1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Генетика
  4. T. 59, № 9, 2023

Генетика, 2023, T. 59, № 9, стр. 1048-1058

Генетическая структура русской верховой породы лошадей

Э. А. Николаева 1, *, В. Н. Воронкова 1, М. А. Политова 2, Е. В. Рябова 3, В. А. Демин 3, Ю. А. Столповский 1

1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук
119991 Москва, Россия

2 Всесоюзный научно-исследовательский институт племенного дела
141212 пос. Лесные Поляны, Московская область, Россия

3 Российский аграрный университет им. К.А. Тимирязева (МСХА)
127434 Москва, Россия

* E-mail: nickolaevaelina@gmail.com

Поступила в редакцию 13.03.2023
После доработки 17.04.2023
Принята к публикации 18.04.2023

Аннотация

С помощью 17 микросателлитных локусов, рекомендованных ISAG, исследовано 166 лошадей русской верховой породы. Для сравнительного анализа генетического разнообразия и современной кластеризации были использованы данные микросателлитного полиморфизма 34 европейских пород – 7874 особи (Mendeley database). По уровню аллельного богатства русская верховая имеет высокие значения – 5.4 аллеля на микросателлитный локус. Всего в породе обнаружено 122 аллеля, в том числе приват-аллель 14 в локусе HTG7. Выявлена популяционно-генетическая структура для русской верховой, арабской, ахалтекинской, немецкой верховой и чистокровной верховой. Кластеризация пород лошадей на круговой дендрограмме, полученной методом UPGMA, выявила шесть основных кластеров. При анализе методом PCA русская верховая образует единую группу с немецкими верховыми и чистокровными английскими лошадьми. При использовании программы STRUCTURE (K = 3) породы разделились на три популяционные структуры: 1) арабская; 2) русская верховая, ахалтекинская, чистокровная верховая; 3) немецкая полукровная. Анализ дифференциации между породами (Fst) показал наибольшие различия между всеми породами и ахалтекинской породой лошадей, наименьшее отличие (Fst = 0.22) – между русской верховой и немецкой верховой. Различия по каждой паре пород были достоверны (p-value < 0.001).

Ключевые слова: лошадь, Equus caballus, микросателлитный анализ, генетическое разнообразие, русская верховая порода.

Список литературы

  1. Парфенов В.А., Спицина Н., Тхинвалели Г.Г. Особенности селекционных процессов в работе с русской верховой породой лошадей // Коневодство и конный спорт. 2011. № 3. С. 5–8.

  2. Храброва Л.А., Блохина Н.В. Генетический мониторинг чистокровной верховой породы лошадей по локусам микросателлитов ДНК // Генетика и разведение животных. 2018. № 3. С. 11–16.

  3. Политова М.А. Работоспособность лошадей русской верховой породы в выездке в 2017–2020 гг. и факторы, ее определяющие // Коневодство и конный спорт. 2021. № 5. С. 31–33. https://doi.org/10.25727/HS.2021.5.60372

  4. Политова М.А., Дорофеева А.В. Сравнительная характеристика методик оценки спортивной работоспособности лошадей по результатам выступлений в выездке // Изв. С.-Петербургского гос. аграр. ун-та. 2021. № 1 (62). С. 146–154.

  5. Никитина Д.А. Анализ распределения по типам высшей нервной деятельности лошадей русской верховой породы Старожиловского конного завода, с учетом их происхождения // Аграрная наука. 2011. № 7. С. 26–27.

  6. Райсманн М., Политова М., Вагнер Х.Й. Молекулярно-генетический анализ мастей в популяциях русской верховой и немецкой верховой пород // Abstracts 3 Intern. Iran and Russia Conf. “Agriculture and Natural Resources”. Сб. докл. М., 2002. С. 41.

  7. Политова М.А, Райсманн М., Вагнер Х.Й. Влияние генотипа в локусах MC1R (Extension) и ASIP (Agouti) на работоспособность и плодовитость лошадей русской верховой породы // Докл. ТСХА. 2003. Вып. 275. С. 476–479.

  8. Калинкова Л.В. Изучение полиморфизма генов ASIP и MC1R у лошадей арабской породы // Генетика и разведение животных. 2020. № 2. С. 50–53.

  9. Rieder S., Taourit S., Mariat D. et al. Mutations in the agouti (ASIP), the extension (MC1R), and the brown (TYRP1) loci and their association to coat color phenotypes in horses (Equus caballus) // Mamm. Genome. 2001. V. 12. № 6. P. 450–455. https://doi.org/10.1007/s003350020017

  10. Воронкова В.Н. Оценка генетического разнообразия лошадей Саяно-Алтайского региона с использованием ядерных и митохондриальных ДНК маркеров: Автореф. дис. … канд. биол. наук. М: ИОГен РАН, 2012. 152 с.

  11. Чебуранова Е.С., Епишко О.А., Горчаков Н.А. и др. Разработка мультилокусной системы по STR-локусам для молекулярно-генетической паспортизации лошадей // Сельское хоз-во – проблемы и перспективы. 2016.

  12. Калашников В.В., Дергунова М.М., Зайцев М.А. и др. Дополнительные возможности метода ДНК-анализа в коневодстве // Farm. Animals. 2013. № 3–4. P. 72–74.

  13. van de Goor L.H.P., van Haeringen W.A., Lenstra J.A. Population studies of 17 equine STR for forensic and phylogenetic analysis // Animal Genet. 2011. V. 42. № 6. P. 627–633. https://doi.org/10.1111/j.1365-2052.2011.02194.x

  14. Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: Simplifying basic population genetic analyses in R // Meth. in Ecol. and Evolution. 2014. V. 5. № 4. P. 384–387. https://doi.org/10.1111/2041-210X.12158

  15. El Mousadik A., Petit R.J. High level of genetic differentiation for allelic richness among populations of the argan tree (Argania spinosa (L.) Skeels) endemic to Morocco // Theor. Applied Genet. 1996. V. 92. № 7. P. 832–839.

  16. Foulley J.L., Ollivier L. Estimating allelic richness and its diversity // Livestock Sci. 2006. V. 101. № 1–3. P. 150–158. https://doi.org/10.1016/j.livprodsci.2005.10.021

  17. Животовский Л.А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 270 с.

  18. Sievert C. Interactive web-based data visualization with R, plotly, and shiny. N.Y.: CRC Press, 2020. 470 p. https://doi.org/10.1201/9780429447273

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Генетика

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал