Журнал физической химии, 2020, T. 94, № 11, стр. 1589-1594
Многомерная модель QSPR для расчета критического давления нормальных и замещенных нафталинов в фазовых переходах первого рода
М. Ю. Доломатов a, b, *, Э. А. Ковалева a, **, Н. С. Валеева a, ***, Н. Х. Паймурзина a, ****
a Уфимский государственный нефтяной технический университет
450062 Уфа, Россия
b Башкирский государственный университет, Физико-технический институт
450074 Уфа, Россия
* E-mail: mdolomatov@bk.ru
** E-mail: kovaleva-ugntu@yandex.ru
*** E-mail: valneli@mail.ru
**** E-mail: paimurzina@inbox.ru
Поступила в редакцию 15.02.2020
После доработки 15.02.2020
Принята к публикации 14.04.2020
Аннотация
Предложена многомерная модель QSPR для прогноза критического давления нормальных и замещенных нафталинов через комбинации топологических дескрипторов молекулярных графов. Рассмотрены 59 соединений нафталинов, которые случайным образом поделены на базовую и тестовую выборки. При рассмотрении молекул нафталинов предполагалось, что критическое давление определяется дескрипторами, характеризующими разветвленность структуры (индекс Винера) и хюккелевским спектром, учитывающим только взаимодействие соседних атомов (функции собственных значений топологической матрицы). В связи с тем, что при оценке ряда физико-химических свойств соединений энергия межмолекулярных взаимодействий зависит в значительной степени от конкретных размеров молекул и степени их разветвленности, при расчете индекса Винера были учтены кратные связи. Сумма квадратов собственных значений топологической матрицы описывает отклонения хюккелевской энергии электронных состояний от ее среднего значения в молекуле. Выбор квадратов собственных значений молекулярного графа обусловлен следствием из теоремы Хорста Сакса. Дескрипторы, используемые в работе, были рассчитаны по программам пакета Maple 13 и PascalABCNet. Для проверки прогностических возможностей предложенной модели рассчитаны критические давления для соединений не входящих в базовый ряд. Модель QSPR адекватно описывает критическое давление нафталинов в фазовых переходах жидкость–пар, что подтверждают экспериментальные данные и статистическая обработка данных. Полученные результаты могут быть рекомендованы для оценки критического давления известных и вновь синтезированных нафталинов, и использоваться при проведении научных и инженерных расчетов в нефтехимии и технологии сверхкритических флюидов.
Разнообразные технологии с использованием сверхкритических флюидов все больше распространяются в химической, нефтяной, нефтехимической промышленности [1]. Поэтому прогнозирование критических свойств жидкостей и расчет процессов в сверхкритических условиях приобретают важное значение. Кроме того, прогнозирование критических свойств необходимо в научных и прикладных исследованиях в теплотехнике, энергетике, решении термодинамических задач и т.д.
Критическое давление (Pc) нафталинов необходимо знать для достоверного расчета технологии разделения смесей нафталинов в газовой фазе методом экстракции, адсорбции и ректификации. С качеством информации о критических свойствах органических соединений связана селективность этих технологий.
Существующие методы определения критических параметров основаны на скейлинговой теории фазовых переходов и представлениях универсальности и теории ренормгруппы К. Вильсона [2]. К сожалению, эти подходы для сложных органических веществ не обеспечивают необходимую точность решения задачи прогнозирования критических свойств. Проблема заключается в том, что критические давления зависят не только от критических параметров фазовых переходов, но и от химических факторов взаимодействия, например, от числа углеродных атомов в молекуле [3]. Поэтому перспективу в изучении критических явлений имеет группа методов QSPR [4], основанных на применении структурно-химических дескрипторов–топологических индексов (ТИ) для молекулярных графов (МГ) соединений. Эти дескрипторы используются в прогнозах температуры кипения, плавления и других физико-химических свойств органических веществ [5–7]. Ранее нами было показано, что критические свойства зависят от нескольких дескрипторов [8].
Цель данной работы – разработка модели QSPR для адекватного прогнозирования критического давления углеводородов ряда нафталинов в фазовых переходах жидкость–пар первого рода.
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
В данном исследовании изучим 59 нормальных и замещенных нафталинов, которые случайным образом поделим на базовую (39 соединений) и контрольную (20 соединений) выборки.
По аналогии с работой [9] при рассмотрении молекул нафталинов будем предполагать, что критические свойства определяются дескрипторами, характеризующими разветвленность структуры (индекс Винера), и хюккелевским спектром топологической матрицы графа, учитывающей только взаимодействие соседних атомов [6]. Вклад хюккелевских состояний важен, так как в критических условиях происходит отклонение структуры молекул от равновесной конфигурации, которая описывается матрицей расстояний.
Для каждой молекулы рассматриваемых углеводородов составим матрицы расстояний и смежности для расчета ТИ. Ниже представлена нумерация атомов молекулы нафталина:
Индекс Винера [10] рассчитан по уравнению:
где V – множество вершин ненаправленного графа G, ${{d}_{G}}(u,{v})$ – расстояние между вершинами u и ${v}$ молекулярного графа (МГ). Так как при оценке ряда физико-химических свойств соединений энергия межмолекулярных взаимодействий зависит в значительной степени от конкретных размеров молекул и степени их разветвленности, при расчете индекса Винера были учтены кратные связи по формуле: где b – кратность связи, равная 1 или 2, в зависимости от того, является ли связь соответственно простой или двойной; ${{z}_{i}}$, ${{z}_{j}}$ – заряды ядер (в нашем случае равные 6). Суммирование распространяют на все связи, образующие кратчайший путь между i-й и j-й вершинами.Характеристический полином матрицы смежности запишем в виде:
(3)
$\begin{gathered} P(\lambda ) = {{( - 1)}^{n}}\det (A - \lambda E) = \\ = \;{{\lambda }^{n}} + {{a}_{1}}{{\lambda }^{{n - 1}}} + ... + {{a}_{{n - 1}}}\lambda + {{a}_{n}}, \\ \end{gathered} $Корни характеристического полинома являются собственными значениями матрицы смежности, которые для π-электронных систем интерпретируются как хюккелевские энергетические уровни электронов в молекуле [11]. Если МГ охватывает все атомы углерода, то очевидно, что спектр собственных значений не имеет такую четкую интерпретацию, как в π-электронных структурах молекул, и отражает взаимодействие только соседних атомов углерода.
Индекс L [4] равен сумме степеней всех вершин:
где λi – собственные значения молекулярного графа.Выбор квадратов собственных значений МГ обусловлен следствием из теоремы Хорста Сакса [6], согласно которому сумма корней характеристического полинома (3), т.е. сумма собственных значений топологической матрицы молекулы, равна нулю. Ранее было показано, что индекс L описывает отклонения хюккелевской энергии электронных состояний от ее среднего значения в молекуле [12].
Для достижения цели в работе использована многофакторная модель, полученная путем аппроксимации расчетных данных с применением многомерной статистики и алгоритмов множественной регрессии.
Значения суммы квадратов собственных значений молекулярных графов (L), индекс Винера (W) были рассчитаны с помощью пакета Maple 13 [13] и PascalABCNet [14].
Рассмотрим критическое давление ${{P}_{{{\text{расч}}}}}(L,W)$ как функцию двух переменных (топологических параметров), аргументами которой будут: сумма квадратов собственных значений топологической матрицы молекулы и индекс Винера. Полученную модель представим в виде двумерной зависимости, которая имеет линейный вид:
где аn (n = 0, 1, 2) – коэффициенты модели.Коэффициенты модели, полученные методом наименьших квадратов, вероятно, имеют определенный структурно-химический смысл, а именно: а0 – характеризует вклад в критическое давление факторов не связанных явно с химической структурой, например, дальнодействующих атом-атомных потенциалов; а1 – характеризует влияние на критическое давление хюккелевского спектра; а2 – характеризует влияние на критическое давление длины углеродной цепочки.
Для исследуемого ряда молекул в табл. 1 приведены значения сумм квадратов собственных значений молекулярных графов (L) и индекс Винера (W). Справочные данные по критическому давлению выбирались из баз данных [15–17] и справочной литературы [18, 19].
Таблица 1.
№ | Соединение, химическая формула | W | L | Pc (cпр), атм | Pc (расч), атм | ∆, % |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 1,4,6-триметилнафталин C13H14 | 178.5 | 28 | 26.71 | 26.93 | 0.818 |
2 | 1,2,6-триметилнафталин C13H14 | 179 | 28 | 26.71 | 26.94 | 0.873 |
3 | 1,4,5-триметилнафталин C13H14 | 174.5 | 28 | 26.71 | 26.81 | 0.380 |
4 | 1,2,4-триметилнафталин C13H14 | 174 | 28 | 26.71 | 26.80 | 0.325 |
5 | 1,2,3-триметилнафталин C13H14 | 175 | 28 | 26.71 | 26.83 | 0.434 |
6 | 1,2,5-триметилнафталин C13H14 | 176 | 28 | 26.71 | 26.86 | 0.544 |
7 | 1,3,5-триметилнафталин C13H14 | 177 | 28 | 26.71 | 26.88 | 0.653 |
8 | 1,3,8-триметилнафталин C13H14 | 176.5 | 28 | 26.71 | 26.87 | 0.599 |
9 | 1,6,7-триметилнафталин C13H14 | 181 | 28 | 26.71 | 27.00 | 1.092 |
10 | 1,2,7-триметилнафталин C13H14 | 178.5 | 28 | 26.71 | 26.93 | 0.818 |
11 | 1,3,6-триметилнафталин C13H14 | 179.5 | 28 | 26.71 | 26.96 | 0.927 |
12 | 1,3,7-триметилнафталин C13H14 | 179.5 | 28 | 26.71 | 26.96 | 0.927 |
13 | 2,3,6-триметилнафталин C13H14 | 181.5 | 28 | 26.71 | 27.02 | 1.146 |
14 | 2-бутилнафталин C14H16 | 266.5 | 30 | 24.98 | 25.33 | 1.386 |
15 | 1-пропилнафталин C13H14 | 196 | 28 | 27.56 | 27.44 | 0.434 |
16 | 1,7-диэтилнафталин C14H16 | 236.5 | 30 | 24.60 | 24.45 | 0.615 |
17 | 2,3-диэтилнафталин C14H16 | 234.5 | 30 | 24.60 | 24.39 | 0.853 |
18 | 1,4-диэтилнафталин C14H16 | 230.5 | 30 | 24.60 | 24.27 | 1.329 |
19 | 1,2-диэтилнафталин C14H16 | 228.5 | 30 | 24.60 | 24.21 | 1.566 |
20 | 1,6-диэтилнафталин C14H16 | 238.5 | 30 | 24.60 | 24.51 | 0.377 |
21 | 4,6-диметил-1-этилнафталин C14H16 | 226 | 30 | 24.24 | 24.14 | 0.406 |
22 | 2,4-диметил-1-этилнафталин C14H16 | 220 | 30 | 24.24 | 23.97 | 1.130 |
23 | 2,5-диметил-3-этилнафталин C14H16 | 227.5 | 30 | 24.24 | 24.19 | 0.225 |
24 | 1,5-диметилнафталин C12H12 | 140 | 26 | 30.06 | 29.98 | 0.271 |
25 | 2,3-диметилнафталин C12H12 | 142.5 | 26 | 30.06 | 30.05 | 0.027 |
26 | 1,8-диметилнафталин C12H12 | 139.5 | 26 | 31.00 | 29.96 | 3.342 |
27 | 1,6-диметилнафталин C12H12 | 142.5 | 26 | 30.06 | 30.05 | 0.027 |
28 | 1,4-диметилнафталин C12H12 | 138.5 | 26 | 30.06 | 29.93 | 0.417 |
29 | 1,3-диметилнафталин C12H12 | 141 | 26 | 30.06 | 30.01 | 0.173 |
30 | 1,7-диметилнафталин C12H12 | 142 | 26 | 30.06 | 30.04 | 0.076 |
31 | 1,2-диметилнафталин C12H12 | 140 | 26 | 30.06 | 29.98 | 0.271 |
32 | 1-этилнафталин C12H12 | 146.5 | 26 | 30.00 | 30.17 | 0.563 |
33 | 2-метил-1-этилнафталин C13H14 | 181 | 28 | 27.13 | 27.00 | 0.473 |
34 | 1-метил-2-этилнафталин C13H14 | 183 | 28 | 27.13 | 27.06 | 0.258 |
35 | 2-метил-3-этилнафталин C13H14 | 186 | 28 | 27.13 | 27.15 | 0.066 |
36 | 2-метил-4-этилнафталин C13H14 | 183 | 28 | 27.13 | 27.06 | 0.258 |
37 | 2-метил-5-этилнафталин C13H14 | 186 | 28 | 27.13 | 27.15 | 0.066 |
38 | 2-метил-6-этилнафталин C13H14 | 191 | 28 | 27.13 | 27.29 | 0.605 |
39 | 2-метил-7-этилнафталин C13H14 | 190 | 28 | 27.13 | 27.26 | 0.497 |
(0.647) |
ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
Коэффициент детерминации модели R2 = = 0.984, коэффициент множественной корреляции r ≈ 0.992, что свидетельствует о хороших прогностических возможностях модели (5) для критического давления. Подтверждается сильная статистическая связь между предложенными топологическими характеристиками молекул нафталинов и ее физико-химическим свойством.
