Журнал физической химии, 2019, T. 93, № 3, стр. 373-380

МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ L-ФЕНИЛАЛАНИНА С УРАЦИЛОМ В ВОДНОМ БУФЕРНОМ РАСТВОРЕ ПРИ 293–323 K

Е. Ю. Тюнина *

Российская академия наук, Институт химии растворов им. Г.А. Крестова
153045 Иваново, Россия

* E-mail: tey@isc-ras.ru

Поступила в редакцию 25.05.2018

Полный текст (PDF)

Аннотация

Исследованы взаимодействия L-фенилаланина (Phe) с урацилом (Ura) в водном буферном растворе (рН 7.35) методами денсиметрии и дифференциальной сканирующей калориметрии. Получены экспериментальные значения плотности и удельной теплоемкости систем Ura–буфер, Phe–буфер и Phe–Ura–буфер при T = (293.15, 303.15, 313.15 и 323.15) K при концентрациях Ura от 0.0040 до 0.0365 моль кг–1 и при постоянной концентрации Phe, равной 0.0120 моль кг–1. Показано, что взаимодействие Phe с Ura сопровождается образованием комплекса состава 1:2. Выявлено, что парциальные молярные свойства переноса Ura из буфера в буферный раствор Phe имеют положительные значения для объема и отрицательные – для теплоемкости в изученном интервале температур. Полученные результаты обсуждаются на основе использования модели Гэрни.

Ключевые слова: плотность, теплоемкость, кажущийся молярный объем, кажущаяся молярная теплоемкость, L-фенилаланин, урацил, комплексообразование

Возрастающий интерес к исследованию физико-химических свойств N-гетероциклических молекул объясняется, прежде всего, их биологическим и фармацевтическим значением. Основания нуклеиновых кислот и их производные могут использоваться в качестве противоопухолевых, антибактериальных и противовирусных препаратов [1, 2]. Особое значение имеет выявление характера взаимодействия между компонентами нуклеиновых кислот и молекул белков, поскольку эти взаимодействия обеспечивают выполнение ключевых биологических функций в организме, начиная от синтеза белка и восстанавливая ДНК [35]. Урацил (Ura) является структурным элементом широкого круга биологически значимых молекул (РНК, пиримидин, птеридин, фолиевая кислота, флавин и др.). Молекулы Ura содержат донорные и акцепторные группы, способные к образованию водородной связи [5, 6]. Молекулы ароматической аминокислоты – фенилаланина (Phe) обладают гидрофобным бензольным кольцом и гидрофильными группами (–NH2, ‒COOH). Специфическое взаимодействие между функциональными группами аминокислот и основаниями нуклеиновых кислот может быть использовано для селективного “узнавания” нуклеиновых кислот с помощью белков [7]. Исследования водных растворов белков, нуклеиновых кислот и их производных в присутствии различных добавок (электролитов, органических растворителей, ПАВ, др.) проводятся различными методами [411].

До сих пор недостаточно изучены взаимодействия модельных соединений белков и нуклеиновых оснований в условиях физиологических значений рН среды и при различных температурах. Аминокислотные остатки, входящие в состав белков плазмы крови, могут служить носителями лекарственных средств, образуя с ними комплексы и конъюгаты [2, 12]. Ранее [13] методами калориметрии растворения и УФ-спектроскопии было изучено образование молекулярных комплексов между ароматической аминокислотой Phe и Ura в водном растворе (pH 7.35). Как известно, такие термодинамические свойства, как объем и теплоемкость, чувствительны к структурным изменениям в растворах, происходящих на молекулярном уровне [10, 14]. Задачей настоящего исследования является использование методов денсиметрии и дифференциальной сканирующей калориметрии для идентификации образования и стехиометрии комплекса между Ura и Phe в водном буферном растворе (рН 7.35). Цель работы – обнаружение некоторых особенностей на изотермах и изоконцентратах объемных и теплоемкостных свойств растворов Ura и Phe при изменении концентрации Ura в температурном интервале (293.15–323.15) K, что может свидетельствовать о возможных структурных изменениях, соответствующих процессу комплексообразования в исследуемых системах.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

В работе использовали L-фенилаланин (Sigma, CAS 63-91-2) и урацил (Sigma, CAS 66-22-8). Содержание основного вещества составляло 98–99%. Аминокислоту сушили в вакуумном шкафу при 343 K, а Urа – при 410.15 K в течение 48 ч непосредственно перед использованием. Исследования проводили в водных буферных растворах (рН 7.35), содержащих фосфат натрия одноосновный и фосфат натрия двухосновный, что приближает среду к условиям реальных биологических систем. Значения рН растворов фиксировали цифровым рН-метром Mettler Toledo, модель Five-Easy. Все растворы приготовлены весовым методом, используя весы Sartorius-ME215S (с точностью взвешивания 1 × 10–5 г). Концентрацию урацила варьировали в пределах (0.0041–0.0655) моль кг–1 при фиксированной концентрации аминокислоты (0.0120 ± 0.0002 моль кг–1).

