Журнал физической химии, 2021, T. 95, № 11, стр. 1696-1704

Взаимодействие урацила с L-гистидином в водном буферном растворе в интервале температур 288.15–313.15 К

Е. Ю. Тюнина a*

a Российская академия наук, Институт химии растворов им. Г.А. Крестова
153045 Иваново, Россия

* E-mail: tey@isc-ras.ru

Поступила в редакцию 31.03.2021
После доработки 31.03.2021
Принята к публикации 26.04.2021

Полный текст (PDF)

Аннотация

Методами денсиметрии и дифференциальной сканирующей калориметрии изучены взаимодействия урацила (Ura) с гетероциклической аминокислотой, L-гистидином (His), в водном буферном растворе (рН 7.4). Получены экспериментальные значения плотности и удельной теплоемкости урацила в буферном растворе в присутствии и отсутствии аминокислоты в интервале температур (288.15–313.15) К. Концентрация Ura изменялась от 0.004 до 0.032 моль кг–1 при постоянной концентрации His (0.0125 моль кг–1). Определены кажущиеся молярные параметры урацила (φVUra, ϕCp) в буферном растворе и в буферном растворе, содержащем аминокислоту. Показано, что взаимодействие His с Ura сопровождается образованием между ними молекулярного комплекса. Выявлено, что парциальные молярные свойства переноса ($^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{^\circ }$, $^{\phi }C_{p}^{^\circ }$) урацила из буфера в буферный раствор аминокислоты имеют положительные значения в изученном интервале температур. Полученные результаты обсуждаются на основе использования модели Гэрни.

Ключевые слова: плотность, теплоемкость, кажущийся молярный объем, кажущаяся молярная теплоемкость, L-гистидин, урацил, комплексообразование

Взаимодействия между лекарственными средствами, в состав которых входят гетероциклические соединения, и макромолекулярными белками имеют важное значение в многокомпонентных физиологических средах, таких как кровь, клеточные мембраны, внутри- и межклеточные флюиды и т.д. Изучение механизмов и движущих сил образования между ними комплексов, лежащих в основе молекулярных процессов транспортировки лекарств, доставки их к клеткам-мишеням, относится к приоритетным задачам химии, биологии и фармакологии. Необходимым этапом является исследование физико-химических свойств модельных соединений биомакромолекул в водных растворах прежде, чем приступать к исследованию более сложных систем. Основания нуклеиновых кислот и их производные могут использоваться в качестве противоопухолевых, антибактериальных и противовирусных препаратов [1, 2]. Урацил является структурным элементом широкого круга биологически значимых молекул (РНК, пиримидин, птеридин, фолиевая кислота, флавин и др.). Молекулы урацила содержат донорные и акцепторные группы, способные к образованию водородной связи [35].

До сих пор актуальны исследования поведения аминокислот, молекулы которых содержат полярную боковую цепь [610]. К их числу относится гетероциклическая аминокислота L-гистидин, характеризующаяся наличием имидазольной функциональной группы, которая может служить как донором, так и акцептором образования водородных связей, и проявлять свойства как кислоты, так и основания в зависимости от диапазона pH. Гистидиновые остатки идентифицируются как активные сайты для ~50% всех белковых ферментов [11, 12]. Данная аминокислота является предшественником в биосинтезе гистамина, способствует росту и восстановлению тканей. Гистидин – составная часть многих витаминных комплексов; он используется при лечении глазных заболеваний, ревматоидных артритов, аллергий, язв и анемии [13].

Исследования водных растворов белков, нуклеиновых кислот и их производных в присутствии различных добавок (электролитов, органических растворителей, ПАВ и др.) проводятся разными методами [1417]. Кислотно-основные свойства нуклеиновых оснований и аминокислот влияют на стабильность образуемых ими комплексов и конъюгатов [2, 16, 1820]. Однако до сих пор недостаточно изучены взаимодействия указанных соединений в условиях физиологических значений рН среды при различных температурах.

Ранее [21] методами калориметрии растворения и УФ-спектроскопии было показано образование молекулярного комплекса между L-гистидином и Ura в водном буферном растворе. Как известно, такие термодинамические свойства, как объем и теплоемкость, чувствительны к структурным изменениям в растворах, происходящих на молекулярном уровне [22, 23]. Задачей настоящего исследования является использование методов денсиметрии и дифференциальной сканирующей калориметрии для выявления особенностей межмолекулярных взаимодействий His с Ura в водном фосфатном буферном растворе (рН 7.4) в широком интервале температур и концентраций. В литературе отсутствуют данные по плотности и теплоемкости системы L-гистидин–урацил–буфер.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

В работе использовали L-гистидин (Sigma-Aldrich, Japan, CAS 63-91-2) и урацил (Sigma, CAS 66-22-8). Содержание основного вещества составляло >99%. Аминокислоту сушили в вакуумном шкафу при 343 К, а Urа – при 410.15 К в течение 48 ч непосредственно перед использованием. Исследования проводили в водных буферных растворах (рН 7.4), содержащих NaH2PO4 и Na2HPO4, что приближает среду к условиям реальных биологических систем. Значения рН растворов фиксировали цифровым рН-метром Mettler Toledo, модель Five-Easy. Все растворы приготовлены весовым методом, используя весы Sartorius-ME215S (с точностью взвешивания 1 × × 10–5 г). Концентрацию урацила варьировали в пределах (0.0041–0.0324) моль кг–1 при фиксированной концентрации аминокислоты (0.0125 ± ± 0.0002 моль кг–1). Низкие концентрации Ura использовались в связи с его низкой растворимостью [19].