Обоснуем валидность модели (5). Значения и влияние независимых величин (топологических индексов) на изменение критического давления приведены в табл. 2.
В табл. 2 приведены данные t-статистики, которая характеризует значимость коэффициентов и показывает влияние каждого дескриптора регрессионной модели в отдельности. Табличное значение критерия Стьюдента, соответствующее доверительной вероятности g = 0.95 и числу степеней свободы ${v}$ = n – m – 1 = 39 – 2 – 1 = 36 равно 2.028. Наблюдаемое значение t-статистики Стьюдента для всех коэффициентов больше, чем критическое (табличное) значение статистики Стьюдента, значит, они значимы. Однако заметим, что между дескрипторами существуют сложные взаимосвязи, поэтому их влияние комплексное и его нельзя рассматривать как простую сумму изолированных влияний. Оценим значимость уравнения, для этого выполним сравнение фактического Fфакт и критического (табличного) Fтабл значений F-критерия Фишера
Так как ${{F}_{{{\text{табл}}}}} < {{F}_{{{\text{набл}}}}}$, то с вероятностью 0.95 можно говорить о значимости уравнения регрессии.Для оценки статистической достоверности дескриптора использовали корреляционную поправку:
где Sr – корреляционная поправка, r – коэффициент множественной корреляции, n – число исследуемых соединений. Связь нельзя считать случайной, если к как в нашем случае n = 39, r = 0.992, получаемДля проверки прогностических возможностей уравнения (5) и адекватности прогноза были рассчитаны критические давления замещенных нафталинов, не входящих в базовый ряд. Полученные результаты приведены в табл. 3.
Таблица 3.
№ | Соединение, химическая формула | W | L | Pc (cпр), атм | Pc (расч), атм | ∆, % |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2-метил -8-этилнафталин C13H14 | 185 | 28 | 27.13 | 27.19 | 0.239 |
2 | 1-метил-3-этилнафталин C13H14 | 184 | 28 | 27.13 | 27.17 | 0.159 |
3 | 1-метил-4-этилнафталин C13H14 | 182.5 | 28 | 27.13 | 27.14 | 0.038 |
4 | 1-метил-5-этилнафталин C13H14 | 183 | 28 | 27.13 | 27.15 | 0.078 |
5 | 1-метил-6-этилнафталин C13H14 | 188 | 28 | 27.13 | 27.26 | 0.482 |
6 | 1-метил-7-этилнафталин C13H14 | 185 | 28 | 27.13 | 27.19 | 0.239 |
7 | 1-метил-8-этилнафталин C13H14 | 182 | 28 | 27.13 | 27.13 | 0.003 |
8 | 2-пропилнафталин C13H14 | 202 | 28 | 27.56 | 27.57 | 0.027 |
9 | 2-метилнафталин C11H10 | 111 | 24 | 32.5 | 33.25 | 2.310 |
10 | 2-втор-бутилнафталин C14H16 | 246.5 | 30 | 25.18 | 24.70 | 1.890 |
11 | 1-втор-бутилнафталин C14H16 | 238.5 | 30 | 25.18 | 24.53 | 2.586 |
12 | 2-пентилнафталин C15H18 | 345 | 32 | 22.74 | 23.02 | 1.250 |
13 | 1-пентилнафталин C15H18 | 335 | 32 | 22.74 | 22.81 | 0.286 |
14 | 1,3,5,8-тетраметилнафталин C14H16 | 216 | 30 | 23.89 | 24.04 | 0.609 |
15 | 1,2,4,6-тетраметилнафталин C14H16 | 217.5 | 30 | 23.89 | 24.07 | 0.747 |
16 | 1,2,3,6-тетраметилнафталин C14H16 | 218.5 | 30 | 23.89 | 24.09 | 0.839 |
17 | 1,4,5,8-тетраметилнафталин C14H16 | 214.5 | 30 | 23.89 | 24.00 | 0.472 |
18 | 1,2,3,4-тетраметилнафталин C14H16 | 211.5 | 30 | 23.89 | 23.94 | 0.197 |
19 | 1,2,5,8-тетраметилнафталин C14H16 | 215 | 30 | 23.89 | 24.01 | 0.518 |
20 | 2-этилнафталин C12H12 | 150.5 | 26 | 31.4 | 30.28 | 3.574 |
(0.827) |
Из табл. 3 следует, что средняя относительная ошибка составляет 0.827%, наибольшая относительная ошибка наблюдается для соединения 2-этилнафталин и равна 3.574%. Между справочными и смоделированными значениями критического давления наблюдается линейная зависимость с коэффициентом детерминации R2 = 0.984.
