Физика и химия стекла, 2022, T. 48, № 2, стр. 123-132
Кластерная самоорганизация интерметаллических систем: новые четырехслойные кластеры K339 = Tb@18@42@86@192 и трехслойные кластеры K147 = Tb@18@42@86) и K124 = 0@8@26@90 в кристаллической структуре Tb117Fe52Ge112-cF1124
В. Я. Шевченко 1, *, В. А. Блатов 2, Г. Д. Илюшин 3
1 Институт химии силикатов им. И.В. Гребенщикова РАН
199034 Санкт-Петербург, наб. Макарова, 2, Россия
2 Межвузовский научно-исследовательский центр по теоретическому материаловедению,
Самарский технический университет
443011 г. Самара, ул. Молодогвардейская, 244, Россия
3 Федеральный научно-исследовательский центр “Кристаллография и фотоника”
119333 Москва, Ленинский пр., 59, Россия
* E-mail: shevchenko@isc.nw.ru
Поступила в редакцию 11.03.2021
После доработки 30.11.2021
Принята к публикации 06.12.2021
- EDN: QRZCOU
- DOI: 10.31857/S0132665122020068
Аннотация
С помощью компьютерных методов (пакета программ ToposPro) осуществлен геометрический и топологический анализ кристаллической структуры интерметаллида Tb117Fe52Ge112-cF1124 с гигантскими значениями параметров кубической ячейки a = 28.580 Å, V = 23344.61 Å3, и пр. группой Fm-3m. Установлены 575 вариантов кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц от 3 до 8. Рассмотрены два варианта самосборки кристаллической структуры из четырехслойных кластеров-прекурсоров K339 = = Tb@18(Fe12Ge6)@42(Ge18Tb24)@86(Ge32Tb54)@192(Ge72Fe48Tb72), и двух трехслойных кластеров K147 = Tb@18(Fe12Ge6)@42(Ge18Tb24)@86(Ge32Tb54) и K124 = = 0@8Fe@26(Fe8Tb18)@90(Ge42Tb48). Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структур из новых кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
ВВЕДЕНИЕ
В двойных системах A–B [1, 2] наиболее кристаллохимически сложными структурами c гигантским числом атомов в элементарной кубической ячейке, превышающим 1000, являются кубические интерметаллиды, известные как фазы Самсона NaCd2-cF1157 [3, 4], Cu4Cd3-cF1124 [5], Mg2Al3-cF1227 [6].
В работах [7–9] с помощью компьютерных методов (пакета программ ToposPro [10]) проведен геометрический и топологический анализ указанных структур и установлено, что их образование происходит с участием двух различных наноразмерных кластеров. Для интерметаллидов NaCd2 и Mg2Al3 установлены икосаэдрический нанокластер K63 = 1@12@50 и нанокластер с внутренним полиэдром Фриауфа K61 = = 1@16@44 [7, 8]. Каркасная структура интерметаллида Cu4Cd3 формируется с участием трехслойного нанокластера K139 = 1@16@52@70 с внутренним полиэдром Фриауфа, и 86-атомного супраполиэдрического кластера K86 из восьми связанных по вершинам икосаэдров [9].
Среди тройных интерметаллидов кристаллическая структура с гигантским числом атомов в элементарной ячейке, превышающим 1000, впервые была установлена в 1987 г. для Tb117Fe52Ge112-cF1124 [11] и затем в 1991 г. для изоструктурного Pr117Co52Ge112-cF1124 [12]. В работе [13] осуществлен синтез и приведены кристаллохимические данные новых интерметаллидов семейства TR117Fe52Ge112 (TR = Gd, Dy, Ho, Er, Tm) и интерметаллида Sm117Cr52Ge112. В настоящее время известны 5 кристаллохимических семейств TR117Cr52Ge112 (TR = Nd и Sm), TR117Fe52Ge112 (TR = Y, Pr, Sm, Gd, Dy, Ho, Er, Tm, Lu), TR117Co52Ge112 (TR = Pr и Sm), TR117Ni53 –ySn112 –z (TR = Gd, Tb, Dy) и TR117Co52– xSn112 –y (TR = Pr, Sm, Gd, Tb, Dy) [1, 2].