Измерения плотности исследуемых растворов выполнены на цифровом вибрационном денсиметре (model DMA-5000M, Anton Paar, Австрия) при температурах (288.15, 298.15, 303.15, 308.15 и 313.15) K. Два встроенных платиновых термометра Pt100 в сочетании с элементами Пельтье обеспечивали термостатирование образца внутри ячейки с погрешностью 5 × 10–3 К. Стандартная погрешность измерения плотности исследуемых растворов не превышала 0.00005 г см–3.

Для измерения удельной теплоемкости (cp) смесей Ura-буфер и Ura-His-буфер использовали дифференциальный сканирующий микрокалориметр SCAL-1 (“Биоприбор”, Пущино, Россия), оснащенный термоэлементами Пельтье, двумя измерительными стеклянными ячейками с внутренним объемом 0.377 см3, а также компьютерным терминалом и программным обеспечением для вычисления удельной теплоемкости. Интегральная чувствительность детектора калориметра составляет 33.218 нВт/мВ, калибровочная мощность – 25 мкВт, скорость сканирования – 1 К/мин, постоянная времени – 20 с. Прибор, детальное описание которого приведено в [24], был ранее протестирован по теплоемкости водных растворов хлорида натрия, рекомендованного в качестве стандарта для сканирующей калориметрии растворов [25]. Стандартная погрешность измерения удельной теплоемкости исследованных растворов находилась в пределах ±7 × 10–3 Дж К–1 г–1. Измерения удельной теплоемкости исследуемых растворов выполнены при температурах (288.15, 293.15, 298.15, 303.15, 308.15 и 313.15) K.

Полученные экспериментальные данные по плотности (ρ) и удельной теплоемкости (cp) исследуемых растворов приведены в табл. 1 и 2. Как видно из таблиц, значения ρ уменьшаются с температурой и возрастают с концентрацией Ura, в то время как температурные и концентрационные изменения значений cp носят противоположный характер.

Таблица 1.  

Плотность (ρ) водных буферных растворов урацила (Ura) и водных буферных растворов, содержащих урацил и L-гистидин (His), при разных концентрациях и температурах

m, моль кг–1 288.15 К 298.15 K 303.15 K 308.15 K 313.15 K
  Система: Ura–буфер
0 1029.289 1026.562 1024.859 1023.023 1021.012
0.0040 1029.506 1026.767 1025.057 1023.215 1021.200
0.0070 1029.648 1026.912 1025.197 1023.353 1021.333
0.0099 1029.784 1027.040 1025.325 1023.475 1021.446
0.0126 1029.893 1027.148 1025.425 1023.579 1021.550
0.0150 1029.988 1027.242 1025.524 1023.672 1021.645
0.0201 1030.199 1027.434 1025.715 1023.861 1021.831
0.0250 1030.380 1027.626 1025.890 1024.025 1021.984
0.0300 1030.565 1027.799 1026.065 1024.194 1022.161
  Система: Ura–His–буфер
0 1029.829 1027.165 1025.529 1023.695 1021.643
0.0040 1030.035 1027.363 1025.719 1023.875 1021.814
0.0070 1030.177 1027.501 1025.857 1024.003 1021.938
0.0100 1030.300 1027.623 1025.976 1024.119 1022.055
0.0125 1030.394 1027.716 1026.067 1024.207 1022.144
0.0147 1030.484 1027.799 1026.147 1024.288 1022.223
0.0199 1030.674 1027.995 1026.341 1024.472 1022.405
0.0249 1030.875 1028.188 1026.532 1024.652 1022.573
0.0275 1031.026 1028.339 1026.658 1024.782 1022.688
0.0299 1031.230 1023.485 1026.805 1024.928 1022.822

Примечание. Погрешность экспериментальных значений ρ ± 3 × 10–3 кг м–3, mHis= (0.0125 ± 0.0002) моль кг–1.

Таблица 2.  

