Микробиология, 2022, T. 91, № 6, стр. 769-771

Микоцинотипирование некоторых “самостоятельных” видов рода Candida

В. И. Голубев *

Всероссийская коллекция микроорганизмов (ВКМ), Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина, ФИЦ Пущинский научный центр биологических исследований РАН
142290 Пущино, Московская обл., Россия

* E-mail: wig@ibpm.pushchino.ru

Поступила в редакцию 23.02.2022
После доработки 15.03.2022
Принята к публикации 11.04.2022

Полный текст (PDF)

Аннотация

Изученные типовые штаммы филогенетически обособленных (“самостоятельных”) видов Candida нечувствительны к микоцинам семи родов аскоспоровых дрожжей, часть из которых активны против типовых штаммов С. albicans, C. parapsilosis и C. tropicalis. Полученные данные могут быть полезны для оценки таксономического положения видов дрожжей обширного полифилетического рода Candida.

Ключевые слова: микоцинотипирование, филогения, самостоятельные (unaffiliated) виды

Род Candida Berkhout включает около 300 видов аскомицетных дрожжевых грибов (Lachance et al., 2011), у которых не достигнуто образования аскоспор, что может быть обусловлено рядом причин: незнанием условий, индуцирующих и способствующих их формированию, гетероталлизмом или наличием мутаций, блокирующих этот процесс. В ряде случаев удалось индуцировать спорообразование, и было доказано, что виды Candida являются аспорогенными вариантами (анаморфами) аскоспорообразующих видов (телеоморф) известных родов. Так, например, установлено, что C. pulcherrima (Lindner) Windisch является анаморфой Metschnikowia pulcherrima Pitt et Miller, а C. valida (Leberle) van Uden et Buckley – Pichia membranifaciens (Hansen) Hansen.

На близость подавляющего большинства ас-порогенных видов Candida к известным аскоспоровым родам указывают и результаты филогенетического анализа на основе фрагментов генов рРНК (Lachance et al., 2011). Так, например, патогенный вид C. glabrata (Anderson) Meyer et Yarrow входит в филогенетический кластер рода Nakaseomyces Kurtzman, а C. albicans (Robin) Berkhout близок к видам рода Lodderomyces van der Walt. Однако имеется сравнительно небольшое число “самостоятельных” (unaffiliated) видов в составе рода Candida, которые образуют обособленные филогенетические группы, не примыкая ни к одному из известных родов. Эти виды весьма гетерогенны по морфологическим, физиолого-биохимическим и хемотаксономическим характеристикам. Например, одна из таких групп “самостоятельных” видов Candida была описана в качестве нового рода Diutina (Khunnamwong et al., 2015).

Ранее было установлено, что штаммы дрожжевых грибов могут секретировать антифунгальные белковые вещества, микоцины (киллер-токсины) (Golubev, 2006). Несмотря на то, что спектры действия разных микоцинов различаются, для большинства из них отмечена таксономическая специфичность: обычно они подавляют культуры, филогенетически близкие к микоциногенным штаммам и неактивны в отношении культур, филогенетически удаленные от продуцентов микоцинов (Golubev, 2006; Голубев, 2021). При этом синонимы, анаморфы и телеоморфы одного вида обычно демонстрируют практически идентичные спектры чувствительности (Голубев, 2021). Было также показано, что виды Candida, филогенетически близкие к определенным родам аскоспоровых дрожжей, сходны с видами таких родов по чувствительности к определенным микоцинам (Голубев, 2021).

Исходя из сказанного, можно полагать, что “самостоятельные” (unaffiliated) виды Candida, скорее всего, нечувствительны к микоцинам, которые действуют на клинически значимые виды дрожжей. Соответственно, микоцинотипирование, выполненное в стандартных условиях с использованием релевантных микоцин-образующих штаммов, может быть полезно для предварительного разделения анаморфных морфологически и физиологически сходных аскомицетовых дрожжей и их отнесения к филогенетически удаленным видам.

Для проверки этого предположения на чувствительность к микоцинам были проверены 15 культур, включая типовые штаммы 11 “самостоятельных” видов Candida и носителей их синонимов (табл. 1). Микоциногенные штаммы включали представителей 9 видов из 7 родов аскоспоровых дрожжей (табл. 2), в том числе, Wickerhamomyces Kurtzman et al. и других родов, показавших активность в отношении типовых штаммов клинически значимых видов C. tropicalis (Castellani) Berkhout, C. albicans (Robin) Berkhout и C. parapsilosis (Ashford) Langeron et Talice (Голубев, 2015). Все использованные в работе штаммы получены из ВКМ.

Таблица 1.

