Кристаллография, 2020, T. 65, № 4, стр. 546-552

Интерметаллиды NakMn (М = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb): геометрический и топологический анализ, кластерные прекурсоры и самосборка кристаллических структур

Г. Д. Илюшин 1*

1 Институт кристаллографии им. А.В. Шубникова ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН
Москва, Россия

* E-mail: gdilyushin@gmail.com

Поступила в редакцию 05.07.2019
После доработки 05.07.2019
Принята к публикации 20.07.2019

Полный текст (PDF)

Аннотация

С помощью компьютерных методов (пакет программ ToposPro) осуществлен геометрический и топологический анализ и проведено моделирование самосборки кристаллических структур интерметаллидов, образующихся в системах Na–М, где M = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb. Металлокластеры-прекурсоры кристаллических структур NakMn определены с использованием алгоритмов разложения структурных графов на кластерные структуры и построения базисной сетки структуры в виде графа, узлы которого соответствуют положению центров кластеров. Установлены тетраэдрические металлокластеры M4, образующие упаковки в кристаллических структурах Na3Bi-hP8, Na2Bi2-tP4, Na2Sb2-mP16, тетраэдрические металлокластеры M4 и спейсеры для каркасных структур Na2(Au4)-cF24 и Ba2(Na4)-hP12, октаэдрические кластеры M6 для Na4Au2-tI12, октаэдрические M6 и тетраэдрические M4 металлокластеры для Na2(Na4)(Ba6)-cF96 и Au2(In4)(Na6)-cF96 и икосаэдрические металлокластеры M13 для Na(Zn13)-cF116. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур интерметаллидов NakMn из металлокластеров-прекурсоров S30 в виде: цепь $S_{3}^{1}$ → микрослой $S_{3}^{2}$ → микрокаркас $S_{3}^{3}$.

ВВЕДЕНИЕ

В двойных системах AB с участием атомов щелочных металлов A = Li, Na установлено образование 130 интерметаллидов LinMk и 79 интерметаллидов NanMk [1, 2]. В [3] проведен геометрический и топологический анализ интерметаллидов лития, образующихся в системах Li–М с атомами d-элементов М = Ag, Au, Pt, Pd, Ir, Rh. Из 13 установленных структурных типов интерметаллидов лития для 11 определены тетраэдрические типы металлокластеров-прекурсоров $S_{3}^{0}$ и реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур интерметаллидов. Алгоритм определения кластеров-прекурсоров $S_{3}^{0}$ реализован в комплексе программ TOPOS [4].

Кристаллизация Na-интерметаллидов установлена в 18 системах Na–M [1, 2]. В пяти системах Na–M с атомами M = K, Cs, Ag, Pt, Zn образуется только по одному интерметаллиду, в четырех системах с атомами M = Ba, Au, Bi, Sb – по два интерметаллида. Наибольшее число интерметаллидов – 6, 7 и 10 – образуется в системах с атомами M = Ge, Hg, Sn.

В настоящей работе осуществлен геометрический и топологический анализ и проведено моделирование самосборки кристаллических структур интерметаллидов, образующихся в системах Na–М, где M = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур интерметаллидов из металлокластеров-прекурсоров $S_{3}^{0}$ в виде: цепь $S_{3}^{1}$ → микрослой $S_{3}^{2}$ → микрокаркас $S_{3}^{3}$.

Работа продолжает исследования [3, 59] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением компьютерных методов (пакета программ ToposPro [4]).

МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ

Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro, позволяющего проводить исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде “свернутых графов” (фактор-графов).

Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы основывается на следующих принципах: структура образуется в результате самосборки из кластеров-прекурсоров; кластеры-прекурсоры образуют каркас структуры, пустоты в котором заполняют спейсеры; многослойные нанокластеры-прекурсоры не имеют общих внутренних атомов, но они могут иметь общие атомы на поверхности; кластеры-прекурсоры занимают высокосимметричные позиции; набор нанокластеров-прекурсоров и кластеров-спейсеров включает в себя все атомы структуры.

Кристаллохимические и топологические данные для Na-интерметаллидов представлены в табл. 1. Параметры и объемы элементарных ячеек представителей кристаллохимических семейств Na-интерметаллидов приведены в табл. 2–7. На рис. 1 даны длины связей атомов в кластерах-прекурсорах кристаллических структур металлов, на рис. 2 и 3 – в кластерах-прекурсорах кристаллических структур интерметаллидов.

Таблица 1.  

Кристаллохимические и топологические данные структурных типов Na-интерметаллидов

Структурный тип Группа симметрии, последовательность Уайкова Атом Локальное окружение Координационные последовательности
N1 N2 N3 N4 N5
Na3Bi-hP8 P63/mmc (194), fcb Na1 6Na + 3Bi 9 33 92 155 237
Na2 7Na + 4Bi 11 38 89 158 242
Bi1 11Na 11 41 86 155 245
Na2Bi2-tP4 P4/mmm (123), eca Na1 4Na + 8Bi 12 42 92 162 252
Bi1 8Na + 4Bi 12 42 92 162 252
Bi2 8Na + 4Bi 12 42 92 162 252
Na2Sb2-mP16 P21/c (14), e4 Na1 4Na + 6Sb 10 37 81 150 236
Na2 5Na + 6Sb 11 37 83 148 233
Sb1 6Na + 2Sb 8 32 78 41 226
Sb2 6Na + 2Sb 8 33 79 40 230
Na4Au2-tI12 I4/mcm (140), ha Na1 7Na+ 4Au 11 42 95 170 263
Au1 8Na+ 2Au 10 38 86 158 258
Na2(Na4)(Ba6)-cF96 Fd$\bar {3}$m (227), fed Na1 6Na + 6Ba 12 43 111 196 328
Na2 6Na + 6Ba 12 44 114 210 330
Ba1 6Na + 8Ba 14 53 115 218 352
Au2(In4)(Na6)-cF96 Fd$\bar {3}$m (227), fed In1 6Na + 6Ba 12 43 111 196 328
Au1 6Na + 6Ba 12 44 114 210 330
Na1 6Na + 8Ba 14 53 115 218 352
Ba2Na4-hP12 P63/mmc (194), hfa Ba1 4Ba + 12Na 16 52 125 232 358
Na1 6Ba + 6Na 12 50 120 230 374
Na2 6Ba + 6Na 12 50 110 212 348
Na2Au4-cF24 Fd$\bar {3}$m (227), da Na1 12Ag +4Na 16 52 130 244 380
Au1 6Ag +6Na 12 50 110 216 356
NaZn13-cF112 Fm$\bar {3}$c (226), iba Na1 24Zn 24 62 132 254 384
Zn1 12Zn 12 32 126 188 330
Zn2 2Na + 10Zn 12 55 129 239 376
Таблица 2.  

Кристаллохимическое семейство Na3Bi-hP8, пр. гр. P63/mmc

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å V, Å3
Li3Sb 4.710, 4.710, 8.326 160.0
Na3Sb 5.365, 5.365, 9.515 237.2
Na3Bi 5.459, 5.459, 9.675 249.7
Na3Hg 5.433, 5.433, 9.795 250.4
K3Sb 6.037, 6.037, 10.717 338.3
K3Bi 6.190, 6.190, 10.955 363.5
Rb3Sb 6.320, 6.320, 11.190 387.1
Rb3Bi 6.490, 6.490, 11.490 419.1
Таблица 3.  

Кристаллохимическое семейство Na2Bi2-tP4, пр. гр. P4/mmm

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å V, Å3
Li2Bi2 4.753, 4.753, 4.247 95.9
Na2Bi2 4.910, 4.910, 4.809 115.9
Таблица 4.  

Кристаллохимическое семейство Na2Sb2-mP16, пр. гр. P21/c

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å
β, град
V, Å3
Na2Sb2 6.800, 6.340, 12.480
117.60
476.8
Na2As2 6.242, 5.849, 11.550
117.10
375.4
Таблица 5.

Кристаллохимическое семейство Na2(Au4)-mP16, пр. гр. Fd$\bar {3}$m

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å V, Å3
Na2(Pt4) 7.480, 7.480, 7.480 418.5
Na2(Au4) 7.812, 7.812, 7.812 476.7
Na2(Ag4) 7.923, 7.923, 7.923 497.4
Таблица 6.

Кристаллохимическое семейство Ba2(Na4)-hP12, пр. гр. P63/mmc

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å V, Å3
Ba2(Na4) 7.393, 7.393, 11.999 568.0
K2(Na4) 7.480, 7.480, 12.270 594.5
Cs2(Na4) 7.861, 7.861, 13.062 699.0
Таблица 7.

Кристаллохимическое семейство Na2(Na4)(Ba6)-cF96, пр. гр. Fm$\bar {3}$c

Интерметаллид [1, 2] a, b, c, Å V, Å3
Na2(Na4)(Ba6) 17.027, 17.027, 17.027 4936
Au2(In4)(Na6) 13.533, 13.533, 13.533 2478
Рис. 1.

