Физика и химия стекла, 2020, T. 46, № 6, стр. 527-535

Кластеры-прекурсоры и самосборка кристаллических структур Li36Ca4Sn24-oS64 и LiMgEu2Sn3-oS28

В. Я. Шевченко 1*, В. А. Блатов 2, Г. Д. Илюшин 23

1 Институт химии силикатов им. И.В. Гребенщикова РАН
199034 Санкт-Петербург, наб. Макарова, 2, Россия

2 Международный научно-исследовательский центр по теоретическому материаловедению, Самарский государственный технический университет
443100 Самара, ул. Молодогвардейская, 244, Россия

3 Федеральный научно-исследовательский центр “Кристаллография и фотоника”
119333 Москва, Ленинский пр., 59, Россия

* E-mail: shevchenko@isc.nw.ru

Поступила в редакцию 18.05.2020
После доработки 23.07.2020
Принята к публикации 06.08.2020

Полный текст (PDF)

Аннотация

С помощью компьютерных методов (пакет программ ToposPro) осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование самосборки кристаллической структуры Li36Ca4Sn24-oS64 (пр. гр. Cmcm, a = 4.640, b = 27.112, c = 11.491 Å, V = = 1445.5 Å3) и LiMgEu2Sn3-oS28 (пр. гр. Cmcm, a = 4.782, b = 20.717, c = 7.743 Å, V = = 767.1 Å3). Для интерметаллида Li36Ca4Sn24 установлен новый тип 11-атомного кластера K11, образованного из сдвоенных пентагональных колец: K11 = = 0@11(Li5)Ca(Sn5). Максимальная симметрия кластера K11 и первичной цепи из трансляционно-связанных кластеров K11 соответствует некристаллографической симметрии 5m. Первичные цепи из связанных кластеров K11, сохраняющие только симметрию m, расположены в направлении [100] и расстояние между центрами кластеров определяет длину вектора a = 4.640 Å. Образование слоя происходит при связывании расположенных антипараллельно первичных цепей. Между первичными цепями располагаются тетраэдрические кластеры K4 = 0@4(Li3Sn), образующие цепи в направлении [100]. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры интерметаллида LiMgEu2Sn3-oS28 из кластеров K4 = 0@4(LiMgEuSn) и K3 = 0@3(Sn2Eu). Образование слоя происходит при связывании расположенных параллельно цепей из K4 + K3.

Ключевые слова: интерметаллид Li36Ca4Sn24-oS64, интерметаллид LiMgEu2Sn3-oS28, самосборка кристаллической структуры, кластеры-прекурсоры K3 = 0@3(Sn2Eu), K4 = 0@4 и K11 = 0@11

ВВЕДЕНИЕ

В тройных системах AnBmCk с участием атомов щелочных металлов A число кристаллохимически различных интерметалидов в ряду Li → Na → K, Rb → Cs → последовательно уменьшается: 511 → 176 →135 → 66 → 53 [1, 2]. Если в образовании двойных Li-интерметаллидов принимают участие только 22 химических элемента, то в образовании тройных Li-интерметаллидов принимают участие уже 51 химический элемент. Многочисленные интерметаллиды Li образуются с участием атомов Ge, Sn, Al, Ga, In, Ca, Mg, Zn. Наибольшее число кристаллических структур Li-интерметаллидов характеризуются пр. группами Fm-3m (108 соединений), F‑43m (65), Cmcm (31), Pnma (31) и Fd-3m (27).

В системах Li–Ca–M и Li–Eu–M установлено образование 25 и 11 кристаллохимически различных интерметалидов [1, 2]. Из них только интерметаллиды Li9EuSn6-oS68 [3] и Li9CaSn6-oS68 [3] с пр. группой Cmcm и LiEu2Ge3-oP24 [4] и LiCa2Ge3-oP24 [5] с пр. группой Pnnm являются кристаллохимическими аналогами (табл. 1).

Таблица 1.  

Кристаллографические данные интерметаллидов, образующихся в тройных и четверных системах

Интерметаллид Группа
симметрии
Параметры ячейки, Å V, Å3 Индекс
Пирсона
Li2Sm2Ge3 Cmcm 4.372, 18.494, 6.840 553.1 oS28
Li2Nd2Ge3 Cmcm 4.422, 18.658, 6.891 568.5 oS28
Li2Pr2Ge3 Cmcm 4.443, 18.723, 6.911 575.0 oS28
Li2Ce2Ge3 Cmcm 4.472, 18.825, 6.942 584.5 oS28
Li2La2Ge3 Cmcm 4.531, 19.001, 7.008 603.4 oS28
LiMgSr2Ge3 Cmcm 4.636, 19.703, 7.324 669.0 oS28
LiMgEu2Sn3 Cmcm 4.782, 20.717, 7.743 767.1 oS28
LiMgSr2Sn3 Cmcm 4.843, 20.923, 7.805 790.9 oS28
Li9CaSn6 Cmcm 4.640, 27.112, 11.491 1445.5 oS68
Li9EuSn6 Cmcm 4.723, 27.125, 11.436 1465.1 oS68
LiCa2Ge3 Pnnm 11.380, 10.730, 4.430 540.9 oP24
LiEu2Ge3 Pnnm 10.968, 11.687, 4.548 583.0 oP24