Исследованные типовые штаммы “самостоятельных” видов Candida

Название вида Номер штамма
Candida anutae Bab’eva et al. BKM Y-2868
C. aurita Polyakova et Chernov BKM Y-2910
C. blankii Buckley et van Uden BKM Y-2100
   Syn. C. hydrocarbofumarica Yamada et al. BKM Y-2603
C. entomophila Scott et al. BKM Y-2181
C. incommunis Ohara et al. BKM Y-1515
C. insectalens (Scott et al.) Meyer et Yarrow BKM Y-2588
C. sake (Saito et Oda) van Uden et Buckley ex Meyer et Ahearn BKM Y-124
   Syn. Torula lambica Kufferath BKM Y-700
   Syn. C. salmonicola Komagata et Nakase BKM Y-1463
   Syn. C. vanriji Capriotti BKM Y-1499
C. savonica Sonck BKM Y-2187
C. silvanorum van der Walt et al. BKM Y-2185
C. sophiae-reginae Ramirez et Gonzalez BKM Y-2638
C. sorboxylosa Nakase BKM Y-2076
Таблица 2.

Использованные микоциногенные штаммы

Название вида Номер штамма
Hanseniaspora uvarum (Niehaus) Shehata et al. ex Smith BKM Y-132
Kluyveromyces lactis (Dombrowski) van der Walt BKM Y-1186
Ogataea pini (Holst) Yamada et al. BKM Y-899
Pichia membranifacins (Hansen) Hansen BKM Y-898
Schizosaccharomyces pombe Lindner BKM Y-1912
Starmera quercuum (Phaff et Knapp) Kurtzman et al. BKM Y-1287T
Wickerhamomyces anomalus (Hansen) Kurtzman et al. BKM Y-140, BKM Y-159, BKM Y-1086T
W. ciferri (Lodder) Kurtzman et al. BKM Y-169T
W. silvicola (Wickerham) Kurtzman et al. BKM Y-178T

Примечание. Т: типовой штамм.

Для тестирования использовали среду с 0.05 М цитрат-фосфатным буфером (рН 4.5) следующего состава (г/л): глюкоза – 5, пептон – 2.5, дрожжевой экстракт – 2, NaCl – 30, агар – 20. На поверхность этой среды наносили 0.05 мл клеточной суспензии (105 кл./мл) обследуемой 2‒3-суточной культуры, выращенной на сусло-агаре, и тщательно растирали шпателем. Затем штрихом наносили обильный инокулюм 5‒6-суточной культуры микоциногенного штамма. Засеянные таким образом чашки инкубировали при 18°С до появления роста газона, который должен быть равномерным и сплошным, но не обильным.

Результаты эксперимента показали, что все типовые штаммы обследованных видов Candida и носителей синонимов (табл. 1) нечувствительны к микоцинам, секретируемым использованными в работе культурами аскоспоровых дрожжей (табл. 2). Полученные в настоящей работе данные предполагают, что одна из основных причин нечувствительности рассматриваемых видов Candida сразу к нескольким и разным микоцинам ‒ их филогенетическая отдаленность от продуцентов данных микоцинов. Эти “самостоятельные” (unaffiliated) виды являются, по-видимому, представителями еще неописанных родов дрожжей.

Список литературы

  1. Голубев В.И. Микцинотипирование видов Cyberlindnera // Микробиология. 2021. Т. 90. С. 223‒225.

  2. Golubev W.I. Mycocinotyping of Cyberlindnera species // Microbiology (Moscow). 2021. V. 90. P. 226‒228.

  3. Голубев В.И. Антифунгальная активность Wickerhamomyces silvicola // Микробиология. 2015. Т. 84. С. 529‒535.

  4. Golubev W.I. Antifungal activity of Wickerhamomyces silvicola // Microbiology (Moscow). 2015. V. 84. P. 610‒615.

  5. Golubev W.I. Antagonistic interactions among yeasts // Biodiversity and Ecophysiology of Yeasts / Eds. Rosa C.A., Peter G. Berlin: Springer-Verlag, 2006. P. 197‒219.

  6. Khunnaamwong P., Lertwattanasakul N., Jindamorakot S., Limtong S., Lachance M.-A. Description of Diutina gen. nov., Diutina siamensis f.a. sp. nov., and reassignment of Candida catenulate, Candida mesorugosa, Candida neorugosa, Candida pseudorugosa, Candida ranongensis, Candida rugosa and Candida scorzettiae to the genus Diutina // Int. J. System. Evol. Microbiol. 2015. V. 65. P. 4701‒4709.

  7. Lachance M.-A., Boekhout T., Scorzetti G., Fell J.W., Kurtzman C. Candida Berkhout (1923) // The Yeasts. A Taxonomic Study. 5th ed. Vol. 2 / Eds. Kurtzman C.P., Fell J.W., Boekhout T. London: Elsevier. 2011. P. 987‒1278.

Дополнительные материалы отсутствуют.