Тетраэдрические кластеры в кристаллических структурах металлов. Здесь и далее цифры обозначают длины связей (Å).

Рис. 2.

Металлокластеры-прекурсоры кристаллических структур Na,M-интерметаллидов с M = Bi, Sb, As.

Рис. 3.

Металлокластеры-прекурсоры кристаллических структур Na,M-интерметаллидов с M = Ba, In, Au.

СИММЕТРИЙНЫЙ И ТОПОЛОГИЧЕСКИЙ КОД (ПРОГРАММА) САМОСБОРКИ КРИСТАЛЛИЧЕСКИХ СТРУКТУР ИНТЕРМЕТАЛЛИДОВ

При моделировании кристаллической структуры интерметаллидов определяется иерархическая последовательность ее самосборки в кристаллографическом пространстве XYZ, т.е. восстанавливается симметрийный и топологический код формирования макроструктуры в виде последовательности значимых элементарных событий, характеризующих самую короткую (быструю) программу кластерной самосборки из тетраэдрических металлокластеров $S_{3}^{0}$ в виде: первичная цепь $S_{3}^{1}$ → микрослой $S_{3}^{2}$ → микрокаркас $S_{3}^{3}$.

Структурный тип Na3Bi-hP8 [10]. Кристаллохимическое семейство состоит из 16 интерметаллидов [1, 2]. К семейству щелочных интерметаллидов относятся восемь соединений (табл. 2). В локальном окружении атомов Na1 и Na2 находятся 9 и 11 атомов, атома Bi – 11 атомов (табл. 1). Металлокластер-прекурсор M4 представляет собой тетраэдр Na3Bi с симметрией m (рис. 2). Длины связей Na–Bi и Na–Na равны 3.152 и 3.542 и 3.231 и 3.542 Å соответственно. Для кластеров M4 установлена базовая 2D-сетка 36.

Первичная цепь $S_{3}^{1}$ формируется в результате связывания металлокластеров Na3Bi с индексом связанности Pс = 4 (рис. 4). Расстояние между тетраэдрами вдоль оси X определяет модуль вектора трансляции a = 5.459 Å. Слой $S_{3}^{2}$ образуется в процессе связывания параллельно расположенных цепей со сдвигом. Расстояние между тетраэдрами вдоль оси Y определяет модуль вектора трансляции b = 5.4598 Å. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при упаковке слоев со сдвигом. Расстояние между слоями в направлении оси Z соответствует длине вектора трансляции c = 9.657 Å.

Рис. 4.

Слои $S_{3}^{2}$ из кластеров-прекурсоров кристаллических структур Na-интерметаллидов. Здесь и далее разным цветом выделены эквивалентные структурные единицы.

Структурный тип Na2Bi2-tP4 [11]. Кристаллохимическое семейство включает 47 интерметаллидов. К семейству щелочных интерметаллидов относятся два соединения (табл. 3). Металлокластер-прекурсор представляет собой тетраэдр Na2Bi2 (рис. 2) с симметрией m. Длины связей Na–Bi = 3.436, Na–Na = 3.472 и Bi–Bi = 3.436 Å. Для металлокластеров установлена базовая 2D-сетка 44. Первичная цепь $S_{3}^{1}$ формируется в результате связывания (Pс = 4) тетраэдрических кластеров-прекурсоров Na2Bi2. Расстояние между центрами кластеров определяет длину вектора трансляции b (рис. 4). Слой $S_{3}^{2}$ образуется вдоль оси Y в результате связывания параллельно расположенных цепей с индексом Pc = 10. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при упаковке слоев $S_{3}^{2}$. Расстояние между осями первичных цепей из соседних слоев соответствует периоду трансляции a.

Структурный тип Na2Sb2-mP16. К семейству Na-интерметаллидов относятся Na2Sb2 [12], Na2As2 [13] (табл. 4). Металлокластер-прекурсор представляет собой тетраэдр Na2As2 (рис. 2). Длины связей Na–Sb равны 4.124 и 4.152 Å, Na–Na – 3.707 и 3.542 Å, Sb–Sb – 2.485 Å. Для кластеров M4 установлена базовая 2D-сетка 44. Первичная цепь $S_{3}^{1}$ формируется в результате связывания (Pс = 8) тетраэдрических металлокластеров Na2As2 осью симметрии 21 (рис. 4). Удвоенное расстояние между тетраэдрами в направлении оси Y определяет период трансляции b = 6.340 Å. Образование слоя $S_{3}^{2}$ происходит в ходе связывания параллельно расположенных цепей (рис. 4). Удвоенное расстояние между осями первичных цепей вдоль оси Z равно длине вектора трансляции c = 12.480 Å. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при связывании слоев. Расстояние между слоями в направлении оси X соответствует модулю вектора трансляции a = 6.800 Å.