В настоящей работе проведен геометрический и топологический анализ кристаллической структуры Tb117Fe52Ge112-cF1124. Рассмотрены два варианта самосборки кристаллической структуры с участием четырехслойных нанокластеров-прекурсоров K339 и трехслойных кластеров-прекурсоров K147 и K124. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры из кластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Работа продолжает исследования [7–9, 14–20] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением современных компьютерных методов.
МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ
Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [10]. Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т.е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома. Полученные значения координационных последовательностей атомов в 3D-сетках приведены в табл. 1, в которой также даны число и типы соседних атомов в ближайшем окружении, т.е. в первой координационной сфере атома.
Таблица 1.
Атом | Окружение | Координационные последовательности N1–N5 |
---|---|---|
Fe1 | 2Fe + 5Ge + 5Tb | 12 51 107 195 341 |
Fe2 | 1Fe + 3Ge + 6Tb | 10 43 103 202 362 |
Fe3 | 4Fe + 3Ge + 5Tb | 12 41 95 200 333 |
Fe4 | 4Fe + 6Tb | 10 51 137 248 409 |
Ge1 | 1Fe + 8Tb | 9 49 115 218 337 |
Ge2 | 1Ge + 9Tb | 10 51 112 218 355 |
Ge3 | 1Ge + 9Tb | 10 57 145 226 378 |
Ge4 | 3Fe + 3Ge + 4Tb | 10 46 98 189 319 |
Ge5 | 1Fe + 2Ge + 7Tb | 10 50 116 203 346 |
Ge6 | 4Fe + 1Ge + 5Tb | 10 38 93 189 321 |
Ge7 | 4Fe + 2Ge + 5Tb | 11 47 99 191 320 |
Ge8 | 1Fe + 1Ge + 7Tb | 9 50 113 221 375 |
Ge9 | 3Fe + 3Ge + 6Tb | 12 49 107 186 334 |
Tb1 | 3Fe + 7Ge + 7Tb | 17 51 119 229 381 |
Tb2 | 2Fe + 7Ge + 5Tb | 14 51 121 218 344 |
Tb3 | 2Fe + 6Ge + 6Tb | 14 52 125 225 364 |
Tb4 | 7Ge + 8Tb | 15 58 131 240 388 |
Tb5 | 4Fe + 5Ge + 6Tb | 15 53 127 253 387 |
Tb6 | 4Fe + 5Ge + 8Tb | 17 61 146 270 414 |
Tb7 | 12Fe + 10Ge | 22 40 100 202 286 |
Tb8 | 12Fe + 6Ge6 | 18 42 86 192 344 |
Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры интерметаллида, представленного в виде свернутого графа на кластерные единицы, приведен в работах [7–9].
САМОСБОРКА КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ Tb117Fe58Ge112-cF1124
Использованный нами метод моделирования кристаллической структуры основан на определении иерархической последовательности ее самосборки в кристаллографическом пространстве [14–20]. На первом уровне самоорганизации системы определяется механизм формирования первичной цепи структуры из нанокластеров 0-уровня, сформированных на темплатной стадии химической эволюции системы, далее – механизм самосборки из цепи микрослоя (2-ой уровень) и затем из микрослоя – трехмерного микрокаркаса структуры (3-й уровень).
Кристаллографические данные Tb117Fe58Ge112-cF1124
Пространственная группа Fm-3m (no. 225) характеризуется позициями с симметрией: m-3m (4a, 4b), –43m (8c), mmm (24d) и др.
Для атомов Tb установлены значения координационных чисел КЧ = 14 (2 атома), 15 (2 атома), 17 (2 атома), 18 и 22, для атомов Fe = 10 (2 атома) и 12 (2 атома) и атомов Ge = 9 (2 атома), 10 (5 атомов) и 11 (табл. 1).
Метод полного разложения 3D фактор-графа структуры на кластерные подструктуры был использован для определения каркас-образующих нанокластеров кристаллической структуры. Установлены 575 вариантов кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц от 3 до 8 (табл. 2). Число вариантов разложения на кластерные подструктуры с числом выделенных кластеров, равным 3, 4, 5, 6, 7 и 8, составило 11, 33, 92, 156, 170, 114.
Таблица 2.
Три структурные единицы |
Tb8(4)(1@18@42@86@192) Tb7(1)(1@22) Fe2(0)(1) |
Tb8(4)(1@18@42@86@192) Tb7(1)(1@22) Fe2(1)(1@10) |
Tb8(4)(1@18@42@86@192) Fe2(0)(1) Ge4(1)(1@10) |
Tb8(4)(1@18@42@86@192) Fe2(1)(1@10) Ge4(1)(1@10) |
Tb8(3)(1@18@42@86) Tb7(1)(1@22) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Tb7(2)(1@22@40) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(3)(1@18@42@86) Tb7(2)(1@22@40) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(3)(1@18@42@86) Ge4(1)(1@10) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(3)(1@18@42@86) Ge7(1)(1@11) Tb5(1)(1@15) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Tb7(2)(1@22@40) |
4 структурных единицы |
Tb8(1)(1@18) Tb7(2)(1@22@40) Fe2(1)(1@10) Tb4(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Tb7(2)(1@22@40) Fe2(1)(1@10) Tb4(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Tb7(1)(1@22) Ge9(1)(1@12) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Tb7(1)(1@22) Tb5(1)(1@15) Ge5(1)(1@10) |
Tb8(2)(1@18@42) Ge4(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Ge4(1)(1@10) Tb5(1)(1@15) Ge5(1)(1@10) |
Tb8(2)(1@18@42) Ge9(1)(1@12) Ge7(1)(1@11) Tb5(1)(1@15) |
Tb8(2)(1@18@42) Ge7(1)(1@11) Tb5(1)(1@15) Ge5(1)(1@10) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Tb7(1)(1@22) Ge9(1)(1@12) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Tb7(1)(1@22) Ge5(1)(1@10) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Ge4(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Ge4(1)(1@10) Ge5(1)(1@10) |
ZA1(4b)(3)(0@8@26@90) Tb8(2)(1@18@42) Ge9(1)(1@12) Ge7(1)(1@11) |
8 структурных единиц |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Ge1(1)(1@9) Ge8(0)(1) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Ge1(0)(1) Ge8(0)(1) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(0)(1) Ge9(1)(1@12) Ge1(1)(1@9) Ge8(0)(1) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(0)(1) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Ge1(1)(1@9) Ge8(0)(1) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(0)(1) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(1)(0@8) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(0)(1) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(2)(0@8@26) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(0)(1) Ge9(1)(1@12) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(1)(0@8) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(0)(1) Ge9(1)(1@12) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
ZA2(24d)(1)(0@12) ZA1(4b)(1)(0@8) Tm8(1)(1@18) Tm7(1)(1@22) Ge3(1)(1@10) Ge9(1)(1@12) Ge1(0)(1) Ge8(1)(1@9) |
Рассмотрим два основных варианта самосборки кристаллической структуры: первый – из четырехслойных кластеров-прекурсоров K339 = Tb@18@42@86@192 (рис. 1, табл. 3) и второй – из трехслойных кластеров K147 = Tb@18@42@86 (рис. 1, табл. 4) и трехслойных кластеров K124 = 0@8@26@90 (рис. 2, табл.5) с максимальной симметрией m-3m.
Таблица 3.