Удельная теплоемкость (cp) водных буферных растворов урацила и водных буферных растворов, содержащих урацил и L-гистидин, при разных концентрациях и температурах

m, моль кг–1 288.15 K 293.15 K 298.15 K 303.15 K 308.15 K 313.15K
  Система: Ura–буфер
0 4.0159 4.0181 4.0215 4.0259 4.0306 4.0354
0.0040 4.0137 4.0156 4.0184 4.0225 4.0268 4.0311
0.0042 4.0136 4.0156 4.0183 4.0224 4.0267 4.0309
0.0071 4.0122 4.0138 4.0164 4.0201 4.0242 4.0281
0.0072 4.0121 4.0137 4.0163 4.0200 4.0241 4.0280
0.0098 4.0109 4.0125 4.0147 4.0181 4.0219 4.0256
0.0099 4.0108 4.0123 4.0147 4.0181 4.0219 4.0256
0.0162 4.0086 4.0098 4.0115 4.0147 4.0179 4.0216
0.0163 4.0085 4.0098 4.0114 4.0146 4.0178 4.0215
0.0205 4.0066 4.0077 4.0097 4.0122 4.0152 4.0184
0.0207 4.0065 4.0077 4.0093 4.0121 4.0151 4.0186
0.0312 4.0037 4.0046 4.0060 4.0078 4.0104 4.0127
0.0318 4.0035 4.0044 4.0058 4.0077 4.0102 4.0124
0.0324 4.0032 4.0043 4.0056 4.0074 4.0099 4.0120
  Система: Ura–His–буфер
0 4.0371 4.0431 4.0492 4.0538 4.0591 4.0639
0.0041 4.0359 4.0417 4.0477 4.0523 4.0577 4.06247
0.0071 4.0337 4.0396 4.0456 4.0504 4.0558 4.0604
0.0098 4.0326 4.0385 4.0441 4.0497 4.0548 4.0595
0.0164 4.0295 4.0349 4.0409 4.0461 4.0518 4.0560
0.0207 4.0267 4.0329 4.0383 4.0444 4.0489 4.0536
0.0257 4.0248 4.0312 4.0364 4.0419 4.0464 4.0517
0.0318 4.0237 4.0299 4.0346 4.0404 4.0447 4.0496
0.0324 4.0235 4.0296 4.0341 4.0401 4.0443 4.0495

Примечание. Погрешность экспериментальных значений cp ± (0.002cp) Дж K–1 г–1, mHis = (0.0125 ± 0.0002) моль кг–1.

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

В зависимости от рН среды аминокислота и урацил могут находиться в различных ионных состояниях. Гистидин является основной аминокислотой с гетероциклической полярной боковой цепью. При разных значениях рН His может образовывать три разных протонированных комплекса [26, 27]. Ранее показано, что в случае водных растворов с рН 7.4 L-гистидин существует, прежде всего, как цвиттерион, при этом вероятность наличия его катионной формы ([H2L]+) составляет менее 5% [21, 28]. Урацил представляет собой пиримидиновое основание, обладающее ароматическими свойствами и способное к таутомерии в виде лактамной или лактимной форм [29]. Установлено, что в нейтральной среде преобладает лактамная форма, которая переходит в моноанион при повышении pH (рН ≥ 9.52) [19, 29]. В условиях выбранной буферной среды (рН 7.4) урацил находится в нейтральной молекулярной форме [30]. Таким образом, при обсуждении движущих сил процесса образования комплекса между His и Ura следует рассматривать цвиттерионы аминокислоты и молекулы урацила в качестве их доминирующих форм, присутствующих в водном буферном растворе (рН 7.4).

Объемные свойства растворов

Кажущийся мольный объем Ura (φV) вычислен с использованием экспериментальных данных по плотности и уравнения:

(1)
$^{\varphi }V = 1000({{\rho }_{0}} - \rho ){\text{/}}(\rho {{\rho }_{0}}m) + M{\text{/}}\rho ,$
где ρ0 и ρ – плотности растворителя и раствора (г см–3), m – моляльная концентрация Ura (моль кг–1), М – молекулярная масса Ura. Растворителем в бинарных водных растворах (Ura–буфер) является буферный раствор, а в тройных системах (Ura – аминокислота–буфер) – буферный раствор аминокислоты (His) (с фиксированной концентрацией 0.0125 моль кг–1). На рис. 1 представлены концентрационные зависимости кажущихся мольных объемов Ura φV = f(m) в бинарной и тройной системах, соответственно, при разных температурах. Форма полученных изотерм может свидетельствовать о связывании растворенных веществ в комплекс [23, 31, 32]. Определена стехиометрия образуемого молекулярного комплекса, фиксируемая по максимуму на концентрационной зависимости кажущегося мольного объема Ura в трехкомпонентной системе урацил–аминокислота–буфер (рис. 1б). Максимальные значения φV приходятся на концентрацию mUra = = 0.0249 моль кг–1, которая соответствует молярному соотношению 1His : 2Ura. Зависимости стехиометрии образуемого комплекса от температуры не обнаружено.

Рис. 1.

Концентрационные зависимости кажущихся мольных объемов урацила (Vφ) в водном буферном растворе (а) и водном буферном растворе L-гистидина (б) при температурах: 1 – 288.15 K, 2 – 298.15 K, 3 – 303.15 K, 4 – 308.15 K, 5 – 313.15 К (mHis = 0.0125 ± 0.0002 моль кг–1).