Структурный тип Na2(Au4)-cF24 [14]. Число представителей в кристаллохимическом семействе 224. К Na-интерметаллидам относятся Na2(Au4), Na2(Ag4), Na2(Pt4) (табл. 5). Металло-кластер-прекурсор представляет собой тетраэдр с симметрией $\bar {4}$3m (рис. 3). В тетраэдрах длины связей Pt–Pt = 2.645, Au–Au = 2.762, Ag–Ag = 2.801 Å соответствуют длинам связей атомов в кристаллических структурах Pt-cF4, Ag-cF4, Au-cF4 (рис. 1). Для металлокластеров установлена базовая 2D-сетка 44. Самосборка первичных цепей $S_{3}^{1}$ из кластеров Au4 происходит в направлении диагонали в плоскости XY (рис. 5). Образование слоя $S_{3}^{2}$ происходит при связывании параллельно расположенных первичных цепей в плоскости XY. Расстояния между центрами тетраэдров Au4 из соседних цепей в направлении осей X и Y соответствуют периодам трансляции a = b = 7.812 Å. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при связывании (со сдвигом) слоев $S_{3}^{2}$. Расстояние между слоями $S_{3}^{2}$ определяет половину периода трансляции c = = 7.812 Å.

Рис. 5.

Слои $S_{3}^{2}$ из кластеров-прекурсоров и спейсеров в каркасных структурах Na-интерметаллидов.

Структурный тип Ba2(Na4)-hP12 [15]. Число представителей в кристаллохимическом семействе 59. К Na-интерметаллидам относятся Ba2(Na4), K2(Na4), Cs2(Na4) (табл. 6). Металлокластер-прекурсор представляет собой тетраэдр Na4 с симметрией 3m (рис. 2). Длины связей Na–Na в тетраэдрах равны 3.712 и 3.786, 3.747 и 3.754, 3.930 и 3.976 Å для Ba-, K-, Cs-соединений соответственно. Для металлокластеров установлена базовая 2D-сетка 36. Самосборка первичных цепей $S_{3}^{1}$ происходит параллельно оси Х в плоскости XY (рис. 5). Расстояние между кластерами Na4 соответствует длине вектора трансляции a = 7.393 Å. Слой $S_{3}^{2}$ образуется при связывании (со сдвигом) цепей $S_{3}^{1}$ параллельно оси Y. Расстояние между осями первичных цепей (проходящими через центры тяжести кластеров Na4) равно модулю вектора трансляции b = 7.393 Å. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при связывании слоев со сдвигом. Расстояние между слоями определяет половину периода трансляции c = 11.999 Å.

Структурный тип Na4Au2-tI12 [14]. Число представителей в кристаллохимическом семействе 49. К щелочным соединениям относится только интерметаллид Na4Au2. Металлокластер-прекурсор представляет собой октаэдр Na4Au2 (рис. 3) с симметрией 4/m. Расстояния Au–Au 2.761 Å соответствуют длинам связей в Au-cF4 (рис. 1). Для металлокластеров Na4Au2 установлена базовая 2D-сетка 36. Самосборка первичных цепей $S_{3}^{1}$ происходит в результате связывания кластеров Na4Au2 с индексом Pc = 5 (рис. 4). Слой $S_{3}^{2}$ образуется при связывании параллельно расположенных цепей со сдвигом. Расстояние между центрами кластеров Na4Au2 равно модулю вектора трансляции c = 5.522 Å. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется при упаковке (со сдвигом) слоев $S_{3}^{2}$. Расстояние между первичными цепями вдоль осей Х и Y соответствует периодам трансляций a = = b = 7.415 Å.

Структурный тип Na2(Na4)(Ba6)-cF96. К семейству Na-интерметаллидов относятся Na2(Na4)(Ba6) [16] и Au2(In4)(Na6) [17] (табл. 7). Центры октаэдрических Ba6 и Na6 и тетраэдрических Na4 и In4 кластеров (рис. 3) находятся в позициях 8a и 8b с симметрией m$\bar {3}$m соответственно. В кластерах Na6 и Na4 все длины связей Na–Na равны 3.87 Å. Первичная цепь $S_{3}^{1}$ кристаллической структуры Na2(Na4)(Ba6) формируется в результате связывания кластеров Na4 и Ba6 с участием атомов-спейсеров Na (рис. 5). Первичная цепь $S_{3}^{1}$ Au2(In4)(Na6) образуется при связывании кластеров In4 и Na6 и атомов-спейсеров Au, слой $S_{3}^{2}$ – при связывании (со сдвигом) первичных цепей. Каркас структуры $S_{3}^{3}$ формируется в процессе связывания слоев $S_{3}^{2}$.