Нанокластер K339 | |||
---|---|---|---|
Полиэдр 1@18 | 42-атомная оболочка | 86-атомная оболочка | 192-атомная оболочка |
1 Tb8 | 12 Ge1 | 24 Ge5 | 24 Fe1 |
12 Fe3 | 6 Ge3 | 8 Ge9 | 24 Fe4 |
6 Ge6 | 24 Tb3 | 24 Tb2 | 24 Ge2 |
24 Tb4 | 24 Ge7 | ||
6 Tb6 | 24 Ge8 | ||
48 Tb1 | |||
24 Tb5 | |||
18 вершин, 48 ребер, 32 граней |
42 вершины, 120 ребер, 80 граней |
86 вершин, 228 ребер, 144 грани |
192 вершин, 492 ребер, 302 граней |
Вариант 1. Четырехслойный кластер-прекурсор K339 c центром в позиции 4a характеризуется внутренним 19-атомным полиэдром Tb@18(Fe12Ge6), 42 атомами Ge18Tb24 во второй оболочке, 86 атомами в третьей оболочке Ge32Tb54 и 192 атомами в четвертой оболочке Ge72Fe48Tb72 (табл. 3). Кластеры-прекурсоры K339 формируют слой, в пустотах которого расположены атомы-спейсеры Fe и Tb (рис. 3).
Вариант 2. Трехслойный нанокластер K124 = 0@8Fe@26(Fe8Tb18)@90(Ge42Tb48) c центром в позиции 4b характеризуется внутренним 8-атомным полиэдром 0@8Fe, 26 атомами Fe8Tb18 во второй оболочке и 90 атомами в третьей оболочке Ge42Tb48 (рис. 2). Другой трехслойный нанокластер K147 = Tb@18(Fe12Ge6)@42(Ge18Tb24)@86(Ge32Tb54) c центром в позиции 4a характеризуется внутренним 19-атомным полиэдром Tb@18(Fe12Ge6), 42 атомами Ge18Tb24 во второй оболочке и 86 атомами в третьей оболочке Ge32Tb54 (рис. 4). В пустотах каркаса из связанных кластеров K124 и K147 расположены полиэдрические кластеры K23 = Tb@22(Fe12Ge10) в позиции 8c с симметрией m-3m.
Самосборка кристаллической структуры Tb117Fe58Ge112-cF1148 из кластеров K147 и K124
Первичная цепь. Самосборка первичных цепей происходит при связывании кластеров K147 с K124 в направлении [100] (рис. 4). Расстояние между центрами кластеров соответствует половине длины вектора трансляции a/2 = 28.58 Å/2 = 14.29 Å.
Самосборка слоя. Образование микрослоя ${\text{S}}_{3}^{2}$ происходит при связывании параллельно расположенных первичных цепей в плоскости (001). На этой стадии в пустотах микрослоя происходит локализация кластеров K23 = Tb@22(Fe12Ge10) (рис. 4). Расстояние между центрами кластеров из соседних цепей в направлениях [100] и [010] соответствует длинам векторов a/2 = b/2 = 14.29 Å.
Самосборка каркаса. Микрокаркас структуры ${\text{S}}_{3}^{3}$ формируется при связывании двух микрослоев в направлении [001]. Расстояние между микрослоями определяет длину вектора трансляции c/2 = 14.29 Å.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Осуществлен геометрический и топологический анализ кристаллической структуры интерметаллида Tb117Fe58Ge112-cF1148. Рассмотрены два варианта самосборки кристаллической структуры из четырехслойных кластеров-прекурсоров K339 = Tb@18@42@86@192, и трехслойных кластеров-прекурсоров K147 = Tb@18@42@86 и K124 = 0@8@26@90. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структур из нанокластеров-прекурсоров в виде: первичная цепь → слой → каркас.
Нанокластерный анализ и моделирование самосборки кристаллических структур выполнено при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ № 19-02-00636) и Минобрнауки РФ в рамках выполнения работ по государственному заданию ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН, топологический анализ выполнен при поддержке Минобрнауки РФ в рамках государственного задания № 0778-2020-0005.
Список литературы
Inorganic crystal structure database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ), Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.
Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.
Samson S. Crystal structure of NaCd2 // Nature (London). 1962. V. 195. № 4838. P. 259–262.
Samson S. A method for the determination of complex cubic metal structures and its application to the solution of the structure of NaCd2 //Acta Cryst. 1964. V. 17. P. 491–495.
Samson S. The crystal structure of the intermetallic compound Cu4Cd3 // Acta Cryst. 1967. V. 23 P. 586–600.
Samson S. The crystal structure of the phase β-Mg2Al3 // Acta Cryst. 1965. V. 19. P. 401–413.
Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D. M. Nanocluster model of intermetallic compounds with giant unit cells: β, β'-Mg2Al3 polymorphs // Inorg. Chem. 2010. V. 49. № 4. P. 1811–1818.
Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Intermetallic compounds of the NaCd2 family perceived as assemblies of nanoclusters // Struct. Chem. 2009. V. 20. № 6. P. 975–982.
Blatov V.A., Ilyushin G.D. New Method for Computer Analysis of Complex Intermetallic Compounds and Nanocluster Model of the Samson Phase Cd3Cu4 // Crystallogr. Rep. 2010. V. 55. № 7. P. 1100–1105.
Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576–3585.
Печарский В.Л., Бодак О.И., Бельский В.К. Кристаллическая структура Tb117Fe52Ge112 // Кристаллография. 1987. Т. 32. С. 334–338.
Федина М.Ф., Бодак О.И., Печарский В.К. Взаимодействия в системе Pr–Co–Ge system // Известия АН. Неорганические материалы. 1991. Т. 27. С. 918–920.
Morozkin A.V., Seropegin Y.D., Portnoy V.K., Sviridov I.A., Leonov A.V. New ternary compounds R117Fe52Ge112 (R = Gd, Dy, Ho, Er, Tm) and Sm117Cr52Ge112 of the Tb117Fe52Ge112-type srtucture // Materials Research Bulletin. 1998. V. 33. № 6. P. 903–908.
Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Cluster Self-Organization of Intermetallic Systems: New Two-Layer Nanocluster Precursors K64 = 0@8(Sn4Ba4)@56(Na4Sn52) and K47 = = Na@Sn16@Na30 in the Crystal Structure of Na52Ba4Sn80-cF540 // Glass Physics and Chemistry. 2020. V. 46. P. 448–454.
Ilyushin G.D. Intermetallic Compounds KnMm (M = Ag, Au, As, Sb, Bi, Ge, Sn, Pb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 7. P. 1095–1105.
Ilyushin G.D. Intermetallic Compounds NakMn (M = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb): Geometrical and Topological Analysis, Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 4. P. 539–545.
Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Cluster Self-Organization of Intermetallic Systems: New Three-Layer Cluster Precursor K136 = 0@Zn12@32(Mg20Zn12)@92(Zr12Zn80) and a New Two-Layer Cluster Precursor K30 = 0@Zn6@Zn24 in the Crystal Structure of Zr6Mg20Zn128-cP154 // Glass Physics and Chemistry. 2020. V. 46. № 6. P. 455–460.
Ilyushin G.D. Intermetallic Compounds LikMn (M = Ag, Au, Pt, Pd, Ir, Rh): Geometrical and Topological Analysis, Tetrahedral Cluster Precursors, and Self-Assembly of Crystal Structures // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 2. P. 202–210.
Ilyushin G.D. Cluster Self-Organization of Intermetallic Systems: 124-Atom Cluster 0@12@32@80 and 44-Atom Cluster 0@12@32 for the Self-Assembly of Li48Na80Ga332-oF920 Crystal Structure // Crystallography Reports. 2019. V. 64. № 6. P. 857–861.
Ilyushin G.D. Symmetry and Topology Code of Cluster Crystal Structure Self-Assembly for Metal Oxides: Cs11O3-mP56, Rb(Cs11O3)-oP30, Cs(Cs11O3)-oP60, Rb3(Rb4) Cs11O3)-oP84, (Cs4)(Cs6)(Cs11O3)-hP24, Rb9O2-mP22, (Rb3)(Rb9O2)-hP28, and (Rb2O)3(Rb13)-cF176 // Russian J. Inorganic Chemistry. 2018. V. 63. № 12. P. 1590–1598.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Физика и химия стекла