Измерения плотности исследуемых растворов выполнены на высокоточном цифровом вибрационном денсиметре (model DMA-5000M, Anton Paar, Австрия) при температурах (293.15, 303.15, 313.15 и 323.15) K. Два встроенных платиновых термометра Pt100 в сочетании с элементами Пельтъе обеспечивали термостатирование образца внутри ячейки с погрешностью 5 × 10–3 K. Перед каждым измерением проводили калибровку по воздуху и бидистиллированной воде при атмосферном давлении. Стандартная погрешность измерения плотности растворов не превышала ±6 × × 10–3 кг м–3.

Для измерения удельной теплоемкости (Cp) растворов использовали дифференциальный сканирующий микрокалориметр SCAL-1 (“Биоприбор”, Пущино, Россия). Интегральная чувствительность детектора калориметра составляет 33.218 нВт/мВ, калибровочная мощность – 25 мкВт, скорость сканирования – 1 K/мин, постоянная времени – 20 с. Прибор, детальное описание которого приведено в [15], был протестирован по теплоемкости водных растворов хлорида натрия, рекомендованного в качестве стандарта для сканирующей калориметрии растворов [16]. Стандартная погрешность измерения удельной теплоемкости растворов находилась в пределах ±7 × 10–3 Дж K–1 г–1.

Полученные экспериментальные данные по плотности (ρ) и удельной теплоемкости (Сp) исследуемых растворов приведены в табл. 1 и 2. Как видно из таблиц, значения ρ уменьшаются с температурой и возрастают с концентрацией Ura, в то время как температурные и концентрационные изменения значений Сp носят противоположный характер.

Таблица 1.

Плотность (ρ) и удельная теплоемкость (Сp) водных буферных растворов урацила при разных концентрациях и температурах

mUra, моль кг–1 293.15 K 303.15 K 313.15 K 323.15 K mUra, моль кг–1 293.15 K 303.15 K 313.15 K 323.15 K
ρa, кг м–3 Сpб, Дж K–1 г–1
0 1027.920 1024.870 1021.020 1017.170 0 4.0189 4.0261 4.0349 4.0443
0.0041 1028.126 1025.066 1021.207 1017.350 0.00405 4.0150 4.0228 4.0318 4.0408
0.0071 1028.269 1025.205 1021.339 1017.479 0.00711 4.0135 4.0205 4.0281 4.0390
0.0099 1028.389 1025.314 1021.450 1017.590 0.00985 4.0119 4.0178 4.0249 4.0363
0.0160 1028.629 1025.550 1021.687 1017.820 0.01631 4.0095 4.0146 4.0214 4.0299
0.0206 1028.801 1025.721 1021.860 1017.989 0.02068 4.0083 4.0119 4.0182 4.0281
0.0247 1028.959 1025.874 1022.017 1018.141 0.03123 4.0059 4.0087 4.0114 4.0199
0.0317 1029.239 1026.128 1022.266 1018.383          

a Погрешность экспериментальных значений ρ ± 6 × 10–3 кг м–3 б Погрешность экспериментальных значений Сp ± (0.002 × Сp) Дж K–1 г–1

Таблица 2.

Плотность (ρ) и удельная теплоемкость (Cp) водных буферных растворов урацила, содержащих L-фенилаланин (mPhe = 0.0120 ± 0.0002 моль кг–1), при разных температурах

mUra, моль кг–1 293.15 K 303.15 K 313.15 K 323.15 K mUra, моль кг–1 293.15 K 303.15 K 313.15 K 323.15 K
ρa, кг м–3 Сpб, Дж K–1 г–1
0 1029.816 1026.716 1022.855 1018.308 0 4.0132 4.0207 4.0302 4.0404
0.0041 1030.025 1026.910 1023.033 1018.474 0.0037 4.0015 4.0098 4.0207 4.0328
0.0070 1030.181 1027.051 1023.161 1018.593 0.0068 4.0004 4.00858 4.0199 4.0320
0.0099 1030.304 1027.162 1023.264 1018.680 0.0100 3.9997 4.0078 4.0197 4.0319
0.0160 1030.536 1027.374 1023.466 1018.874 0.0158 3.9989 4.0072 4.0198 4.0321
0.0206 1030.669 1027.505 1023.600 1018.9582 0.0179 3.9987 4.0071 4.0198 4.0320
0.0247 1030.781 1027.618 1023.714 1019.088 0.0201 3.9987 4.0070 4.0199 4.0319
0.0317 1031.059 1027.891 1023.974 1019.318 0.0247 3.9982 4.0063 4.0194 4.0312
0.0365 1031.278 1028.098 1024.168 1019.516 0.0317 3.9970 4.0054 4.0178 4.0293
          0.0361 3.9951 4.0047 4.0162 4.0268

