Генетика, 2023, T. 59, № 6, стр. 640-647

Изучение генетического разнообразия возбудителя пирикуляриоза риса Pyricularia oryzae Сav. по комплексу молекулярных и морфологических признаков

Д. В. Нартымов 1, Е. В. Дубина 12*, М. Г. Рубан 1, Ю. В. Анискина 3, С. В. Гаркуша 12, И. А. Шилов 3, Н. С. Велишаева 3, О. С. Колобова 3, Н. К. Истомин 1

1 Федеральный научный центр риса
350921 Краснодар, пос. Белозерный, Россия

2 Кубанский государственный аграрный университет им. И.Т. Трубилина
350044 Краснодар, Россия

3 Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии
127550 Москва, Россия

* E-mail: lenakrug1@rambler.ru

Поступила в редакцию 28.09.2022
После доработки 29.11.2022
Принята к публикации 16.12.2022

Аннотация

На основе молекулярно-генетических подходов проведено изучение биоразнообразия фитопатогенного гриба Pyricularia oryzae Cav. на юге России и проведена классификация морфолого-культуральных и генетических признаков патогена. За 2020–2022 гг. проведен мониторинг и выделено 24 штамма патогена из пораженного гербарного материала, собранного с полей пяти экологических рисосеющих зон Краснодарского края (Красноармейского, Калининского, Абинского, Славянского районов, Краснодар). С использованием мультиплексной системы ПЦР на основе фрагментного анализа среди изученных штаммов Pyricularia oryzae Cav. за весь период выполнения проекта выявлено пять генотипов, каждый из которых характеризуется уникальным генетическим профилем. Составлены их “ДНК-паспорта”. Изученные изоляты возбудителя пирикуляриоза охарактеризованы по морфолого-культуральным признакам. Выделено шесть морфотипов патогена.

Ключевые слова: генетическое биоразнообразие, фитопатогенные грибы, пирикуляриоз (Pyricularia oryzae Cav.), патотип, штаммы, SSR-локусы, ПЦР, ДНК-паспорта.

Список литературы

  1. Дубина Е.В., Харченко Е.С., Серая Л.И. и др. База данных “Штаммы патοгена Рyriсulаriа oryzае Саv. юга Pοссии”. 2019. Свидетельствο № 2019620149.

  2. Фролова В.С., Коваленко Е.Д., Наскидашвили Ж.Г. и др. Методические указания по оценке устойчивости сортообразцов риса к пирикуляриозу в инфекционном питомнике. М.: ВАСХНИЛ, 1983. 14 с.

  3. Nartymov D., Dubina E., Kharitonov E. et al. Zoning of rice growing territory of Krasnodar region by the set of features of Pyricularia oryzae Cav. isolation // BIO Web of Conferences. 2022. V. 51. 04006. 9 c. https://doi.org/10.1051/bioconf/20225104006

  4. Nartymov D., Kharitonov E., Dubina E. et al. Studying of cultural properties of Pyricularia oryzae Cav. strains in the south of Russia // Microbiol. Res. 2021. V. 12. № 1. P. 21–28. https://doi.org/10.3390/microbiolres1201000310.3390/ microbiolres12010003

  5. Истомин Н.К., Нартымов Д.В., Дубина Е.В. и др. Изучение наиболее оптимальных методов кластеризации морфологических и культуральных признаков // Научно-практ. журн. “Рисоводство”. 2021. № 3(52). С. 22–26. https://doi.org/10.33775/1684-2464-2021-52-3-22-26

Дополнительные материалы отсутствуют.