Молекулярная биология, 2022, T. 56, № 6, стр. 914-914

Pseudomonas putida KT2440 ‒ это метаболически универсальная бактерия со значительными перспективами в качестве основного штамма для производства и переработки сложных органических соединений. В отличие от большинства бактерий, P. putida KT2440 кодирует белки Ku и LigD, участвующие в негомологичном соединении концов (NHEJ). Этот путь восстановления двухцепочечных разрывов (DSB) в ДНК обладает мутагенным потенциалом, который может быть использован в сочетании с доступными в настоящее время инструментами редактирования генома, генерирующими программируемые DSB. В этой работе мы исследовали эффект делеции или сверхэкспрессии NHEJ-ассоциированных ферментов P. putida KT2440 на мутациях, генерируемых при репарации Cas9-опосредованных DSB, с двойной целью ‒охарактеризовать NHEJ и изучить, как он функционально взаимодействует с текущим “золотым стандартом” редактирования генов. Результаты нашей работы проливают свет на нематричные механизмы репарации DSB у P. putida KT2440. Представленная информация послужит основой для расширения инструментария генной инженерии этого важного микроорганизма.