Концентрационные зависимости φV = f(m) хорошо аппроксимируются полиномами второй и третьей степени, соответственно, для бинарной (Ura–буфер) и тройной (Ura–Phe–буфер) систем:

(2)
$^{\varphi }V = {}^{\varphi }V^\circ + {{B}_{1}}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + {{B}_{2}}m_{{{\text{Ura}}}}^{2},$
(3)
$^{\varphi }V = {}^{\varphi }V^\circ + B_{1}^{'}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + B_{2}^{'}m_{{{\text{Ura}}}}^{2} + B_{3}^{'}m_{{{\text{Ura}}}}^{3},$
где φV° – предельное значение кажущегося молярного объема, равное парциальному молярному объему при бесконечном разбавлении, B1, B2 и $B_{1}^{'}$, $B_{2}^{'}$, $B_{3}^{'}$ – постоянные коэффициенты. Получены положительные значения φV°, которые увеличиваются с ростом температуры (табл. 3). При образовании комплекса между His и Ura происходит вытеснение электрострикционно сжатых молекул воды, находящихся в гидратных сферах цвиттерионов His и молекул Ura, в объем раствора, что приводит к расширению общего объема раствора при более высокой температуре.

Таблица 3.  

Предельные кажущиеся мольные объемы (φV°) урацила и значения его производной по температуре (∂φV°/∂T)p в водном буферном растворе и водном буферном растворе с аминокислотой (His) при разных температурах

T, K Ura−буфер Ura−Hisa−буфер
${}^{\phi }V_{{{\text{Ura}}}}^{^\circ }$ × 106,
м3 моль–1
(∂φV°/∂T)p × 106,
м3моль–1 K–1
${}^{\phi }V_{{{\text{Ura}}}}^{^\circ }$ × 106,
м3 моль–1
(∂φV°/∂T)p × 106,
м3 моль–1 K–1
288.15 55.77 ± 0.41 0.252 ± 0.110 57.45 ± 0.33 0.133 ± 0.120
298.15 58.12 ± 0.39 0.282 ± 0.098 59.97 ± 0.28 0.398 ± 0.117
303.15 60.01 ± 0.36 0.297 ± 0.101 62.40 ± 0.30 0.531 ± 0.126
308.15 61.52 ± 0.28 0.312 ± 0.101 65.62 ± 0.29 0.663 ± 0.124
313.15 62.85 ± 0.31 0.326 ± 0.106 68.97 ± 0.24 0.796 ± 0.121

Примечание. mHis = 0.0125 ± 0.0002 моль кг–1, (∂φV°/∂T)p вычислено по уравнению: (∂φV°/∂T)p = β + 2Tγ, где β,γ – константы из (5).

Кажущиеся мольные объемы переноса (ΔtrφV°) при бесконечном разбавлении для Ura из буфера в буферный раствор аминокислоты вычислены по соотношению:

(4)
$\begin{gathered} {{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}{}^{\varphi }V^\circ = {}^{\varphi }V^\circ ({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{His}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{буфер}}) - \\ - \;{}^{\varphi }V^\circ ({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{буфер}}). \\ \end{gathered} $
Наблюдаемые положительные значения ΔtrφV° могут быть обусловлены эффектами дегидратации растворенных веществ и, прежде всего, отражать уменьшение электрострикционного сжатия молекул воды, находящихся в гидратных оболочках реагентов, при их вытеснении в объем раствора в процессе образования комплекса между His и Ura [33, 34]. Согласно модели перекрывания гидратных сфер Гэрни [35, 36], отрицательные изменения объема предполагают ион-гидрофобные и гидрофобно-гидрофобные взаимодействия Ura с His, тогда как ион-гидрофильные и гидрофильно-гидрофильные взаимодействия дают положительные вклады. Иными словами, взаимодействия между регентами, обусловленные, преимущественно, электростатическими силами и водородными связями, сопровождаются увеличением объема (${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}V_{\varphi }^{0} > 0$), а его понижение (${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}V_{\varphi }^{0} < 0$) имеет место в случае участия во взаимодействии неполярных групп (гидрофобные силы)] [31, 32, 37]. Между компонентами (Ura и His) исследуемой тройной системы возможны следующие взаимодействия: (1) цвиттерион-гидрофильные взаимодействия между зарядными группами ${\text{NH}}_{3}^{ + }{\text{/CO}}{{{\text{O}}}^{ - }}$ аминокислоты (АК) и гидрофильными группами (>C=O, >NH) урацила; (2) гидрофильно-гидрофильные взаимодействия между полярными фрагментами His и гидрофильными группами Ura; (3) гидрофильно-гидрофобные взаимодействия между полярными/неполярными группами аминокислоты и неполярными/полярными группами нуклеинового основания (НО); (4) гидрофобно-гидрофобные взаимодействия между неполярными фрагментами АК и гидрофобными группами НО. Два первых типа взаимодействия дают положительные вклады в ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}V_{\varphi }^{0}$, а третий и четвертый типы приводят к отрицательным значениям ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}V_{\varphi }^{0}$ [23, 38]. Полученные положительные изменения объема $\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{^\circ }$ свидетельствуют о том, что в растворах Ura в присутствии His взаимодействия первых двух типов доминируют в условиях существующей конкуренции между различными типами взаимодействий в исследуемых растворах. Таким образом, можно предположить, что комплексы His с молекулами Ura могут быть образованы за счет цвиттерион-гидрофильных взаимодействий и образования водородных связей, что согласуется с литературными данными [39].

Температурные зависимости парциальных мольных объемов φV° урацила в буфере и буферном растворе аминокислоты, представленные на рис. 2, описываются уравнением:

(5)
$^{\varphi }V^\circ = \alpha + \beta T + \gamma {{T}^{2}},$
где α, β и γ – константы, T – температура. Значения (∂φV°/∂T)p и (∂V°/∂T2)p были получены путем дифференцирования уравнения (5). В табл. 3 приведены рассчитанные первые производные (∂φV°/∂T)p, положительные значения которых указывают на высвобождение электрострикционно сжатой воды из гидратных сфер His и Ura в раствор в процессе их связывания в комплекс, что сопровождается увеличением объема системы. Показано, что величины (∂φV°/∂T)p проявляют тенденцию к повышению с температурой как в бинарной (Ura–буфер), так и в тройной (Ura–His–буфер) системах.

Рис. 2.

Температурные зависимости парциальных мольных объемов φV° (а) и парциальных мольных теплоемкостей $^{\phi }C_{p}^{^\circ }$ (б) при бесконечном разбавлении для урацила в буфере (1) и в водном буферном растворе, содержащем 0.0125 моль кг–1 L-гистидина (2).

На основе использования уравнения Хеплера [40]:

(6)
${{(\partial C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial P)}_{T}} = - T{{({{\partial }^{2}}{}^{\varphi }V^\circ {\text{/}}\partial {{T}^{2}})}_{p}},$
можно количественно оценить воздействие растворенных веществ на структру растворителя. Положительный знак второй производной (∂V°/∂T2)p свидетельствует о структурно-образующей способности растворенного вещества, а его отрицательная величина указывает на структурно-разрушающие свойства в водном растворе. В нашем случае значения (∂V°/∂T2)p составляют 0.0029 см6 моль–2 K–2 для Ura в водном буферном растворе и 0.0265 см6 моль–2 K–2 для Ura в водном буферном растворе, содержащем His. Полученные результаты показывают, что растворение полярного вещества Ura в буферном растворе, по-видимому, индуцирует структурирование окружающих молекул воды в соответствии с моделью гидрофобной гидратации [41]. В случае растворов Ura в буфере, содержащем аминокислоту, также наблюдается стабилизация структуры растворителя вследствие процессов ассоциации. При этом можно предположить, что буферные системы с Ura и His более структурированы, чем буферные растворы урацила.

Теплоемкостные свойства растворов

Значения кажущейся молярной теплоемкости урацила (ϕCp) в буфере и буферном растворе с гистидином определены из экспериментальных данных удельной теплоемкости с использованием уравнения (7):

(7)
$^{\phi }{{C}_{p}} = M{{c}_{p}} + 1000({{c}_{p}} - c_{p}^{^\circ }){\text{/}}m,$
где сp и $с_{p}^{^\circ }$ – удельные теплоемкости, соответственно, раствора и растворителя (Дж К–1 г–1), m – моляльная концентрация растворенного вещества Ura (моль кг–1), M – молярная масса Ura (г моль–1). Значения ϕCp урацила получены как функция его концентрации при постоянной концентрации аминокислоты (0.0125 ± 0.0002 моль кг–1). Погрешность определения ϕCp не превышает 2%.

Анализ полученных данных показал, что концентрационные изменения значений ϕCp урацила в буферном растворе близки к линейным и могут быть выражены уравнением:

(8)
${}^{\phi }{{C}_{p}} = {}^{\phi }C_{p}^{^\circ } + {{A}_{1}}m,$
а изотермы ϕCp для тройной системы Ura–His–буфер аппроксимируются полиномом второй степени:
(9)
${}^{\phi }{{C}_{p}} = {}^{\phi }C_{p}^{^\circ } + A_{1}^{'}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + A_{2}^{'}m_{{{\text{Ura}}}}^{2}$
во всем изученном диапазоне параметров (m, Т). Здесь $^{\phi }C_{p}^{^\circ }$ – предельное значение кажущейся мольной теплоемкости, равное парциальной мольной теплоемкости при бесконечном разбавлении, A1, $A_{1}^{'}$ and $A_{2}^{'}$ – постоянные коэффициенты. На рис. 3 представлены концентрационные зависимости кажущихся мольных теплоемкостей урацила в изученной области температур, которые носят нелинейный характер в тройной системе Ura–His–буфер в отличие от бинарной смеси Ura–буфер. Следует отметить, что в указанных условиях эксперимента (m, T) наблюдаемые тенденции к понижению значений ϕCp с ростом концентрации Ura и линейный характер полученных зависимостей ϕCp = f(m) для системы Ura-буфер проявляются и для его водных растворов [42, 43]. Как известно [44], если в растворах отсутствуют изменения во взаимодействиях растворенное вещество–растворитель и растворенное вещество–растворенное вещество, то теплоемкостные свойства раствора будут находиться в линейной зависимости от концентрации.

