Вопросы ихтиологии, 2023, T. 63, № 4, стр. 426-426

Характеристика митогенома подверженной угрозе исчезновения рыбы Beaufortia pingi (Gastromyzontidae): описание генома и филогенетические соображения

З. Шен 1*, Ц. Шенг 2, З. Джин 3, Й. Жанг 2, Х. Льв 2

3Колледж туризма провинции Чжэцзян
Ханчжоу, Китай

1 Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук
Ухань, Китай

2 Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
Хучжоу, Китай

* E-mail: qsheng@zjhu.edu.cn

Поступила в редакцию 14.12.2022
После доработки 08.02.2023
Принята к публикации 10.02.2023

Аннотация

Горные вьюны (щиповки) − богатая видами группа, которая хорошо приспособлена к быстротекущим пресноводным местообитаниям. Потеря среды обитания из-за строительства плотин гидроэлектростанций подвергает этих рыб угрозе исчезновения. Согласно предыдущим исследованиям, филогения рода Beaufortia остается спорной. Чтобы помочь прояснить филогенетические взаимоотношения Beaufortia и близкородственных видов, был секвенирован и проанализирован полный митогеном B. pingi. Кольцевой митогеном имеет длину 16 565 п.н. и содержит 13 генов, кодирующих белок PCGs, 22 гена транспортной РНК, два гена рибосомальной РНК и один контрольный регион. Наиболее распространенным кодоном в PCGs был лейцин (16.66%), за которым следовали аланин (9.32%) и треонин (7.71%). Филогенетический анализ, включающий 17 других видов горных вьюнов, был выполнен с использованием метода максимального правдоподобия, основанного на последовательностях 13 митохондриальных PCGs. Эти виды разделились на две клады: Gastromyzontidae и Balitoridae, а некоторые роды, включая Beaufortia, оказались парафилетическими. В частности, B. pingi попал в одну кладу с Erromyzon kalotaenia, Yaoshania pachychilus и Pseudogastromyzon fangi, которые в последующем образовали кластер с двумя другими видами Beaufortia.

Ключевые слова: Beaufortia pingi, горный вьюн (щиповка), митохондриальный геном, филогенетический анализ.

Дополнительные материалы отсутствуют.