a Погрешность экспериментальных значений ρ ± 6 × 10–3 кг м–3 б Погрешность экспериментальных значений Cp ± (0.002 × Сp) Дж K–1 г–1

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Как известно, в зависимости от рН среды аминокислота и урацил могут находиться в различных ионных состояниях. Ранее показано, что в водных растворах с рН 7.35 Phe существует, прежде всего, как цвиттерион [13]. Урацил представляет собой пиримидиновое основание, способное к таутомерии в виде лактамной или лактимной форм [17]. Установлено, что в нейтральной среде преобладает лактамная форма, которая переходит в моноанион при повышении pH (рН ≥ 9.52) [18, 19]. Для определения долевого распределения разных форм Ura в зависимости от рН среды была использована компьютерная программа RRSU [20], в основу которой заложен модифицированный метод Бринкли. Как видно из полученной нами диаграммы (рис. 1), в условиях выбранной буферной среды (рН 7.35) Ura находится в нейтральной молекулярной форме [21].

Рис. 1.

Диаграмма долевого распределения ионных форм урацила в зависимости от рН среды.

Объемные свойства растворов

Кажущийся мольный объем Ura (Vφ, Ura) был вычислен с использованием экспериментальных данных по плотности и уравнения

(1)
${{V}_{{\varphi ,{\text{Ura}}}}} = 1000({{\rho }_{0}}--\rho ){\text{/}}(\rho {{\rho }_{0}}m) + M{\text{/}}\rho ,$
где ρ0 и ρ – плотности растворителя и раствора (г см–3), m – моляльная концентрация Ura (моль кг–1), М – молекулярная масса Ura. Растворителем в бинарных водных растворах (Ura–буфер) является буферный раствор, а в тройных системах (Ura–аминокислота–буфер) – буферный раствор аминокислоты (Phe) (с фиксированной концентрацией 0.0120 моль кг–1). На рис. 2 представлены концентрационные зависимости кажущихся мольных объемов Ura в тройной системе при разных температурах. Форма полученных изотерм может свидетельствовать о связывании растворенных веществ в комплекс [14, 22, 23]. Определена стехиометрия образуемого молекулярного комплекса, фиксируемая по максимуму на концентрационной зависимости Vφ, Ura = f(m) (рис. 2). Максимальные значения φVUra при указанных температурах приходятся на концентрацию mUra = = 0.0247 моль кг–1, которая соответствует молярному соотношению Phe к Ura как ∼1:2. Влияния температуры на стехиометрию образуемого комплекса не обнаружено.

Рис. 2.

Концентрационные зависимости кажущихся мольных объемов урацила (φVUra) в водном буферном растворе L-фенилаланина при температурах: 1 – 293.15 K, 2 – 303.15 K, 3 – 313.15 K, 4 – 323.15 K (mPhe = = 0.0120 ± 0.002 моль кг–1).

Парциальные мольные объемы при бесконечном разбавлении ($V_{{\varphi ,{\text{Ura}}}}^{0}$) получены путем описания концентрационных зависимостей кажущихся мольных объемов (Vφ, Ura) полиномами второй и третьей степени, соответственно, для бинарной (Ura–буфер) и тройной (Ura–Phe–буфер) систем:

(2)
$^{\varphi }{{V}_{{{\text{Ura}}}}} = {}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{0}}} + {{B}_{1}}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + {{B}_{2}}m_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{2}}},$
(3)
$^{\varphi }{{V}_{{{\text{Ura}}}}} = {}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{0}}} + B_{1}^{{\text{'}}}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + B_{2}^{'}m_{{{\text{Ura}}}}^{2} + B_{3}^{'}m_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{3}}},$
где B1, B2 и $B_{1}^{'}$, $B_{2}^{'}$, $B_{3}^{'}$ – постоянные коэффициенты. Значения ${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{0}}}$, представленные в табл. 3, положительны и увеличиваются с ростом температуры.