Рис. 3.

Концентрационные зависимости кажущихся мольных теплоемкостей урацила (ϕCp) в водном буферном растворе (а) и водном буферном растворе L-гистидина (б) при температурах: 1 – 288.15 K, 2 – 293.15 K, 3 – 298.15 K, 4 – 303.15 K, 5 – 308.15 K, 6 – 313.15 K (mHis = 0.0125 ± 0.002 моль кг–1).

Как видно из табл. 4, значения парциальной молярной теплоемкости ($^{\phi }C_{p}^{^\circ }$) урацила положительны для исследуемых систем и возрастают с температурой в интервале (288.15–313.15) К. По-видимому, нуклеиновое основание (Ura), имеющее в своей структуре гидрофильные и гидрофобные группы, индуцирует структурирование растворителя, как за счет гидрофобной гидратации, так и взаимодействия с растворенной аминокислотой [41, 42]. Увеличение $^{\phi }C_{p}^{^\circ }$ с температурой может указывать на то, что взаимодействия между молекулами растворенных веществ сильнее, чем межмолекулярная водородная связь между молекулами воды.

Таблица 4

.  Предельные кажущиеся мольные теплоемкости ($^{\phi }C_{p}^{^\circ }$) урацила и значения его производной по температуре ${{({{\partial }^{\varphi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ в водном буферном растворе и водном буферном растворе с аминокислотой (His) при разных температурах

T, K Ura−буфер Ura−Hisa−буфер
$^{\phi }C_{p}^{^\circ }$,
ДжK–1 моль–1
(${{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }$/∂T)p,
ДжK–2 моль–1
$^{\phi }C_{p}^{^\circ }$,
ДжK–1 моль–1
(${{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }$/∂T)p,
ДжK–2 моль–1
288.15 449.42 ± 0.03 0.0203 ± 0.005 452.34 ± 0.09 0.1411 ± 0.010
293.15 449.55 ± 0.04 0.0368 ± 0.005 453.04 ± 0.06 0.1314 ± 0.009
298.15 449.73 ± 0.03 0.0533 ± 0.007 453.71 ± 0.09 0.1217 ± 0.011
303.15 450.10 ± 0.04 0.0698 ± 0.007 454.22 ± 0.08 0.1120 ± 0.010
308.15 450.52 ± 0.04 0.0863 ± 0.009 454.76 ± 0.09 0.1023 ± 0.012
313.15 450.92 ± 0.04 0.1028 ± 0.009 455.29 ± 0.08 0.0928 ± 0.015

Примечание. mHis = 0.0125 ± 0.0002 моль кг–1, ${{({{\partial }^{\varphi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ вычислено по уравнению: ${{({{\partial }^{\varphi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ = b1 + 2Tb2, где b1, b2 – константы из (11).

В исследуемых растворах при изменении концентрации Ura происходят структурные превращения, обусловленные изменениями гидрофобных, гидрофильных и электростатических взаимодействий, приводящих, в конечном итоге, к связыванию Ura с His. Обычно положительный вклад в величину кажущейся молярной теплоемкости растворенного вещества дают эффекты дегидратации и увеличения степеней свободы и интенсивности молекулярных движений, что ведет к разрушению структуры раствора. В то же время, эффекты ассоциации и гидратации, образование более упорядоченных структур, сопровождающиеся уменьшением степеней свободы молекул растворенных веществ, приводят к отрицательному вкладу в значения ϕCp [45, 46]. Как показано на рис. 3, с увеличением концентрации Ura наблюдается понижение значений кажущейся молярной теплоемкости. По-видимому, в случае растворения Ura в водном буферном растворе и водном буферном растворе, содержащем полярную гетероциклическую аминокислоту (His), можно говорить о преобладании вклада от эффекта гидрофобного структурирования среды и образования молекулярного комплекса Ura с His в общую теплоемкость раствора.

Структурные изменения, происходящие в растворе в процессе связывания Ura с His, можно объяснить на основе использования модели Гэрни о перекрывания ко-сфер молекул растворенных веществ, как это было показано выше при интерпретации объемных свойств [36, 47]. Изменение парциальной мольной теплоемкости (${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$) при переносе Ura из буфера в буферные растворы с аминокислотой определено по соотношению:

(10)
$\begin{gathered} {{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ } = {}^{\phi }C_{p}^{^\circ }({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{His}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{буфер}}) - \\ - \;{}^{\phi }C_{p}^{^\circ }({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{буфер}}). \\ \end{gathered} $
Полученные положительные значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$ (от 2.92 до 4.37 Дж K–1 г–1 в интервале от 288.15 до 313.15 К) обычно указывают на то, что в присутствии Ura водные буферные системы His более структурированы, чем буферный растворитель [23, 32, 38, 45, 46]. Образование молекулярного комплекса между Ura и His приводит к потере некоторых степеней свободы, что дает отрицательный вклад в ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$, при этом имеет место дегидратация молекул растворенных веществ, что вносит положительный вклад в ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$ [47]. Положительные значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$ свидетельствуют, что взаимодействия полярных гидрофильных групп нуклеинового основания (>C=O, >NH) с цвиттерионными группами (COO/${\text{NH}}_{3}^{ + }$) аминокислоты через перекрывание их гидратных сфер и образование водородных связей доминируют над цвиттерион-гидрофобными взаимодействиями между зарядными центрами His и пиримидинового кольца Ura [44, 48]. Как и в случае $\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{^\circ }$, значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$ проявляют тенденцию к возрастанию с повышением температуры.

