Вопросы ихтиологии, 2019, T. 59, № 5, стр. 578-578
Первая полная последовательность митохондриального генома представителей рода Aphanius (Teleostei)
А. Теймори 1, *, М. Мотамеди 1
1 Департамент биологии научного факультета университета Шахида Бахорана
Керман, Иран
* E-mail: a.teimorii@uk.ac.ir
Поступила в редакцию 15.02.2019
После доработки 11.04.2019
Принята к публикации 15.05.2019
Аннотация
Впервые выделили и охарактеризовали полную последовательность митохондриального генома вида Aphanius farsicus, находящегося под угрозой исчезновения, методами амплификации длинной полимеразной цепной реакции и праймер-опосредованной прогулки. Круговой митогеном A. farsicus, состоящий из 16530 пар оснований, кодирует 13 полипептидов (гены, кодирующие белок), 12S и 16S рибосомальные РНК, а также 22 трансфертные РНК и 884 пар оснований контрольного региона. Эти гены упорядочены так же, как и у большинства других позвоночных. Общий нуклеотидный состав этого генома составил 27.09% для аденина, 27.87% – для тимина, 16.89% – для гуанина и 28.14% – для цитозина (отношение гуанина: цитозина и аденина: тимина – 45 и 55%). Род Aphanius ранее включался в семейство Cyprinodontidae. Тем не менее название Aphaniidae недавно было предложено в качестве отдельного семейства для представителей рода Aphanius (западные палеарктические киллифиши), в то время как семейство Cyprinodontidae ограничено родами Cyprinodon, Floridichthys и Jordanella. Основываясь на филогенетических отношениях, выявленных в настоящем исследовании, мы рекомендуем, чтобы для валидации семейства Aphaniidae были найдены более серьезные филогенетические основания, которые могут быть достигнуты путём добавления большего числа генетических последовательностей видов рода Aphanius. Наличие такого митогенома также может обеспечить набор полезных данных для изучения популяционно-генетического разнообразия и молекулярной эволюции и облегчить оценку генетической структуры A. farsicus для управления и сохранения этого находящегося под угрозой исчезновения вида.
Полностью статья опубликована в английской версии журнала.
Список литературы отсутствует.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Вопросы ихтиологии