Биоорганическая химия, 2020, T. 46, № 2, стр. 180-180

МикроРНК играют критически важную роль в регуляции многих биологических процессов в эукариотах. Batrachuperus karlschmidti – вид саламандр под угрозой вымирания, эндемичный для Китая, который привлек внимание в силу его высокой ценности для палеонтологии и эволюционной истории, а также снижающейся численности популяции. Большая часть микроРНК была обнаружена в животных, однако микроРНК B. karlschmidti ранее не изучались. В данной работе с помощью технологии глубокого секвенирования идентифицированы и проанализированы микроРНК B. karlschmidti. Всего получено 13 377 954 прочтения. Из них 2 724 630 уникальных прочтений соответствуют 866 известным и трем новым микроРНК. Все идентифицированные микроРНК были подтверждены с помощью метода ОТ-ПЦР шпилек. Дополнительно 5452 кандидатов генов-мишеней были предсказаны. Анализ терминов GO и KEGG показал, что большинство мишеней задействованы в широком спектре биологических и метаболических процессов. Также результаты свидетельствуют о том, что некоторые из генов-мишеней являются факторами транскрипции, которые могут быть связаны с адаптацией к экологическим условиям. В целом, полученные результаты представляют собой первый крупномасштабный анализ микроРНК B. karlschmidti. Характеристика микроРНК B. karlschmidti вносит вклад в понимание сложной роли микроРНК-зависимых регуляторных сетей в экспрессии генов для регуляции разнообразных биологических процессов и значительно облегчает дальнейшие исследования микроРНК этого вида.