Температурные зависимости парциальной мольной теплоемкости ($^{\phi }C_{p}^{^\circ }$) при бесконечном разбавлении описываются полиномом второй степени как для бинарной (Ura–буфер), так и тройной (Ura–His–буфер) систем (рис. 2):

(11)
$^{\phi }C_{p}^{^\circ }(T) = a + {{b}_{1}}T + {{b}_{2}}{{T}^{2}}.$
Здесь Т – температура (К), a, b1 и b2 – константы. Значения полученных первых производных ${{({{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ приведены в табл. 4. Видно, что для исследуемого пиримидинового нуклеинового основания значения ${{({{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ положительны, что подтверждает полярный характер молекул Ura [41, 49]. Следует отметить, что для тройной системы Ura–His–буфер наблюдаются более высокие значения ${{({{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$ по сравнению с бинарной системой Ura–буфер из-за присутствия аминокислоты, содержащей как полярные, так и неполярные фрагменты в молекуле.

Таким образом, методами денсиметрии и ДСК определены плотности и удельные теплоемкости буферных растворов, содержащих урацил и L-гистидин в интервале температур 288.15–313.15 К. Вычислены кажущиеся и парциальные молярные свойства (φV, ϕCp) урацила, а также предельные кажущиеся молярные свойства переноса Ura из буферного раствора в буферный раствор с аминокислотой. Показано, что функции φV = f(m) и ϕCp = f(m) имеют нелинейный характер. Полученные данные позволили обнаружить структурные изменения в водных буферных растворах Ura с His, соответствующие образованию между ними молекулярного комплекса.

Определены параметры ${{({{\partial }^{\phi }}C_{p}^{^\circ }{\text{/}}\partial T)}_{p}}$, (∂φV°/∂T)p и (∂V°/∂T2)p для Ura в водном буферном растворе и водном буферном растворе аминокислоты. Выявленная тенденция в изменении их значений при различных температурах показывает, что буферные системы с Ura и His более структурированы, чем буферные растворы урацила. Полученные результаты показывают, что исследуемое нуклеиновое основание (Ura), имеющее в своей структуре гидрофильные и гидрофобные группы, индуцирует структурирование растворителя, как за счет гидрофобной гидратации, так и вследствие взаимодействия с растворенной гетероциклической аминокислотой (His) в буферном растворе.

Наблюдаемые положительные значения свойств переноса Ura из буфера в буферный раствор с His ($\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{^\circ }$, ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{^\circ }$) при изученных температурах являются результатом компенсации отрицательных и положительных вкладов в их величину, соответственно, от гидрофобных взаимодействий аполярных фрагментов молекул Ura с His и от ион-гидрофильных взаимодействий цвиттерионов His с полярными группами Ura и образования водородных связей.

Измерения плотности и удельной теплоемкости выполнены на оборудовании центра коллективного пользования “Верхневолжский региональный центр физико-химических исследований” ИХР РАН (http://www.isc-ras.ru/ru/struktura/ckp).

Список литературы

  1. Wettergren Y., Carlsson G., Odin E., Gustavsson B. // Cancer. 2012. V. 6. P. 2935.

  2. Bakkialakshmi S., Chandrakala D. // Spectrochim. Acta. Part A. 2012. V. 88. P. 2.

  3. Cheng A.C., Frankel A.D. // J. Am. Chem. Soc. 2004. V. 126. P. 434.

  4. Jones S., Daley D.T.A., Luscombe N.M. et al. // Nucleic Acids Rec. 2001. V. 29. P. 943.

  5. Ribeiro R.F., Marenich A.V., Cramer Ch.J., Truhlar D.G. // Phys. Chem. Chem. Phys. 2011. V. 13. P. 10908.

  6. Yasuda Y., Tochio N., Sakurai M., Nitta K. // J. Chem. Eng. Data. 1998. V. 43. P. 205.

  7. Nain A.K., Pal R., Sharma R.K. // J. Mol. Liq. 2012. V. 165. P. 154.

  8. Jardine J.J., Call T.G., Patterson B.A. et al. // J. Chem. Thermodynamics. 2001. V. 33. P. 1419.

  9. Riyazuddeen, Altamash T. // Thermochimica Acta. 2010. V. 501. P. 72.

  10. Banipal T.S., Singh K., Banipal P.K. // J. Solution Chem. 2007. V. 36. P. 1635.

  11. Hansena A.L., Kaya L.E. // PNAS. 2014. P. E1705. (www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1400577111)

  12. Oya-Ohta Y., Ochi T., Komoda Y., Yamamoto K. // Mutation Research. 1995. V. 326. P. 99.

  13. Чернова Р.К., Варыгина О.В., Березкина Н.С. // Изв. Сарат. ун-та. Нов. сер. Сер. Химия. Биология. Экология. 2015. Т. 15. № 4. С. 15.