Таблица 3.

Предельные кажущиеся мольные объемы (${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{0}$) урацила и значения его производной по температуре (∂φV0/∂T)p в водном буферном растворе и водном буферном растворе с аминокислотой (Phe) при разных температурах

T, K Ura–буфер Ura–Phea–буфер
${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{0}$ × 106, м3 моль–1 (∂φV0/∂T)p × 106b, м3 моль–1 K–1 ${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{0}$ × 106, м3 моль–1 (∂φV0/∂T)p × 106b, м3 моль–1 K–1
293.15 57.21 ± 0.19 0.340 ± 0.090 58.08 ± 0.10 0.320 ± 0.051
303.15 59.92 ± 0.20 0.295 ± 0.121 60.87 ± 0.12 0.325 ± 0.062
313.15 63.20 ± 0.14 0.250 ± 0.136 64.77 ± 0.14 0.328 ± 0.122
323.15 65.13 ± 0.13 0.205 ± 0.160 67.62 ± 0.14 0.331 ± 0.150

amPhe = 0.0120 ± 0.0002 моль кг–1 b (∂φV0/∂T)p вычислено по уравнению: (∂φV0/∂T)p = β + 2Tγ, где β, γ – константы из (5).

Величина парциального мольного объема Ura в водном буферном растворе, содержащем 0.0120 моль кг–1 Phe, больше, чем соответствующие значения ${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{{\text{0}}}$ в буфере при каждой температуре. Изменения парциального мольного объема (Δtr$V_{\varphi }^{0}$) при переносе Ura из буфера в буферный раствор Phe вычислены по соотношению:

(4)
$\begin{gathered} {{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}V_{\varphi }^{0} = V_{{\varphi ,{\text{Ura}}}}^{0}({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{Phe}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{б у ф е р }}) - \\ - \;V_{{\varphi ,{\text{Ura}}}}^{0}({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{б у ф е р }}). \\ \end{gathered} $

Величины Δtr$V_{\varphi }^{0}$ чувствительны к сольватационным эффектам и могут быть интерпретированы на основе модели перекрывания гидратных сфер Гэрни [24]. Согласно этой модели, увеличение объема (Δtr$V_{\varphi }^{0}$ > 0) происходит, если взаимодействия обусловлены электростатическими силами, водородными связями и др. Понижение объема (Δtr$V_{\varphi }^{0}$ < 0) имеет место в случае участия во взаимодействии неполярных групп (гидрофобные силы) [2226]. Между компонентами (Ura и Phe) исследуемой тройной системы возможны следующие взаимодействия: (1) цвиттерион-гидрофильные взаимодействия между зарядными группами ${\text{NH}}_{3}^{ + }$/COO аминокислоты (АК) и гидрофильными группами (>C=O, >NH) нуклеиновых оснований (НО); (2) гидрофильно-гидрофильные взаимодействия между гидрофильными центрами АК и гидрофильными группами НО; (3) гидрофильно-гидрофобные взаимодействия между цвиттерионами АК и гидрофобными группами НО или между гидрофильными группами НО и неполярными фрагментами АК; (4) гидрофобно-гидрофобные взаимодействия между гидрофобными фрагментами АК и гидрофобными группами НО. Два первых типа взаимодействия дают положительные вклады в Δtr$V_{\varphi }^{0}$, а третий и четвертый типы приводят к отрицательным значениям Δtr$V_{\varphi }^{0}$ [14, 27, 28]. Полученные относительно небольшие положительные изменения объема $\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{0}$ (от (0.87 до 2.49) см3 моль–1 при 293.15 и 323.15 K) свидетельствуют о том, что в буферных растворах Ura в присутствии Phe взаимодействия первых двух типов несколько доминируют в условиях существующей конкуренции между различными их типами. Таким образом, можно предположить, что комплексы Phe с молекулами Ura образованы за счет цвиттерион-гидрофильных взаимодействий, гидрофобных сил и образования водородной связи, что согласуется с литературными данными [13, 21, 29].

Температурная зависимость парциальных мольных объемов ${}^{\varphi }V_{{{\text{Ura}}}}^{0}$ в буфере и буферном растворе Phe описывается уравнением:

(5)
$^{\varphi }{{V}^{{\text{0}}}} = \alpha + \beta T + \gamma {{T}^{2}},$
где α, β и γ – константы, T – температура. Значения (∂φV0/∂T)p и (∂V0/∂T2)p были получены путем дифференцирования уравнения (5). В табл. 3 приведены рассчитанные первые производные (∂φV0/∂T)p, положительные значения которых указывают на высвобождение электрострикционно сжатой воды из гидратных сфер Ura и Phe в раствор в процессе их связывания в комплекс, что сопровождается увеличением объема системы. В случае бинарной системы Ura–буфер наблюдается тенденция к понижению (∂φV0/∂T)p с температурой, тогда как для тройной системы Ura–Phe–буфер их значения слабо увеличиваются в изученном интервале температур.

