1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Генетика
  4. T. 59, № 7, 2023

Генетика, 2023, T. 59, № 7, стр. 804-812

Генетическое разнообразие речной выдры (Lutra lutra) европейской части России и стран Закавказья (по данным полиморфизма фрагмента мтДНК)

Н. А. Соколова 1, *, Н. П. Кораблев 2, П. Н. Кораблев 3, Х. А. Эрнандес-Бланко 1, Г. А. Калоян 4, А. А. Гёнджян 4, А. Г. Малхасян 5, П. А. Сорокин 1

1 Институт проблем экологии и эволюции им А.Н. Северцова Российской академии наук
119071 Москва, Россия

2 Государственный природный заповедник “Полистовский”
182840 Псковская область, пос. Бежаницы, Россия

3 Центрально-Лесной государственный природный биосферный заповедник
172521 Тверская область, пос. Заповедный, Россия

4 Научный центр зоологии и гидроэкологии Национальной академии наук Республики Армения
0014 Ереван, Армения

5 Армянский филиал Всемирного фонда дикой природы
0019 Ереван, Армения

* E-mail: nadezhdasklva@gmail.com

Поступила в редакцию 17.01.2023
После доработки 27.02.2023
Принята к публикации 02.03.2023

Аннотация

Проведен анализ генетической структуры группировок выдры европейской части России (ЕЧР) и ее сравнение с известной по литературным данным генетической структурой выдры в Европе. Проанализированы данные на основе гаплотипов фрагмента контрольного региона мтДНК (255 пн), в том числе представленных в NCBI. Для выборки (N = 75) из европейской части России описано шесть гаплотипов мтДНК. 62.1% животных принадлежат общему европейскому гаплотипу, 17.6% – гаплотипу, отмеченному в Великобритании и Финляндии, остальные четыре гаплотипа описаны впервые. Гаплотипическое разнообразие для выборки по России и Закавказью составило h = 0.56 ± 0.054, нуклеотидное разнообразие π = 0.0016 ± 0.002. При увеличении длины фрагмента мтДНК до 820 пн у выдр из ЕЧР наблюдается увеличение как гаплотипического разнообразия h до 0.85 ± 0.03, так и нуклеотидного π = 0.002 ± 0.001, число гаплотипов увеличилось до 14. Географическое распределение гаплотипов не зависит ни от региона, ни от системы рек. Имеется как центральный гаплотип, распространенный по всей ЕЧР, так и второстепенные, объединяющие меньшее число регионов. Таким образом, генетическое разнообразие выдры ЕЧР выше, чем в Европе, при этом структура популяций повторяет общеевропейский паттерн, но с региональными особенностями.

Ключевые слова: Lutra lutra, митохондриальная ДНК, контрольный регион, генетическое разнообразие, европейская часть России.

Список литературы

  1. Гимранов Д.О., Косинцев П.А. Географическое распределение морфотипов зубов речной выдры (Carnivora, Mustelidae, Lutra lutra L., 1758) в Северной Евразии // ДАН. 2012. Т. 443. № 1. С. 130–139. https://doi.org/10.1134/S0012496612020019

  2. http://www.ohotcontrol.ru/resource/number/

  3. Красная книга Российской Федерации. Животные. 2-е изд. М.: ВНИИ Экологии, 2021. 1128 с.

  4. Туманов И.Л. Редкие хищные млекопитающие России (мелкие и средние виды). СПб.: Бранко, 448 с.

  5. Mucci N., Pertoldi C., Madsen A.B. et al. Extremely low mitochondrial DNA control region sequence variation in the otter Lutra lutra population of Denmark // Heredity. 1999. V. 130. № 3. P. 331–336.

