Журнал физической химии, 2020, T. 94, № 11, стр. 1589-1594

Многомерная модель QSPR для расчета критического давления нормальных и замещенных нафталинов в фазовых переходах первого рода

М. Ю. Доломатов ab*, Э. А. Ковалева a**, Н. С. Валеева a***, Н. Х. Паймурзина a****

a Уфимский государственный нефтяной технический университет
450062 Уфа, Россия

b Башкирский государственный университет, Физико-технический институт
450074 Уфа, Россия

* E-mail: mdolomatov@bk.ru
** E-mail: kovaleva-ugntu@yandex.ru
*** E-mail: valneli@mail.ru
**** E-mail: paimurzina@inbox.ru

Поступила в редакцию 15.02.2020
После доработки 15.02.2020
Принята к публикации 14.04.2020

Полный текст (PDF)

Аннотация

Предложена многомерная модель QSPR для прогноза критического давления нормальных и замещенных нафталинов через комбинации топологических дескрипторов молекулярных графов. Рассмотрены 59 соединений нафталинов, которые случайным образом поделены на базовую и тестовую выборки. При рассмотрении молекул нафталинов предполагалось, что критическое давление определяется дескрипторами, характеризующими разветвленность структуры (индекс Винера) и хюккелевским спектром, учитывающим только взаимодействие соседних атомов (функции собственных значений топологической матрицы). В связи с тем, что при оценке ряда физико-химических свойств соединений энергия межмолекулярных взаимодействий зависит в значительной степени от конкретных размеров молекул и степени их разветвленности, при расчете индекса Винера были учтены кратные связи. Сумма квадратов собственных значений топологической матрицы описывает отклонения хюккелевской энергии электронных состояний от ее среднего значения в молекуле. Выбор квадратов собственных значений молекулярного графа обусловлен следствием из теоремы Хорста Сакса. Дескрипторы, используемые в работе, были рассчитаны по программам пакета Maple 13 и PascalABCNet. Для проверки прогностических возможностей предложенной модели рассчитаны критические давления для соединений не входящих в базовый ряд. Модель QSPR адекватно описывает критическое давление нафталинов в фазовых переходах жидкость–пар, что подтверждают экспериментальные данные и статистическая обработка данных. Полученные результаты могут быть рекомендованы для оценки критического давления известных и вновь синтезированных нафталинов, и использоваться при проведении научных и инженерных расчетов в нефтехимии и технологии сверхкритических флюидов.

Ключевые слова: нафталины, критическое давление, топологические индексы, собственные значения топологической матрицы, индекс Винера

Разнообразные технологии с использованием сверхкритических флюидов все больше распространяются в химической, нефтяной, нефтехимической промышленности [1]. Поэтому прогнозирование критических свойств жидкостей и расчет процессов в сверхкритических условиях приобретают важное значение. Кроме того, прогнозирование критических свойств необходимо в научных и прикладных исследованиях в теплотехнике, энергетике, решении термодинамических задач и т.д.

Критическое давление (Pc) нафталинов необходимо знать для достоверного расчета технологии разделения смесей нафталинов в газовой фазе методом экстракции, адсорбции и ректификации. С качеством информации о критических свойствах органических соединений связана селективность этих технологий.

Существующие методы определения критических параметров основаны на скейлинговой теории фазовых переходов и представлениях универсальности и теории ренормгруппы К. Вильсона [2]. К сожалению, эти подходы для сложных органических веществ не обеспечивают необходимую точность решения задачи прогнозирования критических свойств. Проблема заключается в том, что критические давления зависят не только от критических параметров фазовых переходов, но и от химических факторов взаимодействия, например, от числа углеродных атомов в молекуле [3]. Поэтому перспективу в изучении критических явлений имеет группа методов QSPR [4], основанных на применении структурно-химических дескрипторов–топологических индексов (ТИ) для молекулярных графов (МГ) соединений. Эти дескрипторы используются в прогнозах температуры кипения, плавления и других физико-химических свойств органических веществ [57]. Ранее нами было показано, что критические свойства зависят от нескольких дескрипторов [8].

Цель данной работы – разработка модели QSPR для адекватного прогнозирования критического давления углеводородов ряда нафталинов в фазовых переходах жидкость–пар первого рода.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

В данном исследовании изучим 59 нормальных и замещенных нафталинов, которые случайным образом поделим на базовую (39 соединений) и контрольную (20 соединений) выборки.