  14. Hunter K.C., Millen A.L., Wetmore S.D. // J. Phys. Chem. B. 2007. V. 111. P. 1858.

  15. Boeckx B., Maes G. // Ibid. B. 2012. V. 116. P. 11890.

  16. Banipal T.S., Kaur N., Banipal P.K. // J. Chem. Thermodynamics. 2016. V. 95. P. 149.

  17. Smirnov V.I., Badelin V.G. // J. Mol. Liq. 2017. V. 229. V. 198.

  18. Bell-Upp P., Robinson A.C., Whitten S.T. et al. // Biophys. Chem. 2011. V. 159. P. 217.

  19. Balodis E., Madekufamba M., Trevani L.N., Tremaine P.R. // Geochim. Cosmochim. Acta. 2012. V. 93. P. 182.

  20. Khalil M.M., Fazary A.E. // Monatshefte für Chemie. 2004. V. 135. P. 1455.

  21. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Mezhevoi I.N. // J. Mol. Liq. 2019. V. 278. P. 505. https://doi.org/10.1016/j.molliq.2019.01.092

  22. Bhat R., Ahluwalia J.C. // J. Phys. Chem. 1985. V. 89. P. 1099.

  23. Terekhova I.V., De Lisi R., Lazzara G. et al. // J. Therm. Anal. Cal. 2008. V. 92. P. 285.

  24. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Mezhevoi I.N. // J. Soltion Chem. 2017. V. 46. P. 249.

  25. Clarke E.C.W., Glew D.N. // J. Phys. Chem. Ref. Data. 1985. V. 14. P. 490.

  26. Miao Y., Cross T.A., Fu R. // J. Magnetic Resonance. 2014. V. 245. P. 105.

  27. Bretti C., Cigala R.M., Giuffrè O. et al. // Fluid Phase Equilibr. 2018. V. 459. P. 51.

  28. Тюнина Е.Ю., Баделин В.Г., Курицына А.А. // Журн. физ. химии. 2020. Т. 94. № 4. С. 557. https://doi.org/10.1134/S0036024420040226

  29. DeMember J.R., Wallace F.A. // J. Am. Chem. Soc. 1975. V. 97. P. 6240.

  30. Badeline V.G., Tyunina E.Yu., Mezhevoi I.N., Tarasova G.N. // Russ. J. Phys. Chem. A. 2015. V. 89. P. 2229.

  31. Zielenkiewicz W., Pietraszkiewicz O., Wszelaka-Rylic M. et al. // J. Solution Chem. 1998. V. 27. P. 121.

  32. Terekhova I.V., Kulikov O.V. // Mendeleev Comm. 2002. V. 3. P. 1.

  33. Lepori L., Gianni P. // J. Solution Chem. 2000. V. 29. P. 405.

  34. Shahidi F., Farrell P.G. // J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1981. V. 77. P. 963.

  35. Franks F. Water: A comprehensive treatise. V. 3. New York: Plenum Press, 1973.

  36. Gurney R.W. Ionic processes in solution. New York: McGraw Hill, 1953.

  37. Banipal T.S., Kaur N., Banipal P.K. // J. Chem. Thermodynamics. 2015. V. 82. P. 12. https://doi.org/10.1016/j.jct.2014.10.015

  38. Bhuiyan M.M.H., Hakin A.W., Liu J.L. // J. Solution Chem. 2010. V. 39. P. 877.

  39. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Mezhevoi I.N. // J. Mol. Liq. 2019. V. 278. P. 505. https://doi.org/10.1016/j.molliq.2019.01.092

  40. Hepler L.G. // Can. J. Chem. 1969. V. 47. P. 4613.

  41. Hadži S., Lah J. // BBA − General Subjects. 2021. V. 1865. P. 129774.

  42. Kishore N., Ahluwalia J.C. // J. Solution Chem. 1990. V. 19. P. 51.

  43. Zielenkiewicz W., Zielenkiewicz A., Grolier J.-P.E. et al. // J. Solution Chem. 1992. V. 21. P. 1.

  44. Васильев В.П. Термодинамические свойства растворов электролитов. М.: Высш. школа. 1982.

  45. Lat`isheva V.A. // Russ. Chem. Rev. 1973. V. XLII. P. 1757.

  46. Madan B., Sharp K.A. // J. Phys. Chem. B. 2001. V. 105. P. 2256.

  47. Banipal P.K., Banipal T.S., Ahluwalia J.C., Lark B.S. // J. Chem. Thermodynamics. 2002. V. 34. P. 1825.

  48. Lark B.S., Patyar P., Banipal T.S., Kishore N. // J. Chem. Eng. Data. 2004. V. 49. P. 553.

  49. Szemińska J., Zielenkiewicz W., Wierzchowski K.L. // Biophys. Chem. 1979. V. 10. P. 409.

Дополнительные материалы отсутствуют.