Генетика, 2020, T. 56, № 8, стр. 964-968
О мономорфизме кариотипа голого землекопа Heterocephalus glaber (Rodentia: Heterocephalidae)
Е. Д. Землемерова 1, *, Д. С. Костин 1, **, Л. А. Лавренченко 1, ***
1 Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук
119071 Москва, Россия
* E-mail: zemlemerovalena@ya.ru
** E-mail: ds.kostin@yandex.ru
*** E-mail: llavrenchenko@gmail.com
Поступила в редакцию 11.07.2019
После доработки 13.08.2019
Принята к публикации 22.08.2019
Аннотация
Цитогенетический анализ кариотипов голого землекопа показал, что популяции из разных частей ареала этого вида, значительно отличающиеся по мтДНК, обладают одинаковым хромосомным набором (2N = 60; NF = 98). Предполагаемая стабильность хромосомного набора интерпретируется как фактор, способствующий поддержанию генетического разнообразия при эусоциальном образе жизни.
Голый землекоп (Heterocephalus glaber), в настоящее время выделяемый в монотипическое семейство Heterocephalidae [1], является широко используемым модельным объектом для различных исследований благодаря отдельным уникальным особенностям экологии и физиологии [2–4]. В то же время внутривидовая структура этого вида на всем его ареале, протянувшемся от Джибути на севере через Восточную Эфиопию и Сомали на юг вплоть до Южной Кении, остается малоисследованной. В особенности это касается цитогенетической изменчивости вида. Имеющиеся работы немногочисленны и основаны на единичных экземплярах из краевых частей ареала (Джордж, 1979 – 5 экз., Южная Кения [5]; Капана и Мерани, 1980 – 2 экз., Юго-Восточное Сомали [6]; Дев, 2006 [7] – 1 экз., лабораторная колония университета г. Кейптаун, ЮАР). При этом стоит отметить, что результаты молекулярно-генетических анализов, выполненных на основе последовательностей митохондриальной ДНК, обнаруживают достаточно выраженную филогеографическую структуру вида [8, 9]. Так, было показано, что митохондриальный генофонд H. glaber представлен двумя хорошо дивергировавшими линиями (K2P дистанция составляет 11% нуклеотидных замен по гену cytb), одна из которых включает популяции с востока Эфиопии, а вторая представлена популяциями из Южной Эфиопии и Кении [9, а также наши неопубликованные данные]. Внутри обеих линий также выделяются обособленные подклады, что, по всей видимости, связано с изолирующим эффектом отдельных горных хребтов (Черчер на востоке страны и Мега на крайнем юге). Существующее филогенетическое разнообразие H. glaber согласуется с предположением о достаточно древнем возрасте вида (возраст дивергенции от сестринского семейства Bathyergidae – 31.2 млн лет, [1]) и подчеркивает необходимость более полного цитогенетического исследования.
Работа была выполнена на 18 экземплярах, пойманных в шести локалитетах на территории Эфиопии (рис. 1,а; табл. 1), популяции которых относятся к основным митохондриальным линиям H. glaber [9]. Кариотипирование было проведено по стандартной методике [10], включающей внутрибрюшинную инъекцию колхицина, гипотонирование клеток костного мозга в растворе хлорида калия и последующую фиксацию трехкратным этанол-уксусным раствором. Окрашивание метафазных пластинок проводилось при помощи 2%-ного раствора красителя Гимза в течение 7 мин.
Таблица 1.
