1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Российские нанотехнологии
  4. T. 18, № 3, 2023

Российские нанотехнологии, 2023, T. 18, № 3, стр. 302-310

Национальная база генетической информации

И. А. Колесников 1, *, М. В. Николенко 1, А. В. Ермаков 1, А. А. Корженков 1, А. А. Заикин 1, В. Е. Велихов 1, С. А. Бобков 1, Ф. С. Шарко 1, З. Б. Намсараев 1, М. В. Патрушев 1

1 Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”
Москва, Россия

* E-mail: ivan.a.kolesnikov@gmail.com

Поступила в редакцию 21.04.2023
После доработки 21.04.2023
Принята к публикации 24.04.2023

Аннотация

В соответствии с поручением Президента Российской Федерации НИЦ “Курчатовский институт” создает Национальную базу генетической информации (НБГИ). Согласно поправкам в Федеральный закон от 29 декабря 2022 г. организации, осуществляющие генно-инженерную деятельность, производство или поставку генно-инженерно-модифицированных организмов или продукции, полученной с их применением, должны в обязательном порядке депонировать информацию в НБГИ. Планируется, что НБГИ станет ключевым элементом инфраструктуры генетических исследований и разработок в Российской Федерации, обеспечивающим хранение, интеграцию и анализ генетических данных. Представлена информация о вычислительной и сетевой инфраструктуре, программном обеспечении, депонировании данных и аналитических возможностях НБГИ.

Список литературы

  1. Rigden D.J., Fernández X.M. // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. № D1. P. D1.https://doi.org/10.1093/nar/gkab1195

  2. Федеральный закон № 643-ФЗ от 29.12.2022 “О внесении изменений в Федеральный закон “О государственном регулировании в области генно-инженерной деятельности”.

  3. https://www.strand-ngs.com/support/ngs-data-storage-requirements

  4. https://kubernetes.io/

  5. Cantelli G., Bateman A., Brooksbank C. et al. // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. № D1. P. D11. https://doi.org/10.1093/nar/gkab1127

  6. Arita M., Karsch-Mizrachi I., Cochrane G. et al. // Nucleic Acids Res. 2021. V. 49. № D1. P. D121. https://doi.org/10.1093/nar/gkaa967

  7. Ogle C., Reddick D., McKnight C. et al. // Frontiers in Big Data. 2021. V. 4. P. 582468. https://doi.org/10.3389/fdata.2021.582468

  8. National Genomics Data Center Members and Partners // Nucleic Acids Res. 2020. V. 48. № D1. P. D24. https://doi.org/10.1093/nar/gkz913

  9. Barrett T., Clark K., Gevorgyan R. et al. // Nucleic Acids Res. 2012. V. 40. № D1. P. D57. https://doi.org/10.1093/nar/gkr1163

  10. Schoch C.L., Ciufo S., Domrachev M. et al. // Database. 2020. V. 2020. P. baaa062. https://doi.org/10.1093/database/baaa062

  11. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=statistics&?&m=0

  12. Yilmaz P., Parfrey L.W., Yarza P. et al. // Nucleic Acids Res. 2014. V. 42. № D1. P. D643. https://doi.org/10.1093/nar/gkt1209

  13. Parks D.H., Chuvochina M., Rinke C. et al. // Nucleic Acids Res. 2022. V. 50. № D1. P. D785. https://doi.org/10.1093/nar/gkab776

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Российские нанотехнологии

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал