Журнал физической химии, 2019, T. 93, № 9, стр. 1322-1327

Кинетика окисления урацила и его производных озоном в водных растворах

А. А. Максютова a, Ю. С. Зимин a*, А. Р. Гимадиева b, А. Г. Мустафин ab

a Башкирский государственный университет
Уфа, Россия

b Российская академия наук, Уфимский федеральный исследовательский центр, Уфимский институт химии
Уфа, Россия

* E-mail: ZiminYuS@mail.ru

Поступила в редакцию 28.12.2018
После доработки 22.02.2019
Принята к публикации 12.03.2019

Полный текст (PDF)

Аннотация

Спектрофотометрическим методом изучена кинетика окисления урацила и его производных (тимина, 6-метилурацила, 5-бром-6-метилурацила, 5-нитро-6-метилурацила, 1,3-диметилтимина и 5‑гидрокси-1,3,6-триметилурацила) озоном в водных растворах. Показано, что реакции протекают по кинетическому закону второго порядка. В интервале 285–309 К исследована температурная зависимость констант скоростей реакций второго порядка и определены активационные параметры реакций.

Ключевые слова: урацил, производные урацила, озон, кинетика, окисление, активационные параметры

Пиримидиновые основания характеризуются широким распространением в живой природе. Они играют важную роль в построении цепей рибонуклеиновых (РНК) и дезоксирибонуклеиновых (ДНК) кислот. Разрушение структур пиримидиновых колец и исчезновение карбонильных и аминогрупп приводят к тяжелым последствиям для организма. Несмотря на то, что существуют механизмы защиты и восстановления нуклеиновых кислот, окислительные процессы пиримидиновых оснований способны приводить к необратимым разрушениям мономерных звеньев цепей РНК и ДНК и, как следствие, к серьезным генетическим заболеваниям.

В настоящее время исследователи разных областей науки всерьез заинтересованы изучением процессов окисления РНК и ДНК. При этом исследования проводятся на модельных системах, среди которых чаще всего используются урацил и его производные (ПУ). К настоящему времени в литературе имеются данные по окислению ПУ молекулярным кислородом (в присутствии солей меди), перманганатом калия, пероксидом водорода, пероксильным, гидроксильным и гидропероксильным радикалами (см., например, работы [14] и цитируемую там литературу). При этом в качестве продуктов окисления были обнаружены различные химические соединения. Так, основным продуктом взаимодействия 5-гидрокси-6-метилурацила с молекулярным кислородом в присутствии хлорида меди (II) оказался 5,5,6-тригидрокси-6-метилпиримидин-2,4-дион [1]. Окисление 5-аминоурацила в таких же условиях приводит к образованию 5,5,6-тригидроксипиримидин-2,4(1Н,3Н)-диона [2]. При окислении урацила и тимина перманганатом калия в водной среде в качестве основных продуктов обнаружены соответствующие гликоли и производные барбитуровой кислоты [5]. Окисление урацилов пероксидными соединениями приводит к разрушению урацильного кольца и образованию мочевины и низших карбоновых кислот [6].

В то же время, среди используемых окислителей практически не представлен такой окислитель как озон, который в последние годы находит широкое применение в разных сферах деятельности человека: обеззараживание воды, очистка сточных вод, косметология, медицина и т.д. И если как окислитель “зеленой химии” озон укрепил свои позиции, то его целесообразное применение в общей терапии научно не было доказано или опровергнуто.

В связи с этим целью настоящей работы явилось изучение кинетики реакции озона с урацилом и рядом его производных в водных растворах.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Для исследований были использованы урацил и шесть его производных (тимин, 6-метилурацил, 5-бром-6-метилурацил, 5-нитро-6-метилурацил, 1,3-диметилтимин и 5-гидрокси-1,3,6-триметилурацил). Урацил, тимин и 6-метилурацил были произведены фирмой “Фармакон” (г. Санкт-Петербург). Остальные производные урацила синтезированы по методикам, описанным ранее [79]. Озон-кислородная смесь была получена с помощью озонатора, конструкция которого описана в работе [10]. Растворитель – свежеперегнанная бидистиллированная вода.

Кинетику реакции изучали спектрофотометрическим методом на приборе UV-2600 фирмы “Shimadzu” при равенстве начальных концентраций реагентов ([ПУ]0 = [О3]0), которое достигалось следующим образом. Вначале определяли концентрацию озона в воде, которую создавал озонатор в день проведения эксперимента. Для этого в пробирку помещали 4 мл бидистиллированной воды и подавали в нее озон-кислородную смесь до насыщения. Дополнительными опытами было установлено, что максимальная концентрация озона в 4 мл воды достигалась за 2 мин барботажа О3–О2-смеси. Далее спектрофотометрически по закону Бугера–Ламберта–Бера определяли эту концентрацию О3 в воде (${{\varepsilon }_{{{{{\text{O}}}_{3}}}}}$ = = 2700 л моль–1 см–1 при = 270 нм [11]). Затем готовили 4 мл водного раствора ПУ такой же концентрации (из заранее приготовленного раствора большей концентрации).

Перед началом кинетического эксперимента вновь насыщали 4 мл бидистиллированной воды озон-кислородной смесью. Далее, после смешения 2 мл озонового раствора с 2 мл водного раствора ПУ, наблюдали за изменением оптической плотности полученной реакционной смеси. Поскольку оба реагента поглощают в ультрафиолетовой области, кинетику озонированного окисления урацила и его производных исследовали на длинах волн (λmax), равных максимумам поглощения сопряжения урацильного кольца11. При этом оптическая плотность в каждый отдельный момент времени представляла собой сумму двух оптических плотностей:

$А = {{А}_{{{\text{ПУ}}}}} + {{А}_{{{{{\text{О}}}_{3}}}}} = {{\varepsilon }_{{{\text{ПУ}}}}}[{\text{ПУ}}]l + {{\varepsilon }_{{{{{\text{О}}}_{3}}}}}[{{{\text{О}}}_{{\text{3}}}}]l,$
где АПУ и АОз – оптические плотности, обусловленные поглощением ПУ и О3, соответственно; εПУ и εОз – коэффициенты экстинкции ПУ и О3, соответственно, на длине волны λmax урацила или его производного, л моль–1 см–1; l – толщина кюветы, см. Учитывая, что [ПУ] = [О3] = С, получаем следующее выражение
$C = \frac{А}{{({{\varepsilon }_{{ПУ}}} + {{\varepsilon }_{{{{О}_{3}}}}})l}},$
которое позволяет от оптической плотности А перейти к текущей концентрации С реагирующих веществ (ПУ или О3). Толщина кюветы (l) во всех опытах составляла 1 см.

Стехиометрические соотношения реагентов (ПУ и О3) определяли с помощью барботажной установки [11, 12], продувая озон-кислородную смесь через водные растворы урацилов и следя за изменением [О3] в газовой фазе на выходе из реактора. Методика проведения данных экспериментов подробно описана в работе [13].

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

Согласно [1416], урацил и его производные в водных растворах при рН < 7.0 существуют преимущественно в дикето-форме. Исследования показали, что pH водных растворов изученных урацилов в диапазоне используемых нами концентраций не превышает 5.8. На основании данного факта можно утверждать, что в условиях наших экспериментов урацилы представлены главным образом дикето-формой.

На первом этапе исследований были определены коэффициенты экстинкции урацила и его производных в водных растворах (по закону Бугера–Ламберта–Бера), которые в дальнейшем будут использованы для расчетов остаточных концентраций ПУ. Было установлено, что линейная зависимость между оптическими плотностями изученных урацилов и их концентрациями в водных растворах четко выполняется до [ПУ] = 2 × 10–4 моль/л. По тангенсам углов наклона зависимостей А = f ([ПУ]) были определены коэффициенты экстинкции урацилов, значения которых представлены в табл. 1.

Таблица 1.  

Значения коэффициентов экстинкции изученных урацилов

Урацилы εПУ × 10–3, л моль–1 см–1 λmax, нм
Урацил 8.4 ± 0.2 257
Тимин 6.8 ± 0.1 264
6-Метилурацил 9.0 ± 0.1 260
5-Бром-6-метилурацил 7.8 ± 0.1 275
5-Нитро-6-метилурацил 9.4 ± 0.1 260
1,3-Диметилтимин 10.0 ± 0.1 267
5-Гидрокси-1,3,6-триметилурацил 7.9 ± 0.1 283

На следующем этапе была изучена кинетика реакции озона с урацилами. Как отмечено в экспериментальной части, реакцию проводили при равенстве начальных концентраций реагентов: [ПУ]0 = [О3]0 = С0. Анализ кинетических кривых изменения концентрации С показал, что они достаточно хорошо линеаризуются в координатах уравнения реакции второго порядка (рис. 1):

(1)
${\text{1/}}C = {\text{1/}}{{C}_{0}} + kt\quad (r \geqslant 0.{\text{995}}),$
где k – константа скорости реакции озона с ПУ, r – коэффициент корреляции. По тангенсам углов наклона прямых (рис. 1) были рассчитаны константы скоростей k реакции озона со всеми исследованными урацилами.