Согласно уравнению Хеплера [30]:

(6)
${{(\partial C_{p}^{0}{\text{/}}\partial P)}_{T}} = - T{{({{\partial }^{{2\varphi }}}{{V}^{0}}{\text{/}}\partial {{T}^{2}})}_{p}},$
положительный знак второй производной (∂V0/∂T2)p свидетельствует о структурно-образующей способности растворенного вещества, а его отрицательная величина указывает на структурно-разрушающие свойства в водном растворе. В нашем случае значения (∂V0/∂T2)p составляют –0.0045 см6 моль–2 K–2 для Ura в водном буферном растворе и 0.00031 см6 моль–2 K–2 для Ura в водном буферном растворе аминокислоты. Полученные результаты показывают, что растворение Ura в буферном растворе аминокислоты приводит к стабилизации структуры растворителя.

Изоконцентрационные зависимости кажущихся мольных объемов φVUra(T) урацила в буферном растворе аминокислоты от температуры приведены на рис. 3а. Выявлена инверсия последовательности кривых φVUra(T): изоконцентрата при 0.0247m расположена выше других, соответствующих более низким и более высоким концентрациям урацила. Это связано, по-видимому, с усилением взаимодействия Ura с Phe и образованием молекулярного комплекса в этой области концентраций, что сопровождается явлениями дегидратации молекул растворенных веществ, понижением электрострикции молекул воды при вытеснении из гидратных сфер и увеличением объема системы.

Рис. 3.

Температурные зависимости кажущихся мольных параметров урацила в водном буферном растворе Phe (mPhe = 0.0120 ± 0.002 моль⋅кг–1) при разных концентрациях Ura: а – объемов φVUra: 1 – 0.0071 m, 2 – 0.0099 m, 3 – 0.0160 m, 4 – 0.0247 m, 5 – 0.0316 m, 6 – 0.0365 m; б – теплоемкостей ϕCp: 1 – 0.0037 m, 2 – 0.0068 m, 3 – 0.0179 m, 4 – 0.0247 m , 5 – 0.0317 m, 6 – 0.0361 m.

Теплоемкостные свойства растворов

Кажущаяся молярная теплоемкость растворенного вещества (ϕCp) была определена из экспериментальных значений удельной теплоемкости по уравнению:

(7)
$^{\phi }{{C}_{p}} = {{M}_{{{\text{Ura}}}}}{{С }_{p}} + 1000({{С }_{p}}--С _{p}^{0}){\text{/}}{{m}_{{{\text{Ura}}}}},$
где Cp и $C_{p}^{0}$ – удельные теплоемкости, соответственно, раствора и растворителя (Дж K–1 г–1), mUra – моляльная концентрация растворенного вещества (моль кг–1), MUra – молярная масса растворенного вещества Ura (г моль–1). Погрешность определения ϕCp не превышает 2%. Как известно [31], если в растворах отсутствуют изменения во взаимодействиях растворенное вещество–растворитель и растворенное вещество–растворенное вещество, то теплоемкостные свойства раствора будут находиться в линейной зависимости от концентрации, что и имеет место в случае растворов Ura в буфере. В системе Ura–Phe–буфер концентрационные зависимости кажущихся мольных теплоемкостей носят экстремальный характер (рис. 4) в изученной области температур и аппроксимируются полиномом второй степени:
(8)
$^{\phi }{{C}_{p}}(m) = {}^{\phi }C_{p}^{0} + A_{1}^{{\text{'}}}{{m}_{{{\text{Ura}}}}} + A_{2}^{{\text{'}}}m_{{{\text{Ura}}}}^{2}$
во всем изученном диапазоне параметров (m, Т). Здесь $^{\phi }C_{p}^{0}$ – предельное значение кажущейся мольной теплоемкости, равное парциальной мольной теплоемкости при бесконечном разбавлении, A1, $A_{1}^{{\text{'}}}$ и $A_{2}^{{\text{'}}}$ – постоянные коэффициенты. Максимальные значения ϕCp(m) наблюдаются вблизи mUra = 0.0201 моль кг–1, что соответствует молярному отношению ∼1:1.7 Phe/Ura. Полученные значения $^{\phi }C_{p}^{0}$ положительны и увеличиваются с ростом температуры от 293.15 до 323.15 K (табл. 4).

