Журнал физической химии, 2019, T. 93, № 12, стр. 1804-1809
Дескриптор модели структура–свойство для расчета критической температуры фазового перехода жидкость–пар с топологическими характеристиками молекул алкенов
М. Ю. Доломатов a, b, Т. М. Аубекеров a, *, О. С. Коледин a, К. Р. Ахтямова a, Э. В. Вагапова a, Э. А. Ковалева a
a Уфимский государственный нефтяной технический университет
Уфа, Россия
b Башкирский государственный университет
Уфа, Россия
* E-mail: timur_1995@inbox.ru
Поступила в редакцию 04.02.2019
После доработки 12.02.2019
Принята к публикации 12.03.2019
Аннотация
Предложена нелинейная многомерная модель для расчета критической температуры нормальных и замещенных алкенов через топологические характеристики молекулярных графов: индекса Рандича, а также индекса, учитывающего различия цис- и транс-изомеров и функции собственных значений топологической матрицы молекулы. Получен трехпараметрический дескриптор модели QSPR, который адекватно описывает критическую температуру алкенов для фазового перехода жидкость–пар; средняя абсолютная ошибка для критической температуры для ряда алкенов из 51 соединения составила 4.7. Сделан вывод, что предлагаемая модель может быть использована для расчета критической температуры в химической технологии и энергетике.
Одна из важнейших фундаментальных характеристик вещества – критическая (жидкость–пар) температура (Тс). Ее значение необходимо знать при проведении процессов в сверхкритических условиях, при решении термодинамических задач, для проведения инженерных расчетов в энергетике и т.д. Особую значимость она приобретает для прогнозирования свойств, зависящих от межмолекулярных взаимодействий. Известно [1], что значения Тс изменяются нелинейно с изменением числа углеродных атомов в молекуле даже в отдельно взятой гомологической группе. В этом и состоит сложность прогнозирования. Следует отметить, что существует группа методов [2], использующая топологические индексы (ТИ) молекул, которые разрабатывались с целью корреляции и прогнозирования широкого ряда физико-химических свойств химических веществ. Например, индексы Рандича наряду с другими дескрипторами более 25 лет с успехом применяются для прогнозирования различных свойств органических веществ [3, 4]. Известны зависимости, связывающие топологические индексы с термодинамическими свойствами [5], критическими параметрами [6], макрокинетическими параметрами процесса термолиза [7], молекулярной массой и молекулярным объемом [8], потенциалами ионизации [9], энтальпией [10] и т.п. В наших исследованиях, рассматривая индивидуальную молекулу, мы предполагаем жесткую фиксацию всех межъядерных расстояний в ее равновесной конфигурации.
В данной работе предложена модель для адекватного прогнозирования критической температуры углеводородов ряда алкенов в фазовых переходах жидкость–пар.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
Так как экспериментальная база по критическим температурам органических веществ явно недостаточна, для решения данной задачи использовано полученное эмпирическим путем нелинейное уравнение множественной регрессии. Это уравнение представляет собой модель QSPR для молекул нормальных и алкилзамещенных алкенов. Параметры подбирали по известным численным значениям рассматриваемого свойства соединений заданной выборки так, чтобы предложенная модель описывала критическую температуру как можно более точно на этой выборке.
Информацию, необходимую для построения модели, выбирали из баз данных [11–13] и справочной литературы [14, 15]. Критическую температуру рассматривали как функцию трех переменных (топологических параметров), характеризующих разветвленность и взаимное расположение атомов углерода в молекулах углеводородов. Полученное уравнение имеет вид:
(1)
${{T}_{{{\text{расч}}}}}\left( {L,\sqrt I ,\frac{\rho }{I}} \right) = {{a}_{0}} + {{a}_{1}}L + {{a}_{2}}\sqrt I + {{a}_{3}}\frac{\rho }{I},$Следует отметить, что коэффициент a0 представляет собой случайную составляющую, обусловленную влиянием на отклик ${{T}_{{{\text{расч}}}}}\left( {L,\sqrt I ,\frac{\rho }{I}} \right)$ множества неучтенных и непредсказуемых факторов, а также ошибок измерений зависимой переменной. Топологические индексы и их комбинации используются нами, так как они легко вычисляются, и с их помощью возможно решение задачи прогнозирования свойств веществ.
Топологические индексы рассчитывали по следующим формулам:
– индекс молекулярной связности (индекс Рандича) [16]
где ${{{\nu }}_{i}}$ – число ребер графа отходящих от i-й вершины; ${{{\nu }}_{j}}$ – число ребер графа отходящих от j-й вершины;– так как для алкенов характерна цис–транс-изомерия, нами был учтен индекс для характеристики различия цис- и транс-изомеров [17]
где Ci – значение, приcвоенное каждому атому углерода в молекуле, δi – сумма логарифмов значения для каждого соседнего углерода.На сегодняшний день мы не можем объяснить физический смысл арифметического корня из топологического индекса, но он применим в сочетании с другими индексами.
В табл. 1 приведены значения Ci и lg Ci, необходимые для расчета индекса, характеризующего различие цис- и транс-изомеров.
Таблица 1.
Фрагмент | Позиция двойной связи | Ci | –lg Ci |
---|---|---|---|
–CH3 | – | 1.0 | – |
–CH2– | – | 0.9 | 0.04576 |
–CH | – | 0.8 | 0.09691 |
>C< | – | 7 | 0.1549 |
CH2=; –CH= | 1C | 0.8975 | 0.04696 |
–CH = trans | 2C | 0.895 | 0.04818 |
–CH = cis | 0.910 | 0.04096 | |
–CH = trans | 3C | 0.875 | 0.05799 |
–CH = cis | 0.885 | 0.05306 |
Индекс называется полуэмпирическим, потому что значения, приписываемые атомам углерода, были основаны на результатах экспериментального хроматографического поведения молекул, измеряющих реальные электрические и стерические характеристики углерода.
Известно [18], что матрица смежности несет информацию о геометрической конфигурации молекулярного или кластерного соединения атомов вещества. Энергетические уровни электронов в молекуле являются собственными значениями ее графа [19]. Построим квадратную матрицу смежности А для МГ, т.е. переведем граф молекулы в матричную форму. Тогда характеристический полином запишем в виде
(5)
$\begin{gathered} P(\lambda ) = {{( - 1)}^{n}}\det (A - \lambda E) = \\ = \;{{\lambda }^{n}} + {{a}_{1}}{{\lambda }^{{n - 1}}} + \ldots + {{a}_{{n - 1}}}\lambda + {{a}_{n}}, \\ \end{gathered} $В данной работе мы предлагаем индекс L, который, по-нашему мнению, описывает флуктуации энергии в гомологическом ряду и представляет собой сумму квадратов собственных значений молекулярного графа [20]:
где λi – собственные значения молекулярного графа. Выбор квадратов собственных значений МГ обусловлен следствием из теоремы Сакса (Захса) [5, 6], согласно которому, сумма корней характеристического полинома (5), т.е. сумма собственных значений топологической матрицы молекулы, равна нулю. Индекс L [19] равен сумме степеней всех вершин. Индексы (2), (6) были нами рассчитаны с помощью системы компьютерной алгебры Maple 13 и языка программирования PascalABCNet.В табл. 2 приведены соответствующие индекс Рандича, индекс, учитывающий различия цис- и транс-изомеров и сумма квадратов собственных значений молекулярного графа для исследуемого ряда из 51 углеводородов.
Таблица 2.
Соединение | L | ρ | I | Соединение | L | ρ | I |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Этилен | 2 | 0.5 | 1.701 | цис-4-Метилгексен-2 | 12 | 2.937 | 5.974 |
Пропилен | 4 | 0.986 | 2.654 | 4-Метилгексен-1 | 12 | 2.917 | 5.780 |
Бутилен-1 | 6 | 1.524 | 3.463 | 4,4-Диметилпентен-1 | 12 | 2.67 | 5.543 |
Изобутен | 6 | 1.354 | 3.086 | 2,3-Миметилпентен-1 | 12 | 2.835 | 5.404 |
Пентен-1 | 8 | 2.024 | 4.271 | цис-3,4-Диметилпентен-2 | 12 | 2.809 | 5.573 |
цис-Пентен-2 | 8 | 2.026 | 4.465 | 3,4-Диметилпентен-1 | 12 | 2.807 | 5.673 |
2-Метилбутен-1 | 8 | 1.914 | 3.894 | 2,4-Диметилпентен-1 | 12 | 2.77 | 5.404 |
2-Метилбутен-2 | 8 | 1.866 | 4.039 | 2,4-Диметилпентен-2 | 12 | 2.777 | 5.548 |
Гексен-1 | 10 | 2.524 | 5.080 | 3,3-Диметилпентен-1 | 12 | 2.758 | 5.543 |
цис-Гексен-2 | 10 | 2.526 | 5.273 | 2-Этилпентен-1 | 12 | 2.975 | 5.511 |
цис-Гексен-3 | 10 | 2.564 | 5.175 | транс-Бутилен-2 | 6 | 1.488 | 3.597 |
2-Метилпентен-1 | 10 | 2.414 | 4.703 | транс-Пентен-2 | 8 | 2.026 | 4.406 |
4-Метилпентен-1 | 10 | 2.379 | 4.972 | транс-Гексен-2 | 10 | 2.526 | 5.214 |
2-Метилпентен-2 | 10 | 2.404 | 4.847 | транс-Гексен-3 | 10 | 2.564 | 5.135 |
цис-3-Метилпентен-2 | 10 | 2.427 | 4.872 | транс-3-Метилпентен-2 | 10 | 2.427 | 4.842 |
цис-4-Метилпентен-2 | 10 | 2.399 | 5.165 | транс-4-Метилпентен-2 | 10 | 2.399 | 5.107 |
2-Этилбутен-1 | 10 | 2.475 | 4.703 | транс-Гептен-2 | 12 | 3.026 | 6.023 |
2,3-Диметилбутен-1 | 10 | 2.297 | 4.595 | транс-Гептен-3 | 12 | 3.064 | 5.944 |
Гептен-1 | 12 | 3.024 | 5.888 | транс-2-Метилгексен-3 | 12 | 2.937 | 5.836 |
цис-Гептен-2 | 12 | 3.026 | 6.082 | транс-5-Метилгексен-2 | 12 | 2.882 | 5.915 |
цис-Гептен-3 | 12 | 3.064 | 5.983 | транс-3-Метилгексен-2 | 12 | 2.927 | 5.651 |
2-Метилгексен-1 | 12 | 2.914 | 5.511 | транс-3-Метилгексен-3 | 12 | 2.965 | 5.611 |
цис-2-Метилгексен-3 | 12 | 2.937 | 5.876 | транс-4-Метилгексен-2 | 12 | 2.937 | 5.915 |
цис-5-Метилгексен-2 | 12 | 2.882 | 5.974 | транс-4,4-Диметилпентен-2 | 12 | 2.699 | 5.678 |
5-Метилгексен-1 | 12 | 2.879 | 5.780 | транс-3,4-Диметилпентен-2 | 12 | 2.809 | 5.543 |
цис-3-Метилгексен-3 | 12 | 2.965 | 5.631 |
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Рассмотрим аналитическое выражение (1). В табл. 3 приведены данные, показывающие влияние каждого параметра регрессионной модели в отдельности, а также совокупное их воздействие на моделируемый показатель. Видно, что стандартная ошибка меньше абсолютной величины коэффициентов, за исключением a0, следовательно, коэффициенты значимы. Сдвиг а0 следует обсуждать как вспомогательную величину, необходимую для получения оптимальных прогнозов. t-Статистика дает более точную оценку значимости коэффициентов. Табличное значение критерия Стьюдента, соответствующее доверительной вероятности g = 0.95 и числу степеней свободы ${v}$ = n – m – 1 = 51 – 3 – 1 = 47; Tкр(0.95; 47) = 2.012.
Таблица 3.
an | an, K | σ | t-Статистика |
---|---|---|---|
a0 | –1.44102 | 24.37636 | –0.05912 |
a1 | 2.669219 | 1.700537 | 1.569634 |
a2 | 123.3845 | 15.89017 | 7.764832 |
a3 | 418.6814 | 40.45518 | 10.34927 |
Сравнивая расчетную t-статистику коэффициентов уравнения с табличным значением, заключаем, что коэффициенты a0 и а1 уравнения регрессии будут незначимы, однако, они вносят существенный вклад в уточнение расчетных данных исследуемой выборки.
Коэффициент детерминации R2 = 0.987. Для характеристики качества регрессионного уравнения был вычислен коэффициент множественной корреляции $r \simeq 0.994$ для критической температуры, подтверждающий сильную связь предложенных топологических характеристик молекулы углеводорода с ее ФХС. Для оценки статистической достоверности дескриптора использовали корреляционную поправку
где ${{S}_{r}}$ – корреляционная поправка; $r$ – коэффициент множественной корреляции; n – число исследуемых соединений. Связь нельзя считать случайной, если $\left| {\frac{r}{{{{S}_{r}}}} \geqslant 3} \right|$. Так как в нашем случае n = = 51, r = 0.994, получаем ${{S}_{{{{r}_{1}}}}} = 0.0017$ и $\left| {\frac{r}{{Sr}}} \right| = \left| {\frac{{0.994}}{{0.0017}}} \right|$ = $584.7 \geqslant 3$ для критической температуры. Следовательно, связь нельзя считать случайной, и регрессионное уравнение проходит через центр облака исходных точек.В табл. 4 приведено сравнение справочных и рассчитанных значений критической температуры алкенов, а также относительная погрешность.
Таблица 4.
Соединение | Ткр (cпр), K | Ткр (расч), K | ∆, % |
---|---|---|---|
Этилен | 282.36 | 287.89 | 1.957 |
Пропилен | 364.76 | 365.79 | 0.282 |
Бутилен-1 | 419.59 | 428.44 | 2.110 |
Изобутен | 417.9 | 415.03 | 0.687 |
Пентен-1 | 464.78 | 473.27 | 1.827 |
цис-Пентен-2 | 475.93 | 470.61 | 1.117 |
2-Метилбутен-1 | 465 | 469.18 | 0.898 |
2-Метилбутен-2 | 471 | 461.31 | 2.057 |
Гексен-1 | 504.03 | 511.37 | 1.457 |
цис-Гексен-2 | 513 | 509.14 | 0.751 |
цис-Гексен-3 | 509 | 513.38 | 0.860 |
2-Метилпентен-1 | 507 | 507.74 | 0.145 |
4-Метилпентен-1 | 496 | 500.71 | 0.949 |
2-Метилпентен-2 | 514 | 504.55 | 1.839 |
цис-3-Метилпентен-2 | 515 | 506.16 | 1.716 |
цис-4-Метилпентен-2 | 499 | 500.12 | 0.225 |
2-Этилбутен-1 | 512 | 513.17 | 0.228 |
2,3-Диметилбутен-1 | 500 | 499.03 | 0.194 |
Гептен-1 | 537.29 | 544.99 | 1.432 |
цис-Гептен-2 | 549 | 543.19 | 1.059 |
цис-Гептен-3 | 545 | 546.80 | 0.331 |
2-Метилгексен-1 | 538 | 541.62 | 0.673 |
цис-2-Метилгексен-3 | 533.58 | 538.95 | 1.007 |
цис-5-Метилгексен-2 | 538.78 | 534.15 | 0.860 |
5-Метилгексен-1 | 530.65 | 535.77 | 0.964 |
цис-3-Метилгексен-3 | 546.75 | 543.83 | 0.534 |
цис-4-Метилгексен-2 | 534.04 | 538.00 | 0.742 |
4-Метилгексен-1 | 534 | 538.52 | 0.846 |
4,4-Диметилпентен-1 | 520.28 | 522.75 | 0.476 |
2,3-Диметилпентен-1 | 532.72 | 537.07 | 0.816 |
цис-3,4-Диметилпентен-2 | 542.11 | 532.90 | 1.699 |
3,4-Диметилпентен-1 | 528.31 | 531.64 | 0.629 |
2,4-Диметилпентен-1 | 528.74 | 532.03 | 0.622 |
2,4-Диметилпентен-2 | 533.21 | 530.78 | 0.456 |
3,3-Диметилпентен-1 | 527.74 | 529.40 | 0.315 |
2-Этилпентен-1 | 543 | 546.25 | 0.599 |
транс-Бутилен-2 | 428.63 | 421.78 | 1.599 |
транс-Пентен-2 | 475.37 | 471.43 | 0.830 |
транс-Гексен-2 | 513 | 509.82 | 0.619 |
транс-Гексен-3 | 509 | 513.90 | 0.963 |
транс-3-Метилпентен-2 | 521 | 506.61 | 2.763 |
транс-4-Метилпентен-2 | 501 | 500.76 | 0.047 |
транс-Гептен-2 | 543 | 543.75 | 0.138 |
транс-Гептен-3 | 540 | 547.23 | 1.339 |
транс-2-Метилгексен-3 | 533.44 | 539.37 | 1.111 |
транс-5-Метилгексен-2 | 536.72 | 534.67 | 0.383 |
транс-3-Метилгексен-2 | 546.42 | 540.76 | 1.036 |
транс-3-Метилгексен-3 | 543.99 | 544.10 | 0.019 |
транс-4-Метилгексен-2 | 535.9 | 538.56 | 0.496 |
транс-4,4-Диметилпентен-2 | 528.63 | 523.62 | 0.948 |
транс-3,4-Диметилпентен-2 | 545.47 | 533.25 | 2.240 |
Среднее значение | 0.939 |
Для проверки прогностических возможностей дескриптора и адекватности прогноза была рассчитана критическая температура десяти замещенных алкенов, не входящих в базовый ряд. Полученные результаты приведены в табл. 5.
Таблица 5.
Соединение | Ткр (cпр), K | Ткр (расч), K | Δ, % |
---|---|---|---|
4-Метил-транс-2-гептен | 563.49 | 563.02 | 0.083 |
цис-3-Октен | 572.11 | 575.10 | 0.523 |
2,3-Диметил-1-гексен | 560.04 | 561.32 | 0.229 |
3-Этил-цис-2-гексен | 572.89 | 572.45 | 0.077 |
2-Метил-1-октен | 594 | 593.03 | 0.164 |
1-Нонен | 593.25 | 597.62 | 0.736 |
4-Метил-1-гептен | 559.87 | 563.11 | 0.578 |
транс-2-Октен | 577 | 570.56 | 1.117 |
3-Метил-цис-3-гептен | 572.89 | 571.04 | 0.324 |
2-Метил-1-нонен | 616.91 | 615.21 | 0.275 |
Таким образом, получена регрессионная модель “структура–свойство”, которая адекватно передает зависимость критической температуры от топологических параметров молекул. Полученная полуэмпирическая модель адекватно описывает критическую температуру. Средняя абсолютная ошибка не превышает 4.7. Разработанная модель может быть использована при проведении инженерных и научных расчетов критической температуры индивидуальных углеводородов. Кроме того, модель может быть использована для характеристики критических свойств многокомпонентных смесей при условии идеальности углеводородной системы, т.е. при выполнении принципов аддитивности.
Список литературы
Трапезникова Е.Ф. Разработка методов расчета физико-химических свойств углеводородов и углеводородных систем: Автореферат дис. … к.т.н. Уфа: УГНТУ, 2011. 25 с.
Федина Ю.А., Папулов Ю.Г., Виноградова М.Г. // Вестник ТвГУ. Сер. Химия. 2012. № 14. С. 160.
Красных Е.Л. // Журн. структур. химии. 2009. Т. 50. № 4. С. 629.
Химические приложения топологии и теории графов / Под ред. Р. Кинга. М.: Мир, 1987. 560 с.
Урядов В.Г., Аристова Н.В., Офицеров Е.Н. // Журн. физ. химии. 2007. Т. 81. № 5. С. 801.
Доломатов М.Ю., Шамова Н.А., Трапезникова Е.Ф. и др. // Хим. технология. 2016. Т. 17. № 1. С. 45.
Доломатов М.Ю., Кутуева А.В., Ковалева Э.А. и др. // Бутлеровские сообщения. 2018. Т. 55. № 8. С. 59.
Михайлов И.В., Шавыкин O.В., Даринский А.А и др. // Вестн. ТвГУ. Сер. Химия. 2015. № 2. С. 68.
Доломатов М.Ю., Ковалева Э.А. // Журн. структур. химии. 2015. Т. 56. № 5. С. 887.
Виноградова М.Г., Папулов Ю.Г., Папулова Д.Р. // Фундаментальные исследования. 2012. № 6. С. 490.
Доломатов М.Ю., Павлов Т.И., Аубекеров Т.М. База данных физико-химических свойств органических соединений: Б.д. 201862459 // 2017.
СhemSynthesis – база данных химических веществ. (www.chemsynthesis.com)
Сетевая база данных по физико-химическим свойствам веществ и материалов. (http://db.itp.nsc.ru. http://metalldb.susu.ac.ru)
Рид Р., Праусниц Дж., Шервуд Т. Свойства газов и жидкостей: Справочное пособие / Пер. с англ. под ред. Б.И. Соколова. 3-е изд., перераб. и доп. Л.: Химия, 1982. 592 с.
Григорьев И.С., Мейлихов Е.З. Физические величины. Справочник. М.: Энергоатомиздат, 1991. 1232 с.
Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. // Успехи химии. 1988. Т. 57. № 3. С. 337.
Heinzen V.E., Soares M.F., Yunes R.A. // J. Chromatography A. 1999. V. 849. P. 495.
Акимов О.Е. Дискретная математика: логика, группы, графы, фракталы. М.: Издатель АКИМОВА, 2005. 656 с.
Цветкович Д., Дуб М., Захс Х. Спектры графов. Теория и применение. Киев: Наукова думка, 1984. 384 с.
Доломатов М.Ю., Аубекеров Т.М. // Журн. физ. химии. 2018. Т. 92. № 3. С. 355.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Журнал физической химии