Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. T. 44, Номер 1, 2026

  1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология
  4. T. 44, № 1, 2026

Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2026, T. 44, № 1, стр. 3-18

ПОИСК ВАКЦИН И ТЕРАПЕВТИЧЕСКИХ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ПРОТИВ РАКА

Е. П. Харченко *

ФГБУН “Институт эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова” РАН
194223 Санкт-Петербург, Россия

* E-mail: neuro.children@mail.ru

Поступила в редакцию 31.08.2025
После доработки 09.10.2025
Принята к публикации 09.10.2025

Аннотация

В статье кратко рассматриваются особенности иммунной системы при канцерогенезе и причины утраты ею надзора над раком. Для поиска в первичной структуре белков, ассоциированных с раком, нонапептидов (иммунных эпитопов), распознаваемых главным комплексом гистосовместимости типа I, предложен биоинформационный подход. Он принципиально отличается от других биоинформативных инструментов определения иммунных эпитопов тем, что дифференциация пептидов построена на учете их первичной структуры, что невозможно учесть при использовании методов, основанных на использовании физико-химических характеристик аминокислот. В качестве полезного этапа дизайна вакцины может быть компьютерное моделирование процессинга белков в иммунопротеосомах, позволяющее предвидеть вероятность сохранности иммунного эпитопа для презентации его Т-клеткам. Анализируются проблемы в поисках вакцин и критически оценивается возможность создания универсальной вакцины против разных типов рака на основе общих для них антигенов, так как невозможно представить в одной вакцине многообразие мозаик мутационных изменений каждого пациента и синтезировать, например, мРНК, как наиболее приемлемую форму вакцины для дизайна универсальной вакцины, без нарушения ограничений в ее синтаксисе. Оценены перспективы и проблемы использования терапевтических нуклеиновых кислот (малые интерферирующие РНК, микроРНК, антисмысловые олигонуклеотиды, мРНК, аптомеры CRISPR-Cas9 система редактирования гена) против рака, расширяющих возможности химиотерапии и вакцинологии.

Ключевые слова: рак, вакцины, терапевтические нуклеиновые кислоты, иммуноэпитопы, процессинг антигенов, меланома

Список литературы

  1. Zitvogel L., Tesniere A., Kroemer G. Cancer despite immunosurveillance: immunoselection and immunosubversion. Nat. Rev. Immunol. 2006; 6: 715–727. https://doi.org/10.1038/nri1936

  2. Pradeu T., Carosella E.D. On the definition of a criterion of immunogenicity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2006; 103: 17858–17863. https://doi.org/10.1073/pnas.0608683103

  3. Plotkin S.A. Correlates of protection induced by vaccination. Clin. Vaccine Immunol., 2010; 17: 1055–1065.// PMID: 20463105.

  4. Dunn G.P., Lloyd O.J., Schreiber R.D. The immunobiology of cancer immunosurveillance and immunoediting Immunity. 2004; 21: 137–148. PMID: .15308095

  5. Харченко E.П. Канцерогенез: иммунная система и иммунотерапия. Иммунология. 2011; 32 (1): 50–56. Kharchenko EP. Carcinogenesis: the immune system and immunotherapy. Immunology. 2011; 32 (1): 50–56. (in Russ.).

  6. Mellor A.L., Munn D.H. The tumor-draining lymph node as an immune-privileged site. Immunological Reviews. 2006: 213: 5–11. https://doi.org/10.1111/j.1600-065X.2006.00444.x

  7. Curiel T.J. Tregs and rethinking cancer immunotherapy.J.Clin.Invest. 2007; 117: 1167–1174. https://doi.org/10.1172/JCI31202

  8. Joyce J.A., Pollard J.W. Microenvironmental regulation of metastasis. Nat. Rev. Cancer. 2009; 9: 239–252.https://doi.org/10.1038/nrc2618

  9. Rabinovich G.A., Gabrilovich D., Sotomayor E.M. Immunosuppressive strategies that are mediated by tumor cells. Annu. Rev. Immunol. 2007; 25: 267–296. https://doi.org/10.1146/annurev.immunol.25.022106.141609

  10. Swann J.B., Smyth M.J. Immune surveillance of tumors. J. Clin. Invest. 2007; 117: 1137–1146. https://doi.org/10.1172/JCI31405

