Доклады Российской академии наук. Науки о жизни, 2021, T. 499, № 1, стр. 375-380
ХИМИЧЕСКАЯ ИНДУКЦИЯ ГИПОКСИИ ТРОФОБЛАСТА ХЛОРИДОМ КОБАЛЬТА ПРИВОДИТ К ПОВЫШЕНИЮ ЭКСПРЕССИИ DDIT3
Е. Н. Князев 1, 2, 3, *, С. Ю. Пауль 2, 4, член-корреспондент РАН А. Г. Тоневицкий 1, 2
1 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
Москва, Россия
2 Факультет биологии и биотехнологии, Национальный исследовательский университет “Высшая школа экономики”
Москва, Россия
3 Центр трансляционных технологий
Москва, Россия
4 Троицкий инженерный центр
Москва, Россия
* E-mail: knyazevevg@gmail.com
Поступила в редакцию 05.04.2021
После доработки 19.04.2021
Принята к публикации 22.04.2021
Аннотация
Клетки хориокарциномы BeWo b30 используются для моделирования гипоксии трофобласта плаценты человека с применением хлорида кобальта (II) и производного оксихинолина (ПО) в качестве химических индукторов фактора, индуцируемого гипоксией (HIF). В данном исследовании было показано, что оба вещества активируют гипоксический путь и эпителиально-мезенхимальный переход и подавляют пути клеточной пролиферации. Однако CoCl2 вызывал активацию пути апоптоза, что выражалось в повышении активности эффекторных каспаз-3 и 7, и увеличивал экспрессию мишени ответа на несвернутые белки DDIT3. При воздействии CoCl2 активировался путь mTORC1, в то время как ПО подавляло данный путь, как это происходит при реальной гипоксии трофобласта. Таким образом, воздействие CoCl2 на клетки BeWo b30 может являться моделью более тяжелой гипоксии с активацией апоптоза, а ПО имитирует умеренную гипоксию.
При нормальном развитии плаценты на 9–10-й день после оплодотворения клетки цитотрофобласта мигрируют в спиральные артерии матки и замещают эндотелий, формируя сосуды с высоким потоком, устойчивые к действию факторов, регулирующих тонус сосудов. Нарушение инвазии трофобласта в сосуды вследствие гипоксии и других факторов приводит к нарушению кровоснабжения, эндоплазматическому стрессу и повышению апоптоза клеток трофобласта [1].
Изучение биологии плаценты при беременности у людей ограничено по этическим причинам, а плацента после нормальных родов или кесарева сечения не отражает ранних этапов развития плаценты, важных для патогенеза преэклампсии. Животные модели плаценты отличаются от человеческой как на анатомическом, так и на молекулярном уровне [2]. В связи с этим особое значение приобретают модели плацентарного барьера in vitro. Первичные клетки трофобласта человека имеют ограниченный потенциал деления и низкую воспроизводимость результатов при использовании клеток от разных доноров. Использование иммортализованных клеточных линий, имитирующих нормальный трофобласт, таких как линия хориокарциномы человека BeWo b30, позволяет достичь лучшей воспроизводимости, а применение внеклеточного матрикса и микрофлюидных устройств для имитации естественного микроокружения и кровотока еще больше приближает модели in vitro к физиологическим условиям [3].
Центральным звеном активации гипоксического пути является накопление индуцируемого гипоксией фактора 1 альфа (HIF-1α). При нормоксии HIF-1α гидроксилируется HIF-пролилгидроксилазами (PHD), что создает условия для присоединения белка фон Гиппеля–Линдау (pVHL) и запуска убиквитинилирования и протеасомной деградации HIF-1α [4]. В условиях гипоксии активность PHD подавляется, уровень HIF-1α повышается, происходит его транслокация в ядро и гетеродимеризация с конститутивно4й субъединицей HIF-1β, что вызывает транскрипцию генов-мишеней [5].
Индукция гипоксии с помощью CoCl2 достигается за счет замещения ионов Fe2+ в активном центре PHD на ионы Co2+. Также CoCl2 вызывает окисление аскорбатов, являющихся важными кофакторами PHD, связывается с HIF-1α, препятствуя взаимодействию с pVHL, и ингибирует аспарагинилгидроксилазу FIH, ингибирующую HIF. Более подробно механизмы действия CoCl2 описаны в обзоре [6]. Следует отметить, что гены, экспрессия которых изменяется при действии CoCl2, лишь частично пересекаются с таковыми при дефиците кислорода, что может объясняться действием CoCl2 на другие ферменты и сигнальные пути клетки [7] и ставит под вопрос релевантность данной модели гипоксии.
