Физика и химия стекла, 2020, T. 46, № 1, стр. 20-26

Кластерная самоорганизация интерметаллических систем. Новый двухслойный кластер-прекурсор K46 = 0@8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6) для самосборки кристаллической структуры Ca11Hg54hP65

В. Я. Шевченко 1*, В. А. Блатов 2, Г. Д. Илюшин 2 3

1 Институт химии силикатов им. И.В. Гребенщикова РАН
199034 Санкт-Петербург, наб. Макарова, 2, Россия

2 Международный научно-исследовательский центр по теоретическому материаловедению, Самарский государственный технический университет
443100 Самара, ул. Молодогвардейская, 244, Россия

3 Федеральный научно-исследовательский центр “Кристаллография и фотоника”
119333 Москва, Ленинский пр., 59, Россия

* E-mail: shevchenko@isc.nw.ru

Поступила в редакцию 11.07.19
После доработки 04.10.19
Принята к публикации 08.10.19

Полный текст (PDF)

Аннотация

С помощью компьютерных методов (пакет программ ToposPro) осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование самосборки кристаллической структуры Ca11Hg54hP65 (a = b = 17.114 Å, c = 10.442 Å, гексагональная пр. группа P-6). Установлены 184 варианта кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц 3–7. Определены полиэдрические кластеры K8 = 0@Ca2Hg6, представляющие собой гексагональные бипирамиды, полиэдрические кластеры K11 = 0@Ca3Hg8 и полиэдрические кластеры с центральным Hg-атомом K12 = Hg(Ca3Hg8). Центры кластеров Ca2Hg6, 0@Ca3Hg8 и Hg(Ca3Hg8) занимают высокосимметричные позиции 1с, 1b, и 1f с симметрией –6. Кластеры-прекурсоры Ca2Hg6 являются темплатами, на поверхности которых происходит образование атомных оболочек из 38 атомов. Состав двухслойного темплатированного кластера K46 = 0@8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6). Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры из нанокластеров-прекурсоров K46 с участием полиэдрических кластеров 0@Ca3Hg8 и Hg(Ca3Hg8).

Ключевые слова: интерметаллид Ca11Hg54hP65, самосборка кристаллической структуры, полиэдрические кластеры K8 = Ca2Hg6 и K12 = Hg(Ca3Hg8), двухслойный кластер K46 = 0@8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6)

ВВЕДЕНИЕ

Кристаллохимическое семейство двойных Hg-интерметаллидов насчитывает около 200 соединений [1]. Образование Hg-интерметаллидов установлено в 45 системах A–Hg. Наибольшее число кристаллохимически различных интерметаллидов (одиннадцать) установлено в двойной системе Ca–Hg, с широкой областью изменения соотношения атомов Hg : A от 11 до 0.33 (табл. 1, [26]).

Таблица 1.  

Кристаллографические данные

Соединение Hg/Ca Струк-
турный тип
Число
соединений
[1]
Пространственная группа Класс
Пирсона
Параметры ячейки, Å V, Å3
Ca3Hg [2] 0.33 Fe3C 194 Pnma (62) oP16 8.161, 10.150, 6.828 565.6
Ca3Hg [3] 0.33 Cu3Au 1827 Pm-3m (221) cP4 4.920, 4.920, 4.920 119.1
Ca2Hg [2] 0.5 Co2Si 43 Pnma (62) oP12 7.860, 4.890, 9.870 379.4
Ca5Hg3 [2] 0.6 Cr5B3 183 I4/mcm (140) tI32 8.189, 8.189, 14.701 985.8
Ca3Hg2 [2] 0.66 U3Si2 142 P4/mbm (127) tP10 8.476, 8.476, 4.197 301.5
Ca2Hg2 [2] 1 CsCl 1797 Pm-3m (221) cP2 3.759, 3.759, 3.759 53.1
CaHg2 [2] 2 AlB2 43 P-3m 1(164) hP3 4.894, 4.894, 3.571 74.1
Ca4Hg9 [4] 2.25 Cu9Al4 47 P-43m (215) cP52 11.130, 11.130, 11.130 1378.8
CaHg3 [2] 3 Mg3Cd 356 P63/mmc (194) hP8 6.635, 6.635, 5.020 191.4
Ca11Hg54 [5] 4.90 Ca11Hg54 3 P-6 (174) hP65 13.389, 13.389, 9.615 1492.7
CaHg11 [6] 11 BaHg11 13 Pm-3m (221) cP36 9.600, 9.600, 9.600 884.7

Кристаллические структуры шести Hg-интерметаллидов входят в кристаллохимические семейства наиболее распространенных типов кристаллических структур, насчитывающие по несколько сотен представителей; три Hg-интерметаллида принадлежат кристаллохимическим семействам с более чем сорока представителями (табл. 1). В работе [7, 8] проведено моделирование кластерной самосборки распространенных типов кристаллических структур, установленных для Hg-интерметаллидов.