По аналогии с работой [9] при рассмотрении молекул нафталинов будем предполагать, что критические свойства определяются дескрипторами, характеризующими разветвленность структуры (индекс Винера), и хюккелевским спектром топологической матрицы графа, учитывающей только взаимодействие соседних атомов [6]. Вклад хюккелевских состояний важен, так как в критических условиях происходит отклонение структуры молекул от равновесной конфигурации, которая описывается матрицей расстояний.

Для каждой молекулы рассматриваемых углеводородов составим матрицы расстояний и смежности для расчета ТИ. Ниже представлена нумерация атомов молекулы нафталина:

Индекс Винера [10] рассчитан по уравнению:

(1)
$W = \frac{1}{2}\sum\limits_{u,\,{v} \in V\left( G \right)}^n {{{d}_{G}}(u,{v})} ,$
где V – множество вершин ненаправленного графа G, ${{d}_{G}}(u,{v})$ – расстояние между вершинами u и ${v}$ молекулярного графа (МГ). Так как при оценке ряда физико-химических свойств соединений энергия межмолекулярных взаимодействий зависит в значительной степени от конкретных размеров молекул и степени их разветвленности, при расчете индекса Винера были учтены кратные связи по формуле:
(2)
${{d}_{{ij}}} = \sum {\left( {\frac{1}{b}\frac{{36}}{{{{z}_{i}}{{z}_{j}}}}} \right)} ,$
где b – кратность связи, равная 1 или 2, в зависимости от того, является ли связь соответственно простой или двойной; ${{z}_{i}}$, ${{z}_{j}}$ – заряды ядер (в нашем случае равные 6). Суммирование распространяют на все связи, образующие кратчайший путь между i-й и j-й вершинами.

Характеристический полином матрицы смежности запишем в виде:

(3)
$\begin{gathered} P(\lambda ) = {{( - 1)}^{n}}\det (A - \lambda E) = \\ = \;{{\lambda }^{n}} + {{a}_{1}}{{\lambda }^{{n - 1}}} + ... + {{a}_{{n - 1}}}\lambda + {{a}_{n}}, \\ \end{gathered} $
где E – единичная матрица; ${{\lambda }_{i}}$, ${{a}_{i}}$, $i = \overline {1,n} $ – корни, коэффициенты полинома соответственно.

Корни характеристического полинома являются собственными значениями матрицы смежности, которые для π-электронных систем интерпретируются как хюккелевские энергетические уровни электронов в молекуле [11]. Если МГ охватывает все атомы углерода, то очевидно, что спектр собственных значений не имеет такую четкую интерпретацию, как в π-электронных структурах молекул, и отражает взаимодействие только соседних атомов углерода.

Индекс L [4] равен сумме степеней всех вершин:

(4)
$L = \sum\limits_{i = 1}^n {\lambda _{i}^{2}} ,$
где λi – собственные значения молекулярного графа.

Выбор квадратов собственных значений МГ обусловлен следствием из теоремы Хорста Сакса [6], согласно которому сумма корней характеристического полинома (3), т.е. сумма собственных значений топологической матрицы молекулы, равна нулю. Ранее было показано, что индекс L описывает отклонения хюккелевской энергии электронных состояний от ее среднего значения в молекуле [12].

Для достижения цели в работе использована многофакторная модель, полученная путем аппроксимации расчетных данных с применением многомерной статистики и алгоритмов множественной регрессии.

Значения суммы квадратов собственных значений молекулярных графов (L), индекс Винера (W) были рассчитаны с помощью пакета Maple 13 [13] и PascalABCNet [14].

Рассмотрим критическое давление ${{P}_{{{\text{расч}}}}}(L,W)$ как функцию двух переменных (топологических параметров), аргументами которой будут: сумма квадратов собственных значений топологической матрицы молекулы и индекс Винера. Полученную модель представим в виде двумерной зависимости, которая имеет линейный вид:

(5)
${{P}_{{{\text{расч}}}}} = {{a}_{0}} + {{a}_{1}}L + {{a}_{2}}W,$
где аn (n = 0, 1, 2) – коэффициенты модели.

Коэффициенты модели, полученные методом наименьших квадратов, вероятно, имеют определенный структурно-химический смысл, а именно: а0 – характеризует вклад в критическое давление факторов не связанных явно с химической структурой, например, дальнодействующих атом-атомных потенциалов; а1 – характеризует влияние на критическое давление хюккелевского спектра; а2 – характеризует влияние на критическое давление длины углеродной цепочки.

