Молекулярная биология, 2022, T. 56, № 3, стр. 510-515

Новые аналоги уридина как возможные противовирусные агенты, специфичные к SARS-CoV-2

А. А. Маслова a*, Е. С. Матюгина a, Е. Ю. Шустова b, В. П. Волок b, Л. И. Козловская bc, С. Н. Кочетков a, А. Л. Хандажинская a

a Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
119991 Москва, Россия

b Федеральный научный центр исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М.П. Чумакова Российской академии наук (Институт полиомиелита)
108819 Москва, Россия

c Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Cеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский университет)
119435 Москва, Россия

* E-mail: maslova_anna94@mail.ru

Поступила в редакцию 24.11.2021
После доработки 06.12.2021
Принята к публикации 07.12.2021

Аннотация

Разработка лекарственных средств против SARS-CoV-2 – важнейшая задача, стоящая перед мировой наукой и здравоохранением. На сегодняшний день основным подходом к созданию средств, эффективных при COVID-19, остается репозиционирование, т.е. перепрофилирование препаратов, допущенных к клиническому применению, например, Ремдесивира (препарат против лихорадки Эбола), Фавипиравира (против гриппа) и др. Однако очевидно, что эти препараты недостаточно специфичны и эффективны. Другой перспективный подход предполагает создание новых молекул, однако нужно отметить, что реализация этого подхода требует гораздо больше времени и затрат. Тем не менее, продолжается поиск новых противовирусных агентов, специфичных к SARS-CoV-2. Цель нашей работы состояла в получении новых 5-замещенных производных уридина – потенциальных ингибиторов РНК-зависимой РНК-полимеразы коронавируса. Такие вещества получены с высоким выходом по реакции Сузуки–Мияуры и охарактеризованы с помощью современных физико-химических методов. Однако тестирование антивирусной активности этих веществ в отношении SARS-CoV-2 не выявило существенного ингибиторного эффекта.

Ключевые слова: коронавирус, SARS-CoV-2, аналоги нуклеозидов, флексимеры, реакция Сузуки–Мияура

Список литературы

  1. Cascella M., Rajnik M., Aleem A., Dulebohn S., Di Napoli R. (2021). Features, evaluation, and treatment of coronavirus (COVID-19). StatPearls.

  2. Santos I.A., Grosche V.R., Bergamini F.R.G., Sabino-Silva R., Jardim A.C.G. (2020) Antivirals against coronaviruses: candidate drugs for SARS-CoV-2 treatment? Front. Microbiol. 11, 1818.

  3. Lei T., Qiang T., Liang C., Ren X., Jia M., Zhang J., Li J., Wan M., YuWen X., Li H., Cao W., Liu H. (2021) RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) inhibitors: The current landscape and repurposing for the COVID-19 pandemic. Eur. J. Med. Chem. 213, 113201.

  4. Cannalire R., Cerchia C., Beccari A.R., Di Leva F.S., Summa V. (2020) Targeting SARS-CoV-2 proteases and polymerase for COVID-19 treatment: state of the art and future opportunities. J. Med. Chemi. acs.jmedchem.0c01140. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.0c01140

  5. De Clercq E., Neyts J. (2009) Antiviral agents acting as DNA or RNA chain terminators. Antiviral Strategies. 189, 53‒84.

  6. Buonaguro L., Tagliamonte M., Tornesello M.L., Buonaguro F.M. (2020) SARS-CoV-2 RNA polymerase as target for antiviral therapy. J. Transl. Med. 18(1), 185. https://doi.org/10.1186/s12967-020-02355-3

  7. Ju J., Li X., Kumar S., Jockusch S., Chien M., Tao C., Morozova I., Kalachikov S., Kirchdoerfer R.N., Russo J.J. (2020) Nucleotide analogues as inhibitors of SARS-CoV polymerase. Pharmacol. Res. Perspect. 8(6), e00674.

  8. Al-Horani R.A., Kar S. (2020) Potential anti-SARS-CoV-2 therapeutics that target the post-entry stages of the viral life cycle: a comprehensive review. Viruses. 12(10), 1092‒1134.

  9. Zhou S., Hill C.S., Sarkar S., Tse L.V., Woodburn B.M.D., Schinazi R.F., Sheahan T.P., Baric R.S., Heise M.T., Swanstrom R. (2021). β-DN 4-hydroxycytidine (NHC) inhibits SARS-CoV-2 through lethal mutagenesis but is also mutagenic to mammalian cells. J. Infect. Dis. 224(3), 415‒419.

  10. Seley-Radtke K. (2018) Flexibility – not just for yoga anymore! Antivir. Chem. Chemother. 26, 2040206618756788.

  11. Матюгина Е.С., Новиков М.С., Козловская Л.И., Волок В.П., Шустова Е.Ю., Ишмухаметов А.А., Кочетков С.Н., Хандажинская А.Л. (2021). Оценка противовирусного потенциала модифицированных гетероциклических оснований и 5′-норкарбоциклических аналогов нуклеозидов в отношении SARS-CoV-2. Acta Naturae, 13(4), 51‒54.

  12. Peters H.L., Jochmans D., de Wilde A.H., Posthuma C.C., Snijder E.J., Neyts J., Seley-Radtke K.L. (2015). Design, synthesis and evaluation of a series of acyclic fleximer nucleoside analogues with anti-coronavirus activity. Bioorg. Med. Chem. Lett25(15), 2923‒2926.

  13. Zimmermann S.C., Sadler J.M., O’Daniel P.I., Kim N.T., Seley-Radtke K.L. (2013) “Reverse” carbocyclic fleximers: synthesis of a new class of adenosine deaminase inhibitors. Nucleosides, Nucleotides Nucl. Acids32(3), 137‒154.

  14. Polshettiwar V., Decottignies A., Len C., Fihri A. (2010) Suzuki–Miyaura cross-coupling reactions in aqueous media: green and sustainable syntheses of biaryls. ChemSusChem: Chemistry & Sustainability Energy & Materials. 3(5), 502–522.

  15. Shaughnessy K.H. (2015). Palladium-catalyzed modification of unprotected nucleosides, nucleotides, and oligonucleotides. Molecules. 20(5), 9419–9454.

  16. Western E.C., Daft J.R., Johnson E.M. 2nd, Gannett P.M., Shaughnessy K.H. (2003) Efficient one-step Suzuki arylation of unprotected halonucleosides, using water-soluble palladium catalysts. J. Org. Chem68(17), 6767–6774.

  17. Okamoto A., Inasaki T., Saito I. (2005) Synthesis and ESR studies of nitronyl nitroxide-tethered oligodeo-xynucleotides. Tetrahedron Lett46(5), 791–795.

  18. Fresneau N., Hiebel M.A., Agrofoglio L.A., Berteina-Raboin S. (2012). Efficient synthesis of unprotected C-5-aryl/heteroaryl-2'-deoxyuridine via a Suzuki–Miyaura reaction in aqueous media. Molecules17(12), 14409–14417.

Дополнительные материалы отсутствуют.