Рис. 4.

Концентрационные зависимости кажущихся мольных теплоемкостей урацила (ϕCp) в водном буферном растворе L-фенилаланина при температурах (K): 1 – 293.15 , 2 – 303.15, 3 – 313.15, 4 – 323.15 (mPhe = = 0.0120 ± 0.002 моль кг–1).

Таблица 4.

Предельные кажущиеся мольные теплоемкости (${}^{\phi }C_{p}^{0}$) урацила и значения его производной по температуре ($\partial {}^{\varphi }C_{p}^{0}$/∂T)p в водном буферном растворе и водном буферном растворе с аминокислотой (Phe) при разных температурах

T, K Ura–буфер Ura–Phea–буфер
${}^{\phi }C_{p}^{0}$, Дж K–1 моль–1 ($\partial {}^{\varphi }C_{p}^{0}$/∂T)p, Дж K–2моль–1 ${}^{\phi }C_{p}^{0}$, Дж K–1 моль–1 ($\partial {}^{\phi }C_{p}^{0}$/∂T)p, Дж K–2 моль–1
293.15 449.17 ± 0.03 0.0731 ± 0.006 446.62 ± 0.09 0.0813 ± 0.005
303.15 450.12 ± 0.11 0.0973 ± 0.005 447.64 ± 0.08 0.1055 ± 0.008
313.15 450.96 ± 0.13 0.1215 ± 0.016 448.65 ± 0.09 0.1297 ± 0.010
323.15 452.46 ± 0.10 0.1457 ± 0.016 450.16 ± 0.07 0.1539 ± 0.015

amPhe = 0.0120 ± 0.0002 моль кг–1.

Обычно возрастание значений кажущейся молярной теплоемкости растворенного вещества отражает увеличение степеней свободы и интенсивности молекулярных движений, что ведет к разрушению структуры раствора, а их уменьшение свидетельствует об образовании более упорядоченных структур, если отсутствует воздействие других факторов, и прежде всего дегидратации молекул растворенных веществ [32]. По-видимому, в случае растворения Ura в водном буферном растворе, содержащем аминокислоту, можно говорить о преобладающем вкладе эффекта дегидратации молекул Ura и Phe при образовании молекулярного комплекса в общую теплоемкость раствора.

При изучении межмолекулярных взаимодействий в буферных растворах, содержащих два растворенных вещества (Ura и Phe), полезно рассмотреть изменение парциальной мольной теплоемкости (${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$) при переносе Ura из буфера в буферные растворы с аминокислотой:

(9)
$\begin{gathered} {{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0} = {}^{\phi }C_{p}^{0}({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{Phe}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{б у ф е р }}) - \\ - \;{}^{\phi }C_{p}^{0}({\text{Ura}}{\kern 1pt} --{\kern 1pt} {\text{б у ф е р }}). \\ \end{gathered} $

Полученные отрицательные значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$ (от ‒2.55 до –2.30 Дж K–1 г–1 в интервале от 293.15 до 323.15 K) обычно указывают на то, что в присутствии Ura водные буферные системы Phe более структурированы, чем буферный растворитель [14, 23, 28, 32, 33]. Структурные изменения, происходящие в растворе в процессе связывания Ura с Phe, можно объяснить на основе использования модели Гэрни о перекрывании ко-сфер молекул растворенных веществ, как это было показано выше при интерпретации объемных свойств [24, 34, 35]. Образование молекулярного комплекса между Ura и Phe приводит к потере некоторых степеней свободы, что дает отрицательный вклад в ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$, при этом имеет место дегидратация молекул растворенных веществ, что вносит положительный вклад в ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$ [34, 35]. В величине ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$ также находит отражение положительный вклад, обусловленный гидрофильно-гидрофильными взаимодействиями цвиттерионных центров (COO/${\text{NH}}_{3}^{ + }$) Phe с полярными группами Ura (>C=O, >NH) через перекрывание их гидратных сфер, а также отрицательный вклад, связанный с гидрофобно-гидрофильными и гидрофобно-гидрофобными силами, действующими между аполярными фрагментами молекул растворенных веществ [31, 36]. Гидратация Ura и Phe, а также их комплекса обеспечивает дополнительный источник отрицательного изменения теплоемкости [37]. Таким образом, относительно небольшие отрицательные значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$ могут быть объяснены конкуренцией гидрофобно/гидрофильно-цвиттерионных взаимодействий при более низкой концентрации Ura и доминированием гидрофильно-цвиттерионных взаимодействий и образования водородных связей при более высокой его концентрации. Как и в случае $\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{0}$, значения ${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$ проявляют тенденцию к возрастанию с повышением температуры.

