2.03
(11.28–19.52)
χ2 0.99 0.25 6.76
p (pfdr) 0.320 (0.577) 0.615 (0.644) 0.009 (0.159)

Экспериментальные данные многих авторов свидетельствуют о том, что тканевые ингибиторы матриксных металлопротеиназ (TIMP) являются многофункциональными молекулами, способными влиять на прогрессирование опухоли [1517]. Механизм онкотрансформации при молекулярно-генетических изменениях гена TIMP2 может быть обусловлен низкой активностью промотора при экспрессии TIMP2, что приводит к медленному ингибированию металлопротеиназ и, как следствие, к воспалительным изменениям микроокружения и канцерогенезу [18].

В настоящей работе рассмотрен полиморфный локус rs8179090 (–418 G>C), расположенный в промоторной области гена TIMP2. Сравнение выборки больных со здоровыми донорами согласно их этнической и гендерной принадлежности не выявило статистически значимых различий в распределении частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs8179090 гена TIMP2 среди населения нашей республики.

Ген TIMP3 кодирует белок TIMP3 массой 24 кДа, который, в отличие от других членов семейства TIMP, находится исключительно в связи с внеклеточным матриксом [19, 20]. Есть сведения о том, что TIMP3 способен индуцировать апоптоз раковых клеток, а также подавлять рост опухоли и ангиогенез [20].

В рамках настоящей работы нами проведен анализ ассоциации полиморфного локуса rs9619311 (–1296 T>C) гена TIMP3 с риском развития РЖ для жителей РБ. Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs9619311 между больными РЖ и здоровыми донорами показал, что генотип rs9619311*Т/Т является для русских маркером повышенного риска развития злокачественных опухолей желудка (χ2 = 8.11; pfdr = 0.013; OR = 2.04; 95% CI 1.27–3.27), а генотип rs9619311*С/Т – маркером пониженного риска развития РЖ для представителей данной этнической подгруппы (χ2 = 6.84; pfdr = 0.013; OR = = 0.51; 95% CI 0.31–0.83) (табл. 6).

Таблица 6.

Распределение частот аллелей и генотипов полиморфного локуса rs9619311 гена TIMP3 в выборках больных РЖ и индивидов контрольной группы в зависимости от этнической принадлежности

Генотип, аллель Больные (в целом) Контроль (в целом) Русские с РЖ Русские, контроль Татары с РЖ Татары, контроль
C/C ni 21 21 8 12 10 9
pi ± sp
(95% CI)
6.69 ± 1.41
(4.19–10.04)
6.69 ± 1.41
(4.19–10.04)
5.97 ± 2.05
(2.61–11.42)
7.69 ± 2.13
(4.04–13.05)
6.90 ± 2.10
(3.36–12.32)
7.56 ± 2.42
(3.52–13.87)
χ2 0.03 0.12 0.001
p (pfdr) 0.873 (0.995) 0.730 (0.975) 0.975 (1.000)
C/T ni 106 129 40 71 53 40
pi ± sp
(95% CI)
33.76 ± 2.67
(28.54–39.28)
41.08 ± 2.78
(35.59–46.75)
29.85 ± 3.95
(22.26–38.36)
45.51 ± 3.99
(37.53–53.67)
36.55 ± 4.00
(28.72–44.95)
33.61 ± 4.33
(25.22–42.85)
χ2 3.29 6.84 0.14
p (pfdr) 0.070 (0.116) 0.009 (0.013) 0.713 (0.927)
OR (CI)   0.51 (0.31–0.83)  
T/T ni 187 164 86 73 82 70
pi ± sp
(95% CI)
59.55 ± 2.77
(53.90–65.03)
52.23 ± 2.82
(46.55–57.87)
64.18 ± 4.14
(55.44–72.27)
46.79 ± 3.99
(38.77–54.94)
56.55 ± 4.12
(48.08–64.75)
58.82 ± 4.51
(49.43–67.76)
χ2 3.13 8.11 0.06
p (pfdr) 0.077 (0.116) 0.004 (0.013) 0.805 (0.969)
OR (CI)   2.04 (1.27–3.27)  
C ni 148 171 56 95 73 58
pi ± sp
(95% CI)
23.57 ± 1.69
(20.30–27.09)
27.23 ± 1.78
(23.78–30.89)
20.90 ± 2.48
(16.19–26.26)
30.45 ± 2.61
(25.39–35.88)
25.17 ± 2.55
(20.28–30.58)
24.37 ± 2.78
(19.06–30.33)
χ2 2.03 6.35 0.01
p (pfdr) 0.154 (0.378) 0.012 (0.224) 0.911 (0.955)
T ni 480 457 212 217 217 180
pi ± sp
(95% CI)
76.43 ± 1.69
(72.91–79.70)
72.77 ± 1.78
(69.11–76.22)
79.10 ± 2.48
(73.74–83.81)
69.55 ± 2.61
(64.12–74.61)
74.83 ± 2.55
(69.42–79.72)
75.63 ± 2.78
(69.67–80.94)
χ2 2.03 6.35 0.01
p (pfdr) 0.154 (0.378) 0.012 (0.224) 0.911 (0.955)