№ | ID | Локалитет | Координаты | cytb | |
---|---|---|---|---|---|
с.ш. | в.д. | ||||
1 | 2946 | НП Борена (5) | 4°33′58′′ | 38°18′55′′ | MK795872 |
2 | 2950 | НП Борена (5) | 4°33′58′′ | 38°18′55′′ | MN296098 |
3 | 2953 | НП Борена (5) | 4°33′58′′ | 38°18′55′′ | MK795871 |
4 | 2954 | НП Борена (5) | 4°33′58′′ | 38°18′55′′ | MN296099 |
5 | 3058 | НП Борена (5) | 4°33′58′ | 38°18′55′′ | MK795882 |
6 | 3119 | Лес Ареро (4) | 4°49′08′ | 38°49′08′′ | MK795887 |
7 | 3184 | НП Борена, блок Мегаду (6) | 3°48′15′′ | 38°05′56′′ | MK795891 |
8 | 3205 | НП Борена, блок Мегаду (6) | 3°46′53′′ | 38°04′02′′ | MK795892 |
9 | 3408 | Джельдесса (1) | 9°45′43′′ | 42°16′55′′ | MN296100 |
10 | 3410 | Джельдесса (1) | 9°45′43′′ | 42°16′55′′ | MN296101 |
11 | 3411 | Джельдесса (1) | 9°45′43′′ | 42°16′55′′ | MN296102 |
12 | 3449 | Дыре-Дауа (2) | 9°44′16′′ | 42°15′30′′ | MN296103 |
13 | 3452 | Дыре-Дауа (2) | 9°44′16′′ | 42°15′30′′ | MN296104 |
14 | 3507 | Слоновий заказник Бабиле (3) | 9°10′40′′ | 42°14′53′′ | MN296105 |
15 | 3508 | Слоновий заказник Бабиле (3) | 9°10′40′′ | 42°14′53′′ | MN296106 |
16 | 3510 | Слоновий заказник Бабиле (3) | 9°10′40′′ | 42°14′53′′ | MN296107 |
17 | 3524 | Слоновий заказник Бабиле (3) | 9°10′11′′ | 42°15′33′′ | MN296108 |
18 | 3527 | Слоновий заказник Бабиле (3) | 9°10′16′′ | 42°15′40′′ | MN296109 |
Примечание. Нумерация локалитетов соответствует нумерации на рис. 1. НП – национальный парк. Номера последовательностей гена цитохрома b, депонированных в базу данных Генбанк, представлены в колонке cytb.
Цитогенетический анализ кариотипов показал, что диплоидный набор голого землекопа состоит из 60 хромосом, из которых 19 пар являются двуплечими (мета- и субметацентриками), а 10 пар представлены акроцентриками, а также средними и мелкими субтелоцентриками (рис. 1,б). X-хромосома представляет собой большой субметацентрик, Y-хромосома – мелкий акроцентрик. Таким образом, фундаментальное число хромосом составляет NF = 98. Полученный результат значительно отличается от немногочисленных и достаточно противоречивых литературных данных. Так, в работе Джорджа [5] значение фундаментального числа равно 120 (все хромосомы, включая мелкие субтелоцентрики, автор учитывал как двуплечие), в то время как Капана и Мерани [6] описывают всего лишь 10 пар двуплечих хромосом, определяя NF равным 82. Стоит отметить, что описанные различия в оценке числа плеч могут возникать вследствие разных методов кариотипирования. Так, хромосомные препараты, полученные методом внутрибрюшинного колхицинирования с последующим взятием клеток костного мозга, могут обнаруживать большую степень спирализации хромосом, в отличие от препаратов, полученных на основе культуры клеток, что вызывает определенные затруднения при подсчете фундаментального числа, особенно в случае мелких хромосом. Полученный нами результат 2N = 60; NF = 98 представляется наиболее адекватным вариантом описания кариотипа голого землекопа и согласуется с известными ранее данными, полученными на основе образцов из лабораторной колонии университета г. Кейптаун, ЮАР [7].
Все 18 кариотипированных образцов обнаружили одинаковый кариотип (насколько это позволяет выявить метод рутинной окраски), несмотря на имеющиеся различия по мтДНК [9]. Данные о существовании различий в “длине коротких плеч” между популяциями с территории Кении и Сомали [8] заимствованы из работы Ханекута с соавт. [12], в которой сравниваются результаты ранних работ Джорджа [5] и Капана и Мерани [6]. Таким образом, упомянутый полиморфизм является скорее результатом использования различных методик отдельными исследователями, нежели реально существующим эволюционным паттерном (см. обсуждение выше). Полученные нами результаты вместе с имеющимися литературными данными ранних работ позволяют предположить, что кариотип голого землекопа является достаточно мономорфным на всем протяжении ареала вида, несмотря на имеющиеся генетические различия между отдельными популяциями.
Принимая во внимание ограниченную разрешающую способность метода рутинной окраски хромосом, можно предположить, что дальнейшее использование современных молекулярно-цитогенетических методов позволит более детально охарактеризовать кариотип голого землекопа. Стоит отметить, что у намного более молодого рода Cryptomys, входящего в сестринское семейство Bathyergidae, хромосомная изменчивость варьирует в широких пределах: от 2N = 40 у C. mechowi до 2N = 78 у C. damarensis [13]. Это позволяет предположить, что выявление выраженного хромосомного полиморфизма в данной группе возможно даже при использовании метода рутинной окраски хромосом.
Процесс адаптации к подземному образу жизни может приводить к снижению уровня дисперсии животных и уменьшению эффективного размера популяции [14]. Это создает условия для возникновения хромосомной изменчивости и именно среди подземных грызунов имеются примеры существования широкого спектра кариотипического разнообразия (например, рода Ctenomys, Thomomys, Spalax, Ellobius, Tachyoryctes) [15–17]. При этом стоит отметить, что дальнейший эволюционный “шаг” – переход от существующего полиморфизма к дивергенции и в конечном результате к процессу видообразования до сих пор остается практически неисследованным [18]. Голый землекоп, по всей видимости, представляет собой пример прямо противоположного эволюционного паттерна, обнаруживая выраженную стабильность кариотипа на всем ареале. Можно предположить, что наблюдаемая картина может быть объяснена, хотя бы отчасти, эусоциальной структурой H. glaber. Так, вследствие ограниченной способности к дисперсии и участия в размножении единичных особей в ранних работах было предположено, что колонии голого землекопа характеризуются крайне высокой степенью инбредности [19]. При этом вовлечение в размножение нескольких (2–3) самцов способно лишь незначительно поддерживать генетическое разнообразие в высокополиморфных локусах [8]. В связи с этим единственным путем поддержания генетического разнообразия является приток новых аллелей за счет особей-мигрантов из других колоний. Существование особой “расселяющейся” морфы, морфологически и физиологически отличающейся от рабочих особей колонии, было показано в исследовании О’Райна с соавт. [20]. Учитывая крайне долгую продолжительность жизни голого землекопа, размножающиеся особи-мигранты увеличивают эффективный размер популяции и могут перемещаться на значительные расстояния, обеспечивая перенос генов между популяциями [14]. Таким образом, при отсутствии иных путей поддержания генетического разнообразия необходимость обеспечения успешного скрещивания с особями из других колоний (что возможно в случае идентичности хромосомных наборов) может быть одним из факторов, сдерживающих хромосомную эволюцию.
Авторы благодарны к. б. н. Д.Ю. Александрову, А.Р. Громову и А.А. Мартынову за помощь в сборе полевого материала.
Работа выполнена при финансовой поддержке Российского научного фонда (проект № 18-74-00114) (цитогенетические исследования) и в рамках госзадания ИПЭЭ РАН, проект № АААА-А18-118042490058-8 (сбор материала).
Все применяемые международные, национальные и/или институциональные принципы ухода и использования животных были соблюдены.
Авторы заявляют, что у них нет конфликта интересов.
Список литературы
Patterson B.D., Upham N.S. A newly recognized family from the Horn of Africa, the Heterocephalidae (Rodentia: Ctenohystrica) // Zool. J. Linn. Soc. 2014. V. 172. № 4. P. 942–963. https://doi.org/10.1111/zoj.12201
Kutsukake N., Inada M., Sakamoto S.H., Okanoya K. A distinct role of the queen in coordinated workload and soil distribution in eusocial naked mole-rats // PLoS One. 2012. V. 7. № 9. P. e44584. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0044584
Delsuc F., Tilak M.K. Naked but not hairless: The pitfalls of analyses of molecular adaptation based on few genome sequence comparisons // Genome Biol. Evol. 2015. V. 7. № 3. P. 768–774. https://doi.org/10.1093/gbe/evv036
Piersigilli A., Meyerholz D.K. The “Naked Truth” naked mole-rats do get cancer // Vet. Pathol. 2016. V. 53. № 3. P. 519–520. https://doi.org/0.1177/0300985816638431
George W. Conservatism in the karyotypes of two African mole-rats (Rodentia, Bathyergidae) // Z. Saugetierkunde. 1979. V. 44. P. 278–285.