  11. Zou W. Immunosuppressive networks in the tumour environment and their therapeutic relevance. Nat. Rev. Cancer. 2005; 5: 263–274. https://doi.org/10.1038/nrc1586

  12. Yuan Yuan, Fan Gao, Ying Chang, Qiu Zhao, Xingxing He. Advances of mRNA vaccine in tumor: a maze of opportunities and challenges. Biomarker Research. 2023; 11: 6. https://doi.org/10.1186/s40364-023-00449-w

  13. Chang L.S., Barroso-Sousa R., Tolaney S.M., Hodi F.S., Kaiser U.B., Le Min. Endocrine toxicity of cancer immunotherapy targeting immune checkpoints. Endocr Rev. 2019; 40(1): 17–65. https://doi.org/10.1210/er.2018-00006

  14. György B., Szabó T.G., Pásztói M., Pál Z., Misják P., Aradi B., László V., Pállinger E., Pap E., Kittel A., Nagy G., Falus A., Buzás E.I. Membrane vesicles, current state-of-the-art: emerging role of extracellular vesicles. Cell. Mol. Life Sci. 2011; 68: 2667–2688. https://doi.org/10.1007/s00018-011-0689-3

  15. Peters B., Nielsen M., Sette A. T Cell Epitope Predictions. Annu. Rev. Immunol. 2020; 38: 123–145. https://doi.org/10.1146/annurev-immunol-082119-124838

  16. Ahn R., Yufei Cui, White F.M. Antigen discovery for the development of cancer immunotherapy Seminars in Immunology. 2023; 66: 101733. https://doi.org/10.1016/j.smim.2023.101733

  17. Харченко Е.П. Новый метод распознавания иммуноэпитопов, маркеры долговременного иммунитета, иммуносупрессивные домены и вакцины против COVID-19. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2022; 21(1): 4–20. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-1-4-20. Kharchenko E.P. Novel Method of Immunoepitope Recognition, Long-Term Immunity Markers, Immunosuppressive Domens and Vaccines against COVID-19. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2022; 21(1): 4–20 (In Russ.). 10.31631/2073-3046-2022-21-1-4-20

  18. Харченко Е.П. Проблемы и коллизии вакцинологии. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2023; 22(6): 183–200. Kharchenko E.P. Problems and Collisions of Vaccinology. Epidemiology and Vaccinal Prevention. 2023; 22(6): 183–200. (In Russ.).https://doi.org/10.31631/2073-3046-2023-22-6-183-200 35.

  19. Joglekar A.V., Li G. T cell antigen discovery. Nature Methods. 2020. https://doi.org/10.1038/s41592-020-0867-z

  20. Харченко Е.П. Иммуноэпитопный континуум родства белков, полиреактивность и аутореактивность антител. Медицинская иммунология. 2015; 17(4): 335–346. Kharchenko E.P. Immune epitope continuum of the protein relationships, poly- and autoreactivity of antibodies”, Medical Immunology (Russia). Meditsinskaya Immunologiya. 2015; 17(4): 335–346.https://doi.org/10.15789/1563-0625-2015-4-335-346

  21. Ohta S., Misawa A., Kyi-Tha-Thu C., Matsumoto N., Hirose Y., Kawakami Y. Melanoma antigens recognized by T cells and their use for immunotherapy. Experimental Dermatology. 2023; 32: 297–305. https://doi.org/10.1111/exd.14741

  22. Rabiner L.R. A tutorial on hidden Markov models and selected applications in speech recognition. Proceedings of the IEEE. 1989; 77: 257–286.

  23. Харченко Е.П. Частные и общие ограничения в кодировании генов и синонимическое рекодирование их. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2024; 42(1): 43–49. Kharchenko E.P. Particular and General Limitations in Gene Coding and Synonymous Recoding of Genes. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2024; 42(1): 43–49 (In Russ.). https://doi.org/10.17116/molgen20244201143

  24. Харченко Е.П. мРНК: организация синтаксиса. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2025; 43(2): 14–27. Kharchenko E.P. mRNA: syntax organization. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2025; 43(2): 14–27. (In Russ.).https://doi.org/10.17116/molgen20254302114

  25. Кудряева А.А., Белогуров А.А. Протеасома: наномашинерия созидательного Успехи биологической химии. 2019; 59: 323–392. Kudriaeva A.A., Belogurov A.A. Proteasome: nanomachineery of the creative Progress of biological chemistry. 2019; 59:323–392 (In Russ.).