Рис. 1.

Линеаризация кинетических кривых изменения концентрации С в координатах уравнения (1); 305 К, 1 – 6-метилурацил, 2 – 5-нитро-6-метилурацил, 3 – тимин.

Далее с помощью барботажной установки, описанной в работах [11, 12], была изучена кинетика поглощения озона водными растворами урацилов. Опыты проводили при комнатной температуре (295 К). На рис. 2 в качестве примера приведены кривые изменения оптической плотности озона для воды (верхняя кривая) и водного раствора 6-метилурацила (6-МУ) (нижняя кривая).

Рис. 2.

Кривые изменения оптической плотности озона для воды (верхняя кривая) и водного раствора 6-метилурацила (нижняя кривая); 295 К, [6-МУ]0 = = 1 × 10–3 моль/л, Wгаз = 6 л/ч.

Количество озона, поглощенное реакционной смесью, пропорционально площади, заключенной между кривыми оптического поглощения S (рис. 2). Зная количество озона, приходящееся на единицу площади рисунка, можно рассчитать количество поглощенного озона. Для этого сначала определяли количество О3, соответствующее площади оценочного прямоугольника Sпр [11, 12]:

(2)
${{[{{O}_{3}}]}_{{пр}}} = \frac{{{{W}_{{газ}}}}}{V}\frac{{\Delta {{A}_{{пр}}}\Delta {{t}_{{пр}}}}}{{\varepsilon \,l\,3600}},$
где Wгаз – скорость газового потока (Wгаз = 6 л/ч), V – объем реакционного раствора (V = 0.05 л), ΔАпр, Δtпр – размеры прямоугольника в координатах Аt (с), ε – коэффициент экстинкции озона при λ = 300 нм (ε = 95 л/(моль·см) [11]), l – длина кюветы (l = 5 см). Количество озона [О3]р, поглощенного реакционной смесью (моль/л), рассчитывали по формуле [11, 12]:

(3)
${{[{{O}_{3}}]}_{р}} = {{[{{O}_{3}}]}_{{пр}}}\frac{{\text{S}}}{{{{{\text{S}}}_{{пр}}}}},\;моль{\text{/л}}{\kern 1pt} .$

Количество 6-метилурацила, израсходованного к данному моменту времени, находили по формуле:

(4)
${{[{\text{6 - МУ}}]}_{р}} = {{[{\text{6 - МУ}}]}_{0}} - {{[{\text{6 - МУ}}]}_{t}},$
где [6-МУ]0 – начальная концентрация 6-метилурацила, [6-МУ]t –концентрация 6-метилурацила, оставшаяся к моменту времени t. Остаточную концентрацию 6-МУ определяли методом УФ-спектроскопии после охлаждения отбираемых проб (с помощью снега) и выдувки озона (с помощью аргона).

В табл. 2 приведены данные по зависимости количеств поглощенного озона [О3]р и израсходованного урацила [6-МУ]р от времени подачи озон-кислородной смеси через водный раствор субстрата. Из приведенных данных следует, что в начальные моменты времени (вплоть до 2 мин) исходные вещества – озон и 6-метилурацил – реагируют в соотношении 1 : 1. Отметим, что для начальных стадий окисления остальных изученных урацилов озоном имело место аналогичное соотношение (1 : 1). Отсюда становится понятным второй порядок озонированного окисления урацилов по данным спектральных исследований. Очевидно, изучаемая реакция имеет первый порядок по ПУ и первый порядок по озону:

(5)
$V = - dС{\text{/}}dt = k[{\text{ПУ}}][{{{\text{O}}}_{{\text{3}}}}].$
Таблица 2.  

