Генетика, 2023, T. 59, № 7, стр. 850-854

Пилотное исследование по выявлению репертуаров гамма-цепи T-клеточных рецепторов у пациентов с ювенильной формой шизофрении

М. Ю. Плотникова 12*, А. Д. Патрикеев 1, А. Ю. Левченко 4, О. Ю. Федоренко 5, Т. В. Андреева 123, Е. И. Рогаев 123

1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
119991 Москва, Россия

2 Центр генетики и наук о жизни, Университет “Сириус”
354340 Краснодарский край, пгт. Сириус, Россия

3 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
119991 Москва, Россия

4 Институт трансляционной биомедицины Санкт-Петербургского государственного университета
199034 Санкт-Петербург, Россия

5 Научно-исследовательский институт психического здоровья Томского национального исследовательского медицинского центра
634014 Томск, Россия

* E-mail: plotnikova.m.u.1996@gmail.com

Поступила в редакцию 12.12.2022
После доработки 09.03.2023
Принята к публикации 10.03.2023

Аннотация

Нарушение функции иммунной системы и нейровоспаление, предполагается, могут играть роль в патогенезе шизофрении. При этом роль адаптивного иммунитета на сегодняшний день мало изучена. Данная работа является пилотным исследованием в выявлении разнообразия репертуаров Т‑клеточных рецепторов гамма-цепи при шизофрении. В рамках проведенного исследования была апробирована методология выявления иммунных репертуаров Т-клеточных рецепторов (ТКР) гамма-цепи с использованием глубокого секвенирования, на примере нескольких пациентов с ювенильной формой шизофрении. Были выявлены профили клонотипов, оценено их разнообразие и предполагаемые отличия в структуре CDR3-региона TRG (T Cell Receptor Gamma Locus) функциональных клонов у пациентов с ювенильной формой шизофрении по сравнению с контрольными индивидами. Данный подход представляется перспективным для дальнейшего изучения изменений в адаптивной иммунной системе на репрезентативных когортах больных с различными формами шизофрении.

Ключевые слова: шизофрения, NGS, Т-клеточные рецепторы, иммуногенетические факторы, CDR3 TRG, клонотипы.

Список литературы

  1. Perälä J., Suvisaari J., Saarni S.I. et al. Lifetime prevalence of psychotic and bipolar I disorders in a general population // Arch. Gen. Psychiatry. 2007. V. 64. № 1. P. 19–28. https://doi.org/10.1001/ARCHPSYC.64.1.19

  2. Vallée A. Neuroinflammation in Schizophrenia: The key role of the WNT/β-catenin pathway // Int. J. Mol. Sci. 2022. V. 23. № 5. https://doi.org/10.3390/IJMS23052810

  3. Ushakov V.L., Malashenkova I.K., Kostyuk G.P. et al. The relationship between inflammation, cognitive disorders and neuroimaging data in schizophrenia // Zh. Nevrol. i Psih. im. S.S. Korsakova. 2020. V. 120. № 11. P. 70–78. https://doi.org/10.17116/JNEVRO202012011170

  4. Mikocziova I., Greiff V., Sollid L.M. Immunoglobulin germline gene variation and its impact on human disease // Genes Immun. 2021. V. 22. № 4. P. 205–217. https://doi.org/10.1038/S41435-021-00145-5

  5. Upthegrove R., Manzanares-Teson N., Barnes N.M. Cytokine function in medication-naive first episode psychosis: A systematic review and meta-analysis // Schizophr. Res. Elsevier. 2014. V. 155. № 1–3. P. 101–108. https://doi.org/10.1016/J.SCHRES.2014.03.005

  6. Fernandes B.S., Steiner J., Bernstein H.G. et al. C-reactive protein is increased in schizophrenia but is not altered by antipsychotics: Meta-analysis and implications // Mol. Psychiatry. 2015. V. 21. № 4. P. 554–564. https://doi.org/10.1038/MP.2015.87

  7. Rodrigues-Amorim D., Rivera-Baltanás T., Spuch C. et al. Cytokines dysregulation in schizophrenia: A systematic review of psychoneuroimmune relationship // Schizophr. Res. Elsevier. 2018. V. 197. P. 19–33. https://doi.org/10.1016/J.SCHRES.2017.11.023

  8. Langerak A.W., Groenen P.J.T.A., Brüggemann M. et al. EuroClonality/BIOMED-2 guidelines for interpretation and reporting of Ig/TCR clonality testing in suspected lymphoproliferations // Leukemia. 2012. V. 26. № 10. P. 2159–2171. https://doi.org/10.1038/LEU.2012.246

  9. Aliseychik M., Patrikeev A., Gusev F. et al. Dissection of the human T-cell receptor γ gene repertoire in the brain and peripheral blood identifies age- and Alzheimer’s disease-associated clonotype profiles // Front. Immunol. 2020. V. 11. https://doi.org/10.3389/FIMMU.2020.00012/PDF

  10. Bolotin D.A., Poslavsky S., Mitrophanov I. et al. MiXCR: Software for comprehensive adaptive immunity profiling // Nat. Methods. 2015. V. 12. № 5. P. 380–381. https://doi.org/10.1038/NMETH.3364

  11. Shugay M., Bagaev D., Turchaninova M.A. et al. VDJtools: Unifying post-analysis of T-cell receptor repertoires // PLoS Comput. Biol. 2015. V. 11. № 11. P. e1004503. https://doi.org/10.1371/JOURNAL.PCBI.1004503

  12. Ravens S., Schultze-Florey C., Raha S. et al. Human γδ T cells are quickly reconstituted after stem-cell transplantation and show adaptive clonal expansion in response to viral infection // Nat. Immunol. 2017. V. 18. № 4. P. 393–401. https://doi.org/10.1038/NI.3686

Дополнительные материалы отсутствуют.