  26. Goloudina A., Le Chevalier F., Authié P., Charneau P., Majlessi L. Shared neoantigens for cancer immunotherapy. Mol Ther Oncol. 2025. PMID: 40256120.

  27. Magoola M., Niazi S.K. Engineering Universal Cancer Immunity: Non-Tumor-Specific mRNA Vaccines Trigger Epitope Spreading in Cold Tumors. Vaccines (Basel). 2025 Sep 12; 13(9): 970. doi: : 41012173https://doi.org/10.3390/vaccines13090970.PMID

  28. Kozlov M. People with some cancers live longer after a COVID vaccine. Nature. 2025 Oct 22. Online ahead of print. PMID: 41125927No abstract available.https://doi.org/10.1038/d41586-025-03432-7

  29. Qdaisat S., Wummer B., Stover B.D., Zhang D., McGuiness J., Weidert F., Chardon-Robles J., Grippin A., DeVries A., Zhao C., Marconi C., Karachi A., Xie C., Jobin G., Liu R., Michel S., Ma X., Moor R.S.F., von Roemeling C., Nguyen D.T., Elliott L., Thomas N., Barpujari A., Geffrard H., Campaneria Y., Ogando-Rivas E., Rabideau C., Soni D., Huang J., Carrera-Justiz S., Fredenburg K., Silver N.L., Sawyer W.G., Rahman M., Ligon J.A., Flores C.T., Lee J.H., Mitchell D.A., Castillo P., Mendez-Gomez H.R., Sayour E.J. Sensitization of tumours to immunotherapy by boosting early type-I interferon responses enables epitope spreading. Nat Biomed Eng. 2025 Sep; 9(9): 1437–1452. Epub 2025 Jul 18.PMID: 40681861.https://doi.org/10.1038/s41551-025-01380-1

  30. Харченко Е.П. Иммуноэпитопный континуум родства белков и полиреактивность и аутореактивность антител. Медицинская иммунология. 2015; 17: 335–346. Kharchenko E.P. (2015). Immune Epitope continuum of the protein relationships, poly- and autoreactivity of antibodies. Meditsinskaya Immunologiya. 2015; 17: 335–346. (In Russ.) https://doi.org/10.15789/1563-0625-2015-4-335-346

  31. Liu Y., Wang C., Fu X., Ren M. The Progress and Evolving Trends in Nucleic-Acid-Based Therapies. Biomolecules. 2025; 15: 376. https://doi.org/10.3390/ biom15030376

  32. Lee M., Lee M., Song Y., Kim S., Park N. Recent Advances and Prospects of Nucleic Acid Therapeutics for Anti-Cancer Therapy. Molecules. 2024; 29: 4737. https://doi.org/10.3390/molecules29194737

  33. Zhang L., Lou W., Wang J. Advances in nucleic acid therapeutics: structures, delivery systems, and future perspectives in cancer treatment. Clinical and Experimental Medicine. 2024; 24: 200. https://doi.org/10.1007/s10238-024-01463-4

  34. Sun X., Setrerrahmane S., Li C., Hu J., Xu H. Nucleic acid drugs: recent progress and future perspectives. Signal Transduction and Targeted Therapy. 2024; 9: 316. https://doi.org/10.1038/s41392-024-02035-4

  35. Miller A.M., Koşaloğlu-Yalçın Z., Westernberg L., Montero L., Bahmanof M., Frentzen A., Lanka M., Logandha Ramamoorthy Premlal A., Seumois G., Greenbaum J., Brightman S.E., Soria Zavala K., Thota R.R., Naradikian M.S., Makani S.S., Lippman S.M., Sette A., Cohen E.E.W., Peters B., Schoenberger S.P. A functional identification platform reveals frequent, spontaneous neoantigen-specific T cell responses in patients with cancer. Sci. Transl. Med. 2024; 16: eabj9905. https://doi.org/10.1126/scitranslmed.abj9905

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска содержание выпуска

Молекулярная генетика, микробиология и вирусология

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал