1. На главную
  2. Электронные версии
  3. Кристаллография
  4. T. 68, № 6, 2023

Кристаллография, 2023, T. 68, № 6, стр. 922-925

Предварительное рентгеноструктурное исследование пуриннуклеозидфосфорилазы из галоалкалофильной бактерии Halomonas chromatireducens

Т. Н. Сафонова 1, *, А. Н. Антипов 1, В. П. Вейко 1, Н. Н. Мордкович 1, 2, Н. А. Окорокова 1, П. В. Дороватовский 3, К. М. Поляков 4, **

1 Институт биохимии им. А.Н. Баха, Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” РАН
Москва, Россия

2 Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова
Москва, Россия

3 Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”,
Москва, Россия

4 Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН
Москва, Россия

* E-mail: tn_safonova@mail.ru
** E-mail: kmpolyakov@gmail.com

Поступила в редакцию 16.06.2023
После доработки 16.06.2023
Принята к публикации 28.08.2023

Аннотация

Кристаллы фермента пуриннуклеозидфосфорилазы из экстремофильной бактерии Halomonas chromatireducens AGD 8-3, подходящие для рентгеноструктурного исследования, выращены методом диффузии паров. Дифракционный набор от полученных кристаллов собран до разрешения 1.8 Å на станции белковой кристаллографии “Белок” синхротрона Национального исследовательского центра “Курчатовский институт” при температуре 100 K. Набор данных обработан для пр. гр. P1, Р2, Р21 и Р622. Решение методом молекулярного замещения с учетом двойникования было найдено для групп Р21 и P1, содержащих в независимой части элементарной ячейки один и два гексамера фермента соответственно.

Список литературы

  1. Ealick S.E., Rule S.A., Carter D.C. et al. // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 1812. https://doi.org/10.1016/S0021-9258(19)40090-2

  2. Mao C., Cook W.J., Zhou M. et al. // Structure. 1997. V. 5. P. 1373. https://doi.org/10.1016/S0969-2126(97)00287-6

  3. Krenitsky T.A., Koszalka G.W., Tuttle J.V. // Biochemistry. 1981. V. 20 (12). P. 3615. https://doi.org/10.1021/bi00515a048

  4. Bennett E.M., Li C., Allan P.W. et al. // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. P. 47110. https://doi.org/10.1074/jbc.M304622200

  5. Ducati R.G., Santos D.S., Basso L.A. // Arch. Biochem. Biophys. 2009. V. 486. P. 155. https://doi.org/10.1016/j.abb.2009.04.011

  6. Михайлопуло И.А., Мирошников А.И. // Acta Naturae. 2010. Т. 2. № 2. С. 36. https://doi.org/10.32607/20758251-2010-2-2-36-58

  7. Nannemann D.P., Kaufmann K.W., Meiler J. et al. // Protein Eng. Des. Sel. 2010. V. 23. P. 607. https://doi.org/10.1093/protein/gzq033

  8. Xie X., Xia J., He K. et al. // Biotechnol. Lett. 2011. V. 33. P. 1107. https://doi.org/10.1007/s10529-011-0535-6

  9. Liekens S., De Clercq E., Neyts J. // Biochem. Pharmacol. 2001. V. 61. № 3. P. 253. https://doi.org/10.1016/s0006-2952(00)00529-3

  10. Carmeliet P. // Nature. 2005. V. 438. № 7070. P. 932. https://doi.org/10.1038/nature04478

  11. Furukawa T., Tabata S., Yamamoto M. et al. // Pharmacol. Res. 2018. V. 132. P. 15 https://doi.org/10.1016/j.phrs.2018.03.019

  12. Pant P., Pathak A., Jayaram B. // J. Phys. Chem. B. 2021. V. 125. P. 2856. https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c10553

  13. Madrid D.C., Ting L.-M., Waller K.L. et al. // J. Biol. Chem. 2008. V. 283. P. 35899. https://doi.org/10.1074/jbc.M807218200

  14. Myers L.A., Hershfield M.S., Neale W.T. et al. // J. Pediatr. 2004. V. 145. P. 710. https://doi.org/10.1016/j.jpeds.2004.06.075

  15. Погосян Л.Г., Нерсесова Л.С., Газарянц М.Г. и др. // Биомед. химия. 2011. Т. 57. № 5. С. 526. https://doi.org/10.18097/PBMC20115705526

  16. Антипов А.Н., Мордкович Н.Н., Хижняк Т.В. и др. // Прикл. биохим. микробиол. 2020. Т. 56. № 1. С. 45. https://doi.org/10.31857/S055510992001002X

  17. Шаповалова А.А., Хижняк Т.В., Турова Т.П. и др. // Микробиология. 2009. Т. 78. № 1. С. 117. https://doi.org/10.1134/S0026261709010135

  18. Мордкович Н.Н., Манувера В.А., Вейко В.П. и др. // Биотехнология. 2012. № 1. С. 21.

  19. Kabsch W. // Acta. Cryst. D. 2010. V. 66. P. 125. https://doi.org/10.1107/S0907444909047337

  20. Murshudov G.N., Skubák P., Lebedev A.A. et al. // Acta Cryst. D. 2011. V. 67. P. 355. https://doi.org/10.1107/S0907444911001314

Дополнительные материалы отсутствуют.

Инструменты

следующая статья выпуска предыдущая статья выпуска содержание выпуска

Кристаллография

Архивы выпусков Информация о журнале Отправить рукопись в журнал