Наиболее кристаллохимически сложное семейство интерметаллидов Ca11Hg54hP65 включает в себя еще два соединения: Sr11Hg54hP65 [5] и Yb11Hg54hP65 [9]. Кристаллическая структура интерметаллида Ca11Hg54hP65 [5] с пр. группой P-6 (no. 174) и V = = 1492.7 Å3 характеризуется 18 кристаллографически независимыми атомами с последовательностью Вайкоффа l6k3j4ihgfa. Для атомов Hg установлен широкий спектр значений КЧ = 11 (5 атомов), 12 (8 атомов) и 13 (1 атом). Атомы Ca имеют КЧ = 14 (1 атом), 15 (2 атома), 16 (1 атом).

В настоящей работе с помощью пакета программ ToposPro [10] проведен геометрический и топологический анализ кристаллической структуры интерметаллида Ca11Hg54hP65. Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структуры из кластеров-прекурсоров K46 в виде: первичная цепь → → микрослой → микрокаркас.

Работа продолжает исследования [7, 8, 1116] в области моделирования процессов самоорганизации систем на супраполиэдрическом уровне и геометрического и топологического анализа кристаллических структур с применением современных компьютерных методов.

МЕТОДИКИ, ИСПОЛЬЗОВАННЫЕ ПРИ КОМПЬЮТЕРНОМ АНАЛИЗЕ

Геометрический и топологический анализ осуществляли с помощью комплекса программ ToposPro [10], позволяющего проводить многоцелевое исследование кристаллической структуры в автоматическом режиме, используя представление структур в виде “свернутых графов” (фактор-графов). Данные о функциональной роли атомов при образовании кристаллической структуры получены расчетом координационных последовательностей, т.е. наборов чисел {Nk}, где Nk – число атомов в k-ой координационной сфере данного атома.

Полученные значения координационных последовательностей атомов в 3D-сетках приведены в табл. 2, в которой выделено число соседних атомов в ближайшем окружении, т.е. в первой координационной сфере атома. Все атомы характеризуются различными наборами координационных последовательностей {Nk}, следовательно, все атомы топологически (и функционально) различны.

Таблица 2.  

Локальное окружение атомов Ca и Hg и значения координационных последовательностей

Атом Локальное
  окружение
Координационные последовательности
N1 N2 N3 N4 N5
Ca1   14Hg    14      47      106       189       312
Ca2   15Hg    15      48      104       190       312
Ca3   15Hg    15      47      105       200       310
Ca4   1Ca + 15Hg    16      46      104       193       310
Hg2   4Ca + 8Hg    12      47      106       189       294
Hg3   3Ca + 8Hg    11      46      104       187       290
Hg4   2Ca + 11Hg    13      47      108       188       297
Hg5   3Ca + 9Hg    12      47      108       189       302
Hg6   3Ca + 9Hg    12      47      103       190       299
Hg7   4Ca + 8Hg    12      48      104       192       302
Hg8   4Ca + 8Hg    12      47      109       193       309
Hg9   1Ca + 11Hg    12      46      106       192       303
Hg10   3Ca + 9Hg    12      46      105       194       316
Hg11   3Ca + 9Hg    12      44      109       194       313
Hg12   3Ca + 8Hg    11      44      101       188       302
Hg13   3Ca + 8Hg    11      47      107       191       299
Hg14   3Ca + 8Hg    11      44      107       182       305
Hg15   11Hg    11      47      107       188       302

Алгоритм разложения в автоматическом режиме структуры любого интерметаллида, представленного в виде свернутого графа, на кластерные единицы основывается на следующих принципах: структура образуется в результате самосборки из кластеров-прекурсоров. При этом кластеры-прекурсоры образуют каркас структуры, пустоты в котором заполняются кластерами-спейсерами (состоящими из небольшого числа атомов), нанокластеры-прекурсоры не имеют общих внутренних атомов, но они могут иметь общие атомы на поверхности, кластеры-прекурсоры занимают высокосимметричные позиции, набор нанокластеров-прекурсоров и кластеров-спейсеров включает в себя все атомы структуры.

Алгоритм реализован в комплексе программ ToposPro [10].

САМОСБОРКА КРИСТАЛЛИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ Ca11Hg54hP65

Использованный нами метод моделирования кристаллической структуры основан на определении иерархической последовательности ее самосборки в кристаллографическом пространстве [11]. На первом уровне самоорганизации системы определяется механизм формирования первичной цепи структуры из нанокластеров 0-уровня, сформированных на темплатной стадии химической эволюции системы, далее – механизм самосборки из цепи слоя (2-ой уровень) и затем из слоя-трехмерного каркаса (3-й уровень).

Кристаллографические данные. Параметры гексагональной ячейки: a = b = 13.389, c = 9.615 Å.

Пространственная группа P-6 (no. 174) c элементами точечной симметрией: g = –6 (1a, 1b, 1c, 1d, 1e, 1f), 3 (2g, 2h, 2i), m (3j, 3k). Порядок группы равен 6.

Полиэдрические кластеры K8, K11 и K12. Установлены 184 варианта кластерного представления 3D атомной сетки с числом структурных единиц от 3 до 7.

Определены полиэдрические кластеры K8 = 0@Ca2Hg6 представляющие собой гексагональные бипирамиды, полиэдрические кластеры K11 = 0@Ca3Hg8 и полиэдрические кластеры с центральным Hg-атомом K12 = Hg(Ca3Hg8) (рис. 1).

Рис. 1.

Полиэдрические кластеры.

Центры кластеров Ca2Hg6, 0@Ca3Hg8 и Hg(Ca3Hg8) занимают наиболее высокосимметричные позиции 1с, 1b, и 1f с симметрией –6.

Супраполиэдрические кластеры-прекурсоры K46. Кластеры Ca2Hg6 являются темплатами, на поверхности которых происходит образование атомных оболочек из 38 атомов (рис. 2). Состав двухслойного кластера K46 = 0@8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6).

Рис. 2.

Кластер K46 (две проекции).

Самосборка кристаллической структуры. Первичная цепь. Образование первичных цепей $S_{3}^{1}$ происходит при связывании кластеров K46 тройными кольцами Hg3 в направлении [001]. Расстояние между центрами кластеров K46 в первичной цепи определяет значение вектора трансляции c = 9.818 Å.

2D слой. Образование слоя $S_{3}^{2}$ происходит при связывании первичных цепей $S_{3}^{1}$ в направлении [100] (рис. 3). Расстояние между осями первичных цепей определяет значение вектора трансляции a = 13.602 Å. Пустоты в каркасе занимают полиэдрические кластеры 0@Ca3Hg8 и Hg(Ca3Hg8) и атомы-спейсеры Hg(14) (рис. 3).

Рис. 3.

Каркасная структура (две проекции).

Самосборка каркаса. 3D каркасная структура $S_{3}^{3}$ формируется при связывании 2D слоев (со сдвигом) в направлении [010] (рис. 3). В 3D каркасе расстояние между эквивалентными 2D слоями определяет значение вектора b = 13.602 Å.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Осуществлен комбинаторно-топологический анализ и моделирование кластерной самосборки кристаллической структуры Ca11Hg54hP65.

Определены полиэдрические кластеры K8 = 0@Ca2Hg6, представляющие собой гексагональные бипирамиды, полиэдрические кластеры K11 = 0@Ca3Hg8 и полиэдрические кластеры с центральным Hg-атомом K12 = Hg(Ca3Hg8).

Кластеры Ca2Hg6 являются темплатами, на поверхности которых происходит образование атомных оболочек из 38 атомов. Состав двухслойного темплатированного кластера K46 = 0@8(Ca2Hg6)@38(Hg6 + CaHg6)2(Ca6Hg6).

Реконструирован симметрийный и топологический код процессов самосборки 3D структур из нанокластеров-прекурсоров K46 в виде “первичная цепь → слой → каркас”. Пустоты между первичными цепями занимают полиэдрические кластеры 0@Ca3Hg8 и Hg(Ca3Hg8), а также атомы-спейсеры Hg.

Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ № 19-02-00636) и Министерства науки и высшего образования в рамках выполнения работ по Государственному заданию ФНИЦ “Кристаллография и фотоника” РАН.

Список литературы

  1. Villars P., Cenzual K. Pearson’s Crystal Data-Crystal Structure Database for Inorganic Compounds (PCDIC) ASM International: Materials Park, OH.

  2. Bruzzone G., Merlo F. The calcium-mercury system // J. Less-Common Met. 1973. V. 32. P. 237–241.

  3. Cenzual K., Gelato L.M., Penzo M., Parthé E. Inorganic Structure Types with Revised Space Groups. I. // Acta Crystallogr. B .1991. V. 47. P. 433–439.

  4. Puselj M., Ban Z. Ternäre Gamma-Messing Phasen in den Systemen Calcium-M(Ib/IIb)-Quecksilber // Z. Naturforsch. B. 1980. V. 35. P. 1594–1595.

  5. Tkachuk A.V., Mar A. Alkaline-earth metal mercury intermetallics A(11 – x) Hg(54 + x) (A = Ca, Sr) // Inorganic Chemistry. 2008. V. 47(4). P. 1313–1318.

  6. Puselj M., Ban Z. Beitrag zur Kenntnis des Systems Quecksilber-Calcium // Croatica Chemica Acta. 1978. V. 51(1). P. 75–79.

  7. Ilyushin G.D. Modeling of self-organization processes in crystal forming systems: the symmetry and topological code of cluster self-assembly for intermetallics // Russian J. Inorganic Chemistry. 2017. V. 62. Issue 13. P. 1730–1769.

  8. Ilyushin G.D. Modeling of the Self-OrInnization Processes in Crystal-Forming Systems. Tetrahedral Metal Clusters and the Self-Assembly of Crystal Structures of Intermetallic Compounds // Crystallography Reports. 2017. V. 62. 5. P. 670–683.

  9. Tambornino Frank, Hoch Constantin. The simplest representative of a complex series. The Hg-rich amalgam Yb11Hg54. Zeitschrift fuer Kristallographie – Crystalline Materials. 2017. V. 232. P. 557–565.

  10. Blatov V.A., Shevchenko A.P., Proserpio D.M. Applied Topological Analysis of Crystal Structures with the Program Package ToposPro // Cryst. Growth Des. 2014. V. 14. № 7. P. 3576–3585. https://topospro.com/

  11. Илюшин Г.Д. Моделирование процессов самоорганизации в кристаллообразующих системах. М.: Едиториал УРСС. 2003. 376 с.

  12. Blatov V.A., Ilyushin G.D., Proserpio D.M. Nanocluster model of intermetallic compounds with giant unit cells: β, β'-Mg2Al3 polymorphs // Inorg. Chem. 2010. V. 49. № 4. P. 1811–1818.

  13. Шевченко В.Я., Блатов В.А., Илюшин Г.Д. Симметрийный и топологический код (программа) кластерной самосборки икосаэдрических структур семейства NaZn13-cF112 и TRB66-cF1944 // Физика и химия стекла. 2015. V. 41. № 4. P. 341–351.

  14. Ilyushin G.D. The Crystal Chemistry of Intermetallic Lithium Compounds. A review // Russian J. Inorganic Chemistry. 2018. V. 63. № 14. P. 1786–1799.

  15. Шевченко В.Я., Блатов В.А., Илюшин Г.Д. Моделирование процессов самоорганизации в кристаллообразующих системах. Новые двухслойные кластеры-прекурсоры 0@(Na2Cd6)@(Na12Cd26) и 0@(Na3Cd6)@(Na6Cd35) для самосборки кристаллической структуры Na26Cd141hP168 // Физика и химия стекла. 2019. V. 45. № 4. P. @.

  16. Ilyushin G.D. Symmetry and Topology Code of the Cluster Self-Assembly of Intermetallic Compounds ${\text{A}}_{2}^{{[16]}}$ ${\text{B}}_{4}^{{[12]}}$ of the Friauf Families Mg2Cu4 and Mg2Zn4 // Crystallography Reports. 2018. V. 63. 4. P. 543–552.

Дополнительные материалы отсутствуют.