Вопросы ихтиологии, 2023, T. 63, № 4, стр. 426-426
Характеристика митогенома подверженной угрозе исчезновения рыбы Beaufortia pingi (Gastromyzontidae): описание генома и филогенетические соображения
З. Шен 1, *, Ц. Шенг 2, З. Джин 3, Й. Жанг 2, Х. Льв 2
3Колледж туризма провинции Чжэцзян
Ханчжоу, Китай
1 Экспериментальная станция по изучению рыбных ресурсов и окружающей среды верхнего и среднего течениия реки Янцзы, Министерство сельского хозяйства и по делам сельских районов, Научно-исследовательский институт рыболовства реки Янцзы, Китайская академия рыбохозяйственных наук
Ухань, Китай
2 Колледж естественных наук, Университет Хучжоу
Хучжоу, Китай
* E-mail: qsheng@zjhu.edu.cn
Поступила в редакцию 14.12.2022
После доработки 08.02.2023
Принята к публикации 10.02.2023
- EDN: ROMMDX
- DOI: 10.31857/S0042875223040252
Полные тексты статей выпуска доступны в ознакомительном режиме только авторизованным пользователям.
Аннотация
Горные вьюны (щиповки) − богатая видами группа, которая хорошо приспособлена к быстротекущим пресноводным местообитаниям. Потеря среды обитания из-за строительства плотин гидроэлектростанций подвергает этих рыб угрозе исчезновения. Согласно предыдущим исследованиям, филогения рода Beaufortia остается спорной. Чтобы помочь прояснить филогенетические взаимоотношения Beaufortia и близкородственных видов, был секвенирован и проанализирован полный митогеном B. pingi. Кольцевой митогеном имеет длину 16 565 п.н. и содержит 13 генов, кодирующих белок PCGs, 22 гена транспортной РНК, два гена рибосомальной РНК и один контрольный регион. Наиболее распространенным кодоном в PCGs был лейцин (16.66%), за которым следовали аланин (9.32%) и треонин (7.71%). Филогенетический анализ, включающий 17 других видов горных вьюнов, был выполнен с использованием метода максимального правдоподобия, основанного на последовательностях 13 митохондриальных PCGs. Эти виды разделились на две клады: Gastromyzontidae и Balitoridae, а некоторые роды, включая Beaufortia, оказались парафилетическими. В частности, B. pingi попал в одну кладу с Erromyzon kalotaenia, Yaoshania pachychilus и Pseudogastromyzon fangi, которые в последующем образовали кластер с двумя другими видами Beaufortia.
Полные тексты статей выпуска доступны в ознакомительном режиме только авторизованным пользователям.
Список литературы отсутствует.
Дополнительные материалы отсутствуют.
Инструменты
Вопросы ихтиологии