Кроме оценки влияния полиморфных вариантов отдельных генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов на риск развития РЖ, нами также рассмотрены сочетания аллелей и генотипов изученных ДНК-локусов. С помощью алгоритма APSampler выявлены сочетания, ассоциированные с повышенным, а также с пониженным риском развития РЖ. В табл. 7 отражены результаты с pperm менее 0.05 и OR более 3.50 или менее 0.33 [21] (табл. 7).

Таблица 7.

Сочетания аллелей/генотипов, ассоциированные с РЖ, полученные с помощью алгоритма APSampler

Выборка Сочетание аллелей/генотипов Частота, % pperm OR 95% CI
больные контроль
Русские Женщины MMP1.2*A/G + MMP3*6A + + TIMP3*T 38.18 9.09 0.0443 6.18 1.31–29.16
Мужчины MMP12*A + TIMP2*G/G 100.00 91.36 0.0470 7.69 1.70–34.86
Низко- и недифференцированный РЖ MMP3*5A + MMP9.1*C 57.45 80.80 0.0071 0.32 0.15–0.67
Высоко- и умеренно- дифференцированный РЖ MMP1.1*2G + + MMP12*A + TIMP3*T 56.00 79.78 0.0108 0.32 0.15–0.69
Татары Женщины MMP1.1*2G + MMP3*5A/6A 43.33 8.00 0.0047 8.79 1.90–40.71
MMP1.2*A/A + MMP12*G 3.33 18.52 0.0242 0.15 0.03–0.73
Мужчины MMP1.1*1G/2G + TIMP3*C 27.38 5.36 0.0029 6.66 1.89–23.44
Высоко- и умеренно- дифференцированный РЖ MMP1.1*2G + MMP1.2*G + + MMP3*5A 55.07 20.00 0.00002 4.90 2.38–10.12
MMP1.2*A + MMP12*G 10.00 28.10 0.0184 0.28 0.12–0.68

Примечание. MMP1.1 – rs1799750 гена MMP1; MMP1.2 – rs494379 гена MMP1; MMP3 – rs3025058 гена MMP3; MMP9.1 – rs3918242 гена MMP9; MMP12 – rs2276109 гена MMP12; TIMP2 – rs8179090 гена TIMP2; TIMP3 – rs9619311 гена TIMP3.

В этнической выборке русских наиболее значимыми сочетаниями, ассоциированными с повышенным риском развития РЖ, оказались: rs494379*A/G гена MMP1 + rs3025058*6A гена MMP3 + rs9619311*T гена TIMP3; rs2276109*A гена MMP12 + rs8179090*G/G гена TIMP2. В этнической выборке татар: rs1799750*2G гена MMP1 + + rs3025058*5A/6A гена MMP3; rs1799750*1G/2G гена MMP1 + rs9619311*C гена TIMP3 и rs1799750*2G гена MMP1 + rs494379*G гена MMP1 + rs3025058*5A гена MMP3 (табл. 7).

ОБСУЖДЕНИЕ

Влияние полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов на развитие и прогрессирование РЖ достаточно широко исследуется многими учеными, однако на выборке населения РБ данное исследование проведено впервые.