Структурный тип NaZn13cF116 [18]. Общее число представителей в кристаллохимическом семействе 46. Установлено, что интерметаллиды AZn13 образуются с атомами A = Li, Na, K, Rb, Ba [1, 2]. Параметры кубической ячейки NaZn13: a = = 12.273 Å, V = 1848 Å3. Кластер-прекурсор представляет собой икосаэдр из 12 атомов Zn с атомом Zn в центре, который занимает позицию 8b с наивысшей возможной кристаллографической симметрией m$\bar {3}$. Для металлокластеров M13 установлена 2D-сетка 44. Самосборка первичных цепей $S_{3}^{1}$ происходит в направлении оси X (рис. 5). Расстояние между центрами кластеров Zn13 соответствует длине вектора трансляции a = 12.273 Å. При связывании икосаэдров Рс = 8. Микрослой $S_{3}^{2}$ образуется при связывании параллельно расположенных коротких цепей $S_{3}^{1}$, микрокаркас $S_{3}^{3}$ – при упаковке микрослоев. Атом Na находится в центре полости и образует 24 связи Na–Zn (по три с каждым из восьми икосаэдров).

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Проведен геометрический и топологический анализ кристаллических структур интерметаллидов, образующихся в системах Na–М с атомами M = K, Cs, Ba, Ag, Pt, Au, Zn, Bi, Sb. С использованием алгоритмов разложения структурных графов на кластерные структуры для интерметаллидов определены металлокластеры-прекурсоры в виде тетраэдров, октаэдров и икосаэдров. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки кристаллических структур из металлокластеров-прекурсоров $S_{3}^{0}$ в виде: первичная цепь $S_{3}^{1}$ → микрослой $S_{3}^{2}$ → микрокаркас $S_{3}^{3}$.

Автор выражает благодарность В.А. Блатову за предоставление для расчетов пакета программ ТороsPro.

Работа выполнена при поддержке Министерства науки и высшего образования РФ в рамках государственного задания ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН и Российского фонда фундаментальных исследований (грант № 19-02-00636).

Список литературы

  1. Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.

  2. Inorganic Crystal Structure Database (ICSD). Fachinformationszentrum Karlsruhe (FIZ), Germany and US National Institute of Standard and Technology (NIST), USA.

  3. Ilyushin G.D. // Crystallography Reports. 2020. V. 65. № 2. P. 202.

  4. Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. P. 3576.

  5. Pankova A., Blatov V., Ilyushin G., Proserpio D. // Inorg. Chem. 2013. V. 52. P. 13094.

  6. Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D. M. // Chem. Mater. 2013. V. 25. P. 412.

  7. Ilyushin G.D. // Crystallography Reports. 2017. V. 62. 5. P. 670.

  8. Ilyushin G.D. // Crystallography Reports. 2018. V. 63. 4. P. 543.

  9. Ковальчук М.В., Алексеева О.А., Благов А.Е., Илюшин Г.Д. и др. // Кристаллография. 2019. Т. 64. № 1. С. 10.

  10. Brauer G., Zintl E. // Z. Phys. Chem. B. 1937. V. 37. P. 323.

  11. Zintl E., Dullenkopf W. // Z. Phys. Chem. B. 1932. V. 16. P. 183.

  12. Cromer D.T. // Acta Cryst. 1959. V. 12. P. 41.

  13. Burtzlaff S., Holynska M., Dehnen S. // Z. Anorg. Allg. Chem. 2010. B. 636. S. 1691.

  14. Haucke W. // Naturwissenschaften. 1937. B. 25. S. 61.

  15. Snyder G.J., Simon A. // Z. Naturforschung B: Chem. Sci. 1994. B. 49. S. 189.

  16. Smetana V. // Dissertation Universitaet Freiburg/Breisgau. 2009.

  17. Li B., Corbett J.D. // Inorgan. Chem. 2005. V. 44. P. 6515.

  18. Wendorff M., Roehr C. // J. Alloys Compd. 2006. V. 421. P. 24.

Дополнительные материалы отсутствуют.