Установлено, что температурные зависимости предельной кажущейся мольной теплоемкости (${}^{\phi }C_{p}^{0}$) описываются полиномом второй степени как для бинарной (Ura–буфер), так и тройной (Ura–Phe–буфер) систем (коэффициент корреляции R = 0.997):

(10)
${}^{\phi }C_{p}^{0}(T) = a + {{b}_{1}}(T - 273.15) + {{b}_{2}}{{(T - 273.15)}^{2}},$
где Т – температура (K), T = 273.15 K – температура сравнения, a, b1 и b2 – константы. Значения полученных первых производных ($\partial {}^{\phi }C_{p}^{0}$/∂T)p приведены в табл. 4.

На рис. 3б представлены изоконцентраты, т.е. температурные зависимости кажущихся мольных теплоемкостей ϕCp(T) урацила в буферном растворе аминокислоты при разных концентрациях урацила. Порядок расположения изоконцентрат ϕCp(T) по мере увеличения m нарушается: изоконцентраты для 0.0317 m и 0.0361 m лежат ниже, чем таковая для 0.0247 m. По-видимому, это объясняется образованием комплекса Ura с Phe в области 0.0247 m и, соответственно, потерей степеней свободы. Однако при этом эффекты от разрушающего действия молекул растворенных веществ на растворитель и от их дегидратации в процессе связывания столь велики, что появление новых степеней свободы превалирует над их потерей при указанном выше процессе как результат конкуренции взаимодействий растворенное вещество–растворенное вещество, растворенное вещество–растворитель и растворитель–растворитель.

Таким образом методами денсиметрии и ДСК определены плотности и удельные теплоемкости буферных растворов, содержащих Ura и Phe в интервале концентраций 0.0040–0.0365 m Ura при температурах от 293 до 323 K. Вычислены кажущиеся и парциальные молярные свойства (φVUra, ϕCp) урацила, а также предельные кажущиеся молярные свойства его переноса из буфера в буферный раствор с Phe. Полученные данные позволили обнаружить структурные изменения в водных буферных растворах Ura с Phe, соответствующие образованию между ними молекулярного комплекса. Показано, что функции φVUra = f(mUra) и ϕCp = f(mUra) имеют максимумы в той области концентраций урацила, которая соответствует молярному соотношению Phe к Ura как ∼1:2. При этом не обнаружено явно выраженной зависимости стехиометрии комплекса от температуры.

Определены параметры (${{\partial }^{\phi }}C_{p}^{0}$/∂T)p, (∂φV0/∂T)p и (∂V0/∂T2)p для Ura в буфере и водном буферном растворе аминокислоты. Полученные результаты показывают, что Ura способствует укреплению структуры водного буферного раствора, содержащего аминокислоту, вследствие образования комплекса.

Наблюдаемые небольшие положительные ($\Delta V_{{{\text{tr}}}}^{0}$) и отрицательные (${{\Delta }_{{{\text{tr}}}}}C_{p}^{0}$) значения свойств переноса Ura из буфера в буферный раствор с Phe при всех изученных температурах являются результатом компенсации отрицательных и положительных вкладов в их величину, соответственно, от гидрофобных взаимодействий аполярных фрагментов молекул Ura с Phe и от цвиттерионных взаимодействий Phe с полярными группами Ura и образования водородных связей.

Измерения плотности и удельной теплоемкости выполнены на оборудовании центра коллективного пользования “Верхневолжский региональный центр физико-химических исследований” ИХР РАН (http://www.isc-ras.ru/ru/struktura/ckp).

Работа посвящена памяти старшего научного сотрудника ИХР РАН, кандидата химических наук Манина Николая Геннадьевича, чьи научные интересы находились в области термодинамики растворов, за его вклад в получение и обсуждение данных по теплоемкости исследуемых систем.