Таким образом, получена двумерная модель QSPR “структура–свойство”, адекватная эксперименту, которая отражает влияние разветвленности, протяженности углеродного скелета и хюккелевского спектра на критическое давление нафталинов. Данная модель может быть рекомендована для оценки критических давлений известных и вновь синтезированных соединений ряда нафталинов, и может быть использована при проведении научных и инженерных расчетов критических давлений в нефтехимии и технологии сверхкритических флюидов.
Список литературы
Clifford Anthony A. et al. // Supercritical Fluid Methods and Protocols. Springer Netherlands. 2000. P. 272. P. 1–16. ISBN: 0-89603-571-9
Анисимов М.А. Критические явления в жидкостях и жидких кристаллах. M.: Наука. Гл. ред. физ.-мат. лит., 1987. 272 с.
Амирханов Д.Г., Гумеров Ф.М., Сагдеев А.А., Галимова А.Т. Растворимость веществ в сверхкритических флюидных средах. Казань: Отечество, 2014. 264 с.
Lulu Zhou, Beibei Wang, Juncheng Jianga et al. // ThermochimicaActa 2017. V. 655. P. 112.
Станкевич М.И., Станкевич И.В., Зефиров Н.С. // Успехи химии. 1988. Т. 57. № 3. С. 337.
Цветкович Д., Дуб М., Захс Х. Спектры графов. Теория и применение. Киев: Наукова думка, 1984. 384 с.
Харари Ф. Теория графов. М.: Едиториал УРС, 2003. 296 с.
Доломатов М.Ю., Шамова Н.А., Трапезникова Е.Ф. и др. // Химическая технология. 2016. Т. 17. № 1. С. 45.
Dolomatov M.Yu., Aubekerov T.M., Koledin O.S. et al. // Rus. J. Phys. Chem. A. 2019. V. 93. № 12. P. 2388. ISSN 0036-0244.
Wiener H. // J. Amer. Chem. Soc. 1947. V. 69. № 1. P. 17.
Иванов В.В., Слета Л.А. Расчетные методы прогноза биологической активности органических соединений. Харьков: ХНУ, 2003. 71 с.
Доломатов М.Ю., Ковалева Э.А., Хамидуллина Д.А. // Журн. физ. химии. 2018. Т. 92. № 5. С. 770. ISSN: 0044-4537.
Дьяконов В.П. Maple 10/11/12/13/14 в математических расчетах. М.: Изд-во ДМК-Пресс, 2018. 800 с. ISBN: 978-5-94074-770-3.
Долинер Л.И. Основы программирования в среде PascalABC.NET. Екатеринбург: Изд-во Урал. ун-та, 2014. 128 с. ISBN: 978-5-7996-1260-3.
Доломатов М.Ю., Павлов Т.И., Аубекеров Т.М. База данных физико-химических свойств органических соединений: Б.д. 201862459. 2017.
СhemSynthesis – база данных химических веществ (www.chemsynthesis.com).
Сетевая база данных по физико-химическим свойствам веществ и материалов (http://db.itp.nsc.ru.http://metalldb.susu.ac.ru).
Рид Р., Праусниц Дж., Шервуд Т. Свойства газов и жидкостей: Справочное пособие / Пер. с англ. под ред. Б.И. Соколова. 3-е изд., перераб. и доп. Л.: Химия, 1982. 592 с.
Бабичев А.П., Бабушкина Н.А., Братковский А.М. Физические величины. Справочник. М.: Энергоатомиздат, 1991. 1232 с.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Журнал физической химии