Зависимость количеств поглощенного озона и израсходованного 6-метилурацила от времени подачи озон-кислородной смеси через водный раствор субстрата; 295 К, [6-МУ]0 = 1 × 10–3 моль/л, Wгаз = 6 л/ч

t, с 3]р × 103, моль/л [6-МУ]р × 103, моль/л 3]р : [6-МУ]р
60 0.5 0.5 1.0
120 1.0 1.0 1.0
180 1.4 1.0 1.4
240 1.9 1.0 1.9
300 2.3 1.0 2.3
360 2.8 1.0 2.8

Обращает на себя внимание тот факт, что на более глубоких стадиях соотношение [О3]р : [6-МУ]р превышает единицу (табл. 2). Повышенный расход озона, очевидно, связан с дальнейшим окислением образующихся продуктов.

В настоящей работе для урацила и шести его производных в интервале 285–309 К была изучена температурная зависимость k, значения которых суммированы в табл. 3. Согласно данным этой таблицы наблюдается следующий порядок реакционной способности урацилов по отношению к озону (285 К): 1,3-диметилтимин > 5-бром-6-метилурацил > урацил, 6-метилурацил > 5-нитро-6-метилурацил > 5-гидрокси-1,3,6-триметилурацил > тимин. Из приведенного ряда следует, что тимин обладает наиболее выраженными антиокислительными свойствами. Отсюда становится понятным, почему именно тимин входит в состав ДНК.

Таблица 3.  

Температурная зависимость констант скоростей реакции озона с урацилами

T, K Урацил Тимин 6-Метил-урацил 5-Бром-6-метилурацил 5-Нитро-6-метилурацил 1,3-Диме-тилтимин 5-Гидрокси-1,3,6-триме-тилурацил
k × 10–1, л моль–1 с–1
285 4.5 ± 0.3 0.67 ± 0.01 4.50 ± 0.04 6.2 ± 0.2 3.10 ± 0.05 6.64 ± 0.4 0.74 ± 0.06
289 5.7 ± 0.4 0.85 ± 0.01 5.3 ± 0.1 7.4 ± 0.2 4.4 ± 0.1 8.7 ± 0.5 0.86 ± 0.05
293 6.6 ± 0.4 0.89 ± 0.01 7.0 ± 0.2 8.1 ± 0.3 6.1 ± 0.1 9.35 ± 0.6 1.19 ± 0.04
297 7.8 ± 0.5 1.10 ± 0.02 8.6 ± 0.4 10.2 ± 0.3 7.6 ± 0.1 13.5 ± 0.8 1.70 ± 0.04
301 8.5 ± 0.6 1.20 ± 0.02 11.5 ± 0.3 11.2 ± 0.5 9.7 ± 0.1 16.9 ± 1.0 2.4 ± 0.1
305 11.4 ± 0.5 1.29 ± 0.02 13.9 ± 0.4 12.4 ± 0.6 11.9 ± 0.2 18.3 ± 1.5 3.0 ± 0.1
309 12.1 ± 0.8 1.46 ± 0.03 17.2 ± 0.5 15.3 ± 0.5 15.0 ± 0.3 24.8 ± 1.1 4.7 ± 0.1

Обработка данных табл. 3 в координатах уравнения Аррениуса позволила определить активационные параметры изучаемых реакций (табл. 4). В качестве примера на рис. 3 приведены результаты линеаризации в координатах lg k = f(1/Т) температурных зависимостей констант скоростей реакции озона с тремя урацилами (6-метилурацилом, 5-нитро-6-метилурацилом и тимином).

Таблица 4.  

Активационные параметры реакции озона с урацилами

Урацилы lg A, л моль–1 с–1 E, кДж/моль
Урацил 7.4 ± 0.7 30.3 ± 4.2
Тимин 5.1 ± 0.5 23.2 ± 2.8
6-Метилурацил 9.4 ± 0.5 42.4 ± 2.9
5-Бром-6-метилурацил 6.6 ± 0.6 26.3 ± 3.2
5-Нитро-6-метилурацил 10.2 ± 0.8 47.4 ± 4.4
1,3-Диметилтимин 9.0 ± 1.1 39.5 ± 3.7
5-Гидрокси-1,3,6-триметилурацил 12.9 ± 1.3 66.4 ± 7.1
Рис. 3.

Температурные зависимости констант скоростей k реакции озона с 6-метилурацилом (1), 5-нитро-6-метилурацилом (2) и тимином (3) в координатах уравнения Аррениуса.

