Вопросы ихтиологии, 2020, T. 60, № 1, стр. 94-94
Секвенирование и характеристика полного митогенома ДНК Rasbora hobelmani (Cyprinidae) с анализом филогении
Х. Х. Чанг 1, *, К. А. К. Камар 1, Л. В. К. Лим 1, Ю. Ляо 2, Т. Т. Лам 2, Ю. Л. Чун 3
1 Факультет ресурсных наук и технологий Малайзийского университета в Сараваке
Саравак, Малайзия
2 Школа общественного здравоохранения Университета Гонконга
Гонконг, КНР
3 Департамент науки и экологических исследований Университета образования Гонконга
Гонконг, КНР
* E-mail: hhchung@unimas.my
Поступила в редакцию 30.04.2019
После доработки 18.09.2019
Принята к публикации 23.09.2019
Аннотация
Расбора Коттелата Rasbora hobelmani – небольшая лучепёрая рыба, которую относят к роду Rasbora семейства Cyprinidae. В данной работе секвенирована полная последовательность генов митохондриального генома R. hobelmani с использованием двух пар праймеров, включающих перекрывающиеся регионы. Митогеном составляет в длину 16 541 пар нуклеотидов и включает 22 гена транспортной РНК, 13 кодирующих белки генов, две рибосомные РНК и один предполагаемый контрольный регион. У данного вида и других видов рода Rasbora наблюдается идентичная генная структура. Тяжёлая цепь содержит 28 генов, в то время как лёгкая цепь – остальные девять генов. Большинство кодирующих белки генов имеют старт-кодон ATG; в гене COI он заменяется на GTG. Контрольный регион включает центральные консервативные блоки (CSB-F, CSB-E, CSB-D), вариабельные блоки (CSB-3, CSB-2, CSB-1), а также терминально связанную последовательность. Построенное с помощью метода максимального правдоподобия филогенетическое дерево свидетельствует о близком родстве R. hobelmani с R. sumatrana, R. aprotaenia, R. lateristriata и R. steineri (бутстреп-поддержка не менее 99%). Работа является важным этапом, который позволит в дальнейшем подробнее изучить эволюцию и популяционную генетику исследуемого вида, а также других видов рода Rasbora.
Полностью статья опубликована в английской версии журнала.
Список литературы отсутствует.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Вопросы ихтиологии