Известно, что полиморфный локус rs1799750, расположенный в промоторном регионе гена MMP1, создает сайт для связывания транскрипционного фактора Ets благодаря дополнительному гуанину. Экспериментально показано, что мутантный аллель 2G обладает повышенной способностью связываться с рекомбинантным фактором ETS-1 в комплексе с C-JUN [22]. В результате проведенного нами исследования обнаружено, что гетерозиготный генотип rs1799750*1G/2G гена MMP1 является маркером повышенного риска развития РЖ для татар. Полученные нами данные расходятся с результатами, полученными S. Dey с коллегами [23]. В своем исследовании авторам не удалось выявить ассоциаций полиморфного локуса rs1799750 гена MMP1 с риском развития РЖ для населения Индии. Однако ученые отмечают, что аллель rs1799750*2G был мажорным аллелем в выборке больных и, скорее всего, является рисковым [23]. Для индийской популяции также показано, что носительство генотипов rs494379*A/G и rs494379*G/G гена MMP1 оказывает протективный эффект в отношении метастазов в регионарные лимфатические узлы, а также в отношении отдаленного метастазирования [23]. В настоящем исследовании выявлено, что носительство аллеля rs494379*G гена MMP1 является маркером повышенного риска развития РЖ, а носительство аллеля rs494379*А и генотипа rs494379*А/А, напротив, маркером пониженного риска развития РЖ для мужчин из РБ. Противоречия в полученных нами результатах и данных других авторов могут объясняться различиями в генетической структуре исследуемых популяций.

Нуклеотидная замена –735 C>T (rs2285053) в промоторе гена MMP2 приводит к исчезновению сайта связывания фактора Sp-1, что существенно снижает активность промотора [24]. W. Shen с коллегами [25] провели метаанализ и выяснили, что сверхэкспрессия MMP2 оказывает неблагоприятное влияние на выживаемость пациентов и клинико-патологические особенности РЖ. Авторы пришли к выводу, что сверхэкспрессия ММP2 может являться прогностическим маркером при РЖ и указывать на возможное распространение метастаз [25]. В исследовании, проведенном D.Y. Zhang с коллегами [26] в Китае, показано, что распределение частот аллелей и генотипов ДНК-локуса rs2285053 гена MMP2 в группе больных РЖ и в группе здоровых индивидов сопоставимо и статистически значимых различий между группами не наблюдается. Результаты, полученные китайскими учеными, соответствуют данным, представленным в нашем исследовании.

Мутантный аллель локуса MMP3 –1171 5A>6A (rs3025058) отличается от нормального присутствием дополнительного аденозина. Эксперименты с репортерными конструкциями показали снижение эффективности транскрипции для аллеля . Для этого же аллеля выявлено увеличение эффективности связывания со специфическим белковым комплексом, предположительно репрессором транскрипции [27]. Оценка роли полиморфного локуса rs3025058 гена ММP3 в развитии РЖ проводилась учеными из Индии [28]. Авторами было обнаружено, что аллель rs3025058*5A и генотип rs3025058*5A/6A – маркеры повышенного риска развития РЖ для исследуемой популяции [28]. Полученные нами данные расходятся с результатами ученых из Индии, это может объясняться значительными этническими различиями исследуемых популяций.

Для полиморфного локуса –1562 С>Т (rs3918242) в гене MMP9 показано, что увеличение транскрипционной активности, ассоциированное с редким аллелем Т, вызвано предпочтительным связыванием репрессора транскрипции с аллелем дикого типа [29]. В 2017 г. Z. Peng с коллегами [30] опубликовали результаты системного метаанализа, который был призван оценить связь между SNP rs3918242 (–1562 C>T) гена MMP9 и риском развития злокачественных новообразований желудка. В результате проведенного метаанализа авторы выяснили, что полиморфный вариант –1562 C>T, расположенный в промоторной области гена MMP9, увеличивает риск развития РЖ [30]. R. Okada с соавт. [31] в этом же году опубликовали работу, в которой отмечали, что носительство генотипа rs17576*G/G гена MMP9 значительно чаще наблюдается у японцев, имеющих родственников первой и второй степени родства со злокачественными новообразованиями желудка, по сравнению с теми, у кого нет семейной истории развития РЖ. В проведенном нами ассоциативном исследовании статистически значимых результатов по полиморфным локусам rs3918242 и rs17576 гена MMP9 для жителей нашего региона не обнаружено. Сведения из публикаций других авторов и полученные нами результаты в очередной раз подчеркивают необходимость учета этнической принадлежности индивидов в ассоциативных исследованиях.