  6. Ferrando A., Ponsà M., Marmi J., Domingo-Roura X. Eurasian otters, Lutra lutra, have a dominant mtDNA haplotype from the Iberian Peninsula to Scandinavia // J. Heredity. 2004. V. 95. № 5. P. 430–435. https://doi.org/10.1093/jhered/esh066

  7. Kalz B., Jewgenow K., Fickel J. Structure of an otter (Lutra lutra) population in Germany-results of DNA and hormone analyses from faecal samples // Mamm. Biol. 2006. V. 71. № 6. P. 321–335. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2006.02.010

  8. Finnegan L.A., Néill L.Ó. Mitochondrial DNA diversity of the Irish otter, Lutra lutra, population // Conserv. Gen. 2010. V. 11. № 4. P. 1573–1577. https://doi.org/10.1007/s10592-009-9955-4

  9. Lanszki J., Hidas A., Szentes K. et al. Genetic structure of otter (Lutra lutra) populations from two fishpond systems in Hungary // Mamm. Biol. 2010. V. 75. № 5. P. 447–450. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2009.09.006

  10. Stanton D.W.G., Hobbs G.I., Chadwick E.A. et al. Mitochondrial genetic diversity and structure of the European otter (Lutra lutra) in Britain // Conserv. Gen. 2009. V. 10. № 3. P. 733–737. https://doi.org/10.1007/s10592-008-9633-y

  11. Mucci N., Arrendal J., Ansorge H. et al. Genetic diversity and landscape genetic structure of otter (Lutra lutra) populations in Europe // Conserv. Gen. 2010. V. 11. № 2. P. 583–599. https://doi.org/10.1007/s10592-010-0054-3

  12. Geboes A.L., Rosoux R., Lemarchand C. et al. Genetic diversity and population structure of the Eurasian otter (Lutra lutra) in France // Mamm. Res. 2016. V. 61. № 2. P. 121–129. https://doi.org/10.1007/s13364-015-0258-5

  13. Honnen A.C., Roos A., Stjernberg T., Zachos F.E. Genetic analysis of Eurasian otters (Lutra lutra) reveals high admixture in Finland and pronounced differentiation in Sweden // Mamm. Biol. 2015. V. 80. № 1. P. 47–53. https://doi.org/10.1016/j.mambio.2014.09.005

  14. Jo Y.S., Won C.M., Jung J. Testing microsatellite loci and preliminary genetic study for Eurasian otter in South Korea // J. Spec. Research. 2012. V. 1. № 2. P. 240–248. https://doi.org/10.12651/JSR.2012.1.2.240

  15. Cassens I., Tiedeman R., Suchentrunk F., Hartle G.B. Brief communication. mitochondrial DNA variation in the European otter (Lutra lutra) and the use of spatial autocorrelation analysis in conservation // J. Hered. 2000. V. 91. № 1. P. 31–35. https://doi.org/10.1093/jhered/91.1.31

  16. Рожнов В.В., Ячменникова А.А., Найденко С.В. и др. Мониторинг переднеазиатского леопарда и других крупных кошек. М.: Тов-во науч. изд. КМК, 2018. 121 с.

  17. Bandelt H.J., Forster P., Röhl A. Median-joining networks for inferring intraspecific phylogenies // Mol. Biol. Evol. 1999. V. 16. № 1. P. 37–48. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a026036

  18. Leigh J.W., Bryant D. PopART: Full-feature software for haplotype network construction // Methods Ecol. Evol. 2015. V. 6. № 9. P. 1110–1116 https://doi.org/10.1111/2041-210X.12410

  19. Excoffier L., Lischer H.E.L. Arlequin suite ver. 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows // Mol. Ecol. Res. 2010. V. 10. P. 564–567.

  20. Pérez-Haro M., Vinas J., Manas F. et al. Genetic variability in the complete mitochondrial control region of the Eurasian otter (Lutra lutra) in the Iberian Peninsula // Biol. J. Linnean Soc. 2005. V. 86. № 4. P. 397–403.

  21. Sommer R., Benecke N. Late and post glacial history of the Mustelidae in Europe // Mamm. Rev. 2004. V. 34. № 4. P. 249–284.

  22. Данилов П.И., Туманов И.Л. Куньи Северо-Запада СССР. Л.: Наука, 1976. 256 с.

  23. Гептнер В.Г., Наумов Н.П., Юргенсон П.Б. Млекопитающие СССР. Т. 2. Морские коровы и хищные. М.: Высш. шк., 1967. С. 553–584.

  24. Барышников Г.Ф., Пузаченко А.Ю. Краниометрическая изменчивость речной выдры (Lutra lutra: Carnivora: Mustelidae) в Cеверной Евразии // Тр. ЗИН РАН. 2012. Т. 316. № 3. С. 203–222. https://doi.org/10.31610/trudyzin/2012.316.3.203

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Генетика

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал