Молекулярная биология, 2022, T. 56, № 6, стр. 1083-1084
Генетическая и молекулярная характеристика гена, гомологичного криптохрому DASH, из антарктических диатомей Phaeodactylum tricornutum ICE-H
M. L. An a, *, J. L. Miao b, c, d, e, **
a Rizhao Polytechnic, Department of Marine Technology
276826 Shandong, Rizhao, China
b First Institute of Oceanography, Ministry of Natural Resource
266061 Shandong, Qingdao, China
c Laboratory for Marine Drugs and Bioproducts of Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology
266237 Qingdao, China
d Qingdao Key Laboratory of Marine Natural Products Research and Development
266237 Qingdao, China
e Guangxi Academy of Sciences
530007 Nanning, China
* E-mail: rubyhawthorn@163.com
** E-mail: miaojinlai@fio.org.cn
Поступила в редакцию 21.04.2022
После доработки 01.07.2022
Принята к публикации 05.07.2022
- EDN: VTUWIM
- DOI: 10.31857/S0026898422060027
Аннотация
Криптохромы типа DASH (cry-DASH) относятся к семейству криптохромов/фотолиаз (CPF), которое включает фотолиазы, способные восстанавливать повреждения ДНК, вызванные ультрафиолетовым излучением, и криптохромы, действующие как фоторецепторы без фоторепарационной активности. Однако недавно показано, что cry-DASH может восстанавливать циклобутанпиримидиновые димеры (CPDs) в поврежденной одноцепочечной ДНК (оцДНК). До настоящего времени криптохромы исследовали у прокариот и эукариот, в то время как особенности и роль cry-DASH антарктических диатомей не анализировали. В представленной работе последовательность мРНК cry-DASH антарктического диатомового растения Phaeodactylum tricornutum ICE-H (Pticry-DASH) была извлечена из данных транскриптома этой водоросли, амплифицирована с помощью ОТ-ПЦР, клонирована, а затем экспрессирована в Escherichia coli. Филогенетический анализ показал, что последовательность Pticry-DASH наиболее близка cry-DASH. Экспрессия гена, кодирующего Pticry-DASH, в условиях абиотического стресса исследована методом количественной ПЦР с обратной транскрипцией (qRT-PCR). Значительное накопление транскриптов выявлено после воздействия ультрафиолетового излучения синего света, высокоинтенсивного излучения и высокой температуры. После экспрессии в E. coli белок Pticry-DASH выделили, очистили и оценили его активность. Эксперименты по фотореактивации подтвердили, что Pticry-DASH может восстанавливать CPDs в повреждениях оцДНК. Таким образом, впервые cry-DASH идентифицирован в антарктической диатомовой водоросли. Свойства и особенности Pticry-DASH, включая ультрафиолет-индуцированную функцию восстановления CPDs, могут способствовать эксплуатации ресурсов Антарктики.
Статья представлена авторами на английском языке.
Список литературы отсутствует.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Молекулярная биология