Полиморфная замена rs2276109 (–82 A>G) гена MMP12 оказывает влияние на связывание транскрипционного фактора AP-1 со своим респонсивным элементом в промоторе гена. Выявлено, что для аллеля А это связывание более эффективно. Для аллеля G показана ассоциация со сниженным уровнем транскрипции гена MMP12. По всей видимости, эта взаимосвязь обусловлена разницей в эффективности связывания AP-1 аллелем А и G [32]. Полиморфный локус rs2276109 гена MMP12 рассматривается учеными при многих злокачественных новообразованиях, тем не менее не всегда данные исследователей согласуются между собой и позволяют однозначно утверждать об эффекте изучаемого локуса. Так, ученые из Китая [33] провели метаанализ, в котором попытались выяснить взаимосвязь между полиморфным вариантом –82 A>G гена MMP12 и риском развития злокачественных опухолей, в частности рассматривались девять нозологий, в том числе аденокарцинома желудка. Авторам удалось выявить ассоциацию только для эпителиальной карциномы яичника; ученые обнаружили, что аллель rs2276109*G является генетическим фактором риска развития данной патологии. Связи между SNP –82 A>G гена MMP12 и восприимчивостью к другим опухолям авторами не обнаружено [33]. S. VAN Nguyen с коллегами [34] провели исследование, в котором оценивали связь между однонуклеотидной заменой rs2276109 гена MMP12 и колоректальным раком у шведских пациентов. В работе показано, что генотип rs2276109*A/A гена MMP12 связан с более высоким риском развития диссеминированного колоректального рака [34]. В нашем исследовании обнаружено, что генотип rs2276109*А/А гена MMP12 достоверно повышает риск развития злокачественных опухолей желудка у татар, а гетерозиготный генотип rs2276109*A/G является протективным в отношении изучаемой патологии для данной этнической подгруппы.

В зарубежной литературе также имеется множество публикаций, в которых изучается роль полиморфных локусов генов тканевых ингибиторов матриксных металлопротеиназ в канцерогенезе различной локализации. В недавнем исследовании ученые из Турции, изучая роль полиморфного локуса rs8179090 гена TIMP2 в наследственной предрасположенности к раку мочевого пузыря, пришли к выводу, что полиморфный локус rs8179090 не связан с риском развития данной патологии [35]. Результаты ученых из Индии показали повышенный риск развития рака желчного пузыря у испытуемых, имеющих генотипы rs8179090*G/C и (C/C + G/C) по сравнению с контрольной выборкой [17]. В китайской популяции [36] носители генотипа rs8179090 (C/C + G/C) имеют на 51% более высокий риск развития РЖ по сравнению с носителями генотипа rs8179090*G/G. Повышенный риск был особенно очевиден у молодых индивидов в возрасте до 58 лет и у курильщиков [36]. В нашем исследовании значимых ассоциаций полиморфного локуса rs8179090 гена TIMP2 с риском развития РЖ для жителей РБ не обнаружено. Возможным объяснением таких противоречивых результатов является наличие этнос-зависимых ассоциаций между аллелями генов и клиническими особенностями изучаемой патологии.

Литературные данные относительно влияния полиморфного локуса rs9619311 гена TIMP3 на развитие онкопатологии также весьма противоречивы. H.-T. Tsai с соавт. [37] показали, что для тайваньских женщин носительство генотипов rs9619311*С/Т или rs9619311*С/С гена TIMP3 является протективным в отношении гепатоцеллюлярного рака по сравнению с женщинами, имеющими генотип rs9619311*Т/Т. Коллективом авторов из Польши [38] опубликованы результаты исследования, в котором показано, что генетические вариации полиморфного локуса rs9619311 гена TIMP3 не связаны с высоким риском развития рака мочевого пузыря для польской популяции. В нашем исследовании выявлено, что носительство генотипа rs9619311*Т/Т гена TIMP3 достоверно повышает риск развития злокачественных новообразований желудка у русских, а гетерозиготный генотип rs9619311*С/Т является маркером пониженного риска развития РЖ для данной этнической подгруппы. Полученные нами данные, а также результаты других исследований показывают, что влияние полиморфного локуса rs9619311 гена TIMP3 на риск развития злокачественных опухолей различной локализации требует дальнейшего изучения.