На основании анализа данных табл. 4 было установлено, что между энергиями активации Е и логарифмами предэкспоненциальных множителей lg A удовлетворительно (рис. 4, r = 0.988) выполняется линейная зависимость – компенсационный эффект [17]. Данный факт может свидетельствовать о едином механизме лимитирующей стадии окисления изученных урацилов озоном. Уменьшение сигнала, относящегося к поглощению сопряжения урацильного кольца, свидетельствует об участии этой группы в реакции с О3. С учетом данного факта, а также кинетического уравнения (5), можно ожидать, что окисление ПУ лимитирует стадия присоединения озона по связи урацильного кольца.

Рис. 4.

Компенсационный эффект в реакции озона с урацилами.

Таким образом, в настоящей работе изучена кинетика озонированного окисления урацила и шести его производных в водных растворах. Показано, что исследуемые реакции протекают по кинетическим уравнениям второго порядка (первого – по урацилу и первого – по озону). В интервале 285–309 К исследована температурная зависимость констант скоростей второго порядка и определены активационные параметры реакций. Для ряда изученных урацилов в водной среде установлена корреляционная зависимость между значениями энергий активации и логарифмами предэкспоненциальных множителей.

Список литературы

  1. Нугуманов Т.Р. Окислительные превращения 5-гидрокси-6-метилурацила под действием молекулярного кислорода в присутствии хлорида меди (II), гидроксильных и пероксильных радикалов: Дис. … канд. хим. наук. Уфа: Институт органической химии УНЦ РАН, 2009. 98 с.

  2. Закирьянова О.В. Взаимодействие 5-аминоурацила с молекулярным кислородом в водных растворах в присутствии хлорида меди (II): Дис. … канд. хим. наук. Уфа: Институт органической химии УНЦ РАН, 2011. 98 с.

  3. Ахатова Г.Р. Антиокислительная эффективность производных урацила: Дис. … канд. хим. наук. Уфа: Башкирский государственный университет, 2012. 115 с.

  4. Зимин Ю.С., Хайруллина Л.Р., Кутлугильдина Г.Г., Мустафин А.Г. // Журн. физ. химии. 2015. Т. 89. № 12. С. 1864.

  5. Bui C.T., Cotton R.G.H. // Bioinorg. Chem. 2002. V. 30. P. 133.

  6. Subbaraman L.R., Subbaraman J., Behrman E.J. // J. Org. Chem. 1971. T. 36. № 9. C. 1256.

  7. Фаттахов А.Х., Лобов А.Н., Гимадиева А.Р. и др. // Вестн. Башк. ун-та. 2012. Т. 17. № 4. С. 1710.

  8. Кривоногов В.П., Толстиков Г.А., Муринов Ю.И. и др. 6-Метилурацил-5-аммонийсульфат в качестве исходного соединения для синтеза оксипроизводных 6-метилурацила: Пат. № 2000298 РФ // Б.И. 1993. № 33-36.

  9. Адамович А.И., Витенберг А.Г. Способ получения 5‑амино-4-метилурацила: А.с. 130044 СССР // Б.И. 1960. № 14.

  10. Вендилло В.П., Емельянов Ю.М., Филиппов Ю.В. // Заводск. лаборатория. 1959. Т. 25. № 11. С. 1401.

  11. Шафиков Н.Я. Кинетика, продукты и механизм окисления этанола озоном: Дисс. … канд. хим. наук. Уфа: Институт химии БФАН СССР, 1985. 166 с.

  12. Зимин Ю.С. Кинетика и механизм озонированного окисления спиртов, эфиров, кетонов и олефинов в водной среде: Дисс. … докт. хим. наук. Уфа: Институт органической химии УНЦ РАН, 2006. 302 с.

  13. Зимин Ю.С., Комиссаров В.Д. // Вестн. Башк. ун-та. 2004. № 4. С. 31.

  14. Iza N., Gil M., Marcillo J. // J. Mol. Struct. 1988. V. 175. № 1. P. 31.

  15. Yekeler H., Ozback D. // J. Mol. Model. 2001. V. 7. № 4. P. 103.

  16. Иванов С.П. Изучение кето-енольного равновесия некоторых производных урацила в водных растворах: Дис. … канд. хим. наук. Уфа: Институт органической химии УНЦ РАН, 2003. 143 с.

  17. Денисов Е.Т., Саркисов О.М., Лихтенштейн Г.И. Химическая кинетика. М.: Химия, 2000. 568 с.

Дополнительные материалы отсутствуют.