Тройные интерметаллиды семейства Li2Ln2Ge3-oS28 (с пр. группой Cmcm и Ln = = La, Ce, Pr, Nd, Sm [6]) имеют кристаллохимические аналоги среди четверных интерметаллидов LiMgSr2Ge3-oS28 [7], LiMgEu2Sn3-oS28 [3], LiMgSr2Sn3-oS28 [3] (табл. 1).

В настоящей работе с помощью пакета программ ToposPro [8] проведен геометрический и топологический анализ кристаллических структур интерметаллидов Li36Ca4Sn24-oS64 и LiMgEu2Sn3-oS28. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры Li36Ca4Sn24-oS64 из кластеров-прекурсоров K4 = 0@Li3Sn и K11 = 0@11(Li5)Ca(Sn5) и LiMgEu2Sn3-oS28 из кластеров K4 = = 0@4(LiMgEuSn) и K3 = 0@3(Sn2Eu) в виде: первичная цепь → слой → каркас. Работа продолжает исследования [917] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением современных компьютерных методов.

МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ

Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [8], позволяющего проводить многоцелевое исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде “свернутых графов” (фактор-графов). Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т.е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома.

Полученные значения координационных последовательностей атомов в 3D-сетках, приведены в табл. 2 и 3, в которых жирным шрифтом выделено число соседних атомов в ближайшем окружении, т.е. в первой координационной сфере атома. Все атомы характеризуются различными наборами координационных последовательностей {Nk}, следовательно, все атомы топологически (и функционально) различны.

Таблица 2.  

Координационные последовательности и локальное окружение атомов в структуре Li36Ca4Sn24

Атом Локальное окружение Координационные последовательности
N1 N2   N3    N4 N5
Li1 8Li + 6Sn 14 47 105 190 290
Li2 8Li + 4Sn 12 41   96 176 294
Li3 5Li + 1Ca + 6Sn 12 47 106 187 299
Li4 6Li + 1Ca + 5Sn 12 42   94 186 302
Li5 8Li + 4 Sn4 12 42   98 174 306
Li6 6Li + 1Ca +5Sn 12 45 100 186 295
Ca1 5Li +10Sn 15 44 108 183 304
Sn1 8Li + 2Ca + 2Sn 12 49 111 192 300
Sn2 6Li + 2Ca + 2Sn 10 44 101 183 283
Sn3 8Li + 2Ca + 2Sn 12 45   96 191 301
Sn4 9Li9   9 38   92 169 284
Таблица 3.  

Координационные последовательности и локальное окружение атомов в структуре LiMgEu2Sn3

Атом Локальное
окружение
Координационные последовательности
N1 N2 N3 N4 N5
Mg1 3Mg + 4Sn + 5Eu 12 44 98 178 262
Sn1 Mg + 2Sn + 6Eu    9 45 90 168 281
Sn2 6Mg +3 Eu3    9 41 96 165 269
Eu1 4Mg + 9Sn +1Eu 14 42 98 184 270
Eu2 6Mg + 6Sn + 1Eu 13 41 102 161 287

Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы реализован в комплексе программ ToposPro [8].

САМОСБОРКА КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ Li36Ca4Sn24-oS64 И LiMgEu2Sn3-oS28

Использованный нами метод моделирования кристаллической структуры основан на определении иерархической последовательности ее самосборки в кристаллографическом пространстве [911]. На первом уровне самоорганизации системы определяется механизм формирования первичной цепи структуры из нанокластеров 0-уровня, сформированных на темплатной стадии химической эволюции системы, далее – механизм самосборки из цепи слоя (2-ой уровень) и затем из слоя – трехмерного каркаса (3-й уровень).

Кристаллографические данные Li36Ca4Sn24-oS64

В элементарной ячейке все атомы находятся в частных позициях пространственной группы Cmcm (no. 63) в двух плоскостях (100) на высоте 0 и 0.5. Из них в позиции 4b (2/m) – атом Li1, в позиции 4с (m2m) – Li1, Li4, Ca1, Sn1, Sn4, в позиции 8f (m) – Li2, Li3, Li6, Sn2, Sn3.

