Молекулярная биология, 2023, T. 57, № 3, стр. 537-538

Поиск прогностических маркеров гепатоцеллюлярной карциномы с помощью интеллектуального анализа текстов и данных

Z. H. Yang a, S. X. Wang b*

a School of Criminal Law, East China University of Political Science and Law
200042 Shanghai, China

b Department of Transfusion, Minhang Hospital, Fudan University
201199 Shanghai, China

* E-mail: 2021110083@ecupl.edu.cn

Поступила в редакцию 20.04.2022
После доработки 15.09.2022
Принята к публикации 14.10.2022

Аннотация

Транскатетерная артериальная химиоэмболизация ‒ один из интервенционных методов лечения гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК). Этот метод обычно используют для пациентов с ГЦК от промежуточной до прогрессирующей стадий. Логично предположить, что идентификация генов, связанных с ГЦК, позволит повысить результативность транскатетерной артериальной химиоэмболизации. С целью исследовать роль связанных с ГЦК генов, и предоставить достоверные доказательства лечения с применением транскатетерной артериальной химиоэмболизации мы провели комплексный биоинформатический анализ. С помощью интеллектуального анализа текста (“гепатоцеллюлярная карцинома”) и анализа данных микрочипа (GSE104580) мы получили стандартный набор генов, который проанализировали по генной онтология и Киотской энциклопедии генов и геномов (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). Значимые восемь генов, кластеризованные в сеть белок-белковых взаимодействий, выбрали для дальнейших исследований. При анализе выживаемости обнаружено, что низкая экспрессия ключевых генов тесно связана с показателем выживаемости пациентов, принимавших участие в исследовании. Для оценки корреляции между экспрессией ключевых генов и иммунной инфильтрацией опухоли использовали корреляционный анализ Пирсона. В результате идентифицировано 15 препаратов, нацеленных на семь из восьми исследованных генов, на основании чего их можно рассматривать как потенциальные лекарственные компоненты для транскатетерной артериальной химиоэмболизации при лечении ГЦК.

Ключевые слова: рак печени, гепатоцеллюлярная карцинома, транскатетерная артериальная химиоэмболизация, биоинформатический анализ, прогноз

Дополнительные материалы отсутствуют.