Особое внимание заслуживают исследования, направленные на изучение влияния сочетаний аллелей/генотипов полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов на риск развития онкопатологии. Z. Rahimi с коллегами [39], исследуя роль полиморфных локусов rs3918242 (–1562 C>T) гена MMP9 и rs2285053 (–735 C>T) гена MMP2, пришли к выводу, что сочетание аллеля rs3918242*Т гена MMP9 с аллелем rs2285053*С гена MMP2 значительно увеличивает предрасположенность курдских женщин из Западного Ирана к раку молочной железы. Исследование, проведенное в Нидерландах [40], показало, что носительство аллеля G полиморфного локуса –181 A>G гена MMP7 в сочетании с носительством аллеля Т полиморфного локуса 303 С>T гена TIMP2 связано с более плохим прогнозом выживаемости для больных РЖ. В проведенном нами исследовании на выборке индивидов из РБ показаны сочетания аллелей и генотипов полиморфных локусов генов матриксных металлопротеиназ и их тканевых ингибиторов, ассоциированные с повышенным, а также с пониженным риском развития РЖ (табл. 7). Полученные нами, а также показанные другими учеными результаты часто расходятся, тем не менее выявленные сочетания аллелей и генотипов в случае подтверждения полученных результатов на независимой выборке могут служить основой для создания тест-системы по идентификации лиц с высоким риском развития онкопатологии.

Таким образом, в ходе проведенных исследований нами получены статистически значимые результаты, обладающие высокой научной новизной и практической значимостью, которые позволяют глубже понять механизмы и молекулярные основы патогенеза РЖ, а также идентифицировать важные молекулярно-генетические маркеры риска развития заболевания для жителей нашего региона.

Исследование поддержано РФФИ (грант №  17-44-020497 р_а) и программой поддержки биоресурсных коллекций ФАНО.

Все процедуры, выполненные в исследовании с участием людей, соответствуют этическим стандартам институционального и/или национального комитета по исследовательской этике и Хельсинкской декларации 1964 г. и ее последующим изменениям или сопоставимым нормам этики.

От каждого из включенных в исследование участников было получено информированное добровольное согласие.

Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.

Список литературы

  1. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2018 году (заболеваемость и смертность). М.: МНИОИ им. П.А. Герцена – филиал ФГБУ “НМИЦ радиологии” Минздрава России, 2019. 250 с.

  2. Egger G., Liang G., Aparicio A., Jones P.A. Epigenetics in human disease and prospects for epigenetic therapy // Nature. 2004. V. 429. № 6990. P. 457–463. https://doi.org/10.1038/nature02625

  3. Ганусевич И.И. Роль матриксных металлопротеиназ (ММП) при злокачественных новообразованиях. І. Характеристика ММП, регуляция их активности, прогностическое значение // Онкология. 2010. Т. 12. № 1. С. 10–16.

  4. Короткова Е.А., Иванников А.А., Огнерубов Н.А. и др. Рак желудка: молекулярно-биологические особенности // Вестник ТГУ. 2014. Т. 19. № 3. С. 957–969.

  5. Mathew C.G. The isolation of high molecular weight eukaryotic DNA // Methods Mol. Biol. 1985. V. 2. P. 31–34. https://doi.org/10.1385/0-89603-064-4:31

  6. Пономаренко И.В. Отбор полиморфных локусов для анализа ассоциаций при генетико-эпидемиологических исследованиях // Науч. результат. Медицина и фармация. 2018. Т. 4. № 2. С. 40–54. https://doi.org/10.18413/2313-8955-2018-4-2-0-5

  7. Schlesselman J. Case-control studies: design, conduct, analysis. N.Y.; Oxford: Oxford Univ. Press, 1982. P. 58–96.

  8. Favorov A.V., Andreewski T.V., Sudomoina M.A. et al. A Markov chain Monte Carlo technique for identification of combinations of allelic variants underlying complex diseases in humans // Genetics. 2005. V. 171. № 4. P. 2113–2121. https://doi.org/10.1534/genetics.105.048090

  9. Cugino D., Gianfagna F., Ahrens W. et al. Polymorphisms of matrix metalloproteinase gene and adiposity indices in European children: results of the IDEFICS study // Int. J. Obes. 2013. V. 37. № 12. P. 1539–1544. https://doi.org/10.1038/ijo.2013.21

  10. Ярмолинская М.И., Молотков А.С., Денисова В.М. Матриксные металлопротеиназы и ингибиторы: классификация, механизм действия // Журн. акушерства и женских болезней. 2012. Т. LXI. № 1. С. 113–125.

  11. Zhang J., Sarkar S., Yong V.W. The chemokine stromal cell derived factor-1 (CXCL12) promotes glioma invasiveness through MT2-matrix metalloproteinase // Carcinogenesis. 2005. V. 26. № 12. P. 2069–2077. https://doi.org/10.1093/carcin/bgi183

  12. Клишо Е.В., Кондакова И.В., Чойнозов Е.Л. Матриксные металлопротеиназы в онкогенезе // Сиб. онкологический журн. 2003. № 2. С. 62–70.

