Вестник Военного инновационного технополиса «ЭРА», 2022, T. 3, № 1, стр. 28-29

АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНА MTHFR – rs1801133 C > T С ВЕРОЯТНОСТЬЮ РАЗВИТИЯ РАКА ЛЕГКИХ

Д. С. Деревянкин 1*, Р. М. Шаповал 1, С. С. Малышкин 1, О. В. Калюжная 1, И. В. Маркин 1, Е. А. Журбин 1

1 Военный инновационный технополис “ЭРА”
Анапа, Россия

* E-mail: era1@mil.ru

Поступила в редакцию 18.12.2021
После доработки 18.01.2022
Принята к публикации 27.01.2022

Полный текст (PDF)

Аннотация

Исследовано влияние полиморфизма гена MTHFR – rs1801133 C > T на риск развития рака легких. Для определения статистической значимости отклонений у носителей полиморфизма проведено исследование частоты встречаемости аллелей TT, CT, CC в группах пациентов, больных раком, в сравнении со здоровыми людьми. Основываясь на имеющихся данных, лица с аллелями TT или CT могут иметь повышенную восприимчивость к раку легких. Тем не менее из-за встречающихся в рассматриваемых статьях неточностей такой вывод следует воспринимать как предрасположенность к развитию болезни. В дальнейшем возможно подтверждение результатов исследования с помощью проведения отдельного исследования полиморфизма rs1801133.

ВВЕДЕНИЕ

Широкие статистические исследования рака показывают, что основная причина смертности от злокачественной карциномы у мужчин и женщин в 2020 г. – рак легких [1]. Данное заболевание относится к наиболее часто встречающемуся виду рака у мужчин и второму по частоте у женщин (после рака груди) [1, 2]. Считается, что табачный дым – основная причина формирования злокачественных новообразований легких. Однако немаловажную роль в канцерогенезе имеет генетическая предрасположенность, обусловливающая полиморфизмы генов метаболических ферментов, онкогены, гены-супрессоры опухолей [1, 2].

Метилентетрагидрофолатредуктаза (MTHFR) является ключевым ферментом в пути метаболизма фолатов, кодируемых геном MTHFR [3]. Метилентетрагидрофолатредуктаза осуществляет необратимое преобразование метаболита фолиевой кислоты 5, 10-метилентетрагидрофолиевой кислоты в 5-метилтетрагидрофолиевую кислоту и далее участвует в синтезе веществ, необходимых для биосинтеза ДНК. Полиморфизм rs1801133 C > T (генетический маркер C677T) – наиболее распространенный однонуклеотидный полиморфизм гена MTHFR. Замена тимина на цитозин в позиции 11796321 хромосомы 1 приводит к замене аминокислоты аланин на валин. Данное изменение в структуре фермента приводит к уменьшению его активности и теплоустойчивости. Многие исследователи предполагают наличие существования ассоциации между C677T и развитием рака [3].

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Для проведения исследования был проведен отбор публикаций, связанных с полиморфизмом rs1801133, из Pubmed, Web of Science, Google scholar и других источников. Для отбора работ использовали следующие критерии:

— рак легких, включая мелкоклеточный и немелкоклеточный рак, был клинически подтвержден;

— группа контроля – здоровые испытуемые без злокачественных заболеваний;

— для представленной выборки выполняется равновесие Харди–Вайнберга;

— в исследовании представлен генотип раковых больных и контрольной группы;

— исследование относилось к группе случай–контроль.

В данном исследовании выполнен анализ гетерогенности с помощью критерия I  2 для доминантной, рецессивной и гомологичной генетической модели. Обследуемые были объединены по следующим группам соответственно: TT + CT vs CC, TT vs CT + CC, ТТ vs CC. Уровень значимости принят равным 1%.

Для каждой из описанных выше совокупностей рассчитаны отношение шансов (ОШ) и его доверительный интервал (ДИ) для уровня значимости 5%.

Математические вычисления проводили в среде RStudio на языке программирования R.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

Для анализа доминантной модели полиморфизма были объединены и рассмотрены следующие группы: TT + CT vs CC. В таком случае пациенты с аллелями TT или CT имели повышенный риск развития рака легких (ОШ = 1.14, 95% ДИ: 1.01– 1.28, р-value < 0.05).