Ранее было показано, что для химического моделирования гипоксии также могут использовать производные оксихинолина (ПО), которые связываются с ионом Fe2+ в активном центре PHD, но не других известных ферментов этого семейства, что приводит к ингибированию гидроксилирования HIF-1α, его накоплению в клетке и активации гипоксийного пути [8]. Заместители в 7 положении ПО имитируют структуру домена HIF-1α, контактирующего с активным центром PHD, что обеспечивает специфичное связывание с этими ферментами и уменьшает число побочных эффектов по сравнению с использованием CoCl2 [9, 10].
Целью данного исследования являлось сравнение изменений в клетках на уровне транскриптома при воздействии CoCl2 и ПО на клетки хориокарциномы BeWo b30.
Клетки хориокарциномы BeWo b30 выращивались в 6-луночных планшетах в среде DMEM с L-глутамином и содержанием глюкозы 4.5 г/л с добавлением 10% фетальной бычьей сыворотки One Shot, 1% 100x MEM NEAA и 1% 100x Pen Strep. При достижении 80% конфлюэнтности клеточная среда заменялась на среду, содержащую 300 мкМ CoCl2 или 5 мкМ ПО 4896–3212. В контрольных условиях производилась замена на свежую культуральную среду. Спустя 24 ч производилась оценка метаболической активности клеток MTT-тестом, а также активности каспазы-3 и 7 как показатель эффекторной фазы апоптоза набором реагентов Abcam Caspase-3 Assay Kit.
Выделение тотальной РНК проводили методом гуанидинтиоцианат-фенол-хлороформной экстракции [11] с помощью набора реагентов Qiagen miRNeasy Mini Kit. Концентрация РНК определялась на приборе NanoDrop 1000 [12]. Качество РНК оценивалось на приборе Bio-Rad Experion по значению RQI [13].
Секвенирование следующего поколения производилось на приборе Illumina NextSeq 500 с подготовкой библиотек набором Illumina Stranded mRNA Library Prep Kit. Изменение экспрессии генов считалось достоверным при кратности различий более 2.0 и p-значении для t-критерий Стьюдента с поправкой Бенджамини–Хохберга на множественность сравнений менее 0.05 [14]. Были определены активированные и подавленные сигнальные пути с использованием коллекции MSigDB.
Тяжелая гипоксия, оксидативный стресс при действии реактивных форм кислорода (ROS) и эндоплазматический стресс могут вызывать активацию внутреннего сигнального пути апоптоза. Эффекторная фаза апоптоза связана с активацией каспаз-3 и 7, обусловливающих основные процессы апоптотической трансформации клеток [15]. Относительная активность каспазы-3 и 7 представлена в табл. 1 вместе с метаболической активностью по MTT-тесту. Из полученных данных можно сделать вывод, что при воздействии CoCl2 сильнее выражена активации апоптоза в клетках, что имитирует более тяжелую гипоксию трофобласта по сравнению с ПО. Отсутствие различий в результатах MTT-теста между двумя воздействиями свидетельствует, что оба вещества практически не оказывают значимого влияния на активность митохондрий клеток как реакцию на активацию гипоксического пути.
Воздействие CoCl2 на клетки BeWo b30 в течение 24 ч привело к статистически значимому изменению более чем в 2 раза экспрессии 3030 генов, а при воздействии ПО – 1030 генов, при этом экспрессия 287 генов изменялась однонаправленно при обоих условиях. При обоих типах воздействия был активирован гипоксический путь и эпителиально-мезенхимальный переход и подавлена активность путей, связанных с транскрипционными факторами семейства E2F и контрольной точкой G2M, т.е. путей клеточной пролиферации. Это совпадает с эффектами гипоксии на плаценту in vivo: активация HIF-1α в клетках трофобласта подавляет деление и стимулирует клеточную подвижность, что приводит к миграции клеток трофобласта и их инвазии в маточные сосуды [1].
На рис. 1а представлены профили экспрессии генов пути гипоксии в образцах контрольных клеток и при воздействии ПО и CoCl2, свидетельствующие об активации одинаковых мишеней HIF-1α. При анализе генов, экспрессия которых достоверно изменилась уникально для воздействия CoCl2, выявлена активация пути апоптоза и ответа на ROS. Это подтверждает данные, что кобальт может вызывать накопление ROS, вызывая повреждение ДНК и приводя к апоптозу [16].
При этом среди генов, экспрессия которых изменилась только при воздействии ПО, активация данных путей не наблюдалась. На рис. 1в представлена экспрессия генов пути апоптоза, свидетельствующая, что картина в контроле и при воздействии ПО практически не отличается, в то время как кобальт вызывает значимую активацию данного пути.
Гипоксия, сопровождающаяся образованием ROS и цитоплазматическим стрессом, приводит к нарушению правильного свертывания белков и активации пути ответа на несвернутые белки. Данный путь приводит к адаптации клетки к гипоксии, однако тяжелая гипоксия, превышающая компенсаторные возможности клетки, приводит через указанный путь к накоплению фактора транскрипции CHOP, кодируемого геном DDIT3, запускающего апоптоз [17]. При воздействии ПО экспрессия DDIT3 значимо не изменялась, однако действие CoCl2 повышало экспрессию DDIT3 в 3.9 раза (p < 0.001). На рис. 2 отображена упрощенная схема пути ответа на несвернутые белки и отмечено повышение экспрессии CHOP, обнаруженное в нашем исследовании. По-видимому, воздействие CoCl2 имитирует более тяжелую форму гипоксии по сравнению с ПО. Было показано, что другое ПО, известное под названием адаптахин, препятствует активации апоптоза через ветвь ответа на несвернутые белки PERK/ATF4/CHOP [18], что согласуется с нашими наблюдениями.
При анализе генов, экспрессия которых достоверно изменилась уникально для воздействия ПО, выявлено снижение окислительного фосфорилирования, что является нормальной реакцией клеток трофобласта при переходе от аэробного к анаэробному метаболизму при гипоксии [19].
Следует особо отметить, что по результатам анализа сигнальных путей в клетках BeWo b30 при воздействии ПО происходит подавление сигнального пути mTORC1, а при воздействии CoCl2 – его активация. Известно, что гипоксия подавляет сигнальный путь mTORC1 [20]. При воздействии CoCl2 в 1.9 раза выросла экспрессия гена RHEB и в 2.5 раза упала экспрессия гена TSC2, в то время как при воздействии ПО экспрессия этих генов достоверно не изменялась, что может объяснять активацию пути mTORC1 при воздействии CoCl2 в отличие от ПО.
На рис. 3 отображена упрощенная схема одного из механизмов контроля пути mTORC1 и отмечено выявленное воздействие CoCl2 на гены TSC2 и RHEB.
Таким образом, сравнение двух химических моделей гипоксии, воздействия ПО и CoCl2, выявило активацию в трофобласте сигнального пути гипоксии и эпителиально-мезенхимального перехода и подавление клеточной пролиферации при обоих воздействиях, однако воздействие кобальта активировало гены, вовлеченные в сигнальный путь апоптоза, и более выраженно усиливало активность каспазы-3 и 7 в сравнении с контрольными условиями и воздействием ПО. CoCl2 активировал путь ответа на несвернутые белки и mTORC1, а ПО подавляло путь mTORC1. Все это указывает на то, что модель химической гипоксии с использованием ПО отражает воздействие умеренной гипоксии на клетки трофобласта, в то время как воздействие CoCl2 является повреждающим воздействием, сопровождающимся выраженным апоптозом. С клинической точки зрения различия в активация сигнальных путей при умеренной и тяжелой гипоксии могут означать необходимость разных подходов к лечению этих состояний. Апоптоз и нарушение инвазии трофобласта в сосуды матери при тяжелой гипоксии могут являться предпосылкой к развитию тяжелого осложнения беременности, преэклампсии [1]. Активация HIF-1α с помощью ПО может запускать в клетках антигипоксический ответ, подготавливая клетку к реакции на тяжелую гипоксию, что оказывает нейропротекторный эффект при инсульте и используется при лечении анемии, связанной с почечной недостаточностью [9]. Полученные результаты создают предпосылки для разработки подходов к профилактике развития гипоксических осложнений беременности.
Список литературы
Rana S., Lemoine E., Granger J.P., et al. Preeclampsia: Pathophysiology, Challenges, and Perspectives // Circ. Res. 2019. V. 124. № 7. P. 1094–1112.
Nikulin S.V., Knyazev E.N., Gerasimenko T.N., et al. Impedance Spectroscopy and Transcriptome Analysis of Choriocarcinoma BeWo b30 as a Model of Human Placenta // Mol. Biol. 2019. V. 53. № 3. P. 411–418.
Samatov T.R., Shkurnikov M.U., Tonevitskaya S.A., et al. Modelling the metastatic cascade by in vitro microfluidic platforms // Prog. Histochem. Cytochem. 2015. V. 49. № 4. P. 21–29.
Ohh M., Park C.W., Ivan M., et al. Ubiquitination of hypoxia-inducible factor requires direct binding to the β-domain of the von Hippel–Lindau protein // Nat. Cell Biol. 2000. V. 2. № 7. P. 423–427.
Maxwell P. Activation of the HIF pathway in cancer // Curr. Opin. Genet. Dev. 2001. V. 11. № 3. P. 293–299.
Muñoz-Sánchez J., Chánez-Cárdenas M.E. The use of cobalt chloride as a chemical hypoxia model // J. Appl. Toxicol. 2019. V. 39. № 4. P. 556–570.
Lendahl U., Lee K.L., Yang H., et al. Generating specificity and diversity in the transcriptional response to hypoxia // Nat. Rev. Genet. 2009. V. 10. № 12. P. 821–832.
Poloznikov A.A., Khristichenko A.Y., Smirnova N.A., et al. Structural optimization of adaptaquin, a HIF prolyl hydroxylase inhibitor // Russ. Chem. Bull. 2019. V. 68. № 1. P. 168–173.
Poloznikov A.A., Nikulin S.V., Zakhariants A.A., et al. “Branched Tail” Oxyquinoline Inhibitors of HIF Prolyl Hydroxylase: Early Evaluation of Toxicity and Metabolism Using Liver-on-a-chip // Drug Metab. Lett. 2019. V. 13. № 1. P. 45–52.
Poloznikov A.A., Zakhariants A.A., Nikulin S.V., et al. Structure-activity relationship for branched oxyquinoline HIF activators: Effect of modifications to phenylacetamide ‘tail’ // Biochimie. 2017. V. 133. P. 74–79.
Shkurnikov M.Y., Makarova Y.A., Knyazev E.N., et al. Profile of microRNA in Blood Plasma of Healthy Humans // Bull. Exp. Biol. Med. 2016. V. 160. № 5. P. 632–634.
Fomicheva K.A., Osip’yants A.I., Knyazev E.N., et al. Detection of Potential Metastatic Prostate Cancer Circulating Biomarkers by Comparison of miRNA Profiles in DU145 Cells and Culture Medium. // Bull. Exp. Biol. Med. 2017. V. 162. № 6. P. 792–796.
Shkurnikov M.Y., Knyazev E.N., Wicklein D., et al. Role of L1CAM in the Regulation of the Canonical Wnt Pathway and Class I MAGE Genes // Bull. Exp. Biol. Med. 2016. V. 160. № 6. P. 807–810.
Osip’yants A.I., Knyazev E.N., Galatenko A.V., et al. Changes in the Level of Circulating hsa-miR-297 and hsa-miR-19b-3p miRNA Are Associated with Generalization of Prostate Cancer // Bull. Exp. Biol. Med. 2017. V. 162. № 3. P. 379–382.
Sendoel A., Hengartner M.O. Apoptotic Cell Death Under Hypoxia // Physiology. 2014. V. 29. № 3. P. 168–176.
Simonsen L.O., Harbak H., Bennekou P. Cobalt metabolism and toxicology–A brief update // Sci. Total Environ. 2012. V. 432. P. 210–215.
Bartoszewska S., Collawn J.F. Unfolded protein response (UPR) integrated signaling networks determine cell fate during hypoxia // Cell. Mol. Biol. Lett. 2020. V. 25. № 1. P. 18.
Aimé P., Karuppagounder S.S., Rao A., et al. The drug adaptaquin blocks ATF4/CHOP-dependent pro-death Trib3 induction and protects in cellular and mouse models of Parkinson’s disease // Neurobiol. Dis. 2020. V. 136. P. 104725.
Illsley N.P., Caniggia I., Zamudio S. Placental metabolic reprogramming: do changes in the mix of energy-generating substrates modulate fetal growth? // Int. J. Dev. Biol. 2010. V. 54. № 2–3. P. 409–419.
Wouters B.G., Koritzinsky M. Hypoxia signalling through mTOR and the unfolded protein response in cancer // Nat. Rev. Cancer. 2008. V. 8. № 11. P. 851–864.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Доклады Российской академии наук. Науки о жизни