  13. Liu H.-Q., Song S., Wang J.-H., Zhang S.-L. Expression of MMP-3 and TIMP-3 in gastric cancer tissue and its clinical significance // Oncol. Lett. 2011. V. 2. № 6. P. 1319–1322. https://doi.org/10.3892/ol.2011.399

  14. Маркелова Е.В., Здор В.В., Романчук А.Л., Бирко О.Н. Матриксные металлопротеиназы, их взаимосвязь с системой цитокинов, диагностический и прогностический потенциал // Иммунопатология, аллергология, инфектология. 2016. № 2. С. 11–22. https://doi.org/10.14427/jipai.2016.2.11

  15. Benzing C., Lam H., Tsang C.M. et al. TIMP-2 secreted by monocyte-like cells is a potent suppressor of invadopodia formation in pancreatic cancer cells // BMC Cancer. 2019. V. 19. № 1. P. 1214–1227. https://doi.org/10.1186/s12885-019-6429-z

  16. Wang K., Wang G., Huang S. et al. Association between TIMP-2 gene polymorphism and breast cancer in Han Chinese women // BMC Cancer. 2019. V. 19. № 1. P. 446–454. https://doi.org/10.1186/s12885-019-5655-8

  17. Ondruschka C., Buhtz P., Motsch C. et al. Prognostic value of MMP-2, -9 and TIMP-1,-2 immunoreactive protein at the invasive front in advanced head and neck squamous cell carcinomas // Pathol. Res. Pract. 2002. V. 198. № 8. P. 509–515. https://doi.org/10.1078/S0344-0338(04)70292-7

  18. Sharma K.L., Misra S., Kumar A., Mittal B. Higher risk of matrix metalloproteinase (MMP-2, 7, 9) and tissue inhibitor of metalloproteinase (TIMP-2) genetic variants to gallbladder cancer // Liver Int. 2012. V. 32. № 8. P. 1278–1286. https://doi.org/10.1111/j.1478-3231.2012.02822.x

  19. Рогова Л.Н., Шестернина Н.В., Замечник Т.В., Фастова И.А. Матриксные металлопротеиназы, их роль в физиологических и патологических процессах (обзор) // Вестник новых мед. технологий. 2011. Т. ХVIII. № 2. С. 86–89.

  20. Miyazaki T., Kato H., Nakajima M. et al. An immunohistochemical study of TIMP-3 expression in oesophageal squamous cell carcinoma // Br. J. Cancer. 2004. V. 91. № 8. P. 1556–1560. https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6602185

  21. Рубанович А.В., Хромов-Борисов Н.Н. Воспроизводимость и предсказательная ценность результатов в генетике предрасположенностей // Мол. медицина. 2014. № 2. С. 8–12.

  22. Rutter J.L., Mitchell T.I., Butticè G. et al. A single nucleotide polymorphism in the matrix metalloproteinase-1 promoter creates an Ets binding site and augments transcription // Cancer Res. 1998. V. 58. № 23. P. 5321–5325.

  23. Dey S., Ghosh N., Saha D. et al. Matrix metalloproteinase-1 (MMP-1) promoter polymorphisms are well linked with lower stomach tumor formation in eastern Indian population // PLoS One. 2014. V. 9. № 2. P. e88040. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088040

  24. Yu C., Zhou Y., Miao X. et al. Functional haplotypes in the promoter of matrix metalloproteinase-2 predict risk of the occurrence and metastasis of esophageal cancer // Cancer Res. 2004. V. 64. № 20. P. 7622–7628. https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-04-1521

  25. Shen W., Xi H., Wei B., Chen L. The prognostic role of matrix metalloproteinase 2 in gastric cancer: a systematic review with meta-analysis // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2014. V. 140. № 6. P. 1003–1009. https://doi.org/10.1007/s00432-014-1630-6

  26. Zhang D.Y., Wang J., Zhang G.Q. et al. Correlations of MMP-2 and TIMP-2 gene polymorphisms with the risk and prognosis of gastric cancer // Int. J. Clin. Exp. Med. 2015. V. 8. № 11. P. 20391–20401.

