1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Биоорганическая химия
  4. T. 49, № 5, 2023

Биоорганическая химия, 2023, T. 49, № 5, стр. 537-542

Биологический микрочип для определения соматических мутаций в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2

В. О. Варачев 1, Д. А. Гуськов 2, А. П. Шехтман 2, Д. В. Рогожин 2, С. А. Поляков 1, А. В. Чудинов 1, А. С. Заседателев 1, Т. В. Наседкина 1, *

1 ФГБУН “Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта” РАН
119991 Москва, ул. Вавилова, 32, Россия

2 Российская детская клиническая больница ФГБОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России
119117 Москва, Ленинский просп., 117, Россия

* E-mail: tanased06@rambler.ru

Поступила в редакцию 08.12.2022
После доработки 13.12.2022
Принята к публикации 14.12.2022

Аннотация

Мутации в генах изоцитратдегидрогеназ 1 и 2 (IDH1 и IDH2) – важные диагностические и прогностические маркеры при целом ряде опухолей (хондроидные опухоли, опухоли головного мозга, лейкозы). Для определения мутаций в генах IDH1/2 разработан метод аллель-специфичной гибридизации на биологическом микрочипе, позволяющий определять наличие мутации в образце опухоли (хондроидные опухоли, глиобластома) и вариант нуклеотидной замены. При сравнении методов определения мутаций IDH1/2 с помощью биологического микрочипа и анализа кривых плавления с TaqMan-зондом получено полное совпадение результатов, при этом метод с использованием биочипа позволяет не только выявлять наличие мутантного генотипа, но и идентифицировать тип нуклеотидной замены без дополнительного этапа секвенирования.

Ключевые слова: изоцитратдегидрогеназа 1 и 2, мутации, глиобластома, хондроидные опухоли, диагностика, биологический микрочип

Список литературы

  1. Dang L., White D.W., Gross S., Bennett B.D., Bittinger M.A., Driggers E.M., Fantin V.R., Jang H.G., Jin S., Keenan M.C., Marks K.M., Prins R.M., Ward P.S., Yen K.E., Liau L.M., Rabinowitz J.D., Cantley L.C., Thompson C.B., Vander Heiden M.G., Su S.M. // Nature. 2009. V. 462. P. 739–744. https://doi.org/10.1038/nature08617

  2. Cairns R.A., Mak T.W. // Cancer Discov. 2013. V. 3. P. 730–741. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-13-0083

  3. Chen S., Fritchie K., Wei S., Ali N., Curless K., Shen T., Brini A.T., Latif F., Sumathi V., Siegal G.P., Cheng L. // Hum. Pathol. 2017. V. 65. P. 239–246. https://doi.org/10.1016/j.humpath.2017.05.015

  4. Hartmann C., Meyer J., Balss J., Capper D., Mueller W., Christians A., Felsberg J., Wolter M., Mawrin C., Wick W., Weller M., Herold-Mende C., Unterberg A., Jeuken J.W., Wesseling P., Reifenberger G., von Deimling A. // Acta Neuropathol. 2009. V. 118. P. 469–474. https://doi.org/10.1007/s00401-009-0561-9

  5. Agarwal S., Sharma M.C., Jha P., Pathak P., Suri V., Sarkar C., Chosdol K., Suri A., Kale S.S., Mahapatra A.K., Jha P. // Neuro Oncol. 2013. V. 15. P. 718–726. https://doi.org/10.1093/neuonc/not015

  6. Arita H., Narita Y., Matsushita Y., Fukushima S., Yoshida A., Takami H., Miyakita Y., Ohno M., Shibui S., Ichimura K. // Brain Tumor Pathol. 2015. V. 32. P. 22–30. https://doi.org/10.1007/s10014-014-0186-0

  7. Perizzolo M., Winkfein B., Hui S., Krulicki W., Chan J.A., Demetrick D.J. // Brain Pathol. 2012. V. 22. P. 619–624. https://doi.org/10.1111/j.1750- 3639.2012.00579.x

  8. Табаков Д.В., Катаргин А.Н., Строганова А.М., Сендерович А.И., Насхлеташвили Д.Р., Киселева Н.П. // Усп. мол. онкол. 2017. Т. 4. С. 53–59. https://doi.org/10.17650/2313-805X-2017-4-1-53-59

  9. Emelyanova M., Arkhipova K., Mazurenko N., Chudinov A., Demidova I., Zborovskaya I., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 2015. V. 23. P. 255–265. https://doi.org/10.1097/PAI.0000000000000084

  10. Emelyanova M., Ghukasyan L., Abramov I., Ryabaya O., Stepanova E., Kudryavtseva A., Sadritdinova A., Dzhumakova C., Belysheva T., Surzhikov S., Lyubchenko L., Zasedatelev A., Nasedkina T. // Oncotarget. 2017. V. 8. P. 52304–52320. https://doi.org/10.18632/oncotarget.17014

  11. Lee D., Suh Y.L., Kang S.Y., Park T.I., Jeong J.Y., Kim S.H. // Brain Pathol. 2013. V. 23. P. 285–293. https://doi.org/10.1111/bpa.12000

  12. Emelyanova M.A., Telysheva E.N., Orlova K.V., Ryabaya O.O., Snigiryova G.P., Abramov I.S., Mikhailovich V.M. // Cancer Genet. 2021. V. 250–251. P. 25–35. https://doi.org/10.1016/j.cancergen.2020.11.005

  13. Gryadunov D.A., Shaskolskiy B.L., Nasedkina T.V., Rubina A.Y., Zasedatelev A.S. // Acta Naturae. 2018. V. 10. P. 4–18. https://doi.org/10.32607/20758251-2018-10-4-4-18

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Биоорганическая химия

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал