Журнал физической химии, 2019, T. 93, № 12, стр. 1804-1809

Дескриптор модели структура–свойство для расчета критической температуры фазового перехода жидкость–пар с топологическими характеристиками молекул алкенов

М. Ю. Доломатов ab, Т. М. Аубекеров a*, О. С. Коледин a, К. Р. Ахтямова a, Э. В. Вагапова a, Э. А. Ковалева a

a Уфимский государственный нефтяной технический университет
Уфа, Россия

b Башкирский государственный университет
Уфа, Россия

* E-mail: timur_1995@inbox.ru

Поступила в редакцию 04.02.2019
После доработки 12.02.2019
Принята к публикации 12.03.2019

Полный текст (PDF)

Аннотация

Предложена нелинейная многомерная модель для расчета критической температуры нормальных и замещенных алкенов через топологические характеристики молекулярных графов: индекса Рандича, а также индекса, учитывающего различия цис- и транс-изомеров и функции собственных значений топологической матрицы молекулы. Получен трехпараметрический дескриптор модели QSPR, который адекватно описывает критическую температуру алкенов для фазового перехода жидкость–пар; средняя абсолютная ошибка для критической температуры для ряда алкенов из 51 соединения составила 4.7. Сделан вывод, что предлагаемая модель может быть использована для расчета критической температуры в химической технологии и энергетике.

Ключевые слова: алкены, критическая температура, топологические индексы, собственные значения топологической матрицы

Одна из важнейших фундаментальных характеристик вещества – критическая (жидкость–пар) температура (Тс). Ее значение необходимо знать при проведении процессов в сверхкритических условиях, при решении термодинамических задач, для проведения инженерных расчетов в энергетике и т.д. Особую значимость она приобретает для прогнозирования свойств, зависящих от межмолекулярных взаимодействий. Известно [1], что значения Тс изменяются нелинейно с изменением числа углеродных атомов в молекуле даже в отдельно взятой гомологической группе. В этом и состоит сложность прогнозирования. Следует отметить, что существует группа методов [2], использующая топологические индексы (ТИ) молекул, которые разрабатывались с целью корреляции и прогнозирования широкого ряда физико-химических свойств химических веществ. Например, индексы Рандича наряду с другими дескрипторами более 25 лет с успехом применяются для прогнозирования различных свойств органических веществ [3, 4]. Известны зависимости, связывающие топологические индексы с термодинамическими свойствами [5], критическими параметрами [6], макрокинетическими параметрами процесса термолиза [7], молекулярной массой и молекулярным объемом [8], потенциалами ионизации [9], энтальпией [10] и т.п. В наших исследованиях, рассматривая индивидуальную молекулу, мы предполагаем жесткую фиксацию всех межъядерных расстояний в ее равновесной конфигурации.

В данной работе предложена модель для адекватного прогнозирования критической температуры углеводородов ряда алкенов в фазовых переходах жидкость–пар.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Так как экспериментальная база по критическим температурам органических веществ явно недостаточна, для решения данной задачи использовано полученное эмпирическим путем нелинейное уравнение множественной регрессии. Это уравнение представляет собой модель QSPR для молекул нормальных и алкилзамещенных алкенов. Параметры подбирали по известным численным значениям рассматриваемого свойства соединений заданной выборки так, чтобы предложенная модель описывала критическую температуру как можно более точно на этой выборке.

Информацию, необходимую для построения модели, выбирали из баз данных [1113] и справочной литературы [14, 15]. Критическую температуру рассматривали как функцию трех переменных (топологических параметров), характеризующих разветвленность и взаимное расположение атомов углерода в молекулах углеводородов. Полученное уравнение имеет вид:

(1)
${{T}_{{{\text{расч}}}}}\left( {L,\sqrt I ,\frac{\rho }{I}} \right) = {{a}_{0}} + {{a}_{1}}L + {{a}_{2}}\sqrt I + {{a}_{3}}\frac{\rho }{I},$
где L – сумма квадратов собственных значений матрицы смежности молекулярного графа; ρ – индекс Рандича; I – индекс, учитывающий различия цис- и транс-изомеров; аn (n = 0, …, 3) – коэффициенты модели, полученные методом наименьших квадратов, K.

Следует отметить, что коэффициент a0 представляет собой случайную составляющую, обусловленную влиянием на отклик ${{T}_{{{\text{расч}}}}}\left( {L,\sqrt I ,\frac{\rho }{I}} \right)$ множества неучтенных и непредсказуемых факторов, а также ошибок измерений зависимой переменной. Топологические индексы и их комбинации используются нами, так как они легко вычисляются, и с их помощью возможно решение задачи прогнозирования свойств веществ.

Топологические индексы рассчитывали по следующим формулам:

– индекс молекулярной связности (индекс Рандича) [16]

(2)
где ${{{\nu }}_{i}}$ – число ребер графа отходящих от i-й вершины; ${{{\nu }}_{j}}$ – число ребер графа отходящих от j-й вершины;

– так как для алкенов характерна цис–транс-изомерия, нами был учтен индекс для характеристики различия цис- и транс-изомеров [17]

(3)
$I = {\text{\;}}\mathop \sum \limits_t \,({{C}_{i}} + {{{\delta }}_{i}}),$
(4)
${{{\delta }}_{i}} = \mathop \sum \limits_{j\sim i} \,\lg {{C}_{j}},$
где Ci – значение, приcвоенное каждому атому углерода в молекуле, δi – сумма логарифмов значения для каждого соседнего углерода.

На сегодняшний день мы не можем объяснить физический смысл арифметического корня из топологического индекса, но он применим в сочетании с другими индексами.

В табл. 1 приведены значения Ci и lg Ci, необходимые для расчета индекса, характеризующего различие цис- и транс-изомеров.

Таблица 1.  

Значения Ci и lg Ci для первичных, вторичных, третичных и четвертичных атомов углерода в алканах и атомов углерода в углеродной цепи цис- и транс-алкеновых изомеров

Фрагмент Позиция двойной связи Ci –lg Ci
–CH3 1.0
–CH2 0.9 0.04576
–CH 0.8 0.09691
>C< 7 0.1549
CH2=; –CH= 1C 0.8975 0.04696
–CH = trans 2C 0.895 0.04818
–CH = cis 0.910 0.04096
–CH = trans 3C 0.875 0.05799
–CH = cis 0.885 0.05306

Индекс называется полуэмпирическим, потому что значения, приписываемые атомам углерода, были основаны на результатах экспериментального хроматографического поведения молекул, измеряющих реальные электрические и стерические характеристики углерода.

Известно [18], что матрица смежности несет информацию о геометрической конфигурации молекулярного или кластерного соединения атомов вещества. Энергетические уровни электронов в молекуле являются собственными значениями ее графа [19]. Построим квадратную матрицу смежности А для МГ, т.е. переведем граф молекулы в матричную форму. Тогда характеристический полином запишем в виде

(5)
$\begin{gathered} P(\lambda ) = {{( - 1)}^{n}}\det (A - \lambda E) = \\ = \;{{\lambda }^{n}} + {{a}_{1}}{{\lambda }^{{n - 1}}} + \ldots + {{a}_{{n - 1}}}\lambda + {{a}_{n}}, \\ \end{gathered} $
где E – единичная матрица, ${{\lambda }_{i}}$, ${{a}_{i}}$, $i = \overline {1,n} $ – корни, коэффициенты полинома соответственно. Корни характеристического полинома являются собственными значениями матрицы смежности, которые интерпретируются как хюккелевские энергетические уровни электрона в молекуле [19].

В данной работе мы предлагаем индекс L, который, по-нашему мнению, описывает флуктуации энергии в гомологическом ряду и представляет собой сумму квадратов собственных значений молекулярного графа [20]:

(6)
$L = \sum\limits_{i = 1}^n {\lambda _{i}^{2}} ,$
где λi – собственные значения молекулярного графа. Выбор квадратов собственных значений МГ обусловлен следствием из теоремы Сакса (Захса) [5, 6], согласно которому, сумма корней характеристического полинома (5), т.е. сумма собственных значений топологической матрицы молекулы, равна нулю. Индекс L [19] равен сумме степеней всех вершин. Индексы (2), (6) были нами рассчитаны с помощью системы компьютерной алгебры Maple 13 и языка программирования PascalABCNet.

В табл. 2 приведены соответствующие индекс Рандича, индекс, учитывающий различия цис- и транс-изомеров и сумма квадратов собственных значений молекулярного графа для исследуемого ряда из 51 углеводородов.

Таблица 2.  

Значения топологических индексов алкенов

Соединение L ρ I Соединение L ρ I
Этилен 2 0.5 1.701 цис-4-Метилгексен-2 12 2.937 5.974
Пропилен 4 0.986 2.654 4-Метилгексен-1 12 2.917 5.780
Бутилен-1 6 1.524 3.463 4,4-Диметилпентен-1 12 2.67 5.543
Изобутен 6 1.354 3.086 2,3-Миметилпентен-1 12 2.835 5.404
Пентен-1 8 2.024 4.271 цис-3,4-Диметилпентен-2 12 2.809 5.573
цис-Пентен-2 8 2.026 4.465 3,4-Диметилпентен-1 12 2.807 5.673
2-Метилбутен-1 8 1.914 3.894 2,4-Диметилпентен-1 12 2.77 5.404
2-Метилбутен-2 8 1.866 4.039 2,4-Диметилпентен-2 12 2.777 5.548
Гексен-1 10 2.524 5.080 3,3-Диметилпентен-1 12 2.758 5.543
цис-Гексен-2 10 2.526 5.273 2-Этилпентен-1 12 2.975 5.511
цис-Гексен-3 10 2.564 5.175 транс-Бутилен-2 6 1.488 3.597
2-Метилпентен-1 10 2.414 4.703 транс-Пентен-2 8 2.026 4.406
4-Метилпентен-1 10 2.379 4.972 транс-Гексен-2 10 2.526 5.214
2-Метилпентен-2 10 2.404 4.847 транс-Гексен-3 10 2.564 5.135
цис-3-Метилпентен-2 10 2.427 4.872 транс-3-Метилпентен-2 10 2.427 4.842
цис-4-Метилпентен-2 10 2.399 5.165 транс-4-Метилпентен-2 10 2.399 5.107
2-Этилбутен-1 10 2.475 4.703 транс-Гептен-2 12 3.026 6.023
2,3-Диметилбутен-1 10 2.297 4.595 транс-Гептен-3 12 3.064 5.944
Гептен-1 12 3.024 5.888 транс-2-Метилгексен-3 12 2.937 5.836
цис-Гептен-2 12 3.026 6.082 транс-5-Метилгексен-2 12 2.882 5.915
цис-Гептен-3 12 3.064 5.983 транс-3-Метилгексен-2 12 2.927 5.651
2-Метилгексен-1 12 2.914 5.511 транс-3-Метилгексен-3 12 2.965 5.611
цис-2-Метилгексен-3 12 2.937 5.876 транс-4-Метилгексен-2 12 2.937 5.915
цис-5-Метилгексен-2 12 2.882 5.974 транс-4,4-Диметилпентен-2 12 2.699 5.678
5-Метилгексен-1 12 2.879 5.780 транс-3,4-Диметилпентен-2 12 2.809 5.543
цис-3-Метилгексен-3 12 2.965 5.631        

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Рассмотрим аналитическое выражение (1). В табл. 3 приведены данные, показывающие влияние каждого параметра регрессионной модели в отдельности, а также совокупное их воздействие на моделируемый показатель. Видно, что стандартная ошибка меньше абсолютной величины коэффициентов, за исключением a0, следовательно, коэффициенты значимы. Сдвиг а0 следует обсуждать как вспомогательную величину, необходимую для получения оптимальных прогнозов. t-Статистика дает более точную оценку значимости коэффициентов. Табличное значение критерия Стьюдента, соответствующее доверительной вероятности g = 0.95 и числу степеней свободы ${v}$ = nm – 1 = 51 – 3 – 1 = 47; Tкр(0.95; 47) = 2.012.

Таблица 3.  

Коэффициенты модели (1), стандартная ошибка (σ) и t-статистика для расчета критической температуры алкенов

an an, K σ t-Статистика
a0 –1.44102 24.37636 –0.05912
a1 2.669219 1.700537 1.569634
a2 123.3845 15.89017 7.764832
a3 418.6814 40.45518 10.34927

Сравнивая расчетную t-статистику коэффициентов уравнения с табличным значением, заключаем, что коэффициенты a0 и а1 уравнения регрессии будут незначимы, однако, они вносят существенный вклад в уточнение расчетных данных исследуемой выборки.

Коэффициент детерминации R2 = 0.987. Для характеристики качества регрессионного уравнения был вычислен коэффициент множественной корреляции $r \simeq 0.994$ для критической температуры, подтверждающий сильную связь предложенных топологических характеристик молекулы углеводорода с ее ФХС. Для оценки статистической достоверности дескриптора использовали корреляционную поправку

(7)
${{S}_{r}} = \frac{{1 - {{r}^{2}}}}{{\sqrt {n - 1} }},$
где ${{S}_{r}}$ – корреляционная поправка; $r$ – коэффициент множественной корреляции; n – число исследуемых соединений. Связь нельзя считать случайной, если $\left| {\frac{r}{{{{S}_{r}}}} \geqslant 3} \right|$. Так как в нашем случае n = = 51, r = 0.994, получаем ${{S}_{{{{r}_{1}}}}} = 0.0017$ и $\left| {\frac{r}{{Sr}}} \right| = \left| {\frac{{0.994}}{{0.0017}}} \right|$ = $584.7 \geqslant 3$ для критической температуры. Следовательно, связь нельзя считать случайной, и регрессионное уравнение проходит через центр облака исходных точек.

В табл. 4 приведено сравнение справочных и рассчитанных значений критической температуры алкенов, а также относительная погрешность.

Таблица 4.  

Сравнение справочных и расчетных значений критических температур алкенов

Соединение Ткр (cпр), K Ткр (расч), K ∆, %
Этилен 282.36 287.89 1.957
Пропилен 364.76 365.79 0.282
Бутилен-1 419.59 428.44 2.110
Изобутен 417.9 415.03 0.687
Пентен-1 464.78 473.27 1.827
цис-Пентен-2 475.93 470.61 1.117
2-Метилбутен-1 465 469.18 0.898
2-Метилбутен-2 471 461.31 2.057
Гексен-1 504.03 511.37 1.457
цис-Гексен-2 513 509.14 0.751
цис-Гексен-3 509 513.38 0.860
2-Метилпентен-1 507 507.74 0.145
4-Метилпентен-1 496 500.71 0.949
2-Метилпентен-2 514 504.55 1.839
цис-3-Метилпентен-2 515 506.16 1.716
цис-4-Метилпентен-2 499 500.12 0.225
2-Этилбутен-1 512 513.17 0.228
2,3-Диметилбутен-1 500 499.03 0.194
Гептен-1 537.29 544.99 1.432
цис-Гептен-2 549 543.19 1.059
цис-Гептен-3 545 546.80 0.331
2-Метилгексен-1 538 541.62 0.673
цис-2-Метилгексен-3 533.58 538.95 1.007
цис-5-Метилгексен-2 538.78 534.15 0.860
5-Метилгексен-1 530.65 535.77 0.964
цис-3-Метилгексен-3 546.75 543.83 0.534
цис-4-Метилгексен-2 534.04 538.00 0.742
4-Метилгексен-1 534 538.52 0.846
4,4-Диметилпентен-1 520.28 522.75 0.476
2,3-Диметилпентен-1 532.72 537.07 0.816
цис-3,4-Диметилпентен-2 542.11 532.90 1.699
3,4-Диметилпентен-1 528.31 531.64 0.629
2,4-Диметилпентен-1 528.74 532.03 0.622
2,4-Диметилпентен-2 533.21 530.78 0.456
3,3-Диметилпентен-1 527.74 529.40 0.315
2-Этилпентен-1 543 546.25 0.599
транс-Бутилен-2 428.63 421.78 1.599
транс-Пентен-2 475.37 471.43 0.830
транс-Гексен-2 513 509.82 0.619
транс-Гексен-3 509 513.90 0.963
транс-3-Метилпентен-2 521 506.61 2.763
транс-4-Метилпентен-2 501 500.76 0.047
транс-Гептен-2 543 543.75 0.138
транс-Гептен-3 540 547.23 1.339
транс-2-Метилгексен-3 533.44 539.37 1.111
транс-5-Метилгексен-2 536.72 534.67 0.383
транс-3-Метилгексен-2 546.42 540.76 1.036
транс-3-Метилгексен-3 543.99 544.10 0.019
транс-4-Метилгексен-2 535.9 538.56 0.496
транс-4,4-Диметилпентен-2 528.63 523.62 0.948
транс-3,4-Диметилпентен-2 545.47 533.25 2.240
Среднее значение 0.939

Для проверки прогностических возможностей дескриптора и адекватности прогноза была рассчитана критическая температура десяти замещенных алкенов, не входящих в базовый ряд. Полученные результаты приведены в табл. 5.

Таблица 5.  

Сравнение справочных и расчетных значений критических температур алкенов

Соединение Ткр (cпр), K Ткр (расч), K Δ, %
4-Метил-транс-2-гептен 563.49 563.02 0.083
цис-3-Октен 572.11 575.10 0.523
2,3-Диметил-1-гексен 560.04 561.32 0.229
3-Этил-цис-2-гексен 572.89 572.45 0.077
2-Метил-1-октен 594 593.03 0.164
1-Нонен 593.25 597.62 0.736
4-Метил-1-гептен 559.87 563.11 0.578
транс-2-Октен 577 570.56 1.117
3-Метил-цис-3-гептен 572.89 571.04 0.324
2-Метил-1-нонен 616.91 615.21 0.275

Таким образом, получена регрессионная модель “структура–свойство”, которая адекватно передает зависимость критической температуры от топологических параметров молекул. Полученная полуэмпирическая модель адекватно описывает критическую температуру. Средняя абсолютная ошибка не превышает 4.7. Разработанная модель может быть использована при проведении инженерных и научных расчетов критической температуры индивидуальных углеводородов. Кроме того, модель может быть использована для характеристики критических свойств многокомпонентных смесей при условии идеальности углеводородной системы, т.е. при выполнении принципов аддитивности.

Список литературы

  1. Трапезникова Е.Ф. Разработка методов расчета физико-химических свойств углеводородов и углеводородных систем: Автореферат дис. … к.т.н. Уфа: УГНТУ, 2011. 25 с.

  2. Федина Ю.А., Папулов Ю.Г., Виноградова М.Г. // Вестник ТвГУ. Сер. Химия. 2012. № 14. С. 160.

  3. Красных Е.Л. // Журн. структур. химии. 2009. Т. 50. № 4. С. 629.

  4. Химические приложения топологии и теории графов / Под ред. Р. Кинга. М.: Мир, 1987. 560 с.

  5. Урядов В.Г., Аристова Н.В., Офицеров Е.Н. // Журн. физ. химии. 2007. Т. 81. № 5. С. 801.

  6. Доломатов М.Ю., Шамова Н.А., Трапезникова Е.Ф. и др. // Хим. технология. 2016. Т. 17. № 1. С. 45.

  7. Доломатов М.Ю., Кутуева А.В., Ковалева Э.А. и др. // Бутлеровские сообщения. 2018. Т. 55. № 8. С. 59.

  8. Михайлов И.В., Шавыкин O.В., Даринский А.А и др. // Вестн. ТвГУ. Сер. Химия. 2015. № 2. С. 68.

  9. Доломатов М.Ю., Ковалева Э.А. // Журн. структур. химии. 2015. Т. 56. № 5. С. 887.

  10. Виноградова М.Г., Папулов Ю.Г., Папулова Д.Р. // Фундаментальные исследования. 2012. № 6. С. 490.

  11. Доломатов М.Ю., Павлов Т.И., Аубекеров Т.М. База данных физико-химических свойств органических соединений: Б.д. 201862459 // 2017.

  12. СhemSynthesis – база данных химических веществ. (www.chemsynthesis.com)

  13. Сетевая база данных по физико-химическим свойствам веществ и материалов. (http://db.itp.nsc.ru. http://metalldb.susu.ac.ru)

  14. Рид Р., Праусниц Дж., Шервуд Т. Свойства газов и жидкостей: Справочное пособие / Пер. с англ. под ред. Б.И. Соколова. 3-е изд., перераб. и доп. Л.: Химия, 1982. 592 с.

  15. Григорьев И.С., Мейлихов Е.З. Физические величины. Справочник. М.: Энергоатомиздат, 1991. 1232 с.

  16. Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. // Успехи химии. 1988. Т. 57. № 3. С. 337.

  17. Heinzen V.E., Soares M.F., Yunes R.A. // J. Chromatography A. 1999. V. 849. P. 495.

  18. Акимов О.Е. Дискретная математика: логика, группы, графы, фракталы. М.: Издатель АКИМОВА, 2005. 656 с.

  19. Цветкович Д., Дуб М., Захс Х. Спектры графов. Теория и применение. Киев: Наукова думка, 1984. 384 с.

  20. Доломатов М.Ю., Аубекеров Т.М. // Журн. физ. химии. 2018. Т. 92. № 3. С. 355.

Дополнительные материалы отсутствуют.