Capanna E., Merani M.S. Karyotypes of Somalian Rodent populations // Monit. Zool. Ital. Suppl. 1980. V. 13. № 1. P. 45–51. https://doi.org/10.1080/00269786.1980.11758548
Deuve J.L., Bennett N.C., O’Brien P.C.M. et al. Complex evolution of X and Y autosomal translocations in the giant mole-rat, Cryptomys mechowi (Bathyergidae) // Chromosome Res. 2006. V. 14. № 6. P. 681–691. https://doi.org/10.1007/s10577-006-1080-3
Faulkes C.G., Bennett N.C., Bruford M.W. et al. Ecological constraints drive social evolution in the African mole-rats // Jarvis Source Proc. Biol. Sci. 1997. V. 264. № 1388. P. 1619–1627. https://doi.org/10.1098/rspb.1997.0226
Землемерова Е.Д., Костин Д.С., Громов А.Р. и др. Предварительные сведения по филогеографии голого землекопа Heterocephalus glaber (Rodentia: Heterocephalidae) // Генетика. 2020. Т. 56. № 3. С. 355–360.
Ford C.E., Hamerton J.L. A colchicine hypotonic citrate, squash sequence for mammalian chromosomes // Stain Technol. 1956. V. 31. P. 247–251.
Jarvis J.U.M. Heterocephalus glaber naked mole-rat // Mammals of Africa: vol. 3. Rodents, Hares and Rabbits / Ed. Happold D. London: Bloomsbury Publ., 2013. P. 668–670.
Honeycutt R.L., Allard M.W., Edwards S.V. et al. Systematics and evolution of the family Bathyergidae // The Biology of the Naked Mole-Rat / Eds Sherman P.W., Jarvis J.U.M., Alexander R.D. Princeton; New Jersey: Princeton Univ. Press, 1991. P. 45–65.
Deuve J.L., Bennett N.C., Britton-Davidian J., Robinson T.J. Chromosomal phylogeny and evolution of the African mole-rats (Bathyergidae) // Chromosome Res. 2008. V. 16. № 1. P. 57–74. https://doi.org/10.1007/s10577-007-1200-8
Braude S. The multiple meanings of inbreeding: the key to understanding the social and genetic structure of subterranean rodent populations // Subterranean Rodents. Berlin; Heidelberg: Springer, 2007. P. 331–340. https://doi.org/10.1007/978-3-540-69276-8_25
Lavrenchenko L.A., Bulatova N.S., Potapov S.G. et al. Genetic and cytogenetic variation of African root-rats Tachyoryctes splendens (Mammalia: Rodentia) from Ethiopia // Rus. J. Theriology. 2014. V. 13. № 2. P. 109–118.
Баклушинская И.Ю., Романенко С.А., Графодатский А.С. и др. Роль хромосомных перестроек в эволюции слепушонок рода Ellobius (Rodentia, Mammalia) // Генетика. 2010. Т. 46. № 9. С. 1290–1293.
Bakloushinskaya I., Lyapunova E.A., Saidov A.S. et al. Rapid chromosomal evolution in enigmatic mammal with XX in both sexes, the Alay mole vole Ellobius alaicus Vorontsov et al., 1969 (Mammalia, Rodentia) // Comparative Cytogenetics. 2019. V. 13. № 2. P. 147. https://doi.org/10.3897/CompCytogen.v13i2.34224
Баклушинская И.Ю. Хромосомные перестройки, реорганизация генома и видообразование // Зоол. журн. 2016. Т. 95. № 4. С. 376–393. https://doi.org/10.7868/S0044513416040036
The Biology of the Naked Mole-Rat / Eds Sherman P.W., Jarvis J.U.M., Alexander R.D. Princeton; New Jersey: Princeton Univ. Press, 1991. 536 p.
O’Riain M.J., Jarvis J.U.M., Faulkes C.G. A dispersive morph in the naked mole-rat // Nature. 1996. V. 380. № 6575. P. 619. https://doi.org/10.1038/380619a0
Дополнительные материалы отсутствуют.