  27. Ye S., Eriksson P., Hamsten A. et al. Progression of coronary atherosclerosis is associated with a common genetic variant of the human stromelysin-1 promoter which results in reduced gene expression // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. № 22. P. 13055–13060. https://doi.org/10.1074/jbc.271.22.13055

  28. Dey S., Stalin S., Gupta A. et al. Matrix metalloproteinase3 gene promoter polymorphisms and their haplotypes are associated with gastric cancer risk in eastern Indian population // Mol. Carcinog. 2012. V. 51. № 1. P. E42–E53. https://doi.org/10.1002/mc.21837

  29. Zhang B., Ye S., Herrmann S.M. et al. Functional polymorphism in the regulatory region of gelatinase B gene in relation to severity of coronary atherosclerosis // Circulation. 1999. V. 99. № 14. P. 1788–1794. https://doi.org/10.1161/01.cir.99.14.1788

  30. Peng Z., Jia J., Gong W. et al. The association of matrix metalloproteinase-9 promoter polymorphisms with gastric cancer risk: a meta-analysis // Oncotarget. 2017. V. 8. № 58. P. 99024–99032. https://doi.org/10.18632/oncotarget.20931

  31. Okada R., Naito M., Hattori Y. et al. Matrix metalloproteinase 9 gene polymorphisms are associated with a multiple family history of gastric cancer // Gastric Cancer. 2017. V. 20. № 2. P. 246–253. https://doi.org/10.1007/s10120-016-0608-2

  32. Jormsjö S., Ye S., Moritz J. et al. Allele-specific regulation of matrix metalloproteinase-12 gene activity is associated with coronary artery luminal dimensions in diabetic patients with manifest coronary artery disease // Circ. Res. 2000. V. 86. № 9. P. 998–1003. https://doi.org/10.1161/01.res.86.9.998

  33. Chen S.-S., Song J., Tu X.-Y. et al. The association between MMP-12 82 A/G polymorphism and susceptibility to various malignant tumors: a meta-analysis // Int. J. Clin. Exp. Med. 2015. V. 8. № 7. P. 10845–10854.

  34. VAN Nguyen S., Skarstedt M., Löfgren S. et al. Gene polymorphism of matrix metalloproteinase-12 and -13 and association with colorectal cancer in Swedish patients // Anticancer Res. 2013. V. 33. № 8. P. 3247–3250.

  35. Pençe S., Özbek E., Ozan Tiryakioğlu N. et al. rs3918242 variant genotype frequency and increased TIMP-2 and MMP-9 expression are positively correlated with cancer invasion in urinary bladder cancer // Cell. Mol. Biol. (Noisy-le-grand). 2017. V. 63. № 9. P. 46–52. https://doi.org/10.14715/cmb/2017.63.9.9

  36. Yang L., Gu H.-J., Zhu H.-J. et al. Tissue inhibitor of metalloproteinase-2 G-418C polymorphism is associated with an increased risk of gastric cancer in a Chinese population // Eur. J. Surg. Oncol. 2008. V. 34. № 6. P. 636–641. https://doi.org/10.1016/j.ejso.2007.09.003

  37. Tsai H.-T., Hsieh M.-J., Chiou H.-L. et al. TIMP-3 ‒1296 T>C and TIMP-4 –55 T>C gene polymorphisms play a role in the susceptibility of hepatocellular carcinoma among women // Tumour Biol. 2014. V. 35. № 9. P. 8999–9007. https://doi.org/10.1007/s13277-014-2170-z

  38. Wieczorek E., Reszka E., Jablonowski Z. et al. Genetic polymorphisms in matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitors of MPs (TIMPs), and bladder cancer susceptibility // BJU Int. 2013. V. 112. № 8. P. 1207–1214. https://doi.org/10.1111/bju.12230

  39. Rahimi Z., Yari K., Rahimi Z. Matrix metalloproteinase-9 –1562T allele and its combination with MMP-2 –735C allele are risk factors for breast cancer // Asian Pac. J. Cancer Prev. 2015. V. 16. № 3. P. 1175–1179. https://doi.org/10.7314/apjcp.2015.16.3.1175

  40. Kubben F.J., Sier C.F., Meijer M.J. et al. Clinical impact of MMP and TIMP gene polymorphisms in gastric cancer // Br. J. Cancer. 2006. V. 95. № 6. P. 744–751. https://doi.org/10.1038/sj.bjc.6603307

Дополнительные материалы отсутствуют.