В табл. 1 приведено локальное окружение атомов Ca, Li, Sn и значения их координационных последовательностей в 3D атомной сетке. Атомы Ca характеризуются КЧ = 15, атомы Li – 12 (пять атомов) и 14, атомы Sn – 9, 10 и 12 (два атома).

Супраполиэдрический кластер-прекурсор K11. Полиэдрический кластер-прекурсор K11 = 0@11(Li5CaSn5) с симметрией m и центром в позиции 8g (1/4, 0.86, 1/4) представляет собой пентагональную пирамиду CaSn5, на каждой грани которой расположены атомы Li, связанные в 5-ные кольца, лежащие в одной плоскости с атомами Ca (рис. 1а). Максимальная симметрия кластера K11 соответствует некристаллографической симметрии 5m.

Рис. 1.

Li36Ca4Sn24-oS64. Кластеры-прекурсоры K11 и K4.

Полиэдриический кластер-прекусор K4. Кластер K4 = 0@4(Li3Sn) с симметрией m представляет собой тетраэдр (рис. 1). Центр кластера K4 находится в позиции 8g (3/8, 0.58, 1/4).

Самосборка кристаллической структуры Li36Ca4Sn24-oS64. Самосборка первичных цепей ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$ из кластеров K11 происходит в направлении [100] (рис. 2). Расстояние между центрами кластеров K11 определяет длину наименьшей трансляции a = 4.640 Å.

Рис. 2.

Li36Ca4Sn24-oS64. Первичная цепь ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$ (слева) и слой ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ (справа).

Образование слоя ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ происходит при связывании расположенных антипараллельно первичных цепей ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$ + ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$ (g = –1, позиция 8d (1/4, 3/4, 1/2) (рис. 2). Между первичными цепями располагаются тетраэдрические кластеры Li3Sn, образующие цепи в направлении [100]. Каркасная структура ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}$ формируется при связывании слоев в направлении [001] (рис. 3). Расстояние между эквивалентными 2D слоями определяет длину вектора c = 11.490 Å.

Кристаллографические данные LiMgEu2Sn3-oS28

Рис. 3.

Li36Ca4Sn24-oS64. Самосборка каркаса ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}$ = ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ + ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ при связывании ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ в направлении [010] (сверху) и [001] (снизу).

В элементарной ячейке атомы находятся в частных позициях пространственной группы Cmcm в двух плоскостях (100) на высоте 0 и 0.5. Из них в позиции 4с – Eu1, Eu2, Sn2; в позиции 8f – (Li + Mg), Sn1. В табл. 3 приведено локальное окружение атомов Mg, Eu, Sn и значения их координационных последовательностей в 3D атомной сетке. Атомы Eu характеризуются КЧ = 13 и 14, атом Mg (Li) – КЧ = 12, атомы Sn – КЧ = 9.

Кластеры-прекурсоры K4 и К3. Полиэдрический кластер-прекусор K4 = = 0@4(LiMgEuSn) с симметрией m представляет тетраэдр (рис. 4). Центр кластера K4 находится в позиции 8g (3/8, 0.76, 1/4). Кластер-прекурсор K3 = 0@3(Sn2Eu) имеет форму треугольника и также занимает позиции 8g (3/8, 0.76, 1/4) и (1/6, 0.52, 1/4).

Рис. 4.

LiMgEu2Sn3-oS28. Кластеры-прекурсоры K4 (слева) и K3 (справа).

Самосборка кристаллической структуры LiMgEu2Sn3-oS28. Самосборка первичной цепи ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$-A из кластеров K4 + K4 co связанностью Рс = 7 происходит в направлении [001] (рис. 5). Вторичная цепь ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$-B из кластеров K3 + K3 формируется при их связывании с тетраэдрами первичной цепи (с Рс = 8) (рис. 5).

Рис. 5.

LiMgEu2Sn3-oS28. Слой ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ (слева) и каркас ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}$ (справа).

Образование каркаса ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}$ происходит при связывании слоев ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ в направлении [100] (рис. 5) и затем в направлении [010] (рис. 6).

Рис. 6.

LiMgEu2Sn3-oS28. Сборка каркаса ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}$ в направлении [010].

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование кластерной самосборки кристаллической структуры Li36Ca4Sn24-oS64 из полиэдрических кластеров-прекурсоров K11 = 0@11(CaSn5Li5) с симметрией m, образованного из сдвоенных пентагональных колец. Максимальная симметрия кластера K11 и первичной цепи из трансляционно связанных кластеров K11 соответствует некристаллографической симметрии 5m. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры из кластеров-прекурсоров K11 и K4 в виде: первичная цепь ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{1}}}$ → → микрослой ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{2}}}$ → микрокаркас ${\text{S}}_{{\text{3}}}^{{\text{3}}}.$ Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры интерметаллида LiMgEu2Sn3-oS28 из кластеров K4 = 0@4(LiMgEuSn) и K3 = 0@3(Sn2Eu). Образование слоя происходит при связывании расположенных параллельно цепей из K4 + K3.

Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ № 19-02-00636) и Министерства науки и высшего образования в рамках выполнения работ по Государственному заданию ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН.

Список литературы

  1. Inorganic crystal structure database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ), Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.

  2. Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data–Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.

  3. Todorov I., Sevov S.C. Heavy–metal aromatic and conjugated species: rings, oligomers, andchains of tin in Li(9 –x)EuSn(6 +x), Li(9 –x)CaSn(6 +x), Li5Ca7Sn11, Li6Eu5Sn9, LiMgEu2Sn3, and LiMgSr2Sn3 // Inorg. Chem. 2005 V. 44. P. 5361–5369.

  4. Xie Q.-X., Nesper R. Crystal structure of dieuropium monolithium trigermanide, Eu2LiGe3 // Z. Kristallogr. – New Cryst. Struct. 2004 V. 219. P. 79–80.

  5. Mueller W., Schaefer H., Weiss A. Die Struktur der Phasen Ca2LiSi3 und Ca2LiGe3 // Zeitschrift fuer Naturforschung, Teil B. Anorganische Chemie, Organische Chemie. 1971. V. 26. P. 5–7.

  6. Guo Shengping, You Taesoo, Bobev S. Closely related rare–earth metal germanides RE2 Li2 Ge3 and RE3Li4Ge4 (RE = La – Nd, Sm): synthesis, crystal chemistry, and magnetic properties // Inorganic Chemistry. 2012. V. 51. P. 3119–3129.

  7. Xie Q.-X., Nesper R. Crystal structure of dieuropium and distrontium di(lithium, magnesium) trigermanide, M2 Li(x) Mg(2 – x) Ge3 (M = Eu, x = 1.16; M = Sr, x = 0.94) // Z. Kristallogr. New Cryst. Struct. 2004. V. 219. P. 83–84.

  8. Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576–3585.

  9. Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Cluster Self–Organization of Intermetallic Systems: New Two–Layer Cluster–Precursor K46 = 0 @8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6) for Self–Assembly of the Crystal Structure of Ca11Hg54hP65 // Glass Physics and Chemistry. 2020. V. 46. P. 1–5.

  10. Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Cluster Self–Organization of Intermetallic Systems: New Precursor Cluster 0@8(Sr2Au6) for Self–Assembly of the Crystal Structure of (Sr2Au6)(Ga3)–hR66 // Glass Physics and Chemistry. 2020. V. 46. P. 6–12.

  11. Илюшин Г.Д. Интерметаллиды LikMn (М – Ag, Au, Pt, Pd, Ir, Rh): геометрический и топологический анализ, тетраэдрические кластерные прекурсоры и самосборка кристаллических структур // Кристаллография. 2020. Т. 65. Вып. 2. С. 202–210.

  12. Илюшин Г.Д. Интерметаллиды NakMn= K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb)): геометрический и топологический анализ, тетраэдрические кластерные прекурсоры и самосборка кристаллических структур // Кристаллография. 2020. Т. 65. С. 428–434.

  13. Ковальчук М.В., Алексеева О.А., Благов А.Е., Илюшин Г.Д. Исследование структуры кристаллообразующих растворов дигидрофосфата калия K(H2PO4) (тип KDP) на основе моделирования кластеров прекурсоров и по данным малоуглового рассеяния // Кристаллография. 2019. Т. 64. Вып. 1. С. 10–14.

  14. Shevchenko V.Ya., Blatov V.A., Ilyushin G.D. Symmetrical and Topological Self–Assembly Code of the Crystalline Structure of a New Aluminosilicate Zeolite ISC–1 from Templated t–plg Suprapolyhedral Precursors // Glass Physics and Chemistry. 2019. V. 45. № 2. P. 85–90.

  15. Ilyushin G.D. Crystal Chemistry of Lithium Intermetallic Compounds: A Survey. Russian // J. Inorganic Chemistry. 2018. V. 63. Iss. 14. P. 1786–1799.

  16. Ilyushin G.D. Modeling of the Self–Organization ProSesses in Crystal–Forming Systems. Tetrahedral Metal Clusters and the Self–Assembly of Crystal Structures of Intermetallic Compounds // Crystallography Reports. 2017. V. 62. 5. P. 670–683.

  17. Илюшин Г.Д. Кластерная самоорганизация интерметаллических систем:124 атомный кластер 0@ Ga12@ (Li20Ga12)@(Li4Na16 Ga60) и 44-атомный кластер 0@Ga12@ (Li2Na18Ga12) для самосборки кристаллической структуры Li48Na80 Ga332 – oF920 // Кристаллография. 2019. Т. 64. № 6. С. 857–861.

Дополнительные материалы отсутствуют.