Список литературы

  1. Wettergren Y., Carlsson G., Odin E., Gustavsson B. // Cancer. 2012. V. 6. P. 2935.

  2. Bakkialakshmi S., Chandrakala D. // Spectrochim. Acta. Part A. 2012. V. 88. P. 2.

  3. Nain A.K., Pal R., Neetu. // J. Chem. Thermodynamics. 2014. V. 68. P. 169.

  4. Hunter K.C., Millen A.L., Wetmore S.D. // J. Phys. Chem. B. 2007. V. 111. P. 1858.

  5. Cheng A.C., Frankel A.D. // J. Am. Chem. Soc. 2004. V. 126. P. 434.

  6. Ribeiro R.F., Marenich A.V., Cramer Ch.J., Truhlar D.G. // Phys. Chem. Chem. Phys. 2011. V. 13. P. 10908.

  7. Jones S., Daley D.T.A., Luscombe N.M., Berman H.M., Thornton J.M. // Nucleic Acids Rec. 2001. V. 29. P. 943.

  8. Boeckx B., Maes G. // J. Phys. Chem. B. 2012. V. 116. P. 11890.

  9. Banipal T.S., Kaur N., Banipal P.K. // J. Chem. Thermodynamics. 2016. V. 95. P. 149.

  10. Bhat R., Ahluwalia J.C. // J. Phys. Chem. 1985. V. 89. P. 1099.

  11. Smirnov V.I., Badelin V.G. // J. Mol. Liq. 2017. V. 229. P. 198.

  12. Khalil M.M., Fazary A.E. // Monatshefte für Chemie. 2004. V. 135. P. 1455.

  13. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Mezhevoi I.N., Tarasova G.N. // J. Mol. Liq. 2015. V. 211. P. 494.

  14. Terekhova I.V., De Lisi R., Lazzara G., Milioto S., Muratore N. // J. Therm. Anal. Cal. 2008. V. 92. P. 285.

  15. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Mezhevoi I.N. // J. Solution Chem. 2017. V. 46. P. 249

  16. Clarke E.C.W., Glew D.N. // J. Phys. Chem. Ref. Data. 1985. V. 14. P. 490.

  17. Тюкавкина Н.А., Бауков Ю.И., Зурабян С.Э. Биоорганическая химия. М.: Просвещение, 2010. 416 с.

  18. Balodis E., Madekufamba M., Trevani L.N., Tremaine P.R. // Geochim. Cosmochim. Acta. 2012. V. 93. P. 182.

  19. DeMember J.R., Wallace F.A. // J. Am. Chem. Soc. 1975. V. 97. P. 6240.

  20. Васильев В.П., Бородин В.А., Козловский Е.В. Применение ЭВМ в химико-аналитических расчетах. М.: Высшая школа, 1993. 112 с.

  21. Badeline V.G., Tyunina E.Yu., Mezhevoi I.N., Tarasova G.N. // Russ. J. Phys. Chem. A. 2015. V. 89. P. 2229.

  22. Zielenkiewicz W., Pietraszkiewicz O., Wszelaka-Rylic M. et al. // J. Solution Chem. 1998. V. 27. P. 121.

  23. Terekhova I.V., Kulikov O.V. // Mendeleev Comm. 2002. V. 3. P. 1.

  24. Gurney R.W. Ionic processes in solution. New York: McGraw Hill, 1953.

  25. Franks F. Water: A comprehensive treatise, vol. 3. New York: Plenum Press, 1973.

  26. Lepori L., Gianni P. // J. Solution Chem. 2000. V. 29. P. 405.

  27. Tyunina E.Yu., Badelin V.G. // J. Solution Chem. 2016. V. 45. P. 475.

  28. Bhuiyan M.M.H., Hakin A.W., Liu J.L. // J. Solution Chem. 2010. V. 39. P. 877.

  29. Tyunina E.Yu., Badelin V.G., Tarasova G.N. // Russ. J. Phys. Chem. A. 2015. V. 89. P. 1595.

  30. Hepler L.G. // Can. J. Chem. 1969. V. 47. P. 4613.

  31. Васильев В.П. Термодинамические свойства растворов электролитов. М.: Высш. школа, 1982.

  32. Латышева В.А. // Успехи химии. 1973. Т. 42. С. 1757.

  33. Madan B., Sharp K.A. // J. Phys. Chem. B. 2001. V. 105. P. 2256.

  34. Banipal P.K., Banipal T.S., Ahluwalia J.C., Lark B.S. // J. Chem. Thermodynamics. 2002. V. 34. P. 1825.

  35. Jasra R.V., Ahluwalia J.C. // J. Solution Chem. 1982. V. 11. P. 325.

  36. Lark B.S., Patyar P., Banipal T.S., Kishore N. // J. Chem. Eng. Data. 2004. V. 49. P. 553.

  37. Madan B., Sharp K.A. // Biophys. J. 2001. V. 81. P. 1881.

Дополнительные материалы отсутствуют.