Для исследуемого ряда молекул в табл. 1 приведены значения сумм квадратов собственных значений молекулярных графов (L) и индекс Винера (W). Справочные данные по критическому давлению выбирались из баз данных [1517] и справочной литературы [18, 19].

Таблица 1.  

Значения топологических индексов и сравнение справочных [17] и вычисленных по модели (5) значений критических давлений для соединений из базовой выборки

Соединение, химическая формула W L Pc (cпр), атм Pc (расч), атм ∆, %
1 1,4,6-триметилнафталин C13H14 178.5 28 26.71 26.93 0.818
2 1,2,6-триметилнафталин C13H14 179 28 26.71 26.94 0.873
3 1,4,5-триметилнафталин C13H14 174.5 28 26.71 26.81 0.380
4 1,2,4-триметилнафталин C13H14 174 28 26.71 26.80 0.325
5 1,2,3-триметилнафталин C13H14 175 28 26.71 26.83 0.434
6 1,2,5-триметилнафталин C13H14 176 28 26.71 26.86 0.544
7 1,3,5-триметилнафталин C13H14 177 28 26.71 26.88 0.653
8 1,3,8-триметилнафталин C13H14 176.5 28 26.71 26.87 0.599
9 1,6,7-триметилнафталин C13H14 181 28 26.71 27.00 1.092
10 1,2,7-триметилнафталин C13H14 178.5 28 26.71 26.93 0.818
11 1,3,6-триметилнафталин C13H14 179.5 28 26.71 26.96 0.927
12 1,3,7-триметилнафталин C13H14 179.5 28 26.71 26.96 0.927
13 2,3,6-триметилнафталин C13H14 181.5 28 26.71 27.02 1.146
14 2-бутилнафталин C14H16 266.5 30 24.98 25.33 1.386
15 1-пропилнафталин C13H14 196 28 27.56 27.44 0.434
16 1,7-диэтилнафталин C14H16 236.5 30 24.60 24.45 0.615
17 2,3-диэтилнафталин C14H16 234.5 30 24.60 24.39 0.853
18 1,4-диэтилнафталин C14H16 230.5 30 24.60 24.27 1.329
19 1,2-диэтилнафталин C14H16 228.5 30 24.60 24.21 1.566
20 1,6-диэтилнафталин C14H16 238.5 30 24.60 24.51 0.377
21 4,6-диметил-1-этилнафталин C14H16 226 30 24.24 24.14 0.406
22 2,4-диметил-1-этилнафталин C14H16 220 30 24.24 23.97 1.130
23 2,5-диметил-3-этилнафталин C14H16 227.5 30 24.24 24.19 0.225
24 1,5-диметилнафталин C12H12 140 26 30.06 29.98 0.271
25 2,3-диметилнафталин C12H12 142.5 26 30.06 30.05 0.027
26 1,8-диметилнафталин C12H12 139.5 26 31.00 29.96 3.342
27 1,6-диметилнафталин C12H12 142.5 26 30.06 30.05 0.027
28 1,4-диметилнафталин C12H12 138.5 26 30.06 29.93 0.417
29 1,3-диметилнафталин C12H12 141 26 30.06 30.01 0.173
30 1,7-диметилнафталин C12H12 142 26 30.06 30.04 0.076
31 1,2-диметилнафталин C12H12 140 26 30.06 29.98 0.271
32 1-этилнафталин C12H12 146.5 26 30.00 30.17 0.563
33 2-метил-1-этилнафталин C13H14 181 28 27.13 27.00 0.473
34 1-метил-2-этилнафталин C13H14 183 28 27.13 27.06 0.258
35 2-метил-3-этилнафталин C13H14 186 28 27.13 27.15 0.066
36 2-метил-4-этилнафталин C13H14 183 28 27.13 27.06 0.258
37 2-метил-5-этилнафталин C13H14 186 28 27.13 27.15 0.066
38 2-метил-6-этилнафталин C13H14 191 28 27.13 27.29 0.605
39 2-метил-7-этилнафталин C13H14 190 28 27.13 27.26 0.497
  (0.647)

Примечание. В скобках приведено среднее значение.

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Коэффициент детерминации модели R2 = = 0.984, коэффициент множественной корреляции r ≈ 0.992, что свидетельствует о хороших прогностических возможностях модели (5) для критического давления. Подтверждается сильная статистическая связь между предложенными топологическими характеристиками молекул нафталинов и ее физико-химическим свойством.

Обоснуем валидность модели (5). Значения и влияние независимых величин (топологических индексов) на изменение критического давления приведены в табл. 2.

Таблица 2.  

Коэффициенты модели (5) для расчета критического давления, t-статистика

an an, атм t-статистика
a0 80.176 32.307
a1 0.029 5.835
a2 –2.088 –17.373

В табл. 2 приведены данные t-статистики, которая характеризует значимость коэффициентов и показывает влияние каждого дескриптора регрессионной модели в отдельности. Табличное значение критерия Стьюдента, соответствующее доверительной вероятности g = 0.95 и числу степеней свободы ${v}$ = nm – 1 = 39 – 2 – 1 = 36 равно 2.028. Наблюдаемое значение t-статистики Стьюдента для всех коэффициентов больше, чем критическое (табличное) значение статистики Стьюдента, значит, они значимы. Однако заметим, что между дескрипторами существуют сложные взаимосвязи, поэтому их влияние комплексное и его нельзя рассматривать как простую сумму изолированных влияний. Оценим значимость уравнения, для этого выполним сравнение фактического Fфакт и критического (табличного) Fтабл значений F-критерия Фишера

${{F}_{{{\text{набл}}}}} = \frac{{{{R}^{2}}}}{{1 - {{R}^{2}}}}\frac{{n - m - 1}}{m} = 1107,$
${{F}_{{{\text{табл}}}}} = F(0.95,\;2,\;36) = 0.05.$
Так как ${{F}_{{{\text{табл}}}}} < {{F}_{{{\text{набл}}}}}$, то с вероятностью 0.95 можно говорить о значимости уравнения регрессии.

Для оценки статистической достоверности дескриптора использовали корреляционную поправку:

(6)
${{S}_{r}} = \frac{{1 - {{r}^{2}}}}{{\sqrt {n - 1} }},$
где Sr – корреляционная поправка, r – коэффициент множественной корреляции, n – число исследуемых соединений. Связь нельзя считать случайной, если
$~\left| {\frac{r}{{{{S}_{r}}}}} \right| \geqslant {\text{3}}{\text{.\;}}$
к как в нашем случае n = 39, r = 0.992, получаем
$~{{S}_{{r1}}} = 0026\quad {\text{и}}\quad \left| {\frac{r}{{{{S}_{r}}}}} \right| = \left| {\frac{{0.992}}{{0.0026}}} \right| = 383.73 \geqslant 3$
для критического давления. Следовательно, связь нельзя считать случайной и регрессионное уравнение проходит через центр облака исходных точек.

Для проверки прогностических возможностей уравнения (5) и адекватности прогноза были рассчитаны критические давления замещенных нафталинов, не входящих в базовый ряд. Полученные результаты приведены в табл. 3.

Таблица 3.  

Значения топологических индексов и сравнение справочных [17] и вычисленных по модели (5) значений критических давлений для соединений из контрольной выборки

Соединение, химическая формула W L Pc (cпр), атм Pc (расч), атм ∆, %
1 2-метил -8-этилнафталин C13H14 185 28 27.13 27.19 0.239
2 1-метил-3-этилнафталин C13H14 184 28 27.13 27.17 0.159
3 1-метил-4-этилнафталин C13H14 182.5 28 27.13 27.14 0.038
4 1-метил-5-этилнафталин C13H14 183 28 27.13 27.15 0.078
5 1-метил-6-этилнафталин C13H14 188 28 27.13 27.26 0.482
6 1-метил-7-этилнафталин C13H14 185 28 27.13 27.19 0.239
7 1-метил-8-этилнафталин C13H14 182 28 27.13 27.13 0.003
8 2-пропилнафталин C13H14 202 28 27.56 27.57 0.027
9 2-метилнафталин C11H10 111 24 32.5 33.25 2.310
10 2-втор-бутилнафталин C14H16 246.5 30 25.18 24.70 1.890
11 1-втор-бутилнафталин C14H16 238.5 30 25.18 24.53 2.586
12 2-пентилнафталин C15H18 345 32 22.74 23.02 1.250
13 1-пентилнафталин C15H18 335 32 22.74 22.81 0.286
14 1,3,5,8-тетраметилнафталин C14H16 216 30 23.89 24.04 0.609
15 1,2,4,6-тетраметилнафталин C14H16 217.5 30 23.89 24.07 0.747
16 1,2,3,6-тетраметилнафталин C14H16 218.5 30 23.89 24.09 0.839
17 1,4,5,8-тетраметилнафталин C14H16 214.5 30 23.89 24.00 0.472
18 1,2,3,4-тетраметилнафталин C14H16 211.5 30 23.89 23.94 0.197
19 1,2,5,8-тетраметилнафталин C14H16 215 30 23.89 24.01 0.518
20 2-этилнафталин C12H12 150.5 26 31.4 30.28 3.574
            (0.827)

Примечание. В скобках приведено среднее значение.

