Вопросы ихтиологии, 2021, T. 61, № 3, стр. 313-313

Первая инвентаризация рыб Суэцкого залива на основе ДНК-штрихкодирования и её значение для видового разнообразия Египта

Е. М. Аббас 1, М. Исмаил 2, А. Эль-Ганайни 1, Ф. С. Али 1*

1 Национальный институт океанографии и рыбного хозяйтсва
Каир, Египет

2 Университет Менуфия
Шибин-эль-Ком, Египет

* E-mail: dr_allam84@hotmail.com

Поступила в редакцию 21.07.2020
После доработки 30.09.2020
Принята к публикации 12.10.2020

Полный текст (PDF)

Аннотация

Суэцкий залив является одним из наиболее важных водных объектов к северу от Красного моря, вносящих значительный вклад в объёмы добываемой рыбы Египта. Настоящее исследование представляет собой первую идентификацию морских видов рыб Суэцкого залива в Египте с помощью молекулярных методов на основе ДНК-штрихкодирования. С использованием фрагмента гена субъединицы I митохондриальной цитохромоксидазы (COI) длиной 662 пары нуклеотидов были получены в общей сложности 96 ДНК-штрихкодов от 32 видов, принадлежащих к 26 родам и 19 семействам. Средняя генетическая дивергенция, основанная на двухпараметрической модели Кимуры (K2P), между семействами и видами составила 0.274 и 0.256 соответственно. Генетическое расстояние между семействами сильно различалось, причём наименьшее генетическое расстояние 0.190 было получено между Carangidae и Atherinidae, в то время как генетическое расстояние между Sphyraenidae и Moronidae составило 0.472. Процентное соотношение состава гуанин-цитозина по видам было выше среднего и колебалось между 51.74% у Acanthopagrus bifasciatus и 66.37% − у Lagocephalus guentheri. Дерево, построенное с помощью метода присоединения соседей, показало чёткую кластеризацию 19 семейств рыб с видами, образовавшими единый кластер в пределах каждого семейства. Результаты текущего исследования подтверждают, что ДНК-штрихкодирование с использованием COI эффективно идентифицирует виды рыб Суэцкого залива. Кроме того, результаты текущего исследования позволили впервые зарегистрировать ДНК-штрихкоды для рыб Суэцкого залива в Египте, что будет способствовать дальнейшей идентификации видов рыб этого региона.

Ключевые слова: ДНК-штрихкодирование, фрагмент гена субъединицы I цитохромоксидазы (СOI), Красное море, Суэцкий залив, инвентаризация ихтиофауны, биоразнообразие рыб.

Полностью статья опубликована в английской версии журнала.

Дополнительные материалы отсутствуют.