В соответствии с рецессивной генетической моделью (TT vs CT+CC) риск рака легких был значительно повышен у пациентов с аллелью TT по сравнению с группой CC + CT (ОШ = 1.26, 95% ДИ:1.08–1.48, р-value < 0.05).

В гомологичной модели (TT vs CC) повышенный риск рака легких был обнаружен у пациентов с генотипом TT по сравнению с CC (ОШ = 1.36, 95% ДИ:1.12–1.65, р-value < 0.05).

Согласно результатам исследования аллель Т увеличивает риск развития рака легких по сравнению с аллелью C. Наибольшие различия между совокупностями данных показала гомологичная генетическая модель. Различия групп в доминантной и рецессивной модели были схожи.

В силу неидеальности статистических методов и рассмотренных научных публикаций данное исследование имеет следующие ограничения. Во-первых, статистическая неоднородность (гетерогенность) наблюдалась во всех генетических моделях исследования (табл. 1). Причина этой неоднородности заключается в различной этнической принадлежности обследуемых, различающихся методах генотипирования, способах формирования контрольной выборки (популяционная выборка, выборка из лечебно-профилактических учреждений). Для устранения неоднородности данные были объединены с помощью модели случайного эффекта, что могло вносить искажения в результат. Во-вторых, при исследовании литературных данных была обнаружена значительная предвзятость авторов, указывающая, что исследования с отрицательными результатами могут быть не опубликованы.

Таблица 1.

Статистический анализ различных генетических моделей

Генетическая модель Группы I2 p-value
Доминантная TT + CTvsCC 67.9% <0.01
Рецессивная TTvsCT + CC 66.4% <0.01
Гомологичная TT vs CC 72.5% <0.01

Примечание. Гетерогенность присуща всем моделям.

Учитывая описанные ограничения, можно заключить, что актуальны дальнейший анализ публикаций и проведение экспериментальных исследований по изучению ассоциации полиморфизма C677T с развитием рака легких; при этом возможно разделение выборок по категориям, таким как пол, возраст, физическая активность, для выделения групп с наибольшим риском.

ВЫВОДЫ

Согласно статистическому анализу приведенных данных восприимчивость к раку легких может быть повышена у носителей аллеля Т по сравнению с пациентами, имеющими в генотипе аллель С (C677T). Однако из-за статистической неоднородности данных и неточностей в публикациях выводы следует делать с осторожностью. В дальнейшем возможно подтверждение результатов работы с помощью отдельного исследования влияния полиморфизма C677T на развитие рака легких.

Список литературы

  1. Brett C.B., Charles S.D. // Clin. Ches. Med. 2020. № 41. P. 1.

  2. Julie A.B., Charles A.P., Juan P.W. // Annals of Global Health. 2019. V. 85. № 1. P. 1.

  3. Zhi L., Zhan L., Irfan M. et al. // Lipids in Health and Disease. 2018. № 17. P. 93–108.

  4. Yun-hui S., Ting Z., Shan-shan L. et al. // Journal of Clinical Pulmonary Medicine. 2018. № 23. P. 621.

  5. Hao D., Yafeng W., Yuanmei C. et al. // Oncotarget. 2017. V. 8. № 66. P. 326.

  6. Zuxun C., Feifei H., Xianping Z. et al. // Journal of Chinese Practical Diagnosis and Therapy. 2016 № 28. P. 866.

  7. Ma Q., Li Y., Ji M. et al. // Chin. J. Clinicians. 2017. № 6. P. 213.

  8. Cheng Z., Wang W., Song Y. et al. // Chin. J. Tuberc. Respir. Dis. 2017. № 34. P. 57.

  9. Cui L., Yu Z., Zhang T. et al. // Pharmacogenomics. 2016. № 12. P. 797.

  10. Arslan S., Karadayi S., Yildirim M. // Mol. Biol. Rep. 2018. № 38. P. 991.

  11. Cui L., Shin M., Kim H. et al. // BMC Med. Genet. 2018. № 12. P. 28.

  12. Yao Q., Chen X., Xue J. et al. // Cancer Prev. Treat. 2017. № 37. P. 531.

  13. Yang X., Li F., Yi J. // Guangdong Med. J. 2016. № 31. P. 2375.

Дополнительные материалы отсутствуют.