Из табл. 3 следует, что средняя относительная ошибка составляет 0.827%, наибольшая относительная ошибка наблюдается для соединения 2-этилнафталин и равна 3.574%. Между справочными и смоделированными значениями критического давления наблюдается линейная зависимость с коэффициентом детерминации R2 = 0.984.

Таким образом, получена двумерная модель QSPR “структура–свойство”, адекватная эксперименту, которая отражает влияние разветвленности, протяженности углеродного скелета и хюккелевского спектра на критическое давление нафталинов. Данная модель может быть рекомендована для оценки критических давлений известных и вновь синтезированных соединений ряда нафталинов, и может быть использована при проведении научных и инженерных расчетов критических давлений в нефтехимии и технологии сверхкритических флюидов.

Список литературы

  1. Clifford Anthony A. et al. // Supercritical Fluid Methods and Protocols. Springer Netherlands. 2000. P. 272. P. 1–16. ISBN: 0-89603-571-9

  2. Анисимов М.А. Критические явления в жидкостях и жидких кристаллах. M.: Наука. Гл. ред. физ.-мат. лит., 1987. 272 с.

  3. Амирханов Д.Г., Гумеров Ф.М., Сагдеев А.А., Галимова А.Т. Растворимость веществ в сверхкритических флюидных средах. Казань: Отечество, 2014. 264 с.

  4. Lulu Zhou, Beibei Wang, Juncheng Jianga et al. // ThermochimicaActa 2017. V. 655. P. 112.

  5. Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. // Успехи химии. 1988. Т. 57. № 3. С. 337.

  6. Цветкович Д., Дуб М., Захс Х. Спектры графов. Теория и применение. Киев: Наукова думка, 1984. 384 с.

  7. Харари Ф. Теория графов. М.: Едиториал УРС, 2003. 296 с.

  8. Доломатов М.Ю., Шамова Н.А., Трапезникова Е.Ф. и др. // Химическая технология. 2016. Т. 17. № 1. С. 45.

  9. Dolomatov M.Yu., Aubekerov T.M., Koledin O.S. et al. // Rus. J. Phys. Chem. A. 2019. V. 93. № 12. P. 2388. ISSN 0036-0244.

  10. Wiener H. // J. Amer. Chem. Soc. 1947. V. 69. № 1. P. 17.

  11. Иванов В.В., Слета Л.А. Расчетные методы прогноза биологической активности органических соединений. Харьков: ХНУ, 2003. 71 с.

  12. Доломатов М.Ю., Ковалева Э.А., Хамидуллина Д.А. // Журн. физ. химии. 2018. Т. 92. № 5. С. 770. ISSN: 0044-4537.

  13. Дьяконов В.П. Maple 10/11/12/13/14 в математических расчетах. М.: Изд-во ДМК-Пресс, 2018. 800 с. ISBN: 978-5-94074-770-3.

  14. Долинер Л.И. Основы программирования в среде PascalABC.NET. Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2014. 128 с. ISBN: 978-5-7996-1260-3.

  15. Доломатов М.Ю., Павлов Т.И., Аубекеров Т.М. База данных физико-химических свойств органических соединений: Б.д. 201862459. 2017.

  16. СhemSynthesis – база данных химических веществ (www.chemsynthesis.com).

  17. Сетевая база данных по физико-химическим свойствам веществ и материалов (http://db.itp.nsc.ru.http://metalldb.susu.ac.ru).

  18. Рид Р., Праусниц Дж., Шервуд Т. Свойства газов и жидкостей: Справочное пособие / Пер. с англ. под ред. Б.И. Соколова. 3-е изд., перераб. и доп. Л.: Химия, 1982. 592 с.

  19. Бабичев А.П., Бабушкина Н.А., Братковский А.М. Физические величины. Справочник. М.: Энергоатомиздат, 1991. 1232 с.

Дополнительные материалы отсутствуют.