Биоорганическая химия, 2020, T. 46, № 4, стр. 410-410
Структура п-хлорбензойной кислоты по данным рентгеноструктурного анализа и расчета методом DFT, а также расчет in silico молекулярного докинга кислоты с ферментом танкираза I
Doaa S El Sayed 1, Sabine Foro 2
1 Chemistry Department, Faculty of Science, Alexandria University
21321 Ibrahimia, Alexandria, P.O. box 426, Egypt
2 FB Material Wissenschaft, FG Strukturforschung, Technische Universitaet Darmstadt
D-64287 Darmstadt, Alarich-Weiss-Str. 2, Germany
Поступила в редакцию 16.01.2020
После доработки 27.01.2020
Принята к публикации 31.01.2020
Аннотация
п-Хлорбензойная кислота несет атом хлора в положении 4, где он может влиять на координацию молекулы и контролировать определенные биологические параметры, он может ингибировать действие специфического фермента в организмах. Данные рентеноструктурного анализа дают количественную информацию о ковалентных и нековалентных взаимодействиях в 3D-формате. Перекристаллизацию п-хлорбензойной кислоты проводили для удаления возможных примесей и получения ее в чистом кристаллическом виде. С помощью рентгеноструктурного анализа изучены строение и геометрические параметры молекулы. Экспериментальные данные сравнивались с расчетными для оптимизированной структуры, полученной методом вычислительного квантово-механического моделирования – теории функционала плотности (DFT). Оказалось, что структура п-хлорбензойной кислоты представляет собой димер, стабилизированный межмолекулярными водродными связями. Изучены инфракрасные спектры и проведен термический анализ этого соединения. Структурные геометрические параметры оценены с помощью метода DFT. Молекулярный докинг in silico тестируемого лиганда в ферменте танкираза I показывает наличие ряда водородных связей, взаимодействий хлора и ароматического кольца, эти расчитанные взаимодействия могут ингибировать аминокислотные активные сайты фермента танкираза I. И поэтому такое ингибирование может препятствовать некоторым видам биологической активности, и особенно – противоопухолевому эффекту.
Полный текст статьи печатается в английской версии журнала.
Список литературы отсутствует.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Биоорганическая химия